Plan de gestion des poissons migrateurs 2014-2019 - Bassins de la Loire, de la Sèvre niortaise et des côtiers vendéens
Auteur moral
Pays-de-la-Loire. Direction régionale de l'environnement, de l'aménagement et du logement
;Centre. Direction régionale de l'environnement, de l'aménagement et du logement
Auteur secondaire
Résumé
<div style="text-align: justify;">Au vu du déclin important des populations de poissons migrateurs (Saumon, Aloses, Lamproies, Truites de mer) depuis le début des années 1980, sur le territoire du bassin de la Loire, des côtiers Vendéens et de la Sèvre Niortaise, différents Plans de Gestion des Poissons Migrateurs (PLAGEPOMI) se sont succédés.<br /><br />Élaboré en concertation avec les principaux usagers de l'eau, ce plan qui fixe pour 5 ans un certain nombre de mesures, émet des orientations et des recommandations en vue de permettre une gestion des milieux et des activités humaines compatible avec la sauvegarde des espèces de grands migrateurs. Après avoir rappelé l'organisation de la gestion des grands migrateurs et le contexte général du territoire ainsi que les caractéristiques principales des différentes espèces de poissons migrateurs (habitats, écologie, répartition et stocks), ce quatrième plan, tout en s'appuyant sur le bilan de l'ancien plan, s'attache à présenter ses nouvelle orientations pour les années à venir.<br /><br />Dans cette optique, les principaux enjeux et objectifs de ce nouveau plan de gestion, élaboré par le Comité de Gestion des Poissons Migrateurs (COGEPOMI), sont décrits brièvement, ainsi que les mesures à mettre en place pour les différentes espèces telles que la préservation et la reconquête des habitats, ou bien encore l'amélioration des connaissances sur les espèces et les milieux. Ce quatrième plan pour la période 2014-2019 a été arrêté par le Préfet de région Pays de la Loire, président du COGEPOMI par l'arrêté du 20 février 2014.</div>
Editeur
DREAL Pays de la Loire
Descripteur Urbamet
gestion de l'eau
;biodiversité
;pollution de l'eau
Descripteur écoplanete
migration animale
;habitat d'espèce
;espèce menacée
;espèce migratrice
;anguille
;alose
;poisson
;saumon
;esturgeon
Thème
Environnement - Nature
;Nature
Texte intégral
Historiquedesversionsdudocument
Version Date Commentaire
Une 04/01/13
Pourpremièresobservations,amendementsetcomplémentsduvolet
relatifauxhabitatsetauxmilieuxdeviedusaumonparlecomitédes
expertssaumon
Deux 12/02/13
Miseàjourdel'étatdeslieuxsurlabasedesobservationsdugroupe
depilotageduplansaumonetduGTaloseslamproiestruitedemer
anguille.
Trois 09/04/13
Mise à jour du document pour sa mise à disposition du groupe
espècesduCogepomietdelaComina.
Quatre 20/06/13
Mise à jour du document pour sa mise à disposition des CLE et
EPTB.
Cinq 26/08/13
Mise à jour du document suite aux observations formulées par le
Cogepomidu01/07/2013etlaCominadu14/05/2013,avantsamise
à disposition des services de l'État et du groupe espèces du
Cogepomi.
Six 15/10/13
Mise à jour duprojet après retour des consultationset dugroupe
«espèces»du25/09/2013.
Versionproposéeàl?adoptionduCogepomile25/10/2013.
Sept 10/12/13 AjustementsduprojetadoptéparleCogepomile25/10/2013.
Huit 17/01/14
Ajustementsaprèsparticipationdupublic envertu de la loi du27
décembre 2012 relative à la mise en oeuvre du principe de
participationdupublic.
Neuf 19/02/14 Miseenformefinaledudocument
Affairesuiviepar
EmericBUSSYDREALCentre/SLBLB/DDB BrunoCAPDEVILLEDREALCentre/SLBLB/DDB
Tél.:0236174151/Fax:0236174102
Courriel:emeric.bussy@developpementdurable.gouv.fr Courriel:bruno.capdeville@developpementdurable.gouv.fr
RolandMATRATDREALPaysdelaLoire/SRNP/DERM
Tél.:0272747617/Fax:0236174102
Courriel:roland.matrat@developpementdurable.gouv.fr
Rédacteurs
ÉmericBUSSYetBrunoCAPDEVILLEDREALCentre/SLBLB/DDB
RolandMATRAT?DREALPaysdelaLoire/SRNP/DERM
Relecteur
PascalineCOUSINDREALCentre/SLBLB
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SOMMAIRE
1L'ORGANISATIONDELAGESTIONDESPOISSONSMIGRATEURSAMPHIHALINS:
CADREINTERNATIONALETCONTEXTERÉGLEMENTAIRE.....................................................4
1.1Lecontextecommunautaireetinternationaldelagestiondespoissonsmigrateurs
amphihalins.......................................................................................................................................4
1.2L'articulationaveclespolitiquesnationalesdegestiondespoissonsmigrateursamphihalins
etdesmilieuxaquatiques..................................................................................................................6
1.3LapolitiquedegestiondespoissonsmigrateurssurlebassindelaLoire,delaSèvre
niortaiseetdescôtiersvendéens......................................................................................................7
2ÉTATDESLIEUX:LESESPÈCESAMPHIHALINESPRÉSENTESDANSLESBASSINSDE
LALOIRE,DELASÈVRENIORTAISEETDESCÔTIERSVENDÉENS.....................................12
2.1Connaissancegénéraledesespècesamphihalines...............................................................12
2.2L'anguille.................................................................................................................................19
2.3Lesaumon..............................................................................................................................21
2.4Lesaloses...............................................................................................................................31
2.5Leslamproies..........................................................................................................................34
2.6Latruitedemer.......................................................................................................................37
2.7Lefletcommunoufletd'Europe.............................................................................................38
2.8Lemuletporc..........................................................................................................................39
2.9L'éperlan.................................................................................................................................41
2.10L'esturgeoneuropéen...........................................................................................................41
3CONTEXTEDUTERRITOIREETHABITATSDESESPÈCESAMPHIHALINES...................43
3.1Leszonesdeviedespoissonsmigrateursamphihalinsdanslebassin.................................43
3.2DescriptiondesdifférentssousbassinsversantsduterritoireduCogepomi..........................46
3.3Dispositifsd'évitementetderéductiondesimpactssurleshabitats......................................52
3.4Caractérisationdespressionsaltérantlesmilieuxaquatiquesetleshabitatsfavorablesaux
poissonsmigrateursamphihalins....................................................................................................60
4ORIENTATIONSDESMESURESDEGESTIONPOURLAPÉRIODE20142019.................70
4.1Synthèsedespressionssurlesespècesamphihalines..........................................................70
4.2ObjectifduPlagepomi.............................................................................................................71
4.3Troisorientationsfondamentalestechniques(OF).................................................................72
4.4OFG:Unecoopérationdanslagouvernance.....................................................................73
4.5OFP:Préserveretnepasdégraderlasituationexistante....................................................76
4.6OFR:Reconquérirleshabitatsfavorablesauxespècesamphihalinesetrestaurerles
populations......................................................................................................................................86
4.7OFC:Améliorerlesconnaissancesetlesuividespopulationsdansuncontextede
changementglobal..........................................................................................................................93
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1 L'organisationdelagestiondespoissonsmigrateurs
amphihalins:cadreinternationaletcontexteréglementaire
1.1 Lecontextecommunautaireetinternationaldelagestiondes
poissonsmigrateursamphihalins
1.1.1 Laréglementationcommunautaire
Lerèglementanguille
Faceaudéclin de la population d?anguilles européennes, la commissioneuropéenneaémis en
septembre2007lerèglementn°1100/2007quiviseàreconstituerlestockd'anguilleseuropéennes.
Enréponseaurèglement,laFranceaprésentésonplandegestiondel'anguille(PGA)quiaété
approuvéparlaCommissioneuropéennele15février2010.
LePGAapourobjectifsde:
? initierlaréductiondesdifférentsfacteursdemortalitédel'anguille;
? permettrel'acquisitiondedonnéesnécessairespourl'atteintedesobjectifsdurèglement.
Touslespêcheursprofessionnelsetamateurs,surlesdomainespublicsetprivés,sontconcernéspar
lesmesuresduPGArelativesàlaréductiondelamortalitéparpêche.LePGAprévoitdesmesures
différentespourchaquestadededéveloppement de l'espèce(civelles, anguille jauneet anguille
argentée).Sonpremierobjectifétaitlaréductiondelapressiondepêcheglobalede30%entre2010
et2012.L'objectifàlongtermeduPGAestd'assurerunniveaud'échappementd'anguillesargentées
d'aumoins40%decequ'ilpourraitêtresansaucunimpactdel'homme(situationdite«pristine»).
Ladirective« HabitatsFauneFlore »
Ladirective«HabitatsFauneFlore»(DHFF)de1992apourobjectifslaprotectiondelabiodiversité
dansl'Unioneuropéenneetlemaintienoulerétablissementdansunétatdeconservationfavorable
deshabitatsnaturelsetdesespècesdefauneetdefloresauvagesd'intérêtcommunautaire.
Laconservationdeshabitatsnaturels(listésàl'annexe1delaDHFF)et deshabitatsd'espèces
d'intérêt communautaire (listées à l'annexe 2 de la DHFF) repose sur la délimitation de zones
spéciales deconservation (ZSC). Parmi les espèces d'intérêt communautaire se trouvent l?alose
feinte, l?esturgeon européen, la grande alose, les lamproies fluviatiles et marines et le saumon
atlantique.
Lesdirectivescadresurl'eau(DCE)etpourlemilieumarin(DCSMM)
Ladirective2000/60/CE,ditedirectivecadresurl'eau(DCE),adoptéele23octobre2000,établitun
cadrepour la politiquecommunautairede l'eau. LaDCEafficheuneambition environnementale
traduiteparunobjectifd'atteintedubonétatdeseauxen2015.Cetobjectifsedéclineenprioritésde
nondégradationdeseauxquiseraientdéjàenbonétatetdereconquêtedubonétatparailleurs.
Intégrantlaréalitééconomique,laDCEintroduitlapossibilitédereporterl'atteintedesobjectifsen
2021ou2027danslescasoùleuratteinteestsusceptibled'engendrerdescoûtsdisproportionnés
pourlesindustriels,lesagriculteursoulescollectivitésterritoriales.L'outilprincipalpourlamiseen
oeuvredelaDCE,transposéeendroitnationalparlaloin°2004338du21avril2004,estleSdage.
Ladirective2008/56/CE,ditedirectivecadresurlastratégiepourlemilieumarin(DCSMM),adoptée
le17juin2008,établit uncadrepour lapolitiquecommunautairedegestiondumilieumarin.La
DCSMMpoursuitl'objectifd'atteintedubonétatdumilieumarinàéchéance2020.Elledéveloppe
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uneapprocheécosystémiqueetsocioéconomiquevisantàconcilierlesfonctionnalitésécologiques
desmersetlesactivitéséconomiquesquis'yexercent.L'outilprincipalpourlamiseenoeuvredela
DCSMM,transposéeendroitnationalparlaloin°2010788du12juillet2010,estlePland'actions
pourlemilieumarin(Pamm).
1.1.2 Lesorientationsinternationales
Conventionsur lecommerceinternationaldesespècesdefauneetdefloresauvagesmenacées
d'extinction(CITESouConventiondeWashington).
LaCITESdoitgarantirquelecommerceinternationaldesespècesinscritesdanssesannexes,ainsi
quedespartiesetproduitsquiensontissus,nenuitpasàlaconservationdelabiodiversitéetrepose
suruneutilisationdurabledesespècessauvages.
Àcettefin,laCITESfixeuncadrejuridiqueetdesprocédurespourfaireensortequelesespèces
sauvages faisant l'objet d'uncommerce international nesoient pas surexploitées. La CITESmet
périodiquementà joursesdonnéesducommerceinternationald'espècesprotégéeset lespublie
(Août2010)
L'esturgeonfigureàl'annexeIdelaCITES(espècesmenacéesd'extinction)etl'anguilleeuropéenne
àl'annexeII(listedesespècesqui,bienquen'étantpasnécessairementmenacéesactuellement
d'extinction,pourraientledevenirsilecommercedeleursspécimensn'étaitpasétroitementcontrôlé).
Leplanfrançaisdemiseenoeuvredesrecommandationsdel'OCSANenmatièredeprotection,de
gestionetdemiseenvaleurdusaumonatlantique
L?Organisation de Conservation duSaumonde l?Atlantique Nord (OCSAN) est uneorganisation
intergouvernementalecrééeen1984pourcontribueràlaconservation,larestauration,lamiseen
valeur et lagestionrationnelle desstocksdesaumondansl?OcéanAtlantiqueNord. Elleapour
partiescontractanteslesÉtatsUnis,leCanada,laNorvège,leDanemarketl?Unioneuropéenne.Elle
aenparticuliervulejourpourgérerlespêcheriesmarinesdesaumonauGroenlandOuest,dunord
delaMerdeNorvègeetdesIlesFéroé(eauxinternationales),apparuesdanslesannées1960,etqui
ontété progressivementréduitesouferméesaudébutdesannées1990suiteàsonactionainsiqu?à
celleduNorthAtlanticSalmonFund,uneorganisationdedroitprivée.
L?OCSANs?appuiesurungroupedetravailscientifiqueduConseilInternationalpourl?Explorationdes
Mers(CIEM),legroupedetravailsurlesaumondel?Atlantique,quiétablitchaqueannéeunrapport
répondant aux questions posées par l?OCSAN: statistiques decaptures, statut des populations,
optionsdecapturesadmissiblespour le futur,derniersélémentsde la recherche(caractérisation
génétique,routesdemigrationmarine?),évaluationdesmodesdegestionetretoursd?expérience.
D?autre part, une équipe scientifique internationale est mobilisée par l?OCSANpour établir une
synthèsedes«bonnespratiques»faisantconsensusparmilesbiologistesetlesgestionnairesdes
pêcheriesetdesbiotopesassociésàcetteespèce.
L?organisationadéfiniuneapprochestratégiqueetdemandéàchacunedesespartiescontractantes
d?établir un «plan de mise en oeuvre» montrant l'application locale des orientations,
recommandations et résolutions de l?OCSANéditées depuis 1998. Le plan français, établi pour
répondreàcettedemande,proposevingtactionsprincipales,répartiesencinqchapitres:lagestion
des pêcheries, la protection et la restauration de l?habitat, les programmes de restauration de
populations, l?aquaculture, les introductions et les transferts, la connaissance et l?échange
d?information.Leplanaétéofficiellementvalidéparl?OCSANenjuin2008etfaitl?objetd?unerévision
en2013.
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1.2 L'articulationaveclespolitiquesnationalesdegestiondespoissons
migrateursamphihalinsetdesmilieuxaquatiques
1.2.1 Lastratégienationalepourlespoissonsmigrateursamphihalins
Lastratégienationalepourlespoissonsmigrateursamphihalins(Stranapomi)viselapréservationà
longtermedecesespèceseninsistantsurleurcaractèreessentield?indicateurdubonétatdesanté
des écosystèmes aquatiques. Elle reconnaît également l?enjeu économique associé à leur
préservationparladépendancedel?activitédepêcheprofessionnelleàcertainesdecesespèces.
AinsilaStranapomimetenavantquatreorientationsfondamentalesrelativesà:
? la préservation et la restauration des populations et de leurs habitats. Cette orientation
fondamentalereposesurlarestaurationincontournabledel?hydromorphologiedescoursd?eau,
associéeàlapriseencomptedesaspectsquantitatifsetqualitatifs.Elleintègreégalementles
notionsdegestiondurabledelapêchedesespècesamphihalinesetdesoutiendeseffectifsdans
unelogiquedeconservationdesespèces;
? une rénovation de la gouvernance des poissons amphihalins. Cette orientation fondamentale
implique, audelà d?une rénovation à l?échelle des bassins hydrographiques, de renforcer les
capacitésdemaîtrisesd?ouvragelocalesetd?améliorerletransfertd?informationentrelesniveaux
debassinetlesniveauxlocauxdegouvernance;
? un renforcement de l?acquisition de connaissances, du suivi et de l?évaluation afin de mieux
connaîtrel?étatdespopulationsetdespressionslesaffectant.Lesindicateursàdévelopperetla
créationdesynergiesentreacteursautourdesdonnéesproduitesserontautantd?outilspermettant
uneadaptationdesobjectifsdegestion;
? ledéveloppementdupartaged?expériences,delacommunicationetdelaformation.Samiseen
oeuvre doit, entre autres, se traduire par l?élaboration dedocumentsdecadrageet de lignes
directrices, qui élargissent aussi le champde la préservation des espèces amphihalines aux
scienceséconomiquesetsociales.
Si les orientations de la Stranapomi ont été prises en compte dans l?élaboration du présent
Plagepomi,cedernierveilleraaucoursdesamiseenoeuvreàtenircomptedelapoursuitedela
déclinaisondesorientationsdelaStranapomi.
1.2.2 Lagestiondespoissonsmigrateursetlapolitiquedepréservationetde
restaurationdesmilieuxaquatiques
Al'échelleduterritoireducomitédegestiondespoissonsmigrateurs(Cogepomi)desbassinsdela
Loire,delaSèvreniortaiseetdescôtiersvendéens,leSdageLoireBretagnedéclinelesobjectifsde
ladirectivecadresurl'eau(DCE).
Les questions importantesduSdage20162021 identifient la nécessitéde restaurer desmilieux
aquatiques vivants et diversifiés des sources à l'océan. La conservation et la restauration des
populations de poissons migrateurs amphihalins et de leurs habitats sur le bassin de la Loire
participentàrépondreàcetenjeu.
Ainsi,latraductiondesdispositionsduplandegestiondespoissonsmigrateurs(Plagepomi)parla
miseenoeuvredesmesurescorrespondantesprofitent,nonseulementauxespèces,maiségalement
àlarestaurationdemilieuxaquatiquesfonctionnels,conditionincontournablepouratteindrelebon
étatdecesmilieuxaquatiques,objectifcentraldeladirectivecadresurl'eau.
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LaportéejuridiqueduSdageLoireBretagneest supérieureàcelleduPlagepomi,encequele
Sdageestopposableauxdécisionsadministrativesdansledomainedel'eau(articleL.2121du
Codedel'environnement).SilePlagepomipeutrecommanderdesmesuresutilesàlareproduction,
audéveloppement,àlaconservationetàlacirculationdespoissonsmigrateursamphihalins,ilest
nécessairederenforcer lesliens,etd'intégrer, lesmesuresrelativesauxhabitatsaquatiquesdu
PlagepomidansleSdage20162021.
1.2.3 Lagestiondespoissonsmigrateursetlapolitiquedepréservationetde
restaurationdumilieumarin
Enmilieumarin,ladéclinaisondeladirectivecadrestratégiepourlemilieumarin(DCSMM)setraduit
parl'élaborationdeplansd'actionspourlemilieumarin(Pamm)pourchaquesousrégionmarine.La
façade atlantiqueduCogepomi Loire, Sèvre niortaise et côtiers vendéens est concernéepar la
sousrégionmarineduGolfedeGascogne.
LePlagepomiétantenmesured'émettredesrecommandationspourlaconservationdesespèces
amphihalines en domaine maritime, la synergie entre le Plagepomi et le Pamm du Golfe de
Gascogne,setraduitpardesrecommandationsduPlagepomisurlemilieumarin,relativesà:
? lapréservationdeshabitatsessentiels(zonesdenourriceriedesjuvénilesetzonesdefrai);
? l'acquisitiondeconnaissancessurlecomportementmarindespoissonsamphihalins;
? l'articulationdesréglementationsdelapêcheendomainesfluvialetmaritime.
1.3 Lapolitiquedegestiondespoissonsmigrateurssurlebassindela
Loire,delaSèvreniortaiseetdescôtiersvendéens
1.3.1 Généralités
Jusqu?audébutduXIXe siècle, touteslesespècesamphihalinesabondaientdanslebassindela
Loire.Depuisledébutdesannées1980,lespopulationsdepoissonsmigrateursconnaissentune
chuteimportantesurleterritoiredubassindelaLoire,descôtiersvendéensetdelaSèvreniortaise,
ainsiqu?àl?échelledel?ensembledeleurairederépartition.Certainesespècestellesquelesaumon
présententaujourd?huidessituationstrèscritiquesetdestendancesderégressionconstantequifont
craindreleurextinction,malgrédesaméliorationsdel'étatdeleurpopulationcesdernièresannées:
pourlesaumon,lamoyennedescomptagesàVichydesdixdernièresannéesatteint670individus.
Cetterégressiondespopulationsdemigrateursaconduitàprendredesmesuresdeprotectionetde
gestionconciliantdifférentsenjeux,parfoisantagonistes:
? l?enjeupatrimonialdumaintiendelabiodiversité reposantsurlemaintiendel?airederépartition
desespèces,larichessedespeuplements,lesdensitésdespopulationsetleuréquilibreavecla
capacitéd?accueildumilieu;
? l?enjeu économique consistant à maintenir la viabilité des pêcheries professionnelles et les
activitésdeloisirliéesàl?exploitationdelaressource,ainsiquelaconciliationaveclesactivités
industrielles;
? l?enjeuhalieutiquegarantissantauxpêcheursunaccèsetunpartageéquitabledelaressource,la
variétédesmodesdepêcheetl?étenduedudomainepêchable.
LagestiondespoissonsgrandsmigrateursestencadréeparlesdispositionsdesarticlesR.43644à
R.43668duCodedel?environnement.
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1.3.2 Espècesconcernés
Ledécretn°94157du16février1994définitlalistedesseptespècesamphihalinesàprendreen
comptedanslePlandegestiondespoissonsmigrateurs(Plagepomi):
? saumonatlantique(Salmosalar);
? grandealose(Alosaalosa);
? alosefeinte(Alosafallax);
? lamproiemarine(Petromyzonmarinus);
? lamproiefluviatile(Lampetrafluviatilis);
? anguille(Anguillaanguilla);
? truitedemer(Salmotrutta,f.trutta).
Ces espèces vivent alternativement en eau douce et en eau salée afin de réaliser leur cycle
biologiquecomplet.
Parmielles,lesaumonatlantique,latruitedemer,lesalosesetleslamproiessereproduisenten
rivièreetgrossissentenmer(espècesanadromesoupotamotoques).L?anguillesereproduitenmer
etgrossitenrivière(espècecatadromeouthalassotoque).
Auxespèceslistéesdansledécretn°94157s?ajoutentdanslePlagepomilesespècesdepoissons
migrateurs amphihalins visées par la Stranapomi, qui sont le mulet porc (Liza ramada), le flet
commun (Platichthys flesus), l?éperlan (Osmerus eperlanus) et l?esturgeon européen (Acipenser
sturio).
1.3.3 LePlandegestiondespoissonsmigrateurs(Plagepomi)
LedocumentderéférenceenmatièredegestiondesmigrateursparbassinestlePlagepomi.Élaboré
par le Cogepomiet arrêtéparsonprésident, le plandegestionest publié au recueil desactes
administratifsdechacundesdépartementsconcernés.
Ildétermineparbassin,parcoursd?eauoupargroupedecoursd?eau:
? lesmesuresutilesàlareproduction,audéveloppement,àlaconservationetàlacirculationdes
poissons migrateurs, sous réserve des dispositions du code l'environnement relatives aux
dispositifsassurantlacirculationdesmigrateurs;
? lesmodalitésd?estimationdesstocksetd?estimationdelaquantitéquipeutêtrepêchéechaque
année;
? lesplansd?alevinageetlesprogrammesdesoutiendeseffectifs;
? lesconditionsdanslesquellessontfixéeslespériodesd?ouverturedelapêche;
? lesmodalitésdelalimitationéventuelledespêches,quipeuventêtreadaptéesenfonctiondes
caractéristiquespropresàlapêcheprofessionnelleetàlapêchedeloisir;
? lesconditionsdanslesquellessontdélivrésettenuslescarnetsdepêche.
Élaboréenconcertationaveclesprincipauxusagersdel?eau,lePlagepomiémetdesorientationset
des recommandations en vue de permettre une gestion des milieux et des activités humaines
compatibleaveclasauvegardedesespècesdegrandsmigrateurs.
Lepremierplandegestionaétéapprouvéle26décembre1996.Il afait l'objetd'unbilanàmi
parcoursenjuin1999.Arrivéàéchéancele31décembre2000,ilaétéprorogéjusqu'àlafinde
l'année2002.
Ledeuxièmeplan,applicablesurlapériode20032007aétéarrêtéparlepréfetdelarégionPaysde
laLoirele24mars2003.Ilaétéprorogéjusqu?au31décembre2008pararrêtédu16juin2008.
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Letroisièmeplanpourlapériode20092013aétéarrêtéparlepréfetdelarégionPaysdelaLoirele
31décembre2008etcomportait79mesuresrelativesauxaloses,lamproies,truitedemeretsaumon
(restaurationdelalibrecirculation,préservationetreconquêtedeshabitats,organiseretconforterla
connaissance,communiquer,plandegestiondusaumon,pêche).
Un plan anguille spécifique qui résulte de la mise en oeuvre du règlement européen du
18septembre2007 instituant des mesures de reconstitution du stock d?anguilles européennes
précisedepuis2009lesmesuresspécifiquesàcetteespèce.Leprésentplanneconcernedoncpas
lapêchedel?anguille,endehorsdesmesuresd?encadrementdesattributionsdelicencesdepêche
delacivelle.
Le Plagepomi 20142019 est élaboré à partir du bilan duPlagepomi 20092013adopté par le
Cogepomi le 27 novembre 2012. Son élaboration se fait sous l'égide du Cogepomi avec des
échanges renforcés avec le Comité de bassin LoireBretagne (présentation du bilan, des
orientationsetdesdispositions,duprogrammedemesures)afind'anticiperuneéventuelleévolution
delagouvernancedanslagestiondespoissonsmigrateursamphihalinsquipourraitdécoulerdela
traductiondelastratégienationalepourlespoissonsmigrateursadoptéeendécembre2010.
Ilavocationà:
? compléter le plan de gestion de l?anguille sur la préservation des habitats et la
librecirculationdel?anguille;
? alimenterlestravauxderévisionduSdageLoireBretagneetd?élaborationduPammdugolfe
deGascogne.
1.3.4 LeComitédegestiondespoissonsmigrateurs(Cogepomi)
Compétencegéographique
ChaquedistricthydrographiqueestcouvertparunoudeuxCogepomidontlacompétences?étend
auxcoursd?eauetauxcanauxaffluantàlamer,tantenamontdelalimitedesaluredeseauxque
dansleurspartiescomprisesentrecettelimiteetleslimitestransversalesdelamer,àleursaffluents
etsousaffluentsainsiqu?auxplansd?eauaveclesquelsilscommuniquent,danslamesureoùs?y
trouventdespoissonsmigrateurs.
Enavaldelalimitetransversaledelamer,leCogepomipeutproposeraupréfetderégioncompétent
en matière de pêche maritime l'application de mesures appropriées dans tous les cas où elles
seraient nécessaires à une gestion équilibrée des poissons migrateurs. Le souci de cohérence
hydrographiquede la gestion de la ressourcematérialisé par le plan degestion peut donc être
prolongéenmer,pardesdispositionscomplémentaires.
SurledistricthydrographiqueLoireBretagne,deuxCogepomiexistent,dontleCogepomidubassin
delaLoire,delaSèvreniortaiseetdescôtiersvendéens.LeCogepomidubassindelaLoire,des
côtiersvendéensetdelaSèvreniortaisecouvreentotalitéouenpartie32départementset9régions
administratives (Pays de la Loire, BasseNormandie, PoitouCharentes, Limousin, Centre,
Bourgogne,Auvergne,RhôneAlpesetLanguedocRoussillon).
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Composition
LeCogepomidubassindelaLoire,delaSèvreniortaiseetdescôtiersvendéensestprésidéparle
PréfetdelarégionPaysdelaLoire.Ilestcomposéde:
? représentantsdel'État:
Directionsrégionalesdel'environnement,del'aménagementetdulogement(Dreal)Centre,Paysde
laLoire,AuvergneetLimousin
DirectionsInterrégionalesdelamer(Dirm)NordAtlantiqueMancheOuest,etSudAtlantique
Directions départementales des territoires et de la mer (DDTM) de la LoireAtlantique, de la
HauteLoireetdelaVienne
? représentantsdesdifférentescatégoriesdepêcheurs:
4 représentants des associations agréées de pêche et de protection des milieux aquatiques
(AAPPMA)
4représentantsdespêcheursprofessionnelseneaudouce
3représentantsdesmarinspêcheursprofessionnels
? représentantdesusagers:
unpropriétaireriveraindésignéparleprésidentducomité
? représentantsdescollectivitésterritoriales:
2conseillersrégionauxdelacirconscriptionducomitédésignésparleurassemblée
2conseillersgénérauxdelacirconscriptionducomitédésignésparleurassemblée
Le code de l?environnement prévoit à son article R.43651que le président du Cogepomi peut
recueillirl'avisdetoutorganismeouassociationetdéciderd'entendretoutepersonnequalifiée.Ainsi
etàtitreconsultatif,assistentauxtravauxduCogepomidesreprésentantsdel'Officenationalde
l?eauetdesmilieuxaquatiques(Onema),del'Institutfrançaispourlarechercheetl'exploitationdela
Plandegestiondespoissonsmigrateurs20142019
BassinsdelaLoire,delaSèvreniortaiseetdescôtiersvendéens?19février2014 10/98
Illustration1:TerritoireduCogepomiLoire,Sèvreniortaiseetcôtiersvendéens
DREALCentre,délégationdebassinLoireBretagne
DREALPaysdelaLoire
mer(Ifremer),deLoireGrandsMigrateurs(Logrami),del'Agencedel?eauLoireBretagne(AELB),de
l'ÉtablissementPublicLoire,descomitésrégionauxdespêchesmaritimesetdesélevagesmarins
desPaysdelaLoireetdePoitouCharentes,d'EDF,duConservatoirenationaldusaumonsauvage
(CNSS),duPNRdeBrière,duParcinterrégionalduMaraisPoitevin.
LalistedesmembresconsultatifsduCogepomiestsusceptibled?évoluer,suivantl?appréciationdu
présidentduCogepomi,pourpermettrelaparticipationd'autresstructurestellesquecertainsSAGE
dubassinLoireBretagne,desuniversitairesetscientifiques,descollectivitésouleursgroupements,
desassociationsdeprotectiondelanature...
Organisation :
LesecrétariatduCogepomiestassuréconjointementparledirecteurrégionaldel?environnement,de
l'aménagementetdulogement(Dreal)duCentre,déléguédebassinLoireBretagne,parledirecteur
régionaldel?environnement,del'aménagementetdulogement(Dreal)desPaysdelaLoire,etparle
directeurinterrégionaldelamer(Dirm)NordAtlantiqueMancheOuest.
Missions :
LeCogepomiestchargé:
? d?élaboreretsuivrel?applicationduplandegestiondespoissonsmigrateursetrecueillirtousles
élémentsutilesàsonadaptationouàsonamélioration;
? deformuleràl?intentiondespêcheurslesrecommandationsnécessairesàlamiseenoeuvredu
plan,etnotammentcellesrelativesàsonfinancement;
? derecommanderauxdétenteursdedroitsdepêcheetauxpêcheursmaritimes,lesprogrammes
techniquesderestaurationdepopulationsdepoissonsmigrateursetdeleurshabitats,adaptésau
plandegestion,ainsiquelesmodalitésdefinancementappropriées;
? dedéfinir etdemettreenoeuvredesplansdepréventiondes infractions pour luttercontre le
braconnagedesespècesdontlapêcheestinterditepartiellementoutotalement;
? deproposerauxpréfetsderégions(PaysdelaLoireet Aquitaine)compétentsenmatièrede
pêchemaritime,l?applicationdemesuresappropriéesaudelàdeslimitestransversalesdelamer
danstouslescasoùcesmesuresseraientnécessairesàunegestionéquilibréedespoissons
migrateurs;
? dedonner unavis sur les orientationsdeprotection et degestiondesmilieuxaquatiquesdu
bassin, sur le schéma directeur d?aménagement et de gestion des eaux (Sdage) et sur les
schémasd?aménagementetdegestiondeseaux(Sage).
? de contribuer à la recherche des sites d?alevinage et à la validation de la qualité des sites
sélectionnés.
Lieud?échangeet deconcertation, leCogepomiavocationàassurerunegestioncohérentedes
poissonsmigrateurssurl?ensembledubassin.
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BassinsdelaLoire,delaSèvreniortaiseetdescôtiersvendéens?19février2014 11/98
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2 Étatdeslieux:lesespècesamphihalinesprésentesdans
lesbassinsdelaLoire,delaSèvreniortaiseetdescôtiers
vendéens
LesbassinsdelaLoire,delaSèvreniortaiseetdescôtiersvendéenssontfréquentésparplusieurs
espècesamphihalines.
Le saumonatlantique, l'anguille, la grande alose, l'alose feinte, la lamproie marine, la lamproie
fluviatile et la truite de mer sont directement visées par les dispositions dudécret n°94157du
16février1994etdoncparlePlagepomi.
LaprésencedumuletporcestégalementconstatéedanslebassindelaLoire.Quantàl'éperlanet
au flet, leur présenceest avérée dans l'estuaire de la Loire et probable dans ceux des côtiers
vendéensetdelaSèvreniortaise.
Enfin, l'esturgeon européen, espèce amphihaline faisant l'objet d'un plan national d'actions,
historiquementprésentdanslebassindelaLoire,aégalementétéintégréàcetétatdeslieux.
2.1 Connaissancegénéraledesespècesamphihalines
Les données sur la connaissance des populations de poissons migrateurs amphihalins
correspondent, d'unepart auxdéclarationsdecaptures, etd'autrepart auxrésultatsd'opérations
spécifiquesdesuividespopulationsdepoissonsmigrateursamphihalins.
LestroisprécédentsPlagepomiontdéveloppé,autraversduPlanLoireGrandeurNature,desoutils
desuividespopulationsdepoissonsmigrateursamphihalins.Ils'agitd'outilspérennes(stationsde
comptagedespoissonsmigrateursamphihalins)oud'étudesspécifiquespermettantdecaractériser
lecomportement,etd'apprécierleseffectifsdespopulations.
Lestableauxdebord«anguille»et«saumon,aloses,lamproiesettruitedemer»ontvocationà
centraliser l'ensemble des données biologiques de connaissance des poissons migrateurs
amphihalinsainsiquedesdonnéesrelativesauxmilieuxaquatiquesoùévoluentcesespèces.Cette
bancarisationdel'informationpermetensuitedefaireconnaîtrel'informationetdelavaloriserdans
lecadred'expertises, quipermettentdemieuxcomprendrelefonctionnementdespopulationset
ainsid'éclairerlesprisesdedécisionsdegestionenmatièredegestion.
Il est aussinécessairederappeler que lesconnaissancesbiologiquesnesontquepartielles,en
particulierdanslamesureoùellesconcernentcertainscoursd'eauetnonl'ensembledescoursd'eau
dubassindelaLoireetdescôtiersvendéens.
L'élargissementprogressif,danslecadreduPlagepomi,delacouvertureduterritoirepardifférentes
opérationsdesuivipermetdecompléterlesconnaissancesetd'avancerversunecaractérisationla
pluscomplètepossibledel'étatdespopulationsetdeleurshabitatsàl'échelledesbassinsdelaLoire
etdescôtiersvendéens.Ledéveloppementdesynergiesavecdessuivislocauxdespopulationsde
poissonsmigrateursamphihalinsproposésparcertainsacteursduterritoire(parexempledansle
bassinversantduCheraval)pourradécuplerlescapacitésd?acquisitiondeconnaissances.
2.1.1 Lessuivisdesmigrations
Lespointsdecontrôledesmigrationssontdedeuxtypes:
? les stationsdecomptagedespoissonsmigrateurs à la montaison, au nombrededix sur les
bassinsdelaLoireetdescôtiersvendéens;
? lespassespiègespourlesanguilles.
Plandegestiondespoissonsmigrateurs20142019
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Lesdix stationsdecomptagepermanentont été installéesauniveaudepassesàpoissonssur
l'Allier,laLoire,l'Arroux,laVienne,laCreuse,laGartempeetlaSèvreniortaise.Leurlocalisationest
préciséesurlacartedel'illustration2.
Elles permettent le dénombrement des passagesà la montaison par vidéocomptage avec une
exhaustivitévariablesuivantlesstationscomptetenudelaconfigurationdesouvrages(existencede
plusieursvoiesdepassagedifférentesparfois).
Lesrampesàcivellespeuventfairel'objetd'unsuividespassagesàlamontaisonlorsqu'ellessont
équipéesdepièges.Lesouvragesconcernéssontalorsdénommés«passespièges».Acejour,
48passesàanguillesontfaitl?objetdesuivisdanslesbassinsdelaLoireetdescôtiersvendéens.
Chaquepasseestgéréeparunorganismelocal(collectivité,syndicatdepropriétaires,parcnaturel
ouassociationagrééepourlapêcheetlaprotectiondumilieuaquatique(AAPPMA)).Lacollectede
donnéesestdanscertainscascoordonnéeàl'échelledépartementale,parl'animationqu'assureune
structure (cas du Parc Interrégional du Marais Poitevin, de la fédération départementales des
AAPPMAdeVendée).LebarragedesEnfrenaux,àl'exutoiredelaSèvreniortaiseestparexemple
équipéd'unepassepiègeàanguilles.
Lesstationsdecomptageetlespassespiègesàanguillessontliéesàlaprésenced'unouvrage
transversalmaisneconstituentpasunusagedecedernier.Enconséquence,unpointdecontrôlene
sauraitenaucuncasjustifierdelapérennitéd'unouvragetransversal.Danslecontextedemiseen
oeuvre du nouveau classement des cours d'eau au titre de l'article L.21417 du Code de
l'environnement, la disparition d'unestation decontrôle par effacement ou arasement partiel de
l'ouvragelasupportantdoitêtreconsidéréecommeunréelbénéficepourlespopulationsdepoissons
migrateursamphihalinsdesbassinsdelaLoireetdescôtiersvendéens.
D'autressuivissontégalementenplacesurlesalosesetlesanguillesargentéesenparticulierafin
d'évaluerlesfluxetlesindicesd'abondance.
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Illustration2:LesdixstationsdevidéocomptagedanslesbassinsdelaLoireetde
laSèvreniortaise.
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2.1.2 Lerecensementdesfrayères
Des opérations ponctuelles de recensement des frayères de saumon, de lamproies et d'aloses
interviennentafinderenseignersurl'abondancedelareproduction.
Le saumon et les lamproies bâtissent des nids par aménagement du fond du lit suivant une
organisationsemicirculaireconstituéed'uncreuxetd'undôme.Cesaménagementsdesgaletset
gravierspermettentunrepéragevisueldeszonesdefrayères.Desprospectionssontainsimenées
pour comptabiliser les zones de frayères sur certains cours d'eau du bassin de la Loire. Des
opérations ont en particulier été menées dans les bassins versants de l'Allier, de la Loire
bourguignonneetdelaVienne.
Enparallèledecesobservationsdefrayères,lacartographiedesfacièsd'écoulementetdeshabitats
permetdemettreenévidencedeszonespotentiellesfavorablesàlareproduction.Ainsi,leszonesde
reproductionpotentiellesdusaumonontpuêtremisesenévidencedanslebassindelaVienne.
Lareproductiondel'aloseestmoinsdépendantedusubstrat.Decefait,lesuividelareproduction
desalosesnécessitedeuxétapes:
? sur la base des caractéristiques hydrodynamiques (faciès d'écoulement, vitesse du courant,
substrat),ladéterminationdeszonespotentiellesdereproductiondesaloses;
? surceszonespotentiellesdereproduction,lesuividelareproductioneffective(constatationde
bulls nocturnes) est réalisé, afin de préciser l'activité de reproduction sur les différents sites
potentielsdereproduction.
Des opérations de recensement de frayères d'aloses ont notamment eu lieu dans les bassins
versantsdel'Allier,duCher,delaLoirebourguignonne,delaLoiremoyenneetdelaVienne.
2.1.3 Lerecensementdesjuvéniles
Lesjuvénilesdesaumonsetd'alosesfontl'objetd'opérationsdesuivis.
Despêchesélectriques,afindedéterminerdesindicesd'abondances,ontnotammentlieusurles
tacons. Ces informations mettent en évidence dans l?Allierdes abondances de tacons plus
importantesdanslazonerefugeentrePoutèsetLangeacetdanslesecteurcomprisentreLangeac
etBrioude(illustration3).Sileshabitatssontproductifssurceszones,ilslesontégalementenamont
dubarragedePoutès,oùlesfaibleseffectifsdegéniteursexpliquentenpartielesfaiblesabondances
observées.
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LesopérationssurlesalosonsenLoiremoyennepermettentdedisposerd'élémentsd'appréciation
ducalendriermigratoiredesalosonsdumoisdejuinaumoisd'octobre,dedonnéesbiométriqueset
decaractériserleshabitatsfréquentésparlesalosonsetleurrégimealimentaire.
2.1.4 Pressionsdeprélèvements
Prédations
Lesespècesamphihalinessontexposéeslorsdeleurcycledevieeneaudouceàdesprédations
multiples,exercéespardesespècesendogènescommeexotiques.
Laprédationpardesespècesautochtonesconcerne, outre lespoissonscarnassiers, lesoiseaux
piscivores(martinpêcheur,aigrette,hérons...),toutparticulièrementlegrandcormoran,etenfinla
loutre.Cesdeuxdernièresespècesfontl'objetdemesuresdeprotection,avecdanslecasdela
loutrelamiseenoeuvred'unplannationald'actions.
Anoterquelegrandcormoranfait l'objetdemesuresderégulation.Unquotanationaldetirsde
grandcormoransest défini chaqueannéeauvudel'évolutiondeseffectifs,réparti entrechaque
département.Surlestroissaisonsd'hivernage20092010,20102011et20112012,lenombrede
tirsdecormoranseneauxlibresavariéde50à700selonlesdépartementsdanslebassin.Les
quatredépartementsayantlesquotasdetirseneauxlibreslesplusimportantssontlaNièvre,le
Cher,leLoiretet l'Allier. Si lapressionpotentielle laplus importantepourrait concerner larivière
Allier,ilconvientdepréciserquelesdortoirsdecormoranspeuventêtresituésàproximitéd'uncours
d'eau sans pour autant que les cormorans ne pêchent dans ce cours d'eau. Aussi, la période
d'hivernages'étendd'octobreàmarset lesdépartsenmigrationdescormoransvers leNordde
l'Europesontobservéspourmoitiédeseffectifsavantlafinjanvier.Cettetendance,constatéedans
lesrecensementsnationaux,estplusmarquéepourleszonessuddel'airederépartitionenFrance,
dont le massif Central. La prédation des poissons amphihalins, notamment des smolts, par les
cormoransestprobablementfaible,maisiln'estpasexclutoutefoisqu'ellepuisseexisterdemanière
nonnégligeablecertainesannéesauniveaudequelquesretenues(Poutès,Vichy...).
Parailleurs,lesdéséquilibresrencontrésdanslesécosystèmes etlesintroductionsd'espècesont
favorisélacolonisation,notammentdubassindelaLoire,pardenouvellesespèces.Cesdernières
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BassinsdelaLoire,delaSèvreniortaiseetdescôtiersvendéens?19février2014 15/98
Illustration 3: Indices d'abondance moyens de tacons 0+ en 5 minutes dans l'Allier, Logrami.
0
20
40
60
80
100
120
140
160
Amont Langogne Langogne ? Poutès Poutès-Langeac
Langeac ? Brioude Aval Brioude
N
o
m
b
re
d
e
0
+
/5
m
in
DREALCentre,délégationdebassinLoireBretagne
DREALPaysdelaLoire
peuventengendrerdesperturbationsdel'équilibretrophiquedespoissonsamphihalins.
Enparticulier,lesilureaprogressivementcolonisélebassindelaLoire.Lacroissancedeseffectifs
desiluretendraitàaccroîtrelaprédationdespoissonsamphihalinsparcetteespèce.Lessecteursde
plusgrandevulnérabilitédespoissonsamphihalinsseraientl'approchedespassesàpoissonsavec
lestationnementdespoissonsenavaldel'ouvrageetleszoneslentiquesdereposdanslamigration.
L'approfondissementdesconnaissancessurl'impactdusilureglane,ainsiqueplusglobalementsur
lesrelationstrophiquesentrelespoissonsmigrateursetleursprincipauxprédateurs,doitêtreunpoint
devigilance.
Il enestdemêmepour lesespècesquicolonisent progressivement lebassindela Loire: aspe
(Aspiusaspius),et,dansunemoindremesure,esturgeondeSibérie(Acipenserbaeri).
Pêche
Endomainemaritime,lapêchepélagiqueconduitàdescapturesaccessoiresdepoissonsmigrateurs
amphihalins,entreautresd?aloses.Néanmoins,iln?existepasdepêcheriesmaritimescibléessurles
espècesdepoissonsmigrateursamphihalins.
Lapêcheeneaudouceest pratiquéedans le bassinde la Loirepar despêcheursauxengins
amateursetprofessionnelsetdespêcheursauxlignes.Danslesbassinsdescôtiersvendéens,elle
estuniquementpratiquéepardespêcheursamateursauxenginsetauxlignes.
Lapêches'exerceencoursd'eauetenmarais,surledomainepublicetsurledomaineprivé.La
cartedel'illustration4faitétatdeslimitesderéglementationdelapêcheentreledomainefluvialetle
domainemaritimedansl'estuairedelaLoire.
LeCodedel'environnementpréciseàsesarticlesR.43670etR.43671quetoutepêcheestinterdite
danslesdispositifsassurantlacirculationdespoissonsdanslesouvragesconstruitsdanslelitdes
coursd'eau,ainsiquedanslespertuis,vannagesetpassagesd'eauàl'intérieurdesbâtiments.La
pêcheestégalementinterditeàpartirdesbarragesetdeséclusesainsiquesurunedistancede50
mètresenavaldel'extrémitédeceuxci,àl'exceptiondelapêcheàl'aided'uneligne.
Les tailles minimales de capture des poissons migrateurs amphihalins sont définies par la
réglementationgénéralerelativeàlapêcheeneaudouceetenmer(articlesR.43618etR.43662du
Codedel'environnementetarrêtésministérielsdu28etdu29janvier2013)tellesqueprécisées
dansletableau1.
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Illustration4:Réglementationdelapêchedansl'estuairedelaLoire
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Tableau1:Taillesminimalesdecapturedespoissonsamphihalins
Espèce Tailleminimaledecaptureenamontdelimitede
saluredeseaux(eaudouce)
Tailleminimaledecapturesen
avaldelalimitedesaluredes
eaux(mer)
Alose 30cm 30cm
Flet pasderéglementationgénérale 20cm
Lamproiefluviatile 20cm 20cm(uniquementenamontdela
limitetransversaledelamer)
Lamproiemarine 40cm 40cm(uniquementenamontdela
limitetransversaledelamer)
Mulet 20cm 30cm
Saumonatlantique 50cm 50cm
Truitedemer 35cm 35cm
Parmilespoissonsmigrateursamphihalins,lapressiondepêchedanslebassindelaLoireportesur
lesaloses,leslamproies,l'anguilleetlemulet.Lapêchedusaumonetdelatruitedemeresteneffet
interdite.L'effortdepêcheestrépartientre lespêcheursprofessionnelsetlespêcheursamateurs
récréatifs (pêcheauxenginsetpêcheàlaligne).
Lacaractérisationdelapressiondepêcheprésentéeciaprèsreposesurlesdéclarationsdecaptures
despêcheursauxengins(amateursetprofessionnels).Ladéclarationdecapturen'estpasexigée
pourlespêcheursamateursauxlignes.L?obtentionetlavalorisationdesdonnéesdecaptureseneau
douceetenmerrestentinsuffisantes.
Lesdéclarationsdecapturesdespêcheursauxengins(amateursetprofessionnels)fontétatd?une
capturemoyenneannuelled'alosesde8tsurlebassindelaLoire(Loireestuaire,avaletmoyenne)
surlapériode20042010(donnéesSNPE).Lescapturesd'alosesdanslebassindelaLoiresuivent
l'évolutiondécritecidessousdansl'illustration5.Parmicellesci,lescapturesdespêcheursamateurs
auxenginsetauxfiletsreprésententmoinsde3%descapturesdespêcheursprofessionnels.
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Lescapturesd'alosesdéclaréessur lescôtiers vendéenssont enmoyennede l'ordrede10kg
chaqueannée.
Les déclarations de captures de lamproies par les pêcheurs professionnels font apparaître une
moyenneannuellesurlapériode20042010de25,6tsurlebassindelaLoire. Lescapturesde
lamproiesdanslebassindelaLoiresuiventl'évolutiondécritecidessousdansl'illustration6.Parmi
cellesci,lescapturesdespêcheursamateursauxenginsetauxfiletsreprésententmoinsde20%
descapturesdespêcheursprofessionnels.
Lapêchedel'anguilleciblelesdifférentsstadesdedéveloppementcontinentauxdel'espèce:civelle,
anguillejauneetanguilleargentée.Touslespêcheursauxengins(professionnelsetamateurssurles
domainespublicetprivé)ontl'obligationdedéclarerleurscapturesd'anguillesauxdifférentsstades
dedéveloppement.Lapêchedel?anguilleestautoriséeàl?intérieurdeslimitesdel?unitédegestion
del?anguillesuivantlesmodalitéspréciséesdansleplandegestiondel?anguille.
Lescapturesdecivellesfontl'objetd'unsuivispécifiqueparleministèreenchargedel'écologiedans
lecadreduPlandegestiondel'anguille.Lacaptureparunitéd'effort(CPUE)surlapériode1999
2002variede3à12kgparsortiedepêche(moyenne:6kg)alorsqu'elleatteignait15kgen1979
1982,soit unechutede56%en20ans(Cemagref,2006).L'efficacitédelapêchesembleavoir
continuéàdiminuer:eneffetlaCPUEnedépassepas2kgparsortiedepêchepourlapériode
20082012(donnéesCIEM/WGEEL2013).Il convient de noter durant cette période la mise en oeuvre
des quotas depuis la saison de pêche 2009-2010 en application du PGA, ce qui a conduit à une
réduction de l'effort de pêche.
Braconnage
Le braconnage représente également une pression non négligeable. En 2009, 3 saumons sur les 30
suivis par radiopistage en amont du barrage de Vichy ont été braconnés. L'activité de braconnage est
également particulièrement marquée sur la civelle et l'anguille argentée dans les étiers des marais.
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2.2 L'anguille
2.2.1 Écologiedelapopulationd'anguilles
Lesanguilleseuropéennessereproduisent dans lamerdesSargasses, auniveaude fossesde
4000mètresdeprofondeuraulargedelaFloride,demarsàjuillet.
Leslarvesleptocéphales,portéesparlecourantduGulfStream,arriventsurlescôteseuropéennes
aprèsunemigrationdeplusieursmilliersdekilomètresquidure6à9mois.
A l?approche du plateau continental, une première métamorphose modifie les leptocéphales en
civelles,quivontceconcentrerensuitedanslesestuairesenutilisant lescourantsdemarée,de
décembreàmars.
Différentsstadespigmentairesapparaissentprogressivementdurantlaphasecivelle, traduisant la
transitionentrelemilieumarinetdulçaquicole.Lescivellespigmentéesouanguillettescolonisentle
domainecontinental,maispeuventégalementsesédentariserenmilieueuryhalin,voiremarin.
Lesanguillesjaunescorrespondentaustadedesédentarisation.Cettephase,plusoumoinslongue
(de3à20ans),estentièrementorientéeverslacroissance.
Au terme de cette phase de croissance, les anguilles subissent une seconde métamorphose,
transformantl?anguillejauneenanguilleargentée,auboutd?uneduréetrèsvariableselonlesiteet
lesindividus:3à14anspourlesmâleset6à20anspourlesfemelles.Lesanguillesargentées
entament en automne et en hiver (octobre à février) leur migration de dévalaison pour aller se
reproduiredanslamerdesSargasses.
2.2.2 Airederépartition
L'airederépartitiondel'anguilleeuropéennecorrespondauxzonescôtièresetauxcoursd?eaude
l?Europeet de l?AfriqueduNord. L?anguille yoccupedeshabitatstrèsvariés(estuaires, rivières,
étangs,lacs,etc.).
DanslebassindelaLoire,lescôtiersvendéensetlaSèvreniortaise,touslesmilieuxaquatiques
jusqu'àunealtitudede1000mconstituentleshabitatsnaturelsdel'anguille.L'avaldesbassinsetles
zones humides de plaines présentent des abondances relativement plus importantes et sont
majoritairementoccupéspardesmâles,dontlecycledeviecontinentaleestpluscourt.Lesfemelles,
deplusgrandetaille,étantplusreprésentéesàl'amontdesbassins(argentureplustardive).Ainsi,
l'ensembledescoursd'eaudesbassinsversantreprésenteunhabitatdecroissancepotentielpour
l'espèce,celuiciétantplusoumoinsmobiliséenfonctiondesonaccessibilité.
Lesdensitésd?anguillesobservéessont,pourlamajoritédesaffluents,endiminutionouaumieuxen
stagnation (données du réseau hydrographique piscicole). L?aire de répartition de l?anguille est
considéréeenrégressiondanslebassinLoire.
2.2.3 Estimationdelapopulationd'anguilles
Ungrandnombred'étudesontmisenévidencelaforterelationentreladensitéd'anguilledansles
rivièresetladistanceàlamer.C'estgénéralementleparamètrequiexpliquelemieuxlesdensités
observéesàl'échelledubassin.
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AinsidanslebassindelaLoire,lesdensitéslesplusfortesseretrouventpourlaplupart,relativement
prochesdel'estuaire(illustration7).Lesdensitésd'anguillesjaunessurlebassinsontestiméespar
modélisationàpartir desdonnées issuesdespêchesdecontrôleréaliséepar l'Onema(source:
BDMAP).LapopulationdeLoireaainsiétéestiméeàenviron9,2millionsd'anguillesen2009.Ce
chiffreest donné ici à titre indicatif. Il est utilisé dans la modélisationpourestimer la production
annuelleenanguillesargentéesdévalantes(Npotentiel =459162d'anguillesargentées,soit5%des
densitésestimées)etlabiomassepotentielledegéniteurs(Bpotentiel=367tonnes).
Cette production théorique d'anguilles argentées est en partie exploitée par la pêcherie
professionnellefluvialedeLoire(12851capturesd'anguillesdéclaréesen2009,horspêcheriede
GrandLieu),l'échappementréel(Ncurrent)estdoncestiméprochede440000anguillesargentéespar
an.
2.2.4 Étatsanitaire
L?anguilleestuneespècesensibleauxpollutions:ellevitlamajeurepartiedesavieprèsdufond
(comportementbenthique)etpossèdeunecapacitéderespirationcutanée.Laduréeducycledevie
de l?anguille entraîne unebioaccumulation importante des polluants, ce qui fait de l?espèceun
excellentbiomarqueurdelapollutiondel?eau.
Les anguilles de Loire sont également exposées à la parasitose de leur vessie natatoire par
A.Crassus. Leséchantillonnageseffectuésen2009surlesanguillesargentéesdévalantesparla
pêcherieprofessionnelledeLoireonmontréque56%d'entreellesenmoyenneétaientparasitées
paraumoinsunver (enmoyenne5,4parasitesparanguille), mais la quasitotalitédesvessies
observées(99%)présentaientaumoinsdestracesd'unparasitismepassé.
2.2.5 Synthèsedesenjeuxpourl'anguille
LebassindelaLoireestidéalementsituésurl'airederépartitioneuropéenne:parsalatitudesurl'arc
atlantiqueetl'attractivitédeleurspanachesd'eaudouce,lesestuairesdelaLoire,deVendéeetdela
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Illustration7:Répartitiondesdensitésd'anguilledanslebassindelaLoire(OnemaBDMAP,données
19762006)
DREALCentre,délégationdebassinLoireBretagne
DREALPaysdelaLoire
Sèvreniortaisereçoiventunepartimportantedurecrutementeuropéenencivelles.
L?anguille est aujourd?hui en forte régression, en France, commesur l?ensemble desonairede
répartition européenne. En effet, l?anguille européenne est classée sur la liste rougede l?UICN
commeespèceendangercritiqued?extinction(CR).
Unensembledefacteursestàl?originedecettediminutiondelapopulation:obstaclesàlamigration,
braconnage,pollutionparlespesticides,dégradationdeshabitats,parasitisme,pêcheetc.
Legroupedetravail?Anguille?(WGEEL)duConseilinternationalpourl'explorationdelamer(Ciem)
produitchaqueannéedesrapportssurl?étatdelapopulationd?anguilleseuropéenne,desdonnées
actualiséesetdesmesuresdegestiondel?espècepourchaquepaysappliquantunplandegestion
?anguille?. Unindicederecrutement?civelles?estcalculéàpartirdesdéclarationsdecapturedes
différentespêcherieseuropéennes,rapportéesauxquantitéscapturéesen1980.L?indiceestexprimé
de0à1(Lavaleur1correspondautonnageen1980moyennésur5ans).Toutefois,aveclamiseen
placedusystèmedesquotaspourlapêchedelacivelle,lescapturesdelapêcheprofessionnelle
sontmoinsreprésentativesdurecrutementestuarien.
En2012leCiem/WGEELindiquaitqu'ilsemblaitquelestockd?anguillesacontinuédedécliner,avec
un indice de recrutement (en moyenne sur les 5 dernières années) actuellement à sonniveau
historiqueleplusbasparrapportauxannées1960à1979:moinsde1%pourlaMerduNordet5%
pourlerestedel?airederépartitiondel?espèce.Aucoursdelasaison20112012,lerecrutement
(hors?MerduNord?)aretrouvésonniveaude20072008.Cettevariationcorrespondàlavariabilité
normaledessériesderecrutement,dontleniveaurestebas.
Dans les estuaires de la Loire et de Vendée, les captures déclarées étaient de 43 tonnes en
20072008(avantlamiseenapplicationdesmesuresd'encadrementdelapêchedel'anguilleparle
plan de gestion de l'anguille), alors qu'elles atteignaient 770 tonnes en 1976 (données
CemagrefOnemaÉtat,reprisesdanslerapport2012dugroupeanguilleduCiem).
L'enjeuprincipalpourl'espècedanslebassindelaLoireestlaréouverturedel'accèsauxhabitatsde
croissancedel'anguilleetlaréductiondetouteslessourcesdemortalitésanthropiques(impactdes
turbineshydroélectriques, pollutions, prélèvements par pêche, braconnage...) afin de restaurer le
potentield'accueildubassinet l'échappementdegéniteurs,pourcontribuerà lareconstitutionde
l'espèceàl'échelleeuropéenne.
2.3 Lesaumon
2.3.1 ÉcologiedelapopulationdesaumonsdeLoireAllier
Lesaumonatlantique,espèceanadrome,sereproduitenrivièreoùlesjuvénilespassentunàdeux
ansavantdedévalerversl'océan(entrefévrieretmai)pourrejoindreleurszonesd'engraissement
situéesdans l'AtlantiqueNord. Les adultespassent généralement un à trois hiversen mer puis
reviennenteneaudoucepoursereproduiregénéralementsurlarivièreoùilssontnés(phénomène
appelé«homing»).
Lamigrationdesadulteseneaudouces'étalesurprèsd'unan,avecuneentréeenestuaireetune
migration dans les sous bassins versants de l'aval du bassin de la Loire entre septembre et
décembre,puisunemigrationverslessousbassinsversantssituésplusenamont(AllieretLoire
bourguignonnenotamment)entrejanvieretjuin,suivid'unereprisedemigrationàl'automnesuivant
pouratteindreleszonesdefrayèreslesplusenamont.Aprèslareproduction,touslesadultesne
meurent pas, et une partie d'entre eux est susceptible d'engager une nouvelle migration de
dévalaison.
Lecycledeviedusaumonestrécapitulédansl'illustration8.
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LapopulationdesaumondeLoireAllierprésenteunintérêtpatrimonial, enpremierlieupourses
particularitésmigratoires(avecdesfrayèreséloignéesd?environ800kmdel?océan,cequinese
retrouvequesurquelquesrivièrescanadiennesetaméricaines,etunparcoursenmerdel?ordrede
4000km? illustration9) : elle est enpartie naturelle carnonuniquement issuedes lâchersde
juvénilesd?élevage,etellenecomprendqu?uneinfimeproportiondecastillons(saumonsd?unhiver
marin)àVichy,lesquelsneparticipentvraisemblablementpasàlareproductionnaturelle.Il s?agit
doncessentiellementd?unepopulationdepoissonsdedeuxet troishiversdemer; lessaumons
tribermarinsmesurentunmètreenvironetentrenteneaudouceprèsd?unanavantdesereproduire.
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Illustration8:Cyclebiologiquedusaumonatlantique,DrealCentre.
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CettepopulationestladernièrequisubsistenaturellementdanstoutlebassindelaLoireaudébutdu
21esiècle,aprèsladisparitionau20esiècledesnombreusessouspopulationsinféodéesauxautres
grandscoursd?eaudubassin(Vienne,Creuse,Gartempe,Cher,Loireamont?),principalementdu
faitdelaconstructiondegrandsbarragesempêchantl?accèsauxfrayères.
2.3.2 Airederépartition
Historiquement,ilestestiméqu?audébutduXVIIIesiècle,plusde100000saumonsseprésentaient
chaqueannéeàl?estuairedelaLoire.LaconstructiondesgrandsbarragesauXIXeetauXXesiècles
aprogressivement réduit l?accèsauxzones amont dubassin(illustrations10et 11) et limité les
possibilitésdereproductionparlaréductiondel'accèsauxsurfacesdefrayèreshistoriques.
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Illustration9:Principauxsecteursdemigrationsocéaniques
dusaumondeLoireAllierverslamerdeNorvège,Dreal
Centre.
NB:Unepartiedelapopulationestsusceptiblederejoindredes
zonesdegrossissementsituéesaulargeduGroenlandetde
TerreNeuve.
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Entre1890et1930,lenombredesaumonsestiméssurlebassindelaLoirepassede45000à
15000pouratteindre2000audébutdesannées1980etseulementunecentaineen1990.
Leseffortsderestaurationentreprisdepuislemilieudesannées1970ontpermisunereconquête
progressivedecertainscoursd'eaudubassindelaLoire.
Desjuvénilesdesaumonssontparfoistrouvésdansdescoursd'eaunefigurantpassurlacartedans
l'illustration 12, entre autres lors des pêches d'inventaire que peuvent réaliser l'Onema et les
FDAAPPMA.
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Illustration10:AirederépartitiondusaumonaudébutduXIXèmesiècle,CSP.
Illustration11:RépartitiondusaumondanslebassindelaLoireen1976,lorsdu
lancementdespremièresopérationsderestaurationdelapopulation,CSP.
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2.3.3 Répartitiondeshabitatsfavorables
Leshabitatsd?eaudoucefavorablesausaumon,précisésdans le guidepour lapréservation, la
restauration et l?amélioration des habitats du saumonatlantique, édité par l?Organisation pour la
conservationdusaumondel'AtlantiqueNord(OCSAN)en2010,sontdétaillésparstadedeviedu
saumonatlantiquedansletableau2.
Tableau2:Recommandationsdel'OCSANpourleshabitatsd?eaudoucefavorablesauxdifférentsstadesdevie
dusaumonatlantique.NASCOGuidelinesfortheprotection,therestorationandtheenhancementofatlantic
salmonhabitat,2010.
Périodededéveloppement Exigencesentermesd'habitat Facteursd'impacts
Ponteetincubation Graviers grossiers et débit d'eau
fraîcheetbienoxygénée
Sédimentationdesfines
Modificationdel'hydromorphologie,de
l'hydrologieetdelaqualitédeseaux.
Croissancedesjuvéniles Zones de mélange d'eaux fraîches,
peuchargéesetbienoxygénées
Équilibredelachaînetrophique
Substrat ménageant des abris pour
uneprotectionfaceauxprédateurset
aux évènements hydrologiques
sévères(cruesouétiages)
Sédimentationdesfines
Modificationdel'hydromorphologie,de
l'hydrologieetdelaqualitédeseaux
Modificationdelachaînetrophique
Migrationsdesjuvénilesetdesadultes Routes migratoires libres d'obstacles
chimiques,physiquesetbiologiques
Obstaclesphysiquesauxmigrations
Modificationdel'hydromorphologie,de
l'hydrologieetdelaqualitédeseaux
Modificationdelachaînetrophique
Prégéniteursadultes Zonesd'eauprofondepeuchargéeet
bienoxygénée
Substrat ménageant des abris pour
uneprotectionfaceauxprédateurset
aux événements hydrologiques
sévères(cruesouétiages)
Sédimentationdesfines
Modificationdel'hydromorphologie,de
l'hydrologieetdelaqualitédeseaux
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Illustration12:RépartitiondusaumondanslebassindelaLoireen2008,
Onema.
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LeszonesdefrayèresàlafinduXVIIIesiècles'étendaientsur2200haàl'échelledubassindela
Loire,dont760hasurlebassindel'Allier(Bachelier,L?histoiredusaumonenLoire.1963).
Deuxméthodesontpuêtredéveloppéesdepuislemilieudesannées1970pourévaluerlessurfaces
d'habitatsdusaumon:
? une méthode d'expertise, conduisant à une surface dite productive expertisée, valorisant les
donnéesbiologiquesrecueilliesparailleurs,notammentlesrésultatsdespêchesd'abondancede
tacons;
? uneméthodedepondérationdessurfacescaractériséesparailleurs,enfonctiondeleurintérêt
pourlafraieetlacroissancedesjuvéniles.Cetteméthode,ditedeséquivalentsradiersrapides
(ERR)conduit à l'évaluationd'unesurfaced'ERR(SERR),égaleàlasommedessurfacesde
radiers,derapidesetaucinquièmedessurfacesdeplatscourants.
Les surfaces d'habitats productifs caractérisés par ces deux méthodes sont précisées dans le
tableau3.
Tableau3:Surfacesd'habitatsproductifsactuellementconnus(Sources:Allieretaffluents:CSP,1999.
Besbre:Logrami,2011.Gartempe:LogramiOnema,2012).
Coursd'eau Surfaceproductiveexpertisée(m²) SERR(m²)
Affluentsdel'Arroux 178000
Alagnon 555036 356519
Allier 2102335 1191563
Besbre 194000
Chapeauroux 181805 126296
Dore 510560 287948
Gartempe 485000
AffluentsdelaGartempe 223000
Sioule 585201 321959
L?étudedelasurviesousgraviers,réaliséesurquatrefrayèresartificiellesdansl?Allierlorsdel?hiver
20092010par Logrami, met enévidenceungradient de survie décroissant de l?amont (72%à
Vabres,enamontdelaretenuedePoutès)versl?aval(40%auxGranges,enavaldeBrioude).Cette
étudeconfirmeégalementunesurviedesoeufsquiaugmenteavecl?oxygénation.
Enfin,leradiopistagede30saumonsparLogramien2009amontréqueleshabitatsdel?Alliern?ont
pastouslamêmevaleurpourlesadultesdurantlapériodeestivaledeleurmigrationversleszones
dereproduction:lamortalitéaétéde71%danslapartieentreVichyetleseuildelabanquede
France,de38,5%enremontantjusqu?àlaconfluencedel?Alagnonetde14%enamontdecette
confluence,dansl?Allieretdansl?Alagnon.
2.3.4 Phasedeviemarine
Lestauxdesurvieenmerdespopulationsdesaumonatlantiqueontétédivisésenmoyenned'un
facteurdeuxdansl'AtlantiqueNord,depuislesannées1980.Lescapturesmondialesdesaumons
sauvagesdansladernièredécenniesontàleurplusbasniveauhistorique(moinsde3000tonnes),à
lafoisàcausedelasurviemarinequirestefaibleetdufaitdesnombreusesréductionsd'effortsde
pêchedansleseauxinternationales(en1993et1994)ouconsentiesdepuis1998parbeaucoupde
pays.
Selon les modélisations effectuées par le groupede travail sur le saumonduCIEM, les stocks
d'EuropeduNord,prisglobalementetavantquelapêchenes'exerce,sontgénéralementeneffectif
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satisfaisant. Cependant,ladégradationdesconditionsdevieenmertendàrendreplusdélicatela
surviedessaumonsàlongséjourmarin.La populationdesaumonsdeLoireAllierestconstituée
majoritairementdesaumonsdedeuxettroishiversmarins.
Comptetenudesévolutionshydroclimatiquesrécentes(élévationprogressivedestempératuresde
surface)et dechangementsglobauxdumilieu marinpeumaîtrisables(répartitiondesstocksde
fourrage,modificationdescourantsmarins,élévationdestempératuresdesurface...),combinéesàla
pressiondepêchemaritimeaccessoiredansl'AtlantiqueNord,l'améliorationdesconditionsdevieen
merestincertaineets'accompagned'incertitudessurl'évolutiondel'airederépartitiondusaumon
atlantiquedansl'océanAtlantiquenord.
Danscecontexte,lesscientifiquesinsistentsurlebesoindefaciliterlaphasedeviecontinentaledu
saumon, considérant que les effets possibles des quelques actions sur la phase devie marine
concernentessentiellement,hormisl?améliorationdequalitéd?eauetdoncladiminutiondubouchon
vaseuxestuarien,unediminutiondescapturesparpêchedansleseauxcôtièresterritoriales.
Ilconvientainsidefacilitersansattendrelesconditionsdemigrationdessaumonseneaudoucevers
leurszonesdefrayèresetàladévalaison.Cetteprioritéestd'autantplusprégnantepourlesaumon
deLoireAllierquidoitparcourirplusieurscentainesdekilomètreseneaudouceavantderejoindre
seszonesdereproduction.
2.3.5 L'unicitégénétiquedelapopulationdesaumondeLoireAllier
LathèsedeC.PERRIER(Inra,2011)confirmel'originalitéécobiologiquedelapopulationdesaumons
deLoireAlliersurleplangénétique.Cestravauxontmisenévidencelatrèsfaiblemixitégénétique
de la populationdesaumonsdeLoireAllier avecd?autrespopulations desaumons, malgrédes
déversementsexogènes(souchesoriginairesduCanadaet d'Écosse), en faibleseffectifs, par le
passé.
2.3.6 ApprochedeseffectifsdelapopulationdesaumonsdeLoireAllier
Lessaumonsdeplusieurshiversmarins,quiconstituentlagrandemajoritédeseffectifssurlebassin
delaLoire,sontconsidérésparleCIEMencapacitéreproductiveréduiteenEuropedel?Ouest.Leur
survieàlongtermeestplusincertainequenel?estcelledescastillons.
Laréductiondeseffectifsàunecentaine desaumonsaudébut desannées1990aentraîné la
fermeturedelapêcheen1994etlerenforcementdesopérationsdesoutiend?effectifdébutéesdèsle
milieudesannées1970,maisquiétaientalorsd?unfaibleniveau.
Le constat reste aujourd'hui contrasté selon les cours d?eau, mais les éléments techniques et
scientifiquesdisponiblestendentàindiquerquelapopulationdesaumonssauvagesn'apasatteint
unniveaudeviabilitépérenne.Àtitreindicatif,ceniveaudeviabilitéaétéestiméà2000saumons
adultes,soit1700saumonsobservésàlastationdecontrôledeVichy,chaqueannéeparleCSP
danssonexpertisede1999.
Les conditions du milieu (obstacles aux migrations pénalisants, débits printaniers insuffisants
certaines années, état des biotopes à juvéniles?) sont parmi les causes les plus prégnantes
permettantd'expliquerlanonatteintedelaviabilitédelapopulationdesaumonssauvagesàcejour.
Sousbassindel'Allier
Lapopulationdesaumonssauvagesdanslesbassinsdel'AllieretdelaLoirebourguignonnereste
résiduelle et le modèle dedynamiquedepopulation établi par l'Inra (Prévost et Dauphin, 2012)
montrelapartsubstantielledessaumonsissusdesopérationsdesoutiend'effectifdanslapopulation
desaumonsobservésàVichycesquinzedernièresannées,del'ordrede50à80%del'effectif
globalsuivantlesannées.Aussilapopulationsauvageauraitellevraisemblablementeula capacité à
se maintenir sans soutien d'effectif, avec toutefois des effectifs moindres (estimation d?un effectif moyen
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annuel de 150 à 200 saumons à Vichy contre la moyenne observée de 574 saumons). Enfin, le modèle
précise par une projection à vingt ans sans soutien d?effectif, toutes autres conditions stables par ailleurs, que
la probabilité de maintien de la population sauvage ne serait pas nulle, bien que les effectifs seraient toutefois
moins importants (260 saumons en moyenne annuelle) et plus variables, mais que le risque d'extinction
(moins de 100 saumons de retour chaque année) ne pourrait pas être négligé (risque de l'ordre de 10 %).
Les comptages annuels réalisés à Vichy depuis 1997 (illustration 13) rendent compte d?une
populationmoyennesurl?AllierfranchissantlebarragedeVichyde574individus(écarttype:266),
avecuneaugmentationdanslapériode20022012(657saumons,écarttype:280)auregarddes
années19972001(390saumons,écarttype:88).
LacompositiondelapopulationdesaumonsdeLoireAlliersecaractériseparuneforteproportionde
saumonsdedeuxettroisansdemer.Danslebassindel'Allier,cesclassesd'âgereprésententplus
de90%del'effectifglobal,commelemontrelarépartitiondessaumonscomptésàVichyentre1997
et2011parclassesd'âgedansl'illustration14.
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Illustration13:Saumonscomptéssurl'Allierdepuis1986,Logrami.
(NB:LastationdecomptageàVichyàétémiseenserviceen1997;celledeLangeacen2004puisn'aplus
étéfonctionnelleentre2009et2012)
0
200
400
600
800
1000
1200
1400
1986 1990 1994 1998 2002 2006 2010
Vichy Langeac Poutès
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Le potentiel reproductif des saumons de trois hivers de mer serait environ deux fois et demie
supérieuraupotentielreproductifdessaumonsdedeuxhiversdemer.
SousbassindelaVienne,delaCreuseetdelaGartempe
Dans le bassin de la Gartempe, il n'est pas encore constaté la présence d'une population de
saumonssauvages.
LescomptagessontréalisésàChateauponsacdanslaGartempeenHauteViennedepuis2001,à
ChâtelleraultdanslaViennedepuis2004etàDescartesàl'entréedubassindelaCreuseetdela
Gartempedepuis2007.
LecompteuràrésistivitédelastationdecomptagedeChateauponsacaétéremplacéen2012par
uncompteurvidéoquiestfonctionneldepuislamigrationdemontaison2013.
Surlapériode20072012,oùlessaumonsontétécomptésàl'entréedesbassinsdel'Allier,dela
VienneetdelaCreuse,lecontingentdesaumonsremontantdanslesbassinsdelaVienneetdela
Creuseareprésentéde12à18%ducontingenttotaldesaumonsadultesremontantdanslebassin
delaLoire.
LescomptagesàChateauponsacfontétatauplusd'unedizainedesaumonsparan,endehorsde
l'année2004où57saumonsont étécomptés. LescomptagesàChâtellerault etDescartessont
fournisdansl'illustration15.
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Illustration14:Évolutiondelarépartitiondessaumonsatlantiquesparclassesd'âgeàlastation
decomptagedeVichy,19972011(Logrami)
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LefaibleeffectifdesaumonscomptésàChateauponsacparrapportàl'effectifcomptéàDescartes
peuts'expliquerenpartiepar:
? l'engagementd'unepartiedessaumonsdanslaCreuse;
? lesdifficultésdemigrationsdanslaGartempeaveclaprésencedenombreuxseuils(1seuiltous
lesdeuxkilomètres);
? lemanquedefiabilitéducompteuràrésistivitéjusqu'enfind'année2012.Lecompteurn'aeneffet
fonctionnéque27%dutempsen2009et12%dutempsen2010.Lamiseenplaced'unnouveau
dispositifdecomptageen2013devraitaméliorerlafiabilitéducomptage.
Larépartitionenclassesd'âgeestplusfavorableauxsaumonsd'unhiverdemerdanslesbassinsde
la Vienne, de la Creuseet de la Gartempe, avec entre10et 30 %ducontingent constituéde
saumonsd'unhiverdemer.
SousbassindelaLoirebourguignonneetdesesaffluents(Arroux)
L'engagementd'opérationsdesoutiend'effectifenjuvénilesdesaumonsdanslebassindel'Arroux
en1998aentraînédesremontéesdesaumonsadultesdanscebassin.Ellesrestenttoutefoisencore
limitées,avecauplusdixsaumonscomptésàlastationdecontrôledeGueugnondepuissamiseen
serviceen2006.
2.3.7 Étatsanitaire
L'Agencenationaledesécuritésanitairedel'alimentation,del'environnementetdutravail(Anses)a
menéuneétudeen2010cherchantunehypothèsesanitaireexpliquantl'augmentationdesmortalités
desaumonsenLoireAllier.
Lestravauxréalisésdanscecadren'ontpaspermisdemettreenévidencel'implicationformellede
microorganismesichtyopathogènesspécifiquesagissantseulsouensynergiedanslasurvenuedes
mortalitésdessaumonsenmigrationenLoireAllier.Ainsi,uneorigineinfectieuseaétéprobablement
misehorsdecausedanslaresponsabilitépremièredeslésionsobservées,maispourraittoutefois
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Illustration15:SaumonscomptésdanslaViennedepuis2004etdanslaCreusedepuis2007,
Logrami.
0
10
20
30
40
50
60
70
80
90
100
110
120
130
140
2004 2006 2008 2010 2012
Chatellerault Descartes
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agirensecondrôleaprèsl'apparitiond'unelésiondueàdesperturbationsenvironnementalesouà
desséquellesphysiologiquesconsécutivesàlaphasedevieenmer.
Ainsi lesdifficultésde franchissement desobstaclessont susceptiblesd'engendrer depremières
lésionsàmêmedefaciliteruneinfectionsecondairedessaumonsblessés.
2.3.8 Synthèsedesenjeuxpourlesaumon
ComptetenudesspécificitésécobiologiqueetgénétiquedelapopulationdesaumonsdeLoire
Allier,leprincipalenjeudesplansdegestion«saumon»successifsestqu'elleatteigneunniveau
deviabilitépérenne.Comptetenudel'étatdespressionssurlessousbassinsversantsetde la
présenceounond'unepopulationrésiduelledesaumonssauvages,ilconvient:
? enpriorité,deconserveretpréserverlapopulationdesaumonssauvagesdanslesbassinsde
l'AllieretdelaLoirebourguignonne.Auvudesdifficultésderéintroductiondesaumonatlantique
dans les rivières où il a préalablement disparu, il est essentiel d?empêcher la disparition du
saumon de LoireAllier, qui marquerait selon toute vraisemblance au vu des connaissances
techniquesactuelleslafindelaprésenced'unepopulationdesaumonssauvagesdanslebassin
delaLoire;
? de réintroduire des saumons dans d'autres bassins versants, notamment le bassin Vienne
Creuse,afinderestaurerdespopulations.
Enaccompagnement,unenjeud'améliorationdesconnaissancespersiste.Ilconcerneranotamment
desaffluents desdrains principauxdans les trois sousbassinsversantsde l'Allier, de la Loire
bourguignonneetdeVienneCreuse.
2.4 Lesaloses
Lesdeuxespècesd'aloses,lagrandealose(Alosaalosa)etl'alosefeinte(Alosafallax)fréquententle
bassindelaLoire,laSèvreniortaiseetlescôtiersvendéens.
2.4.1 Cyclebiologiquedesaloses
Lapériodedereproductiondesalosessesitueentremaietjuillet(avecunseuilthermiqued'uneeau
à18°Cquiagiraitcommeunstimulusdelareproduction),àl'issuedelapériodedemontaisondes
adultes,quialieuentremarsetjuin.Lapontealieudenuit,enpleineeau,lorsdephénomènes
appelésbulls.LesévolutionsdesconditionsthermiquesconstatéesenLoiredepuislesannées1980,
avec un réchauffement printanier des eaux plus rapides, sont susceptibles d'entraîner un
déclenchementplusprécocedelareproductiondesaloses, vraisemblablementsurdeszonesde
frayèressituéesplusenavalparrapportauxzonesdefrayèreshistoriques.
Lesjuvénilesrestentquelquesmoisenrivière(moinsde3mois?Lochet,2006)puisgagnentlamer
enété,ennepassantqu'untempstrèscourtenestuaire(quelquesjours).
C'est enmer(prèsdescôtes)qu'ilsvont effectuer leurcroissance, pendant3à7ansselon les
espècesetlesexe(maturationsexuellepluslonguechezlafemelle).Enparticulier,unepartiedes
alosess?éloigneraitduplateaucontinentalàl'âgede3ans.
Lamigrationdesgéniteurssedérouledelafindel'hiveràlafinduprintemps,suivantungradient
latitudinal(lespopulationslesplusausudsontlesplusprécoces).
Lapopulationdegrandesalosesdubassinaunedynamiqueparticulière. Lesuivi descaptures
réaliséesenLoiremoyenneentre1984et2011parunréseaudepêcheurséchantillonneursaufilet
barragea montré que les succès reproducteurs sont liés aux conditions d?hydraulicité durant la
reproductionetlacroissancedesjuvéniles.L?indiced?abondanceétabliàpartirdecettepêcheriemet
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enévidenceque l?importancedescohortesdépendfortementde l?hydraulicité printanièrede leur
annéedenaissance(AAIPPBLB,2011).Aussilavariabilitédesdébitsenpériodeprintannièreestelle
favorableauxmigrationsdesalosesetaufranchissementdesobstacleséquipésparcesespèces.
Ainsi,leretourd?adultesestgénéralementélevéunegénérationaprèsl'avènementd'unprintemps
exceptionnellement humide (1983), lorsque les hautes eaux réduisent l?impact des barrages et
facilitent l?accès aux frayèresproductives sur le coursamont des grands axes. En revanche, le
recrutementestfaibleencasd?hydraulicitédéfavorable(printempssecs1990à1993)mêmesiles
géniteurs étaient nombreuxà se présenter dans l'estuaire. Depuis l?amélioration de la continuité
écologique,notammentsurlaVienneavecl?effacementdubarragedeMaisonsRougesen1998,la
productivitédubassindelaLoireaétémultipliéepartroisparrapportàlapériode19801997.Le
recrutementdescohortesestdésormaisfortementliéàlavariabilitédesdébitslorsdesmigrations
desgéniteurs.
L'analyse de la composition des cohortes depuis 1983 met en évidence une augmentation
progressivedelapartdesfemellesdanslapopulation.Ilsembleraitégalementquelespopulations
d'alosesdubassindelaVienneetdesbassinsdelaLoirebourguignonneetdelaViennepuissent
êtredifférenciées.
2.4.2 Airederépartition
Lagrandealoseconstituelaplusgrandepartiedustockd'alosesetoccupel?airederépartitionlaplus
importante,quicorrespondauxgrandsaxesdemigrationdubassin(illustration16).L?alosefeintene
représenterait que1à5%despopulationsétudiées.Elleresteraitcantonnéeàlapartieavaldu
réseau,jusqu?enLoiremoyenne,surlecoursinférieurdesesaffluents(Mayenne,Sarthe,Vienne,
Cher),ainsiquedanslemaraispoitevin(Sèvreniortaise).
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BassinsdelaLoire,delaSèvreniortaiseetdescôtiersvendéens?19février2014 32/98
Illustration16:Airederépartitionpotentielledelagrandealosesurlebassindela
Loireetlescôtiersvendéens,Onema.
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2.4.3 Répartitiondeshabitatsfavorables
Leszoneshydrographiquesquidéveloppent lesplusgrandessurfacesd?habitats favorablesà la
reproductiondesalosessont lesportionsderivière importantesoù lapentenaturelle génèrede
nombreuseszonescourantessousformederadieràsubstratgrossier.
Ainsi, les secteurs les plus riches en frayères potentielles correspondent aux grands axes de
migrationenamontdeszonesàfaiblepente.Lesairesdereproductiondesalosesrecouvrenten
partiecelledusaumon,lorsquelesconditionsdelibrecirculationetd?accèsauxzonesamontsont
assurées.Moinsexigeantesencequiconcernelapenteetlagranularitédesfonds,lagrandealose
peutaussiexploiterdeszonescourantessituéessurlecoursmédiandesgrandsaxesetsurlapartie
bassedeleursprincipauxaffluents.
2.4.4 Estimationdelapopulationd'aloses
Leniveauhistoriqued'abondancedeseffectifsd'alosesn'estpasconnu.
Leréseaudestationdecomptages,progressivementmisenplacesurlebassindelaLoiredepuisla
findesannées1980,permetdedisposerd'élémentsfiablesdeconnaissancedeseffectifsd'aloses
remontantsurlessecteursdubassinsituésenamontdesstationsdecomptage.
Unepartiedeshabitatsfavorablesàlareproductiondesalosessetrouvantenavaldesstationsde
comptage, ces effectifs ne sauraient être interprétés comme étant des effectifs exhaustifs des
populationsdegéniteursd'alosesdubassindelaLoire.
Les données annuelles rassemblées dans l'illustration 17 permettent toutefois de disposer des
évolutions tendancielles sur la fréquentationpar lesgéniteursdessecteurssituésenamontdes
stationsdecomptage.
AprèsquatreannéesderetoursimportantssurlespartiesamontdubassindelaLoireetsurl'Allier,
neretraçantpasforcémentuneaugmentationdeseffectifsentrantsurlebassinmaissimplementune
remontéeplusimportanteversl'amontdubassin,leseffectifscomptésauxstationsdecontrôleont
décrudepuis2008.L'observationdecettetendanceestmoinsmarquéesurlebassindelaVienneet
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BassinsdelaLoire,delaSèvreniortaiseetdescôtiersvendéens?19février2014 33/98
Illustration17:Remontéesd'alosesdepuis1997surlebassindelaLoireauniveaudesstationsdecontrôle,Logrami.
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Vichy (Allier) Decize (Loire) Descartes (Creuse) Chatellerault (Vienne)
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delaCreuse.
Cettesituationdeseffectifsd'alosesestàrapprocherdesobservationsfaitessurlesautresbassins
versantsdelafaçadeatlantiquefrançaise,notammentenGaronneDordogne,oùundéclinrapide
deseffectifsaéténotédepuislemilieudesannées2000.
2.4.5 Synthèsedesenjeuxpourlesaloses
Lapopulationd?alosesrequiertlapoursuitedel?améliorationdelaconnaissancedesonmécanisme
derenouvellement,enparticulierdanslesbassinsversantsdelaLoiremoyenneetbourguignonne,
de l?Allier, du Cher, de la Maine et de la Sèvre niortaise. La connaissance du comportement
maritimedesalosesrelèvedecetenjeuetrejointl?intérêtdedévelopperunesynergieaveclePamm
dugolfedeGascogne.
Audelà decet enjeu deprioritaire, les constats actuels sur l?évolution des effectifs, qui seront
complétéspar lesnouvellesconnaissances, amènentàretenir ensecondeprioritéunenjeude
préservationdesespècesd?aloses,notammentlagrandealose,quisembleconstituerl?essentielde
lapopulationd?alosesdansleterritoireduCogepomi.Cetenjeuinviteàdévelopperlaconciliation
entre lesbesoinsécologiques desaloseset lesactivités socioéconomiquesexistantes(activité
halieutiqueprésentesurcesespèces,tourisme,loisirs).
2.5 Leslamproies
Lesdeuxespècesdelamproies,lalamproiemarineetlalamproiefluviatile,fréquententlebassinde
laLoire,laSèvreniortaiseetlescôtiersvendéens.Lalamproiemarineconstituel'essentieldustock
delamproiessurlebassindelaLoire,lalamproiefluviatilen'étantsignaléequ'occasionnellementau
niveaudesstationsdecontrôle.
2.5.1 Cyclebiologiquedeslamproies
Lareproductiondelalamproiemarinealieudefinavril àfinmai, àl?issuedelamontaisondes
adultesentreoctobreetmai.
Aprèslaponte,lesgéniteursmeurent.Lesammocètes(larves)mènentuneviesédentaire,enfouies
dans les sédiments des cours d?eau pendant 4 à 6 ans. A ce terme, elles subissent une
métamorphoselespréparantàladévalaisonverslamer,quiintervientaucoursdel'hiver.
Lacroissanceenzonecôtièredureenmoyenne2ans, et durant leurviemarine, les lamproies
adoptentunmodedevieparasitaire.Eneffet,lalamproieseventousesurunpoisson.Lesangetles
produitsdelacytolysedestissusformentlabasedelanourrituredelalamproiemarine.
2.5.2 Airederépartition
Commelesautresespècesquisereproduisent danslessectionsmédianeset amontdescours
d?eau, la lamproie marine a subi l?impact des différents épisodes d?aménagement de barrages.
Toutefois, elle conserve une aire de répartition relativement large à l?intérieur du bassin
(illustration18)etunfrontdemigrationquipeuts?étendretrèsenamontcertainesannées(observée
àLangeacsurleHautAllieren2003).
Elleestprésentesurl?ensembledesprincipauxaxesduréseaudemigrationetsurcertainsaxes
secondaires:Sèvreniortaise,AutiseetMignon,Loire,Mayenneaval,Sartheaval,Vienne,Creuse,
Gartempe,Cheraval,Allier,Sioule,Arroux,Aron,Anglin?
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2.5.3 Répartitiondeshabitatsfavorables
Lessecteursfavorablesàl?accueildefrayèresdelamproiessesituentdanslestronçonsdecours
d?eaulargesoù lafaiblepentegénèredenombreuseszonescourantessousformederadiersà
substratgrossier.
Unecartographiedeshabitatsfavorablesestprogressivementréaliséegrâceauxtravauxmenéspar
l'EPTBVienne,Logramietl'Onema,notammentdanslesbassinsversantsduCheretdelaVienne.
2.5.4 Estimationdelapopulationdelamproies
Leréseaudestationdecomptages,progressivementmisenplacesurlebassindelaLoiredepuisla
fin des années 1980, permet de disposer d'éléments fiables de connaissance des effectifs de
lamproiesremontantsurlessecteursdubassinsituésenamontdesstationsdecomptage.
Les donnéesannuelles rassembléesdans l'illustration 19permettent dedisposer des évolutions
tendanciellessurlafréquentationparlesgéniteursdessecteurssituésenamontdesstationsde
comptage.
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BassinsdelaLoire,delaSèvreniortaiseetdescôtiersvendéens?19février2014 35/98
Illustration18:AirederépartitionpotentielledelalamproiemarinesurlebassindelaLoire
etlescôtiersvendéens.
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LebassindelaVienneetdelaCreuseapparaîtcommelesousbassinversantprivilégiéàl'échelle
dubassindelaLoireparlapopulationdelamproies,lecontingentdelamproiesmigrantsurcessous
bassinsversantsenamontdesstationsdecontrôleayantvariéentre15000et95000individus
depuis2007etlamiseenserviceducomptageàDescartes.Lapopulationdelamproiesarecolonisé
cesousbassinversantaprèsl'effacementdubarragedeMaisonsRouges,quifermaitlebassindela
Viennejusqu'en1998.LapopulationdelamproiesmarinedesbassinsdelaVienneetdelaCreuse
estàcejourlaplusabondanteàl?échelleeuropéenne.
LesobservationsdelamproiessurlaLoirebourguignonneetl?Alliersontnettementplusfaibleset
s?élèventseulementàquelquesdizainesd?individusdepuis2009.
PourcequiestdubassindelaSèvreniortaise,l?étatdelapopulationdelamproiesyestpréoccupant,
notamment en raisonde la difficulté de franchissement de certains obstacles et des problèmes
d?assecrencontréschaqueannéesurdeszonesdefrayère.Quelquesindividusdelamproiemarine
et de lamproie fluviatile sont dénombréschaqueannéeauniveaude la stationdecomptagedu
MaraisPin,surlaSèvreniortaise,etdesfrayèressontrecenséessurl'AutiseetleMignon.
Les résultats des flux migratoires enregistrés au niveau des différentes stations de comptage
montrentdesfluctuationscycliquescorréléesàladuréeducyclebiologiqueainsiqu?unecolonisation
clairementorientéeversunaxeprivilégié(VienneCreuse).Cesdonnéesconfirment lefaitquela
population ligérienne semble suivre une relation stock?recrutement ainsi qu?une répartition
géographiqueorientée.
2.5.5 Synthèsedesenjeuxpourleslamproies
Leseffectifsdelamproiemarineconduisentàretenircommeenjeuessentielpourcetteespècesa
préservation, afin d?assurer sa viabilité et les activités halieutiques existantes sur l?espèce. Il
convientainsidemaintenirunevigilancedanslesuivideseffectifsafinderéagiravecdesmesures
degestionadaptéesencasdebesoin.Cetenjeusedéclineprioritairementdanslebassinversant
VienneCreuse,puisdanslesbassinsversantsdelaLoiremoyenneetbourguignonne,del?Allier,
duCher,delaMaineetdelaSèvreniortaise.
Comptetenudecetenjeu,lemaintiendel?encadrementdelapêchedanscertainsbassinsversants
sejustifie.
Pour ce qui est de la lamproie fluviatile, l?enjeu porte sur l?acquisition de connaissances et la
caractérisationdelaprésenced?unepopulationdanslebassindelaLoire.
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Illustration19:Remontéesdelamproiesmarinesdepuis1997surlebassindelaLoire,Logrami.
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2.6 Latruitedemer
2.6.1 Cyclebiologiquedelatruitedemer
Lareproductiondelatruitedemeralieudenovembreàdécembre.
Après laponte, lesgéniteursquittent rapidement leszonesdefrayèresetretournentenmer. Ils
pourronteffectuerplusieursreproductionsdurantleurvie.
Lesjuvénilesrestent de1à3ansenrivièrepuissubissent lasmoltification, métamorphoseleur
permettantdes'adapteraumilieumarin.
Letempspasséenmervarieselonlesindividus.Certainestruites(Finnock)nerestentque3moisen
meravantdereprendrelamigrationversleszonesdefrayères(eaudouce).D'autresrestentplus
longtemps(jusqu'à3ans).
2.6.2 Airederépartition
L?airederépartition(illustration20)restethéorique.Eneffet,lestrèsfaibleseffectifsdetruitesdemer
recensésauxstationsdecomptagedanslebassindelaLoirenepermettentpasdeprécisercette
airederépartition.
2.6.3 Estimationdelapopulationdetruitesdemer
LestockdetruitesdemeresttoujourstrèsmalconnusurlebassindelaLoireetlasimilitudedecette
espèceaveclesaumonatlantiquenefacilitepasl?acquisitiondedonnéesspécifiquespouraméliorer
laconnaissancedecettepopulation.
Celleciestprésentedanslebassin,maiscomptetenudesaplasticitébiologique,onnesaitpass?il
s?agit d?une population naturelle autonomegénétiquement et démographiquement, d?une fraction
migratrice d?une ou plusieurs populations de truites sédentaires ou d?introductions involontaires
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Illustration20:AirederépartitionpotentielledelatruitedemersurlebassindelaLoireet
lescôtiersvendéens.
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entretenuespardesalevinagesentruitesfario.
Entoutétatdecause,leseffectifsdetruitedemersontfaiblessurlebassindelaLoireetmême
anecdotiquesenamontdubecdeVienne.LenombredepassagesaudroitdesstationsdeVichysur
l?AllieretmêmedeChâtelleraultsurlaVienne,situéeplusprèsdel?estuaire,nedépassejamaisla
dizaine d?individus et est mêmenul certaines années. Sur la Loire bourguignonne, les effectifs
observésauniveaudeDecizenesontpasplusimportantsqu?àVichysurl?Allier.
2.6.4 Synthèsedesenjeuxpourlatruitedemer
Comptetenudelatrèsfaibleprésencedetruitedemerconstatéeauxstationsdecomptage,l?enjeu
prioritairepourcetteespèceestl?améliorationdesconnaissancesdesoncomportement.
2.7 Lefletcommunoufletd'Europe
2.7.1 Cyclebiologiquedufletcommun
Lefletcommun,adaptéàlaviebenthique,possèdeuncorpsaplatiasymétriqueetsesyeuxsontsur
leflancdroit(dextre).
C?est unmigrateuramphihalin thalassotoque (reproductioneneausaléepuis croissanceeneau
saumâtreoudouce)quivitessentiellementenestuairedanslesmaraislittorauxetestuariens.La
population se déplace vers l?amont en été, tandis qu?à l?approche de l?hiver, elle effectue le
mouvementinverse.
Lareproductionalieudejanvieràavril,enmer,surdesfondsmeublesàuneprofondeurd?environ
50m.
Aprèsuneviepélagiquedequelquessemaines,leslarvesserapprochentdelacôteensetenantà
uneprofondeurmoyennede10m.Lamétamorphoses?effectueàunetaillede1530mm,avantque
lesjeunesn?entrentdanslesestuaires,oùilseffectuentleurspremièresannéesdecroissance.Chez
lesjuvénilesdemoinsd?unan,lamoitiédesproiessontplanctoniques(copépodes,diatomées?),le
resteestconstituédelarves d?insectes. Par la suite, le flet commun se nourrit de la petite faune
benthique.
La taille maximale du flet commun est de 50 cm pour 1,5 kg.
2.7.2 - Aire de répartition
Lefletcommuncoloniseleseauxdoucesdesestuairesetdelapartieavaldesgrandsfleuvesetdes
fleuvescôtiers,voiredeleursaffluents(illustration21).
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Illustration 21: Aire de répartition du flet commun en France (Atlas des poissons d'eau douce)
2.7.3 - Estimation de la population de flets communs
Les données sur cette espèce sont encore rares et ne permettent pas de préciser plus largement son
abondance et sa répartition dans les bassins de la Loire, de la Sèvre niortaise et des côtiers
vendéens.
2.7.4 - Synthèse des enjeux pour le flet commun
Comptetenudesraresconnaissancesdisponibles,leprincipalenjeupourlefletcommunporte:
? enpremièrepriorité,surl'acquisitiondeconnaissances,enparticulierdanslesestuaires,enLoire
aval,danslaSèvreniortaiseetlescôtiersvendéens;
? ensecondepriorité,surlesuividel?activitédepêchequipourraits?exercersurcetteespèce.
2.8 Lemuletporc
2.8.1 Cyclebiologiquedumuletporc
Lemuletporcest uneespèceamphihaline thalassotoque,capabledemigrationssurdegrandes
distancesentreleseauxmarinesetdulçaquicolesàdesfinstrophiques,voiredematurationsexuelle.
Ilserencontredanslesfleuves,lesestuairesetleszonesintertidales,etauxstadeslesplusjeunes
dansleszoneshumideslittorales(maraisetlagunes).
Lesdéplacementsdesadultessont d?amplitudeetdeduréessupérieuresàceuxdesjeunes.La
migrationanadromes?effectueduprintempsaudébutdel?étéetlamigrationcatadromeenautomne.
Lapontesedérouleenmerdel?automneàl?hiver.Lerecrutementdesjuvénilesenzoneslittorales
s'étenddel'hiverauprintemps,àl'âgede3à4mois.
Lataillecourantedesadultesvarieentre30et50cmpourunpoidsentre2et4kg.
2.8.2 Airederépartition
LemuletporcestprésentenMéditerranée,enMerNoireetlelongdescôtesdel?Atlantiquedela
NorvègeauMaroc(illustration22).
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2.8.3 Estimationdelapopulationdemuletporc
Lesdonnéessurcetteespèce (illustration23)nepermettent qu'unepremièreapproximationdes
limitesdesonairederépartitiondanslesbassinsdelaLoire,delaSèvreniortaiseetdescôtiers
vendéens.
2.8.4 Synthèsedesenjeuxpourlemuletporc
Compte tenude la pêchecommerciale existant sur cetteespèceet desconnaissancesencore
parcellairesàsonsujet,leprincipalenjeupourlemuletporcporte:
? enpremièrepriorité,surl'acquisitiondeconnaissances,enparticulierdanslesestuairesetles
coursavaldesfleuves,enLoireaval,danslaSèvreniortaiseetlescôtiersvendéens;
? ensecondepriorité,surlesuividel'activitédepêchequis'exercesurcetteespèce.
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Illustration22:Airederépartitiondumuletporc,Atlasdespoissonsd'eaudouce.
Illustration23:RemontéesdemuletsporcsdanslebassindelaLoiredepuis1997,Logrami.
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Vichy (Allier) Decize (Loire) Descartes (Creuse) Chatellerault (Vienne)
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2.9 L'éperlan
2.9.1 Cyclebiologiquedel'éperlan
L'éperlanestuneespècepotamotoque.Ellepassel'essentieldesoncycledevieenestuaire,mais
estcapabledequelquesmigrationslittorales.Elleremonteenestuaire,voiredansleszonesavaldes
fleuves,poursereproduire.
L'éperlanadulteatteintunetailledel'ordrede15cm.
2.9.2 Airederépartitiondel'éperlan
L'éperlanestprésentdansl'estuairedelaLoire.
2.9.3 - Estimation de la population d'éperlan
Les données sur cette espèce sont encore rares et ne permettent pas de préciser plus largement son
abondance et sa répartition dans les bassins de la Loire, de la Sèvre niortaise et des côtiers
vendéens.
2.9.4 - Synthèse des enjeux pour l?éperlan
Comptetenudesraresconnaissancesdisponibles,leprincipalenjeupourl?éperlanporte:
? enpremièrepriorité,surl'acquisitiondeconnaissances,enparticulierdanslesestuaires,enLoire
aval,danslaSèvreniortaiseetlescôtiersvendéens;
? ensecondepriorité,surlesuividel'activitédepêchequipourraits'exercersurcetteespèce.
2.10 L'esturgeoneuropéen
2.10.1 Cyclebiologiquedel'esturgeoneuropéen
L'esturgeoneuropéenestuneespècepotamotoque,capabledevivreunequarantained'annéeset
d'effectuerplusieurscyclesbiologiques.
La reproduction intervient en eaudouce, à une profondeur d'environ 5 mdans des habitats de
graviersgrossiers.Lesjuvénilespassentl'essentieldeleurdéveloppementenestuaire,del'âgede
troisàseptans.Durantcettephasedevie,lesjuvénilesévoluentenestuaireeteffectuentquelques
migrationslittoralesavecdesretoursenestuaireessentiellementauprintemps.Aprèscettephasede
développementdeplusieursannées,l'esturgeoneuropéenpartenmigrationmaritimedanssonaire
derépartitionsurleplateaucontinental.C'estaucoursdecettephasequelesesturgeonseuropéens
acquièrentleurmaturitésexuelle,àl'âgede10à12anspourlesmâlesetde13à16anspourles
femelles.
Lesadultesreviennentenestuaireentrejanvieretoctobre,avecunepériodeprincipaleenavriletmai
en hautes eaux. La période de reproduction est observée un mois après leurs retours,
essentiellementfinmai,eneaudouce.
Au niveau morphologique, l'esturgeon européen atteint une taille adulte comprise entre 1,40 et
2,20m.
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2.10.2 Airederépartitiondel'esturgeoneuropéen
HistoriquementprésentdanslebassindelaLoirejusqu'auXIXesiècle,l'esturgeoneuropéenn'yest
plusrecenséactuellement.UnepopulationrésiduelleresteenplacedanslebassindelaGaronneet
faitl'objetd'unplannationald'actionssurlapériode20112015.
Enzonemaritime,l'esturgeoneuropéenfréquenteessentiellementleszoneslittoralesduGolfede
Gascogne,ainsiquelesmersd'Irlande,duNordetBaltique(illustration24).
2.10.3 Estimationdelapopulationd'esturgeoneuropéen
L'esturgeoneuropéenn'estplusprésentdanslebassindelaLoire.
2.10.4 Synthèsedesenjeuxpourl'esturgeoneuropéen
Comptetenudel'absencedepopulationd'esturgeoneuropéendanslebassindelaLoire,lesenjeux
surcetteespèceportentsur:
? lesuivirégulierdelamiseenoeuvreduplannationald'actionsdanslebassindelaGaronne,
etlemaintiend'unevigilancesurdesobservationséventuellesd'esturgeonsenestuaireou
enzonemaritimecôtièrebordantleterritoireduCogepomi;
? lerespectdesinterdictionsdepêcheetdevented'esturgeoneuropéen,notammentparles
pêcheriesmaritimesayantleursiègesocialimplantésurleterritoireduCogepomi.
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Illustration24:Airederépartitionfluvialeet
océaniquedel'esturgeoneuropéen,plan
nationald'actionsenfaveurdel'esturgeon
européen20112015.
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3 Contexteduterritoireethabitatsdesespèces
amphihalines
3.1 Leszonesdeviedespoissonsmigrateursamphihalinsdansle
bassin
3.1.1 Lesestuaires
Lesestuairesconstituentlazonenévralgiquedesmigrationspuisquecesontlespassagesobligésà
lamontaisonetàladévalaisondesdifférentesespèces.Leurqualitéphysicochimiquereflètel'état
généraldubassinversant;ellevarieselonlesfluctuationssaisonnièresdurégimefluvialcombinées
auxoscillationsdesmarées.Sil'estuairedelaLoireestleplusimportant,ceuxdescôtiersvendéens
ontunrôlenonnégligeablecarilsdonnentaccèsàdesréseauxdensesd'étiers,decanauxetde
fossésdanslesmaraislittoraux(maraisbretonetmaraispoitevinnotamment).
Lesestuaires,soumisaufrontdesalinitéetaumarnage,comprennentdeszoneshumidesétendues
de grand intérêt. Ces vasières abritent une macrofaune benthique en quantité importante.
Représentant dans l'estuaire de la Loire une surface de plus de 2000 ha, elles ont un rôle de
nourricerie pour plusieurs espèces de poissons : des poissons marins comme la sole ou le bar, mais
aussi amphihalins comme le flet.
Ladégradationetlaréductiondessurfacesdesvasièress'estaccéléréesousl'effetdesdifférents
aménagements(agricole,urbain,industrialoportuaire),sourcesdemodificationsmorphologiqueset
depollutions.
3.1.2 Leszoneshumidesetannexeshydrauliques
Les zones humides, les marais et les annexes hydrauliques apportent une continuité latérale
constitutive de la trame hydrographique, dite trame bleue. La fonctionnalité de ces continuités
latéralescontribueàlaqualitédesmilieuxaquatiques,enparticulierentermesd'habitatspourles
poissonsmigrateurs.
Zoneshumides
Unezonehumideestunterrainhabituellementinondéougorgéd'eaudouce,saléeousaumâtrede
façonpermanenteoutemporaire;lavégétation,quandelleexiste,yestdominéepardesplantes
hygrophilespendantaumoinsunepartiedel'année(Codedel'environnement,articleL.2111).
LesmisesenoeuvreduSdageLoireBretagne20102015etduplannationald'actionsenfaveurdes
zoneshumidesontconduitàlamiseenplaced'unepolitiqued'inventairedeszoneshumides.Dans
lesterritoires,lesSagesontchargés,quandilsexistent,delaréalisationdecesinventairesendeux
étapes:enveloppedeprobabilitédeprésencepuislocalisationprécise.Sicesderniersontvocationà
couvrirl'ensembleduterritoire,ilsnesontpardéfinitionpasexhaustifs.Lescommissionslocalesde
l'eau peuvent déléguer aux communes la réalisation de ces inventaires, notamment lors de
l'établissementoudelarévisiondesdocumentsdeplanificationdel'urbanisme.
Au niveau du bassin LoireBretagne, l'état des inventaires connus à la date d'approbation du
Plagepomifaitétatdel'enveloppedeforteprobabilitédeprésencedezoneshumidesetestcentralisé
dansleréseaupartenarialdesdonnéessurleszoneshumides.
Considérant la présence des espèces amphihalines sur le territoire, certaines zones humides
présentent un intérêt particulier pour la préservationdespoissonsmigrateursamphihalins, ence
qu'ellesconstituentd'importantssecteursd'habitats.Lesprincipaleszoneshumidesdubassindela
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Loire,connectéesauréseauhydrographique,sontidentifiéessurlacartesuivante.Ils'agitdansla
partieavaldubassindemaraislittoraux,territoiresgagnéssurlamerparendiguementssuccessifs.
Plusenamont,lamajoritédeszoneshumidesd?intérêtpourlesespècesamphihalinescorrespondent
auxzoneshumidesdesvalléesalluvialves.
Parailleurs,certainsplansd?eauconnectésauréseauhydrographique,etquineconstituentpasdes
zoneshumidesausensréglementaire,offrentdessurfacesd?habitatspotentielsintéressantesdans
leszonescentralesetamontdubassindelaLoire.
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Illustration25:LesgrandeszoneshumidesetmaraisdesbassinsdelaLoire,delaSèvre
niortaiseetdescôtiersvendéens,considéréescommed?importancemajeurepourla
biodiversitéparl?officenationaldeszoneshumidesen1994,plandegestiondel'anguille
voletLoire,2010.
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Maraislittorauxetestuariens
Ces zones humides constituent un élément paysager caractéristique du littoral atlantique. Ces
marais,naturelsouendigués,douxousaumâtres,représententdesmilieuxdiversdegranderichesse
écologique. Leur histoire et leursaménagements anthropiques témoignent d'uneexploitation par
l'homme,quidoitveilleràrestercompatibleavecleursfonctionnalitésécologiques.Cesdernières,
marquéesentreautresparlesconnexionsàl'océanouauxestuaires,jouentunrôleessentielpour
lespoissonsmigrateursamphihalins.
Silesmaraislittorauxetestuariensreprésententpourleslamproies,lesaloses,lesaumonetlatruite
demerplutôtunezonedetransit(dumoinsleschenauxprincipaux)versleszonesdereproduction
situées plus en amont, ils constituent pour les anguilles des zones de développement et de
croissance. Historiquement, la populationd'anguilles dans cesmarais était nombreuseavec une
majoritédemâles.
Annexeshydrauliques
La Loire dans sa partie fluvioestuarienne et sa partie aval est caractérisée par l'existence de
nombreusesannexeshydrauliques(boires,brasmorts,maraistemporaires).
Lessurfacesd'annexeshydrauliquessontmajoritairementconcentréesdanslebieffluvialdelaLoire
aval, entre Les PontsdeCéet Anetz. Des annexes hydrauliques existent aussi plus enamont,
notammentenLoiremoyenne.
Cesannexespeuventjouerlerôledezonesd'abripourlespoissonsmigrateursamphihalinsaucours
deleursmigrations.
3.1.3 Leréseauhydrographique
Leréseauhydrographiqueconcernépar l'applicationduplandegestiondespoissonsmigrateurs
(PLAGEPOMI)comprend:
? lescoursd'eauetgroupesdecoursd'eauinscritsdanslebassinhydrographiquedelaLoirequi
s'étendentsur102000km²;
? lescoursd'eaucôtiersvendéensetàlaSèvreniortaisequis?étendentsur15000km²;
? plus généralement, les plans d'eau et zones humides, reliés au réseau hydrographique, et
fréquentésparlespoissonsmigrateursamphihalins.
Les caractéristiques topographiques, géologiques et hydrologiques conduisent à distinguer deux
grandescomposanteshydrographiquesdanslebassindelaLoire,delaSèvreniortaiseetdescôtiers
vendéens.
Lemassifarmoricainetlestablessédimentairesdubassinparisien
Cesterrains représentent lesdeux tiers duréseauhydrographiquedubassin. Cevaste territoire
couvretoutelapartieavalduréseauetpluslargementl?ensembledelapartiecentreouestdubassin.
Cesecteur représentea priori lesplusgrandessurfacesd'habitats productifs pour les poissons
migrateursamphihalins,enraisondesasuperficieetdesonaccessibilitédepuislafaçadeatlantique.
Pourautant, lescontraintesphysiqueset lespressionsanthropiquesquis?exercentsur lescours
d?eaudumassifarmoricainoudestablessédimentairesdubassinparisienlimitentlaformationde
facièsproductifspourlesespècespotamotoques,enparticulieràcausedesfaiblesniveauxdepente
naturelle qui caractérisent les versants de ce secteur aval et des obstacles à l'écoulement qui
accentuentfortementcedéficitdepentenaturelle.
La nature dominante des fonds doit également être prise en compte dans la mesure où la
granulométrieconstitueunélémentdéterminantdelaqualitédeshabitatsutilisésparlesespèces
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potamotoques.Eneffetlesgéniteursontbesoindelitsdecaillouxetdegraviersgrossierspoury
déposer leurs oeufs et les pontes sont très sensibles au colmatage par les éléments fins. Les
caractéristiquesgranulométriquesdescoursd?eaudelapartiecentreouestdubassinsontégalement
limitantes à cet égard, sous l?effet des contraintes naturelles et des transformations
hydromorphologiquesquipèsentsurlescoursd?eau.
Enfin,malgrélaproximitédel?océan,lafaiblessedesreliefsetlecaractèreimperméabledesterrains
dumassif armoricain limitent aussi ledébit d?étiageetlesconditionshydrologiquesfavorablesau
maintiendesfacièsd?eaucourantependantlesphasesdecroissancejuvénile.
Lemassifcentral
Cesterrainscouvrentunesurfacepluslimitée(untiersdelasuperficietotaledubassin)maisleurs
caractéristiques topographiques, géologiques et hydrologiques sont plus favorables aux espèces
potamotoques. En effet, les éléments structurants de ce secteur hydrographique favorisent la
formationdezonesdefrayèresetd?habitatsproductifspourlesjuvéniles.
Ces cours d?eau bénéficient d?altitude, de gradient de pente et de conditions hydrologiques
(12à17l/s/km2enmoyenneannuelle), qui se traduisent par unedominante naturelle de faciès
courantsurdesfondsàgranulométriegrossière.
En outre, contrairement au profil d?équilibre des rivières armoricaines et sédimentaires, la
morphologiedescoursd?eaudumassifcentralestsoumiseàdenombreuxaccidentstopographiques
etaffleurementsrocheux.Cesconditionsaugmententlafréquenced?apparitiondesradiersetrapides
le long des parcours migratoires, y compris dans les parties aval descours d?eau, en zone de
piémont.
3.1.4 Unterritoireàfortpotentielpourlespoissonsmigrateursamphihalins
Laconfigurationhydrographiquedubassin(estuaires,zoneshumidesetcoursd'eau)estfavorableà
l'accueildespoissonsmigrateursamphihalinspar:
? lapositioncentraledubassinsurlafaçadeatlantique,particulièrementbiensituéeparrapportàla
distributionocéaniquedesfluxmigratoires,
? lasurfaceimportantedubassin,soitplusducinquièmeduterritoiredeFrancemétropolitaine,et
surlequelsontrecensés120000kmdecoursd'eauàdesaltitudesfavorablesàlacolonisation
parlesespècesmigratrices,
? lessurfacesimportantesdemaraisetdezoneshumides,
? lecontextehydroécologiquetrèsrichesuivantladiversitédureliefetlagéologie,
? laprésenced'habitatsàfortpotentielproductif,enparticulierpourlesaumonatlantiquesurles
terrainsanciensdumassifcentral.
Suivantleurgradientdepente,leszonesdesocledubassinamontrépondentbienauxconditions
morphodynamiques nécessaires à la reproduction des grands migrateurs (saumon, lamproies,
aloses).Parailleurs,l'intégritédecesmilieuxestrelativementbienconservéedanslespartiesamont
dubassin,souventpréservéesparunespaceruralàdominanteherbagèreouforestière.
3.2 Descriptiondesdifférentssousbassinsversantsduterritoiredu
Cogepomi
Dixsousbassinsversantsontétédéfiniscomptetenudeleurhomogénéité:
? l'Allier,
? laLoireamont,
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? laLoirebourguignonne,dubarragedeVillerestàlaconfluencedel'AllieraveclaLoire,
? laLoiremoyenne,delaconfluencedel'AllieraveclaLoireàlaconfluencedelaVienneavecla
Loire,
? leCher,
? laVienne,
? laMaine,
? laLoireaval,delaconfluencedelaVienneaveclaLoirejusqu'àl'océan,
? laSèvreniortaise,
? lescoursd'eaucôtiersvendéens,affluentsàl'océanentrelabaiedel'Aiguillonetl'estuairedela
Loire.
Lessurfacesd'habitatsfavorablesparespèceserontprécisées,quandellessontconnues,dansla
partie 2 du Plagepomi, dans les paragraphes relatifs à chacune des espèces. Seuls sont ici
mentionnésdesélémentsqualitatifspourchacundesneufsoussecteurs.
3.2.1 Bassinversantdel'Allier
Lebassindel'Allierconcentrel'essentieldeshabitatsfavorablesactuellementaccessiblespourle
saumonatlantique àl'échelledubassindelaLoire.C'estégalementleseulbassinoùsurvit une
populationrésiduelledesaumonssauvages1.
Despopulationsd'anguilles, de lamproiesetd'alosessont égalementprésentessur lebassinde
l'Allier.
Laconstructiondeseuilsetbarragesdestinésàlaproductiond?hydroélectricité,ausoutiend'étiage,
àl?écrêtementdescruesoulacréationderetenuesd?eaupourl?irrigation,aprogressivementrestreint
l'airederépartitiondespoissonsmigrateursamphihalinssurcebassin,notammentdusaumon,en
limitantl'accèsauxhabitatssituéssurlespartieamontdescoursd'eaudecebassinversant.
L'effacementdubarragedeSaintÉtienneduViganen1998etl'équipementdubarragedePoutèsen
dispositifsde franchissementà la montaisonen1986et à la dévalaisonen1998ont permisde
faciliterl'accèsdusaumonauxsecteursdereproductionsituéssurlehautAllieretsesaffluents.Le
projetderéaménagementdubarragedePoutès(abaissementduseuiletréductiondelalongueurde
laretenue,accompagnésd'équipementspourlamontaison(passeàpoissonsàbassinssuccessifsà
macrorugositésdefond)etladévalaison(glissièrededévalaisonetgrillesantiintrusionauniveaude
la prise d'eau) et de clapets amovibles pour des débits de crueen position centrale du nouvel
ouvrage)permettradefaciliterlaconnexiondeshabitatsproductifsduHautAllier etderétablir le
transportsédimentaire.Toutefoisdesdifficultésmigratoirespersistentparailleurssur l'Allier etse
manifestentparl'accumulationderetardsdanslesmigrations.Cesdifficultéssemblentplusfortement
marquéesàladévalaison.
Contrairementauxautressousbassinsversants(Cher,Vienne,Maine,Sèvreniortaise)etbienque
lesconditionsdemigrationsrestentàaméliorer parendroit, leshabitatsfavorablesauxpoissons
migrateursamphihalinsdubassindel'Allierontpuresterplusaccessiblesqu'ailleurs.
3.2.2 BassinversantdelaLoireamont
Ce territoireconcerne la Loire, depuis sa source jusqu'aubarragedeVillerest. Actuellement, ce
territoire n'est pas accessible aux poissons migrateurs amphihalins, compte tenu du caractère
infranchissabledubarragedeVillerest.
1 Estconsidérécommeunsaumonsauvageunsaumonnédanslarivièredeparentsnéseuxmêmesdanslarivière,
d?aprèsladéfinitionduCIEM(WGNAS)en1997.
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Historiquement,cebassinaccueillaitdespopulationsdepoissonsmigrateursamphihalins.
3.2.3 BassinversantdelaLoirebourguignonne
CebassinversantestconstituéparlaLoire,dupieddubarragedeVillerestjusqu'aubecd'Allier.De
l'amontversl'aval,troisaffluentsprincipauxconfluentaveclaLoiredanscesecteurgéographique:
l'Arroux,laBesbreetl'Aron.
Historiquementlesaumonatlantique,lagrandealose,lalamproiemarineetl'anguilleétaientprésents
danscescoursd'eau.
La réduction des habitats de reproduction ou de grossissement est essentiellement due sur ce
territoire,notammentsurlesaffluentsdelaLoire,auxobstaclesquiontprogressivemententravéla
librecirculationpiscicoleetauxactivitésd'extractiondegranulatsquiontengendrédesdéséquilibres
sédimentairesprovoquantl'altérationd'unepartiedeshabitatsfavorables.
Al'heureactuelle,lesaumon,lalamproiemarineetlagrandealosesontrencontrésdanslaLoireet
dans les parties aval des affluents précédemment cités. Depuis l'aménagement de nouveaux
dispositifsdefranchissementaubarragedenavigationdeRoanneen2012,lespoissonsmigrateurs
amphihalins sont enmesurede remonter la Loire jusqu'aubarragedeVillerest. L'anguille est le
poissonamphihalinquiprésentelapluslargerépartitiongéographiquedanscesousbassinversant.
3.2.4 BassinversantdelaLoiremoyenne
Dubecd'AllieraubecdeVienne,laLoirereçoitdeuxaffluentsprincipaux:leCheretl'Indre.Lesous
bassinversantduCherfaitl'objetduparagraphe3.2.5.
La Loire moyenne constitue un secteur de passage pour l'ensemble des espèces migratrices
amphihalines. L'effacement du seuil mobile de Blois en 2005 dans le cadre du plan Loire et
l'équipementdesseuilsdesquatrecentralesnucléairesdeBellevillesurLoire,DampierreenBurly,
SaintLaurentNouanetAvoineontrétablitlatransparencemigratoire.
Deshabitatsfavorablesàlareproductiondesalosessontrecenséssurlapartieamontdecesecteur,
làoùlaLoiredélimitelesdépartementsduCheretdelaNièvre.
L'Indreestmarquéeparunnombreimportantd'obstaclestransversauxquiexpliquelaréductiondela
présencedespoissonsamphihalinssurcecoursd'eau.Seulel'anguilleyresteaujourd'huiprésente
demanièrenonanecdotique.
3.2.5 BassinversantduCher
Le bassin versant du Cher était historiquement peuplé d'anguilles, d'aloses, de lamproies, de
saumonset de truitesdemer. Il constitueaujourd'hui undesquatrebassinsprioritairespour la
restaurationdespopulationsd'anguillesdansleSdage20102015,etprésenteégalementunintérêt
pourd'autrespopulations,notammentd'alosesetdelamproies.
L'anthropisation de son cours, avec les aménagements pour la navigation en aval de
SaintAignansurCher (Cher dit «canalisé»), la créationdeseuils pour l'exploitation de la force
motricedel'eauetlesextractionsdegranulats,notammententreMontluçonetVierzon,ainsiqu'à
ChâtressurCher, ont engendré une altération de la continuité écologique et de la morphologie
pouvantexpliquerlarégressiondespopulationsdepoissonsmigrateursamphihalinsdansleCher.
L'abaissementdespartiesmobilesdesbarragesàaiguilleduChercanaliséenpériodeactivede
migration printanière va dans le sens d'une facilitation des migrations des poissons migrateurs
amphihalins.
Suiteàcespremièresévolutions,deslamproiesetdesalosessontobservéesdansleCherjusqu?à
unecinquantainedekilomètresenamontdeVierzon.Desmuletssontégalementprésentssurle
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Cher,notammentenavaldel?ouvragedeSavonnières,etdesobservationssporadiquesdetruitesde
mersontsignalées.L'anguillerestelepoissonmigrateuramphihalinlepluslargementrépartisurle
bassinduCheractuellement,avecuneprésencedanslesrivièresCher,Yèvre,Sauldre,etFouzon.
LeCherenamontdubarrageduPrat, infranchissable, est inaccessibleauxpoissonsmigrateurs
amphihalins.
3.2.6 BassinversantdelaVienne
Lebassinde la Vienneétait historiquementpeuplépar l'anguille, lesaloses, les lamproieset le
saumonatlantique.
Leterritoireestmarquéparuneagricultureextensivedepolycultureélevagesurl'ensembledestêtes
debassinversantetrassembledeszonesdegrandesculturesdanslesplainesdel'aval.
Auniveauhydraulique,l'édificationprogressived'ouvragestransversauxaconduitàuneraréfaction
desespècesdepoissonsamphihalines,quirecolonisentlebassindepuisl'effacementduseuilde
MaisonsRougesen1998à l'exutoiredu bassin de la Vienne. Si la densitédes ouvrages reste
importantesurlaVienne,laCreuseetlaGartempe,lesopérationssuccessivesd'aménagementen
faveur du rétablissement de la continuité écologiqueont permis, notamment sur la Vienne, une
progressiondufrontdecolonisationparlespoissonsamphihalinssurunedistancede120kmdepuis
15ans.Lesouvragesdescomplexesdel'IsleJourdain,surlaVienne,etd'Éguzon,surlaCreuse,
constituentactuellementdesverrousinfranchissables.
LebassindelaVienneestégalementmarquéparlaprésencedeplusieursmilliersdeplansd'eau,
susceptiblesd'impacterlesrégimeshydrologiqueetthermiquedescoursd'eauauxquelsilspeuvent
êtreconnectésoudanslesbassinsversantsdesquelsilsinterceptentlesécoulementsgravitaires.
Actuellement,lebassindelaVienneaccueillelapopulationdelamproiesmarineslaplusnombreuse
à l'échelle européenne et la population d'aloses la plus nombreuse dubassin de la Loire. Des
anguillessontégalementprésentesdanscebassin,l'undesquatredubassinLoireBretagneétant
identifié commebassin prioritaire pour la restauration de la population d'anguilles par le Sdage
20102015.
La Gartempea fait l?objet depuis les années1980d?un programmede restauration dusaumon
atlantique.Actuellement,dessaumonsfréquententlecoursavaldelaVienne,delaCreuseetdela
Gartempe.Aucuneopérationdesoutiend?effectifn?étantmenéedanslaVienneetdanslaCreuse,
cesobservationstémoignentdel?existenced?unerecolonisationnaturelledecesousbassinversant.
Toutefois, les données biologiques disponibles ne permettent pas d'attester l'existence d'une
populationsauvageautonomedesaumonsdanscebassin.
3.2.7 BassinversantdelaMaine
LebassindelaMaineaccueillaithistoriquementdespopulationsd'anguilles,d'aloses,delamproieset
de truites de mer. Ce bassin versant est aujourd'hui un des quatre bassins prioritaires pour la
restaurationdespopulationsd'anguillesdansleSdage20102015,etprésenteégalementunintérêt
marquépourlespopulationsd'alosesetdelamproies.
Lararéfactiondelaprésencedesmigrateursamphihalinsdanscebassinversantpeutprovenird'un
effetcumulédedifférentsfacteursayantengendréunealtérationdeshabitatsetdelamorphologie
descoursd'eau.
Ladensitédesouvragesestimportantesurlesprincipauxcoursd'eaudecebassinversant.Des
opérationsdegestionengagéescesdernièresannéessur laMayenneont permisderéduire les
difficultésdemigrationsurcecoursd'eau,notammentdesanguillesàladévalaison.Parailleurs,le
cloisonnementdesmilieuxestrenforcéparunedensitéimportantedeplansd'eaudanscebassin,qui
interceptent une partie des écoulements naturels. Un autre enjeu sur ce territoire porte sur la
conciliation des prélèvements pouvant être marqués, notamment en période d'étiage, avec les
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besoinsminimauxpourconserverlesfonctionnalitésdesmilieuxaquatiques.
3.2.8 BassinversantdelaLoireaval
DubecdeVienneàsonestuaire,laLoirepassedesondernierbieffluvialàsasectionmaritime.
Lechenalconstitueessentiellementunezonedetransitpourlespoissonsmigrateursquil?empruntent
lorsde leurmigrationdemontaisonet dedévalaison. Ilsdoivent doncs?adapterauxparamètres
environnementauxtrèsvariablesdel?estuaire(salinité,oxygènedissous,turbidité...).
Ce secteur est marqué par la présence de nombreuses annexes hydrauliques et des marais
estuariensdontlesfonctionnalitésetl'intérêtécologiquesontmajeursnotammentpourl'anguille.La
configurationactuelle desmarais remonteessentiellement aux travauxd'assèchement intervenus
entreleXVIIe et XIXe siècle, suite à de premiers aménagements dès le XIIe siècle.
LesmaraisNordLoireetSudLoireenavaldeNantes
LesmaraisestuariensdelaLoires?étendentsurunesuperficiede10130ha.Ilssontconstituésd?un
réseauhiérarchisédecanaux, douves et rigolesqui représentent un linéairecumulédeplusde
1700km,réguléparplusde250ouvrageshydrauliques.
Ceszonesdemaraisrassemblentégalementdessecteursd'habitatstemporairesintéressantspour
certainesautresespècesamphihalines(anguille,flet,mulet)oumarines(plie,sole,gobie,bar).La
présenced'espècesmarinesdanscesmaraisrenforcent d'autant plus l'intérêt d'unecoordination
entrelePlagepomi,leSdageetlePammdelasousrégionmarineduGolfedeGascogne.
Les aménagements portuaires, les modifications du lit des cours d?eau et la multiplication des
ouvrageshydrauliquesont bouleversé lescaractéristiqueshydrauliqueset le fonctionnementdes
marais,particulièrementdansl'estuairedelaLoire.
LesannexeshydrauliquesdelaLoireentreNantesetMontsoreau
Les annexes hydrauliques de la Loire (plus de 120 entre Nantes et Montsoreau) sont des
dépendances du fleuve qui ont un rôle temporaire visàvis des écoulements superficiels. Leur
agencement,généralementparallèleaufleuve,estdûàlatopographieparticulièreduremplissage
sédimentaire,lesabordsdulitmineur?lebourreletderiveplusélevésquelespiedsdecoteaux
s?opposantbiensouventàlafusiondirectedeseaux.
Ellesneparticipentauxécoulementsqu?audelàd?unecertainehauteurd?eauenfonctiondel?altitude
relativedeleur(s)connexion(s)aufleuve.Troistypesd?annexessontidentifiés:
? Lesbrassecondairessontconnectésenamontetenavalaubrasprincipaldontilssontséparés
pardesîlesstabiliséesetvégétalisées.Al?étiage,ilsprésententdevastesplagesdesablealors
qu?enpériodesdehauteseaux, ils peuvent devenir brasprincipaux. Nombred?entreeuxsont
barréspardesdiguesoudeschevrettesenenrochementsrenvoyant,endeçàd?uncertaindébit,
leseauxdanslesbrasnavigables.Lesbrassecondairesremplissentunefonctiond?écoulement
descrues,variablesselonleurniveaud?ensablementetdeconnexion(fonctionplusfaiblepourles
brasfermés).Leursfonctionsbiologiquesnesontpasnégligeablespourautant:sitesd?accueil
pourledéveloppementdesalevinsàlasortiedesbrasmorts,productivitéprimairesupérieureau
chenalprincipalet installationd?invertébrés(trichoptèresHydropsychidae, mollusquesdugenre
Unio?)grâceauralentissementducourant,reproductionenfonctiondesvariationshydrologiques
d?espècesrhéophiles (chevaine, ombre, barbeau, vandoise) et limnophiles(gardons, rotengle),
refugeencasdepollutionsaccidentelles.
? Les bras morts (ou boires) sont des dépressions de la plaine alluviale, anciens bras
abandonnés.Ellessontcaractériséesparunevégétationpermanenteetuneconnexionunique,le
plussouventàl?aval.Quandleurfondestperméable(sable,gravier),leniveaudel?eauysuitcelui
delanappealluvialeparcapillarité;parcontrequandellessontétanches,ellesseremplissentdes
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eauxderuissellementdescoteauxoudesaffluents,oupardébordementdirect.Lesbrasmorts
jouentunrôle importantauniveaudela reproductiondespoissonsphytophiles(inféodésà la
végétationherbacée)commelacarpe,lerotengleetlebrochet.Ellesreprésententégalementdes
zonesd'habitatsetdegrossissementpourl'anguilleadulte.
? Lesbassesvalléesd?affluentssontdeszonesinondables,submergéesparleseauxdel?affluent
oulorsdurefoulementdeseauxdelaLoire.Lebourreletderivecontraintl?affluentàemprunter
uneouplusieursboiresavantdesejeterdanslefleuve.Danslamajoritédescas,desvannages
placésàleurdébouchédanslavalléeymaintiennentuncertainniveaud?eaupendantl?étiage.
Elles constituent entre autres fonctions, en complémentarité avec les bras morts et les bras
secondaires, des zones de frayères productives, en particulier pour le brochet, grâce à la
couverturevégétale
L?aménagement du fleuve pour la navigation (obturation des bras secondaires par des digues,
resserrementdubrasnavigableentredesépis)etlesextractionsdesabledansle lit mineuront
provoquél?incisionduthalwegdenavigationdanslessablesdulit,induisantl?affaissementdeslignes
d?eaudefaiblesdébitset,demanièreconcomitante,l?assèchementestivaldesannexes.L?ensemble
du fonctionnement écologique de la vallée, en termes d?échanges de matière, d?énergie et de
population,enaétéaffecté.
Or,lesdépendancesetsolidaritéslatéralessontvitalespourdenombreusesespèces,notammentde
poissons,dontlebrochetetl?anguille.
DesPontsdeCéàNantes,lacartographiedes81annexeshydrauliquesréaliséeparleGIPLoire
Estuaire en2006constitue un inventaire exhaustif de cesmilieux répartis commesuit: 36bras
secondaires, 35 bras morts, 6 annexes artificielles et 4 marais mouillés. Lasuperficie totale est
d?environ2600hectares.
Deuxtypesdebiefssontdifférenciésenfonctiondesconditionshydrauliques: les35kmdubief
fluviomaritime,dontlalimiteamontsesitueàAnetzetles45kmdubieffluvial,d?AnetzauxPontsde
Cé.Lenombredebrasmortsetdebrassecondairesserépartitéquitablementdansles2biefs,mais
paslasuperficie,quirestelargementsupérieuredanslebieffluvial.
3.2.9 BassinversantdelaSèvreniortaise
LebassinversantdelaSèvreniortaiseétaithistoriquementpeupléd'anguilles,d'aloses,delamproies
etdetruitesdemer.Ilaccueilleégalementdespopulationsdefletcommunetreprésenteunintérêt
aujourd'huiimportantpourtouteslespopulationsdepoissonsamphihalins.Enparticulier,c'est,avec
lescôtiersvendéens,l'undesquatrebassinsversantsprioritairespourlarestaurationdespopulations
d'anguillesd'aprèsleSdage20102015.
Cebassinversantsedistingueparlafortedensitédesonréseauhydrographique,répartientredes
fleuvesetrivièresalimentantlemaraispoitevin,etunréseaudecanauxdanslemarais.
Lagestiondesniveauxd'eaudanslemaraisaconduità l'édificationdesnombreuxouvragesde
régulation depuis le Xe siècle. Cesystèmehydrauliquecomplexe se traduit par une succession
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d'ouvragesàfranchirpourlespoissonsmigrateursamphihalins.Unpremierenjeudanscebassin
versantportesurlarestaurationdelacontinuitéécologique.
La gestion quantitative représente l'enjeu majeur de ce territoire. En effet, les assèchements
successifsdezonesdemaraisparlepassé,etlesassecstemporairespouvantsurvenirenpériode
estivale, notamment dans certains cours d'eau, ont conduit à une forte réduction des surfaces
d'habitatsproductifspourlespoissonsmigrateursamphihalins.Aussi,lesopérationsdecuragedes
coursd'eauayantpuêtremenéesontengendréundéséquilibresédimentairequiaconduit àde
nouvellespertesd'habitatsessentielspourlesespècesamphihalines.Lagestiondesniveauxd'eau
revêt un intérêt biologique majeur, afin de restaurer des habitats productifs et de préserver la
submersiondezones demarais favorables à la reproduction et audéveloppement de certaines
espècesamphihalines.
3.2.10 Bassinsversantsdescôtiersvendéens
Lesbassinsversantsdescôtiersvendéenssontnotammentfréquentésparl'anguille,maispeuvent
aussi accueillir de petites populations d'aloses, de lamproies et de truite de mer. Ces bassins
versants restent des bassins favorables à l'accueil, notamment, des populations d'anguilles et
constituent,aveclaSèvreniortaise,undesquatrebassinsversantsprioritairespourlarestauration
despopulationsd'anguilled'aprèsleSdage20102015.
Laprésenced'ouvrageslimitelescapacitésdeprogressiondesespècesamphihalinesversleszones
amont desbassinsversants, tandis quedessurfacesd'habitats productifspeuvent êtreperdues
temporairementpardesépisodesd'assecsenpériodeestivaleessentiellement.
Les enjeuxprincipaux dans ces bassins versants portent, d'unepart, sur la gestion quantitative
équilibréedelaressourceeneau,afindemaintenirunehydrologiequipermettelemaintiend'habitats
productifs,etd'autrepart,surlarestaurationdelacontinuitéécologique,notammentamontaval.
3.3 Dispositifsd'évitementetderéductiondesimpactssurleshabitats
Plusieursdispositifs,denatureréglementaireoucontractuelle,permettentaujourd?huidemettreen
placedesmesuresdeprotectionetdegestiondeshabitatsenvuedesauvegarderlesespèceset
notammentlespoissonsmigrateurs.Cesdispositifsdeprotection,contraignantsouvolontaires,sont
considéréscommedesdispositifsvisantàpréveniretéviterlesimpactssurleshabitatsfavorables
auxpoissonsmigrateursamphihalins.
Enaccompagnementdecesmesuresdeprotectionetdegestion,ladémarchedesgestionnairesde
milieuxaquatiquesdéveloppedesapprochesderéductiondesimpactsdeaménagementssurles
fonctionnalitésdesmilieuxaquatiques.Cesmesuresderéductiond'impactdécoulentessentiellement
del'applicationdesdocumentsdeplanificationdansledomainedel'eau:leSdageetlesSage.
3.3.1 Lesprotectionscontraignantes
Laloiacréédesdispositifsdeprotectiondelabiodiversitépouvantprofiterauxhabitatsdespoissons
migrateursamphihalins.Cesdispositifscontraignants,prévusparlaréglementation,sontautonomes
oudécoulentdustatutdecertainscoursd'eaudansleSdageLoireBretagne20102015.
Laprotectiondesfrayères
Enapplicationdel'articleL.4323duCodedel'environnement,lesfrayèresdesaumonatlantique,de
lamproiemarine,delamproiefluviatile,degrandealoseetd'alosefeinteontétéinventoriéesdans
chaquedépartement.Ladestructiondefrayèressurlessecteursdélimitésestpassiblede20000¤
d'amende.Cedispositifapporteunpremierniveaudeprotectiondeshabitatsdereproductionetde
développementdesjuvénilesdesespècesamphihalinespotamotoques.
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L'inventairedes frayèresétablit enapplicationde l'article R.43211duCodede l'environnement
repose:
? pourlesaumonatlantique,lalamproiefluviatileetlalamproiemarine,surl'identificationdezones
defrayèresàpartird'unegranulométriecaractéristique(galetsdediamètre20à150mmpourle
saumonatlantique;graviersetpetitsgaletsdediamètre2à60mmpourlalamproiefluviatile;
graviersetgaletsdediamètre5à200mmpourlalamproiemarine);
? pourlagrandealoseetl'alosefeinte,surl'observationd'unedéposed'oeufsoudelaprésence
d'alevins.
Lesréservesnaturelles
Crééespardécretetplacéessousl?autoritédupréfet,lesréservesnaturellesnationalesconcernent
despartiesdeterritoiresdanslesquelleslafaune,laflore,lesol,leseaux,lesgisementsdeminéraux
oudefossilesoulemilieunaturelprésententuneimportanceparticulière.
Lesobjectifssontnotamment:
? lapréservationd?espècesanimalesouvégétalesetd?habitatsenvoiededisparitionsurtoutou
partieduterritoirenational;
? lareconstitutiondespopulationsanimalesouvégétalesoudeleurshabitats;
? lapréservationdebiotopesetdeformationsgéologiquesouspéléologiquesremarquables;
? lapréservationoulaconstitutiond?étapessurlesgrandesvoiesdemigrationdelafaunesauvage.
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Leclassement d'un territoireen réserve naturelle protège le milieude toutedestruction et toute
modificationanthropique.Chaquesitenaturelétantunique, l'ampleurdelaréglementationetdes
interdictionssur leterritoired'uneréserveest déterminéeaucasparcasetdécritedans l'arrêté
préfectoralquiinstituelacréationdelaréserve.
SurleterritoireduCogepomi,desréservesnaturellesnationalesontétéinstituéesdansplusieurs
territoires.OnpeutnotammentciterlesréservestellesqueleLacdeGrandlieu,levaldeLoireen
Bourgogneet le val d'Allier en Auvergnequi visent explicitement la protection des eaux et des
poissons et qui par leurs étendues de marais ou d'annexes fluviales représentent des habitats
diversifiéspermettantl'accueildecertainspoissonsmigrateursamphihalins,notammentl'anguille.
Lesarrêtésdeprotectiondebiotope
Instituéepararrêtépréfectoral, laprotectiondebiotopeviseàprévenir ladisparitiondesespèces
protégées(espècesanimalesnondomestiquesouvégétalesnoncultivées)parlafixationdemesures
deconservationdesbiotopes(entenduausensécologiqued?habitat)nécessairesàleuralimentation,
àleurreproduction,àleurreposouàleursurvie,cesbiotopespouvantêtreconstituéspardesmares,
desmarécages,desmarais,deshaies,desbosquets,deslandes,desdunes,despelousesoupar
toutesautresformationsnaturellespeuexploitéesparl'homme.
Unarrêté de protection debiotopepeut également avoir pour objet l'interdictionde touteaction
portant atteinte de manière indirecte à l'équilibre biologiquedes milieux telle que l'écobuage, le
brûlage, le broyagedes végétaux, la destructiondes taluset deshaies, l'épandagedeproduits
antiparasitaires.
Sur le territoireduCOGEPOMI, laGartempedans leLimousinest protégéesur40km.L?arrêté
prescritcertainesrestrictionsdesactivitéshumainesenvuedeprévenirladisparitiondufonddes
rivièresetpréserverainsileshabitatsnécessairesausaumon.LaLoireenBourgogneaégalement
faitl?objetd?unarrêtéenvuedeprotégerlesfrayèresd?alose.
Lagestionfoncièredeszoneshumides
LesloisGrenelleimposentl?acquisitionàl?échellenationalede20000hadezoneshumides d'ici
2015.LesAgencesdel?eauontpourobjectifd?acquérir13000hadezoneshumides(dont2600ha
enLoireBretagne),les7000harestantétantàacquérirparleConservatoirenationaldulittoralet
desrivageslacustres.
LeCodedel?urbanismeprévoitparsonarticleL.1421qu?àdesfinsdepréservationdelaqualitédes
sites, des paysages, des milieux naturels, des champs naturels d'expansion des crues et de
sauvegardedeshabitatsnaturels,lesConseilsgénérauxsontcompétentspourélaboreretmettreen
oeuvreunepolitiquedeprotection,degestionetd'ouvertureaupublicdesespacesnaturelssensibles
(ENS), boisés ou non. Cette politique des Conseils généraux doit être compatible avec les
dispositionsdesschémasdecohérenceterritoriale,euxmêmecompatiblesavecleSdage.Ainsi,les
ConseilsgénérauxpeuventêtreamenésàdélimiterdesENSàdesfinsdepréservationdeszones
humides,etcontribueràl'acquisitionfoncièredecesespaces.
LesConservatoiresd'espacesnaturelsontégalementuneprérogatived'acquisitionfoncièrepourla
préservationdelabiodiversité,cequileurpermetd'agirégalementenfaveurdelaprotectionfoncière
deszoneshumides.
Enfin,toutesleszoneshumidesinventoriéesdanslebassindelaLoiredoiventfairel'objetd'une
protectionsuffisantepar leur intégrationdanslesplans locauxd'urbanisme(PLU),établispar les
communes,tellequeleprévoitladisposition8A1duSdage.
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Leszoneshumidesd'intérêtenvironnementalparticulieretleszoneshumidesstratégiquespourla
gestiondel'eau
LeCodedel?environnementpermet(articleL.2113)àl?autoritéadministrativededélimiterdeszones
humides d'intérêt environnemental particulier (ZHIEP), qui doivent alors faire l?objet d?un plan
d?actions. LesZHIEPpeuvent êtreproposéespar les Commissions locales de l'eau (CLE). Ces
dernièrespeuventalors,àl?intérieurdecellescidélimiterdeszoneshumidesstratégiquespourla
gestiondel'eau(ZSGE).SeulelaCLEestcompétentepourproposerunclassementenZSGE.
CeclassementenZHIEPetZSGEretentitsurl?élaborationdesschémasrégionauxdecohérence
écologique(SRCE).Eneffet,leurtramebleuedoitintégrerlesZHIEPetZSGE(articleL.3711du
Codedel?environnement).
Toutefois,cedispositif n'a jusqu'àprésentpasétéutilisédanslebassindelaLoire,delaSèvre
niortaiseetdescôtiersvendéens.
Lescoursd'eaunécessitant uneprotectioncomplètedespoissonsmigrateursamphihalinset les
réservoirsbiologiques
LeSdageLoireBretagne20102015adéfinilescoursd'eaudanslesquelsuneprotectioncomplète
des poissons migrateurs amphihalins doit être assurée. Les cours d'eau correspondant sont
cartographiésdansl'illustration28.
Enparallèle,leSdage20102015aégalementdélimitédesréservoirsbiologiques(illustration29).
Cesdernierscorrespondentàdeszonesàfortediversitébiologique,depuislesquelsledéplacement
desespècesest susceptiblede restaurer l'écosystèmedesmassesd'eauattenanteset ainsi de
contribueràl'atteintedubonétatdecellesci.
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Illustration28:Coursd'eaunécessitantlaprotectioncomplètedespoissonsmigrateursamphihalins
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Lescoursd'eau,partiesdecoursd'eauoucanauxclassésautitredel'articleL.21417duCodede
l'environnement
Noncontraignantseneuxmême,lescoursd'eauprotégésparl'undesdeuxdispositifsprécédents
ont,defaitetcommepourlescoursd'eauentrèsbonétat,étéintégrésauclassementenliste1au
titredel'articleL.21417duCodedel'environnement(illustration30).
Ce classement dispose qu'aucune autorisation ou concession ne peut être accordée pour la
construction de nouveaux ouvrages s'ils constituent un obstacle à la continuité écologique. Le
classementenliste1autitredel'articleL.21417duCodedel'environnementesteffectifdepuisla
publicationdel'arrêtédupréfetcoordonnateurdebassinLoireBretagnele22juillet2012.
Leclassementenliste1prévoitégalementquesurlescoursd'eau,partiesdecoursd'eauoucanaux
classés, le renouvellement de la concession ou de l'autorisation des ouvrages existants,
régulièrementinstallés,estsubordonnéàdesprescriptionspermettantdemaintenirletrèsbonétat
écologiquedeseaux,demainteniroud'atteindrelebonétatécologiquedescoursd'eaud'unbassin
versantoud'assurerlaprotectiondespoissonsmigrateursvivantalternativementeneaudouceeten
eausalée.
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Illustration29:Coursd'eaujouantlerôlederéservoirbiologique
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L'articleL.21417duCodedel'environnement,alinéaI2°,préciseaussiquel'autoritéadministrative
établit,pourchaquebassinuneliste(diteliste2)decoursd'eau,partiesdecoursd'eauoucanaux
danslesquelsil estnécessaired'assurerletransportsuffisantdessédimentsetlacirculationdes
poissonsmigrateurs.Toutouvragedoityêtregéré,entretenuetéquipéselondesrèglesdéfiniespar
l'autoritéadministrative,enconcertationaveclepropriétaireou,àdéfaut,l'exploitant.
L'articlepoursuitenprécisantquecesobligationss'appliquent,àl'issued'undélaidecinqansaprès
lapublicationdeslistes,auxouvragesexistantsrégulièrementinstallés.
Leclassementenliste2autitredel'articleL.21417duCodedel'environnement(illustration31)est
effectif depuis la publication de l'arrêté du préfet coordonnateur de bassin LoireBretagne le
22juillet2012.
Lerétablissementdelacontinuitéécologiqueaudroit desouvragessituésdansdescoursd'eau
classésenliste2requiertquesoientprisesencomptelesespècesamphihalinesetholobiotiquesqui
ontjustifiéleclassementenliste2.
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Illustration30:Coursd'eauclassésenliste1autitredel'articleL.21417duCodedel'environnementdansle
bassindelaLoire
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Lamiseenconformitédesouvragesvisàvisdesobligationsderésultat relativesà lacontinuité
écologique fait l'objet de contrôles ciblés prévus dans les plans de contrôle des missions
interservicesdel?eauetdelanature(MISEN)parlacirculairedu12novembre2010.
3.3.2 Lesprotectionsvolontaires
LeszonesspécialesdeconservationduréseauNatura2000
Les zones spéciales de conservation (ZSC) désignent des aires d'habitats d'espèces d'intérêt
communautaire,listésenannexe2deladirective«HabitatsFauneFlore»(DHFF).DanslesZSCse
mettentenplace,autraversdudocumentcontractuelqueconstitueledocumentd'objectifdusite
(DOCOB), des mesures destinées à éviter la détérioration des habitats et des mesures de
conservationrépondantauxexigencesécologiquesdeshabitatsnaturels.
Lesplansd'actionspourlapréservationetlagestiondeszoneshumides
LeSdage20102015prévoitquelesSagemettentenplacedesplansd'actionspermettantd'assurer
la gestion et l'entretien des zones humides sur leur territoire. Ce dispositif peut éventuellement
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Illustration31:Coursd'eauclassésenliste2autitredel'articleL.21417duCodedel'environnementdansle
bassindelaLoire
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s'appuyer sur des contractualisations agroenvironnementales afin de favoriser un mode
d'exploitationagricolequipérenniselescaractéristiquesdezonehumidedesterrainsexploités.La
miseenoeuvredecesplansconcourtàlapréservationdeszoneshumides.
Lesschémasrégionauxdecohérenceécologique(SRCE)
LesSRCE,coélaborésparl'ÉtatetlesRégions,définissentlestramesvertesetbleues,constituées
decoeursdebiodiversitéreliésentreeuxpardescorridors.
L'articleL.3711duCodedel'environnementdisposequelatramebleuedesSRCEcontiennea
minimalescoursd'eau,partiesdecoursd'eauoucanauxclassésenliste1etliste2autitrede
l'articleL.21417duCodedel'environnement,ainsiquetoutoupartiedeszoneshumidesdontla
préservationoularemiseenétatcontribueauxobjectifsdebonétatdeseaux.
Lesdocumentsdeplanificationet lesprojetsde l'État, descollectivitésoudeleursgroupements
prennent en compte les SRCE et précisent les mesures permettant d'éviter, réduire, et le cas
échéant,compenserlesatteintesauxcontinuitésécologiques.
3.3.3 Réductiondesimpactssurlesmilieuxaquatiquesetleshabitats
Laréductiondesimpactspeut portersur leshabitatsdereproductionoudegrossissementmais
égalementsurlessecteursdemigrations.
Réductiondesimpactssurleshabitats
Leszoneshumidessontlesprincipauxhabitats,pourlesquelsdesmesuresderéductiond'impact
sontprévuesoupossiblesdanslesdocumentsdeplanificationdansledomainedel'eau.
LeSdageLoireBretagne20102015disposequelorsqu'unprojetimpacteunezonehumide,àdéfaut
detouteautrealternativeavérée,unecompensationdoitêtreprévuedanslemêmebassinversantet
àfonctionnalitéséquivalentes(dupointdevuedel'hydrologieetdelabiodiversité,disposition8B2
duSdageLoireBretagne20102015).Sanslaréuniondecestroisexigences,lacompensationdoit
portersuraumoins200%delasurfacedezonehumidedétruiteparleprojet.
LesSagepeuventdansleurrèglement(articleR.21247duCodedel'environnement)définirtoute
règlenécessaireaumaintienetàlarestaurationdesZHIEPetdesZSGE.
Pourassurerlarestaurationetlapréservationdelaqualitédel'eauetdesmilieuxaquatiques,les
Sagepeuvent égalementdéfinir des règlesparticulières d'utilisation de la ressourceeneauaux
opérationsentraînantdesimpactscumuléssignificatifsentermesdeprélèvementsouderejetsdans
lebassinversantouauxexploitationsagricolesprocédantàdesépandagesd'effluentsliquidesou
solides.
Réductiondesimpactssurlesmigrations
LeSdageLoireBretagne20102015prévoitquetouteopérationderestauration,modificationoude
créationd?ouvragetransversaldanslelitmineurdescoursd?eaufassel?objetd?unexamenportant
surl?opportunitédumaintienoudelacréationdel?ouvrage.Sicetexamenconclutàlapossibilitéde
créationd'unnouvelouvragetransversalenlitmineur,desmesurescompensatoiresdoiventalors
êtremisesenoeuvre. Cesmesurescompensatoires, présentéespar lemaîtred?ouvrage,doivent
prévoir,danslemêmebassinversant,desactionsd?effacementoud?arasementpartieloutouteautre
solution permettant de retrouver des conditions équivalentes de transport des sédiments, de
diversification des habitats, de vitesse de transfert des eaux (retardant la production de
phytoplancton)etdecirculationpiscicole.Adéfautdelaréuniondecesexigences,lacompensation
portesuruneréductioncumuléedechutesartificiellesd?aumoins200%,encherchantunecontinuité
linéairelaplusimportantepossible,surlemêmebassinversantouendernierrecourssurunautre
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BassinsdelaLoire,delaSèvreniortaiseetdescôtiersvendéens?19février2014 59/98
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immédiatementvoisin(disposition1B2duSdageLoireBretagne20102015).
L'exigencedecompensationnes?appliquepasauxouvragesexistants,légalementautorisésetdont
l?usageaétésuspendupourdesraisonsdesécuritépublique.
Parallèlement et afin d'améliorer le transport naturel des sédiments et d'assurer la continuité
écologique,lesSagepeuvent,dansleurrèglement(articleR.21247duCodedel'environnement),
définir touterèglefixant desobligationsd'ouverturepériodiquedecertainsouvrageshydrauliques
fonctionnantaufildel'eau.
3.4 Caractérisationdespressionsaltérantlesmilieuxaquatiquesetles
habitatsfavorablesauxpoissonsmigrateursamphihalins.
Lesmilieuxaquatiquescontinentauxoùviventlespoissonsmigrateursamphihalinssontexposésà
troisgrandescatégoriesdepressionsquesontl'altérationde:
? l'hydromorphologieavecnotammentlacontinuitéécologiqueetlaqualitédesetdeshabitats;
? l'hydrologieetlerégimethermique;
? laqualitédeseaux.
Lesréseauxdecontrôleetdesurveillancesuivisdepuis2007enapplicationdeladirectivecadresur
l'eaupermettentdedisposerd'unecaractérisationdel'étatécologiquedesdifférentesmassesd'eau
dubassinLoireBretagne,traduisantl'impactdecespressionssurlesmilieux.L'étatécologiquede
l'année2010afaitl'objetd'unevalidationparleComitédebassinenoctobre2012etestprésentéci
dessousdansl'illustration32.30,5%descoursd'eaudubassinLoireBretagnesontenbonoutrès
bonétatécologique.
Illustration32:Étatécologique2010descoursd'eau(Source:AELB,rapportàlaCommissionplanification,2012)
Le compartiment estuarien, qui constitue un espace essentiel dans l'adaptation des poissons
migrateursamphihalinsdumilieudulçaquicoleaumilieumarinetviceversa,estaffectéparlestrois
typesdepressionscitéscidessus.Leureffetseretrouvecumulédanslephénomènedubouchon
vaseuxestuarien,quiferal'objetd'undétailspécifique.
Enfin,lespressionss'exerçantsurlespoissonsmigrateursamphihalinsdanslemilieumarinseront
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BassinsdelaLoire,delaSèvreniortaiseetdescôtiersvendéens?19février2014 60/98
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égalementdétaillées.
Cetétatdeslieuxnepoursuitpasunobjectifdeprécisionexhaustif,maischercheplusàs'appuyer
surl'étatdeslieuxproduitdanslecadredelaDCEetàmettreenavantlespressionsmajeures
affectantlespopulationsdepoissonsmigrateursamphihalins.
3.4.1 Continuitéécologiqueetaccessibilitéauxhabitatsdereproductionetde
grossissement
Uneappréciationdelacontinuitéécologiqueàl?échelledubassindelaLoirepeutêtrefourniepar
l?indicateurdutauxd?étagement,développéedanslecadredelamiseenoeuvredeladirectivecadre
surl'eau.Letauxd'étagementestcalculéensommantleshauteursdeschutesartificiellesducours
d?eau, puisenlesdivisant par ledénivelénaturel du linéairederivièreconsidéré. Cet indicateur
intègre:
? lapertededissipationd?énergielelongducoursd?eau;
? laperted?habitatsetdediversité,parennoiementdeszoneslotiques,uniformisation,blocages
sédimentairesetcolmatage;
? ladifficultédefranchissementpourtouteslesespèces;
? l?altération de la qualité de l'eau, due au temps de séjour augmenté dans la retenue :
échauffement,évaporationetaggravationdel'eutrophisation.
Letauxd?étagementestuneapprochesynthétiqueduniveaud?altérationdel'hydromorphologied'un
coursd'eauetenparticulierdelapentenaturelleducoursd?eau,laquelleestlefacteurstructurant
l?orientation et la continuité de l?écoulement (eau et sédiments), la dynamique fluviale, la
diversificationetlaqualitédeshabitats,etlarépartitiondesespècesaquatiques.Letauxd'étagement
en2009desdrainsprincipauxdubassindelaLoireestdisponibledansl?illustration33.
Lefractionnementdesmilieuxaquatiquesparlacréationd'ouvragestransversauxestundesfacteurs
explicatifsdeladégradationdel'étatdeseaux.Engénéral,plusletauxd?étagementestélevé,moins
l'Indice«poissonsrivière»(IPR),indicateurde laqualitédespeuplementspiscicoles,estbon,et
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BassinsdelaLoire,delaSèvreniortaiseetdescôtiersvendéens?19février2014 61/98
Illustration33:Tauxd'étagementdesprincipauxcoursd'eaudubassindelaLoireen
amontdubecdeVienne(Onema,2009)
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donc plus les peuplements de poissons sont dégradés (illustration34) : le bon état de ces
peuplements(enbleu)seréduitàmesurequeletauxd?étagementaugmente;inversementlerisque
denonatteintedubonétat(rose)augmenteavecletauxd?étagement.
Letauxd'étagementdémontreunesituationinégaleàl'échelledubassindelaLoire.SilaLoireet
l'Alliersontcaractérisésparunfaibleétagement,duàunfaiblenombred'obstaclesàl'écoulement,
d'autressousbassinsversantsprésententunétagementimportant(laVienneparexemple).Letaux
d'étagementprésenteégalementcertaineslimites:
? enzonedereliefimportant(bassinsversantsduMassifcentral,telquelebassinversantdela
Sioule),letauxd'étagementestartificiellementfaibledufaitdel'importantdénivelénaturel;
? enzonedemaraisetdeplaine,oùledénivelénaturelesttrèsfaible,unfaiblenombred'ouvrages
conduitàunétagementtrèsimportant.
Cetindicateurfaittoutdemêmeressortirlarelativepréservationdel'axeLoireAllier,quiconstitueun
hydrosystèmecontinudeprèsde1000kmavecunefaibledensitéd'ouvrages(unouvragetousles
vingt kilomètres dans l'Allier). Ce cas de figure est quasiment unique à l'échelle de la façade
atlantiqueeuropéenne.
Si les risques de mortalité au franchissement des ouvrages sont susceptibles d?augmenter en
fonction du nombre des ouvrages sur un cours d?eau, ils dépendent en premier lieu de la
configuration de ceuxci, liée à leur usage. Entre autres, les ouvrages à usage hydroélectrique
représentent une risque particulier de mortalité, compte tenu des risques d?entraînement des
poissonsdanslesturbines.
Lapolitiquenationalederestaurationdelacontinuitéécologique(traduiteparlepland'actionspourla
restaurationdelacontinuitéécologique),pilierdelapolitiquedereconquêtedubonétatdesmilieux
aquatiques,s'esttraduitepardesavancéesimportantesdepuislafind'année2009.Danslecadrede
la traduction des objectifs des lois Grenelle dans le IXème programme de l'Agence de l'eau
LoireBretagne,405ouvragesencoursd'eauontfait l'objetd'uneinterventionà lafinde l'année
2012.
Leseffortsdoiventnéanmoinssepoursuivrepourlerétablissementdelacontinuitéécologiquedans
les deux sens de migration, notamment à la dévalaison, et dans le respect des obligations et
échéances réglementaires. Aussi et bien que certains ouvrages aient déjà pu faire l'objet
d'aménagements pour la circulation piscicole, l'obligation de résultats impose une efficacité
permanenteetrequiertunentretienadéquat:
? certains ouvrages équipés sont sources de retard, soit par des difficultés d'attrait vers les
dispositifsdefranchissement,soitparunmanqued'entretiensetraduisantparuneobstructionde
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BassinsdelaLoire,delaSèvreniortaiseetdescôtiersvendéens?19février2014 62/98
Illustration34:Relationentreletauxd'étagementetl'état
despeuplementspiscicolesdubassindelaLoire(Source:
Onema,2010)
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cesmêmesdispositifs;
? certains ouvrages disposent d'équipements insuffisants pour être conformes au nouveau
classementdescoursd'eauenliste2autitredel'articleL.21417duCodedel'environnement
(obligationderétablirlacirculationpiscicoled'espècescibles,amphihalinesetholobiotiques,etla
circulationdessédiments).
Ces efforts doivent permettre aux espèces amphihalines de reconquérir les milieux jusqu?aux
ouvragesactuellement infranchissables,ditsverrous,etnonclassésenliste2autitredel'article
L.21417duCodedel'environnement.Sontconsidéréscommeverrous:
? lebarrageduPratsurleCher;
? lebarragedeLaRocheBâtl'AiguesurlaCreuse;
? lebarragedeVillerestsurlaLoire;
? lebarragedeSaintFraimbaultsurlaMayenne;
? lebarragedeChardessurlaVienne;
? lebarragedeQueuillesurlaSioule.
3.4.2 Hydrologieetrégimethermique
L'hydrologie est un facteur de contrôle important des migrations des poissons migrateurs
amphihalins.Eneffet,ledébitdescoursd?eauconditionnelestauxdesurviesàtouslesstadesdu
cycle biologique des poissons migrateurs amphihalins, dans tous les secteurs du bassin. En
particulier,lesdéficitshydrologiquesretentissentnégativementsurlesphasesdemigration,etlesflux
demontaisonetdedévalaisondesespècesamphihalinesdanslebassindelaLoire.
Lesfaiblesdébitsretardentl'engagementdesgéniteursenestuaire,amplifientl?effetdesobstacleset
augmentent les risquesdemortalité (échauffement plus rapide descoursd'eau). Demême, les
déficitshydrologiquessontsusceptiblesderetarderladévalaisondesespèces,pardiminutiondela
vitesseducourant(ilsselaissentengrandepartieporterparleflux),augmentationdelaprobabilité
de transit par les turbines des centrales hydroélectriques (plutôt que par les déversoirs ou
évacuateurs),etaugmentationdutempsd'attentedanslesretenuesdeseuilsetbarrages.
DanslecasdubassindelaLoire,l?incidencedel?hydrologieestd?autantplusfortequelescircuitsde
migrationsont plus longs. Il enrésultedes impactscumulatifsexacerbés, notamment encasde
sécheresseprintanière.
Outrecesévolutionsnaturelles,lamodificationdel'hydrologiepeutprovenirdesprélèvements,des
évolutionsdel'hydrographieparl'existencedeplansd'eau,oudelagestiondesétiagesetdescrues.
Lescruesjouentunrôleessentielpourlebonétatécologiquedescoursd'eau,notammentlespetites
cruesmorphogènesqui sont susceptibles demodifier le lit des coursd'eau, d'entretenir ainsi la
fonctionnalité des habitats, et de faciliter les mouvements migratoires, enparticulier en agissant
commeunstimulusdeladévalaison.
Lapressionexercéeparlesprélèvementssemanifestepardespompagesdanslescoursd'eaupour
divers usages (AEP, irrigation, abreuvement notamment) ou par des dérivations d'une certaine
quantité du débit sur un linéaire spécifique, par exemple pour l'alimentation d'une usine
hydroélectrique.
La gestionéquilibrée de la ressourceeneau fait l'objet duchapitre 7duSdageLoireBretagne
20102015.
Les plans d'eaumodifient également l'hydrographie naturelle du bassin versant. Afin de réduire
l'impact des plans d'eau sur les fonctionnalités écologiques des bassins versants, le Sdage
LoireBretagneencadre la créationet la régularisationdesplansd'eau(orientation1CduSdage
LoireBretagne20102015).Enparticulier,lacréationdenouveauxplansd'eaun'estplusautorisée
danslesbassinsversantscontributeursdesréservoirsbiologiquesouencasdedensitéimportante
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de plans d'eau. Aussi, les plans d'eau autorisés depuis 2010 doivent être isolés du réseau
hydrographiqueparuncanal dedérivationavecunprélèvementdustrict volumenécessaireaux
usagesassociésaupland'eauouêtrealimentésparruissellement.
Toutouvragerégulièrementautoriséquiengendreunobstacleàl'écoulementouladérivationd'une
partiedudébitducoursd'eau(alimentationd'unpland'eau,brasusinier...)faitl'objetd'unedécision
administrative.Enparticulier,cettedécisiondéfinitledébitréservédevantêtrelaissédanslecours
d'eaunaturel.Cedébitréservédoitpermettrede maintenirentouttemps,danslecoursd?eauun
débitminimalgarantissantenpermanencelavie,lacirculationetlareproductiondesespècesvivant
dansleseauxaumomentdel?installationdel?ouvrage.Cedébit estdit débit minimalbiologique
(DMB).Apartirde2014,ledébitréservénepeutpas,saufcasparticuliers,êtreinférieuraudixième
dumoduleducoursd'eauaudroitdel'ouvrage.
Aussi, le développement des différents usages, en particulier l'alimentation en eau potable, le
fonctionnementdescentralesnucléairesetl'agriculture,aconduitsurl'AllieretlaLoireàmettreen
placeunesystèmedesoutiendesdébitsenpérioded'étiage.Ilintroduittoutefoisuneartificialisation
significative du régimehydrologique, que le cadre défini pour encadrer son fonctionnement tend
cependantàlimiter.
Danslecontexteduchangementclimatique,lesévolutionsdurégimehydrologiquedanslebassinde
laLoire tendraient vers uneoccurrenceplus fréquented'étiagesplus marquéset plus longs. La
gestiondespoissonsmigrateursamphihalinsdevrasefairedanscesperspectives.
3.4.3 Qualitédeseaux
L'altérationdelaqualitédel'eauetdesmilieuxaquatiquespeutavoirpourorigine:
? lesmacropolluantsd'origineorganique,dontlapollutionparlesnutriments;
? lesmicropolluants.
Cespolluantssontsusceptiblesd'avoir uneffetdirectsur lespoissonsmigrateursamphihalinsen
perturbantleurmétabolismeetleurcomportementouuneffetindirectendégradantlaqualitédeleurs
habitats vitaux. Cela peut être le cas des apports en nutriments, à l'origine de phénomènes
d'eutrophisationpouvantaltérer l'oxygénationdumilieu, etainsi lasurviedespoissonsmigrateurs
amphihalinsdanscertainshabitatssurunepartiedel'année.
Cependant,àtitreindicatif,enLoireaval, lesconcentrationsmaximalesennitratesàlastationde
mesuredeSainteLucesurLoirenedépassentguère25mg/l,avecunesaisonnalitémarquée:les
plus fortesconcentrationsétant observéesenhiver. Entre1984et 2010,aucunetendancenese
dégage pour les teneurs en nitrates à la station de SainteLucesurLoire. Pour ce qui est du
phosphore,lasaisonnalitéestmoinsmarquéeetilestplutôtobservéeunecroissancedelateneuren
phosphore avec l'augmentation du taux de matières en suspension (MES), le phosphore étant
majoritairementadsorbésurlesMES.
Ainsi,lamiseenoeuvredesdirectiveseauxrésiduairesurbainesetnitratescontribuedepuis1991à
réduirelapollutionparlesmacropolluantsd'originesdomestique,industrielleetagricole:
? ladirectiveeauxrésiduairesurbainesaconduitàclasserl'ensembledubassindelaLoireetdes
côtiersvendéensenzonesensibleàl'azoteetauphosphoreavecdeuxéchéancespourlamise
enconformitédesstationsdetraitementdeseauxuséesdesagglomérationsdeplusde10000
équivalentshabitants,en2013et2017.Cettedirectiveconsisteàmettreenplacepourtoutesles
agglomérationsd'assainissementunsystèmedetraitementdeseauxuséesadapté,c'estàdire
respectantlesobjectifsdequalitédeseauxréceptricesafindenepascompromettrelesusages
quiysontassociés.
? ladirectivenitrateschercheàréduirelapollutiondescoursd'eauparlesnitratesd'origineagricole
etàcontenir lephénomèned'eutrophisationdescoursd'eauetdeseauxcôtières.Samiseen
oeuvresetraduitparladélimitationdezonesvulnérables(illustration35)surlesquellessontmisen
oeuvredesplansd'actionsquadriennauxvisantàfaireévoluerlespratiquesagricolesversune
réductiondesapportsennutrimentsetuneréductiondestransfertsverslescoursd'eau.Elleest
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accompagnée aussi d'incitations à modifier les pratiques agricoles: mesures
agroenvironnementalesenfaveurd'uneréductiondesintrantsetdel'agriculturebiologique,aides
pourlasécurisationdel'utilisationdespesticides,laplantationdehaies,l'implantationdezones
tamponsépuratoires...
Ceseffortsconcourentàréduireprogressivementlestauxdenitratesdansleseauxsuperficielleset
participent ainsi à uneaméliorationdubilanenoxygènedescoursd'eau, élément favorable aux
poissonsmigrateursamphihalins.Localement,desaltérationsdubilanenoxygènepeuventencore
êtrerencontréesappelantàmaintenirlesefforts.
La DCEconfirme les objectifs de cesdirectives sectorielles, dont la mise enoeuvre contribueà
l'atteintedubonétatdesmassesd'eau.Elleexigeparailleursdesrésultatsenmatièrederéduction
desrejetsdesubstancesdangereuses.Surcepoint,despolluantsd'origineindustrielle(commeles
polychlorobiphénylesPCB et les hydrocarbures aromatiques polycycliquesHAP) sont également
retrouvésdanslesmilieuxaquatiquesdanslebassindelaLoire,essentiellementdanslessédiments.
Lapollutiondessolsetdessédimentsaconduitàl'interdictiondel'usagedesPCBen1987.Compte
tenudespropriétéslipophilesdesPCB,lesespècespiscicolesvivantaucontactdessédimentssont
exposées à un risque d'accumulation accru de PCBdans leur tissus adipeux. C'est le cas des
anguillesnotamment.LeurcontaminationparlesPCBlorsdeleurgrossissementeneaudouceapour
conséquence une réduction des capacités reproductives des anguilles argentées. Afin de mieux
connaîtrel?étenduedelacontaminationdescoursd?eauparlesPCB,unplaninterministérield?actions
aétélancéentre2008et2012.Ceplans?articulaitautourdesixaxes:
? intensifierlaréductiondesrejetsdePCB;
? améliorerlesconnaissancesscientifiquessurledevenirdesPCBdanslesmilieuxaquatiqueset
gérercettepollution;
? renforcerlescontrôlessurlespoissonsdestinésàlaconsommationetadopterlesmesuresde
gestiondesrisquesappropriées;
? améliorerlaconnaissancedurisquesanitaireetsaprévention;
? accompagnerlespêcheursprofessionnelsetamateursimpactésparlesmesuresdegestiondes
risques;
? évalueretrendrecomptedesprogrèsduplan.
LesHAP,moléculeshydrophobes,s'adsorbentsurlessédiments.EnLoireaval,touteslesmolécules
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Illustration35:LeszonesvulnérablesauxnitratesdanslebassinLoireBretagne
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utiliséesdelafamilledesHAPontététrouvéesdansdesanalysesdesédimentsmenéesentre1996
et 2011. La remise en suspension de ces molécules, notamment par les dragages, reste peu
caractérisée.
Concernantlespesticides,leplanEcophytoaétélancéen2008parl'Étatafinderéduirel'usagedes
pesticidestoutenmaintenantuneagricultureéconomiquementperformante.Atitreindicatif,enLoire
aval,lamoléculelaplusfréquemmentidentifiéeestl'AMPA(produitdedégradationduglyphosate),
qui est présente dans 50% des échantillons analysés entre 1996 et 2011. L'atrazine déséthyl,
l'atrazineetlediruonsontlesmoléculeslesplusfréquemmentretrouvéesaprèsl'AMPA.
Les PCB, HAP et une partie des pesticides sont susceptibles de jouer le rôle de perturbateurs
endocriniens.L'effetdecesperturbateursendocrinienssurlespoissonsmigrateursamphihalinsreste
àcejourpeuconnu.
Audelàdesobjectifsd'étatdesmassesd'eaudéfinisparleSdageLoireBretagneetdesobjectifsà
atteindreenconséquenceentermesdequalitédeseaux, telsque fixéspar l'arrêtéministérieldu
25janvier2010,lesSagepeuventdéfinirdesobjectifsspécifiquesdequalitédeseauxafind'atteindre
leurspropresobjectifsdéfinisauvudesenjeuxduterritoire.
3.4.4 BouchonvaseuxestuariendelaLoire
En provenance des bassins versants, de l'océan ou du fond du lit des fleuves, les sédiments
transitentets?accumulentdanslesestuaires,formantuntapissurlefond,mélangedevaseetde
matièreorganique.Eneffet,pourl'estuairedelaLoire,larencontredesfluxenprovenancedufleuve
(27Gm3/an)etdel'océan(150Gm3/an)induisent,notammentenpériodedemorteseaux(faibles
coefficientsdemarée),defaiblesvitessesd'écoulements(faibledébitfluvial,faiblesdébitsdeflotset
dejusants)quiengendrentundépôtsédimentairesurlefonddel'estuaire.
Sousl?actiondescourants,demaréeoudecrue,lavaseetlamatièreorganiquesontremisesen
suspensionetconstituentlebouchonvaseux.L?extensiondubouchonvaseuxdépendnotammentdu
coefficientdemarée:plusceluiciestélevépluslavaseestmiseensuspensionetestdisperséesur
unegrandedistance(illustration36).
Ledéplacementdubouchonvaseuxdansl?estuaireestprincipalementconditionnéparledébitdu
fleuve: lorsque le débit est faible, la mer pénètre davantage dans l?estuaire et fait remonter le
bouchonvaseuxenamont;lorsdescrues,leseauxdoucespeuventexpulserlebouchonvaseux
versl'estuaireexterne.Ladynamiquedubouchonvaseuxdel'estuairedelaLoireestdétailléci
dessousdansl'illustration37.
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Illustration36:Évolutiondelateneurenmatièresensuspensionenfonctionducoefficientdemaréedans
l'estuairedelaLoire(GIPLoireestuaire)
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Ladégradationdesgrandesquantitésdematièreorganiquecontenuesdans le bouchonvaseux
consommedel?oxygèneetpeutentraînerdeshypoxiespréjudiciablespourlespoissonsmigrateurs
amphihalins.CesdéficitssontmajoritairementobservésenavaldeNantes,lesplusintensesétant
mesuréspendantlesviveseauxestivales(lestempératuresélevéesfavorisentladégradationdela
matièreorganique). Enhiver et auprintemps, lesdébits élevéset les températuresplusbasses
favorisentl?oxygénationdeseaux(illustration38).
Lesaménagementssuccessifsdel'estuairedelaLoirepourlanavigation(chenalisation)ontmodifié
sonfonctionnementhydromorphologique.Alorsquelefrontdemaréedynamiqueneremontaitque
jusqu'àNantesaumilieuduXIXesiècle,ilremontedésormaissurprèsde100km,jusqu'àhauteur
d'Ancenis.L'augmentationdesfluxdepolluantsenprovenancedubassindelaLoiredepuiscette
mêmepériodeacontribuéégalementàl'augmentationdesvolumesdematièresetdesteneursen
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Illustration38:ÉvolutiondesconcentrationsenO2dansl'estuairedelaLoireenrelation
avecledébitetlatempératuredel'eau(exempledel'annéehydrologique20072008)
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Illustration37:Localisationdubouchonvaseuxdansl'estuairedelaLoire(GIPLoireestuaire)
polluantsdubouchonvaseux. Cetteaccumulationdepolluantspeutêtrepréjudiciableauxpoissons
migrateursamphihalinsquiséjournentplusieurssemaines,voirequelquesmois,enestuaire:civelles,
flets,éperlans,esturgeons.
Les réseaux de suivi de la qualité des eaux de l'estuaire ont permis de mieux comprendre la
dynamiquedubouchonvaseux et permettent dedisposer d'uneappréciation deson impact sur
l'adaptationdespoissonsmigrateursamphihalinsenestuaire.Lepassagedel'estuairereprésente
unephaseobligatoireetessentielledanslecycledeviedespoissonsmigrateursamphihalins.Ces
espècesutilisenteneffetl'estuaire pour se nourrir, se réfugier, ou transiter. Selon leur période de
présence, elles sont plus ou moins impactées par les hypoxies.
Lesconnaissancessurlesrythmesmigratoiresontpermisd'analyserl'impactdubouchonvaseuxsur
lesdifférentespopulationsdepoissonsamphihalins,enfonctiondeleurprésenceenestuaire.Lecas
dusaumonestdétaillécidessousdansl'illustration39.
Cesdonnéesindiquentquelespériodesd'hypoxiesévèresontrencontréesessentiellemententre
juilletetoctobre.Lesgéniteurspotentielsenmontaisonquientreraienttôtdansl?estuairedelaLoire
pourraientêtreaffectésparunepérioded'hypoxietardive.Lessmoltsquitransitentenestuaireen
juinsontplusexposésaurisqued'hypoxiesévèrequeleurscongénèresarrivésplustôtenestuaire.
Les réseaux de suivis de l'estuaire de la Loire permettent également de calculer la durée des
périodes d?hypoxie, généralement citée commeun facteur clé pour la capacité de résistanceet
d?adaptation des poissons à ces déficits en oxygène. Sur la période20092012, la plus longue
périoded'hypoxieaatteintaumoins23jourset20heuresauPellerin(août2010),etplusde25jours
àCordemais(aoûtseptembre2012).
3.4.5 Pressionssurlemilieumarin
Danslemilieumarin,lesaltérationsducycledeviedesamphihalinscorrespondentàdesrésultantes
depressionsapportéesparlesfluxcontinentauxouàdespressionsspécifiques.
Lesapportsenpolluants(nutriments,substancesdangereuses...)sontsusceptiblesd'affecterlecycle
deviedespoissonsamphihalins, notammentsur leplateaucontinentalparuneaccélérationdes
phénomènes d'eutrophisation (se manifestant par les marées vertes sur le littoral) ou une
contaminationdesfondsmarinsaudroitdeszonesdenourricerie,réduisantleurproductivitéavecun
risquederépercussionsurl'équilibretrophique.Lesdragagesdesfondsestuariensoumarins,entre
autrespour la navigation, et le clapagedessédimentsdraguésenmer est unautre facteur de
déséquilibrepotentiel.
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Illustration39:Interactionentrelebouchonvaseux(concentrationminimalesenO2dissous
atteintesentre2007et2010)etlaprésencedessaumonsadultesetdessmoltsdansl'estuaire
delaLoire(GIPLoireestuaire)
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Enparallèle,lesévolutionsclimatiquesconstatéesengendrentprogressivementdesmodificationsde
lacourantologieetdupositionnementdesairesdegrossissementdesespècespotamotoques,qui
sontautantdefacteurspouvantaugmenterlesdistancesdemigration.
Les prélèvements par les pêcheries, pouvant constituer des valorisations accessoires, ne sont
vraisemblablementpasnonplusnégligeables.Atitred'exemple,lespêcheriesdemaquereauxen
Islande et aux îles Féroé ont capturé accidentellement, d'après les déclarations de capture
disponiblespourlesannées2010et2011,enmoyenne1,5saumonpour1000tdemaquereaux.
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4 Orientationsdesmesuresdegestionpourlapériode
20142019
4.1 Synthèsedespressionssurlesespècesamphihalines
L'étatdeslieuxdeshabitatsetdesespècesmetenévidencelesdifférentespressionsauxquelles
sontexposés lespoissonsmigrateursamphihalins. Cespressionsconcernentd'abord lesmilieux
aquatiquesetleshabitats,etenaffectentlaproductivité:
? altérationdelacontinuitéécologiqueetdelamorphologiedescoursd'eauengendrantdes
pertesdefonctionnalitésécologiques(réductiondesconnexionslatéralesetlongitudinales,
complexificationdescircuitsdemigrations);
? altérationdelaqualitédeseaux,rendantlesespècesamphihalinesplusvulnérables;
? modification de l'hydrologie, se traduisant par des adaptations nécessaires des espèces
amphihalines à unehydrologie réguléeou réduite (par les prélèvements) et impactant le
régimethermiquedescoursd'eau.
Mais les poissons migrateurs amphihalins sont également exposés à des pressions de
prélèvements:
? lespressionslistéescidessusets'exerçantsurlemilieuaquatique,ainsiquelesintroductions
d'espèces exotiques, sont susceptibles de provoquer des déséquilibres établissant de
nouvelles relations entre proies et prédateurs et nécessitant l'adaptation des poissons
migrateursamphihalins;
? lesprélèvementsparpêche.
LesinterventionsduPlagepomidoiventseconcentrersurlesquatrefacteurs,dits«maîtrisables»,
surlesquelsdeseffetspeuventêtreobtenus,àsavoir:
? laqualitédeseaux;
? lacontinuitéécologique;
? lamorphologieetleshabitats;
? lesprélèvementsparpêche.
Les actions sur les trois premiers axes permettent d'améliorer l'accessibilité aux habitats de
reproductionetdegrossissement,lafonctionnalitédesestuairesetlaproductivitédeshabitatseneau
douce.
Desactionssontaussisusceptiblesd'avoirdeseffetssurlesinteractionsproiesprédateursetsur
l'hydrologie,maisdemanièrepluslimitée.
Ilfautrappelerparailleursl'existencedepressionsqualifiéesde«nonmaîtrisables»autraversdu
Plagepomi:
? lespressionspropresaumilieumarin;
? lechangementclimatique.
PourchacundesdixsousbassinsversantsidentifiésparlePlagepomi,lespressionsrelativesàla
qualitédeseaux,àlacontinuitéécologiqueetàlamorphologie,àl'hydrologie,sontappréciéesen
regarddel'étatdeslieuxdesmassesd'eauétablienapplicationdeladirectivecadresurl'eau.Une
évaluationqualitativedelapressiondeprélèvementsparpêcheestégalementproposée.Pourle
saumonetlatruitedemer,cettepressiondepêchecorrespondàunepressiondepêcheaccidentelle
ouillégalecomptetenudesinterdictionsdepêcheeneaudouce.Ilestendemêmepourlesaloses
dans le bassin de la Sèvre niortaiseainsi quepour les lamproies dans les bassinsde la Loire
bourguignonne,delaMaineetdelaSèvreniortaise.
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Un faible niveau de pression sur un facteur maîtrisable conduira à une prépondérance des
orientations de préservation, tandis qu'un fort niveau de pression impliquera sur les facteurs
concernésàprivilégierlesorientationsderestauration(illustration40).Lesactionsdepréservationet
derestaurationserontmenéesprioritairementdanslessousbassinsversantsenfonctiondesenjeux
identifiéspourlesdifférentesespèces(illustration41).Lesopérationsd'acquisitiondeconnaissances
pourrontportersurlesdifférentssousbassinsversants,notammentceuxoùunenjeuimportantapu
êtreidentifiépourl'espèceconsidérée.
4.2 ObjectifduPlagepomi
Lasynthèsedespressionsauxquellessont exposées lesespècesmigratricesamphihalineset la
précision des enjeux relatifs à chaqueespèce conduisent à identifier un objectif de long terme
communpourlagrandealose,l?anguilleeuropéenne,lesaumonatlantiqueetlalamproiemarine:la
préservation et la reconquête de la viabilité pérenne des populations sauvages dans les
bassinsdelaLoire,delaSèvreniortaiseetdescôtiersvendéens.
Tousleseffortsdéployésdoiventseconcentrersurl?atteintedecetobjectif,cequisupposed?agir:
? enprioritépourlapréservationetlareconquêtedeshabitatsetdelacontinuitéécologique,
notammentdanslesbassinsversantsmodérémentanthropisés,descoursd'eauclassésen
liste2autitredel'articleL.21417ducodedel'environnementpourlespoissonsmigrateurs
amphihalinsetdelazoned?actionsprioritairespourl?anguille;
? aucasparcasetenaccompagnementpardesmesuresd?encadrementdespratiquesde
pêcheoudesoutientemporairedeseffectifs.Cesdernièresopérationsseront pleinement
valoriséespourmaintenirl?évolutionfavorabledespopulationsversleurviabilité,enparallèle
desactionsdepréservationetdereconquêtedeshabitatsetdelacontinuitéécologique;
? en faveur d?une poursuite de l?acquisition des connaissances afin de renforcer la
compréhensiondufonctionnementdespopulations.
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Illustration40:Caractérisationdespressionsprépondérantessurlesneufsousbassinsversants
Illustration41:Synthèsedesenjeuxrelatifsàchaqueespècedanslesneufsousbassinsversants
NB:Pourlesespècesdontleseffectifsoulesconnaissancessontfaiblesetnepermettentpasd'identifierunenjeuterritorial,
«noncaractérisé»signifiequel'espècepeutêtreprésentedanslebassinversantetqu'unenjeupeutexister,et«absent»
signifiequel'espècen'estpasprésentedubassinversant.
Anguille Saumon Aloses Lamproies Truite de mer Flet Mulet porc Esturgeon
Allier moyen fort moyen moyen non caractérisé absent non caractérisé absent absent
Loire bourguignonne moyen moyen fort moyen non caractérisé absent non caractérisé absent absent
Loire moyenne fort moyen fort moyen non caractérisé non caractérisé non caractérisé non caractérisé non caractérisé
Cher fort faible fort fort non caractérisé absent non caractérisé absent absent
Vienne fort moyen fort fort non caractérisé non caractérisé non caractérisé non caractérisé non caractérisé
Maine fort faible moyen moyen non caractérisé non caractérisé non caractérisé non caractérisé non caractérisé
Loire aval fort moyen moyen moyen non caractérisé non caractérisé non caractérisé non caractérisé non caractérisé
fort faible moyen moyen non caractérisé non caractérisé non caractérisé non caractérisé non caractérisé
Côtiers vendéens fort faible faible moyen non caractérisé non caractérisé non caractérisé non caractérisé non caractérisé
Eperlan
Sèvre niortaise
Pressions
Qualité de l'eau Continuité écologique et morphologie Hydrologie Prélèvements par pêche
Allier moyenne moyenne faible faible
Loire bourguignonne faible moyenne faible faible
Loire moyenne moyenne faible faible moyenne
Cher moyenne forte moyenne faible
Vienne moyenne moyenne moyenne faible
Maine forte forte moyenne faible
Loire aval forte forte moyenne forte
moyenne forte moyenne moyenne
Côtiers vendéens moyenne forte forte forte
Sèvre niortaise
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L?atteintedecet objectif requiert la recherched?uneconciliationdesenjeuxbiologiquesetsocio
économiquesassociésauxespècesmigratricesamphihalinesdanslesterritoires,enveillantàceque
lapriseencomptedecesderniersnecompromettepasl?atteintedeceluici.
Danslecasparticulierdusaumon, l'atteintedelaviabilitéde lapopulationsauvageconfèreune
prioritédepréservationdeshabitatsfonctionnelsetderestaurationdelacontinuitéécologiqueaux
territoires du bassin versant de l'Allier où se concentrent aujourd'hui les habitats productifs
accessibles sur lesquels est constatée la reproduction de saumons sauvages. L'atteinte de cet
objectif suppose un suivi de l'évolution tendancielle d'une série d'indicateurs reliant l'habitat au
développementdessaumons,commeparexempleletauxdesurviedesoeufs,letauxdesurviede
l?oeufausmolt,letauxdemortalitéàladévalaison,lenombredefrayères,lelinéairedecoursd?eau
accessible... Lesobjectifspources indicateurssont d'évoluer favorablement entre2014et 2019.
Enfin,àtitreindicatif,leCSPavaitfaitétaten1999enpremièreapproched'uneffectifdeviabilitéde
1700saumonsparanàVichy. Cettevaleurguidehistoriqueseraréviséelorsquelaconcertation
prévueendispositionsP4BetC2Dseraaboutie.
4.3 Troisorientationsfondamentalestechniques(OF)
AuregarddelaStranapomietdel'analysedespressionsconnuesetmaîtrisables,troisorientations
fondamentalestechniquesontétédéfiniespourbâtirleprésentPlagepomi:
? PPréserveretnepasdégraderl?existant:Cetteorientationfondamentaleprioritairerecouvre
aussibienlesespècesqueleshabitats.Ellerépondauxobjectifsdeprotectiondeshabitats,de
pêche durable des espèces amphihalines ou de fermeture de pêche selon la situation des
espèces,etderenforcementdelaprotectiondesespèces.
? R Reconquérir et restaurer les milieux favorables aux espèces amphihalines: Cette
orientationfondamentaleporteessentiellementsurleshabitats,leurqualitéetleuraccessibilité.
Desmesuresdesoutientemporaired?effectifsauregardd?unniveaudepopulationactuellement
insuffisantpourgarantirlapérennitéàlongtermedelapopulationsurlebassindegestionpeuvent
égalementcontribuerauxobjectifsdecetteorientationfondamentale.
? C Améliorer les connaissances et le suivi des populations dans un contexte de
changementglobal: Cetteorientationfondamentaleest indissociabledesdeuxpremières.La
connaissancedoitresteraucoeurdelaprisededécisiondesgestionnaires.Lesobjectifsdecette
orientationfondamentaleonttrait auxthématiquesbiologiques(caractérisationducomportement
desespèces...)etsocioéconomiques(caractérisationdelapressiondepêche,desouvrages,des
retenuesd'eau...).
La traduction opérationnelle de ces trois orientations fondamentales techniques s?appuie
nécessairementsurunequatrièmeorientationfondamentaletransversale(OFG,cf.paragraphe4.4),
visant à promouvoir le renforcement de la coopération entre les différents niveaux de
gouvernance,dudistrictLoireBretagneaubassinversantlocal.Cetteorientationfondamentale
repose sur la proposition d?une nouvelle place aux décideurs locaux, à travers notamment les
commissions localesde l?eau(CLE), ainsiquesur le partaged?expérienceset la communication
autourdelaproblématiquedespoissonsamphihalins.
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BassinsdelaLoire,delaSèvreniortaiseetdescôtiersvendéens?19février2014 72/98
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Chaqueorientationfondamentaleestdétailléeenorientations,dispositions.Unprogrammede
mesuresaccompagnelesdispositionsetpermetdeguiderleurdéclinaisonopérationnelle.
Lesorientationsetdispositionsrestentgénérales,àl'exceptiondequelquescasparticuliers.
Leprogrammedemesuresprécise l'espèceet lesbassinsversantsprioritaires. Lechamp
d?applicationterritorialdesmesuress?appuieaumaximumsurleszonagesexistants:cours
d?eaunécessitantlaprotectioncomplètedespoissonsmigrateursamphihalins,linéairesde
frayèresclassés,réservoirsbiologiques...
LesorientationsetdispositionsduPlagepomisontrédigéesdefaçon«autoportée».Ainsi,la
lectureetl'appropriationduPlagepomisontfacilitéesetl'insertiond'élémentsdecontenudu
PlagepomidansleSdageenserarendupossible. Eneffet, le Plagepominepossède une
portée réglementaire que pour soncontenu relatif à la pêche et ausoutiend?effectif. Le
contenuduPlagepomiconcernantlesmilieuxaquatiquesetleshabitatsn'aquevaleurde
recommandation. Or, l'essentiel des limites rencontréesdans l'atteinte depopulations de
poissonsmigrateursamphihalinsviablesconcernentlaqualitéetlafonctionnalitédesmilieux
aquatiques.Decefait,l'enjeuestdecréerdesliensavecleSdageetlesSage,documentsde
planificationopposablesdansledomainedel'eauetdesmilieuxaquatiques.
IlestainsiprécisédanslesorientationsetdispositionsduPlagepomi:
? l'existenced'orientationset/oudedispositionssimilairesdansleSdageLoireBretagne
20102015,qu'ilconviendraitdechercheràreconduiredansleSdage20162021;
? l'intérêtquecertainesdispositionsduPlagepomi20142019,notammentcellesrelatives
auxmilieuxaquatiquesetauxhabitats,soientreprisesdansleSdage20162021,afinde
leurconféreruncaractèreopposable.
Cettedémarchesejustifie,considérantquelesactionsenfaveurdespoissonsmigrateurs
amphihalins,donclamiseenoeuvreduPlagepomi,concourentàl'atteintedesobjectifsdela
politiquedepréservationetderestaurationdemilieuxaquatiquesissusdelaDCE.
LesorientationsetdispositionsduPlagepomidoiventainsiapporter,notammentencequi
concernelesmilieuxaquatiquesetleshabitats,despropositionsd'évolutionoudemaintien
delaréglementationetdesdocumentsdeplanificationenvigueurdansledomainedel'eau
etdesmilieuxaquatiques.
4.4 OFG:Unecoopérationdanslagouvernance
Enappuiauxtroisorientationsfondamentalestechniques,décritesciaprès,l'orientationrelativeàla
gouvernancepréciseladoublecohérencenécessaireàlamiseenoeuvreduPlagepomi:
? cohérence thématique: entre la thématique des poissons migrateurs amphihalins et la
thématiquedesmilieuxaquatiques;
? cohérence en matière de gouvernance: entre l'échelon du bassin hydrographiqueet du
Cogepomi, les partenaires techniques et l'échelon des décideurs locaux en matière de
milieuxaquatiques(CLE).
L'insertiondelagouvernancedespoissonsmigrateursamphihalinsdanslagouvernancedel'eauet
desmilieuxaquatiquesinviteàprivilégierlesoutilsexistants.
Plandegestiondespoissonsmigrateurs20142019
BassinsdelaLoire,delaSèvreniortaiseetdescôtiersvendéens?19février2014 73/98
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4.4.1 OrientationG1:Maintenirunpilotagepartenarialdebassinsurlagestiondes
poissonsmigrateursamphihalins,inscritdanslecontextedelagouvernancedel'eau
etdesmilieuxaquatiques
Afindeconserverlavisibilitédelathématiquedespoissonsmigrateursamphihalins,ilconvientde
maintenir unecoordinationde lamiseenoeuvredecettepolitiquepar l'Étatet sesservices, qui
assurentlesecrétariatduCogepomi.
DispositionG1A:LesecrétariatduCogepomipilotelacoordinationdelamiseenoeuvredes
mesuresdegestion.
UnerépartitionthématiqueestretenueauniveaudusecrétariatduCogepomientre:
? la Dreal des Pays de la Loire, en chargede la déclinaison duPlagepomi pour les espèces
thalassotoques.ElleestencelaenchargenotammentdelacoordinationduPlagepomiavecle
plan de gestion de l'anguille (PGA) pris par la France en application du règlement visant la
reconstitutiondustockd'anguilleseuropéennes.EllepilotelePGAsurleterritoireduCogepomi;
? laDrealCentre,délégationdebassinLoireBretagne,enchargedeladéclinaisonduPlagepomi
pourlesespècespotamotoques.Elleestencelaenchargenotammentdelagestiondusaumon
atlantique,aveclepilotageduvoletduPlagepomirelatifausaumonatlantique,ditplansaumonde
LoireAllier.
LesecrétariatduCogepomitravailleenconcertationaveclaDirectiondel'eauetdelabiodiversitédu
ministèreenchargedel'écologieetveilleenparticulieràlabonnecirculationdesinformationssur
l'anguille(relationsentrePlagepomietPGA),parexempleausujetdesdonnéesdecaptures.
Disposition G1B: Le Cogepomi informe en tant que de besoin le Comité de bassin de
l'avancementduPlagepomi.
Cettedispositioncorrespondàlatraductionlocaledel'orientation13delastratégienationalepourles
poissonsmigrateursamphihalins,quiprévoitderapprocherlagouvernancedespoissonsmigrateurs
delagouvernancedel'eauetdesmilieuxaquatiques.
Lesecrétariat duCogepomiveilleàassocier lesacteursde l'eauetdesmilieuxaquatiquesà la
concertationdans laprisededécision. Enparticulier, il travaille encollaborationétroiteavec les
instancesdubassinLoireBretagne,notammentdanslapériodederévisionduSdagejusqu'enfin
d'année2015.
Disposition G1C: Le secrétariat du Cogepomi pilote le Plagepomi en s'appuyant sur
différentspartenaires.
LesecrétariatduCogepomipeutnotammentpérenniserouinstaurerdesgroupesd'appuiaupilotage,
rassemblantdespartenairessusceptiblesd'apporteruneanalyseobjectiveéclairantlaconduitedu
plandegestion.
Cesgroupesontvocationàapporterunregardcritiqueetàfaireémergerdespropositionspouvant
alimenterdesdocumentsdecadrageouinitierdesdémarchesverslessousbassinsversants.Les
projetsdedécisionssontétablisensynthèsedestravauxdecesgroupesetadoptésparlesecrétariat
duCogepomi,éventuellementaprèsconsultationdespartenaireslocauxoudebassinsurlessujets
quilenécessiteraient.
LespartenairesimpliquésdanslamiseenoeuvreduPlagepomisontnotamment:
? descollectivitésouleursgroupements;
? desétablissementspublics;
? desassociationsoufédérationsassociatives;
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? desentreprises.
4.4.2 OrientationG2:Associerlesinstanceschargéesdelagestiondel'eauetdes
milieuxaquatiquesàladéclinaisonduPlagepomi.
Lepartenariataveclesacteurslocauxdelagestiondel'eauetdesmilieuxaquatiquesestunenjeu
essentielduPlagepomi20142019.
G2A:Al'échelledessousbassinsversantsidentifiésauchapitre3oud'entitésexistantes
par ailleurs (bassin versant d'un Sage, périmètre d'un EPTB), une concertation peut être
instauréeenfaveurdespoissonsmigrateursamphihalins.
LesCLEouleurscommissionsthématiquesorganisentdeséchangessurlespoissonsmigrateurs
amphihalinsetlamiseenoeuvreduPlagepomi.Lesobjectifsdecettedémarchesontde:
? favoriserl'appropriationlocaledelathématiquepoissonsmigrateurs,endiffusantlocalementles
informationsacquisessurlespoissonsmigrateursamphihalins,afindesusciterunemobilisation
localesurlesujet,pouvantparexemplesetraduirepardesdispositionsrelativesauxpoissons
migrateursamphihalins dans lesplans d'aménagement et de gestion durable de l'eauet des
milieuxaquatiquesdesSage;
? mettre à disposition des acteurs locaux les éléments, notamment de cadrage ou de
connaissances,ayantpuêtreproduitsparailleursdanslamiseenoeuvreduPlagepomi.Cette
informationpermetenretourdefaireémergerdesbesoinslocalementqu'ilpeutêtreintéressantde
traduiredanslecadreparexempled'uncontratterritorialenfaveurdesmilieuxaquatiques,ouà
uneéchelleplusglobaledanslecadredelamiseenoeuvreduPlagepomi;
? informerdelaréalisationd?opérationsenfaveurdespoissonsmigrateursamphihalinsdansleur
territoire.
A défaut de CLE, tout groupe de travail fonctionnel déjà consacré aux poissons migrateurs
amphihalinspeutmenercetteconcertation.
Aussi il peut être envisagé, à l'échelle des grands sousbassins versants, la constitution de
commissions interSagesur lespoissonsmigrateursamphihalinsouuneinformationrégulièredes
commissionstechniquesterritorialesduComitédebassin,afinentreautresdefaciliterlacoordination
desactionsdesSage,desprogrammescontractuelsetdesservicesdel?Étatdanslamiseenoeuvre
duPlagepomi.
4.4.3 OrientationG3:Renforcerlepartaged?expériencesetlacommunication.
Lavalorisationdesconnaissancesacquisesàtraversunpartagedesexpériencesetunretourde
bonnespratiquesestunenjeuessentielduPlagepomi.Celasupposeuneinformationrégulière,des
structureschargéesdupilotageduPlagepomicommedesporteursdeprojet,del?avancementdes
actionsetainsidelamiseenoeuvredesmesuresopérationnellesduPlagepomi.
G3A:LamiseenoeuvreduPlagepomifait l?objetd?informationsrégulières, à l?échellede
bassincommeauxéchelleslocales.
Auniveaudubassin,lesecrétariatduCogepomifaitétatdel?avancementdanslamiseenoeuvredes
mesuresduPlagepomiets?appuiesur:
? des communications orales lors de réunions de concertation spécifiques aux poissons
migrateursamphihalinsoudanslecadrepluslargedelapolitiquedel?eauetdesmilieux
aquatiques;
? desdocumentsécrits decommunication (lettresd?information, communiquésdepresse...)
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rendantcomptedesprogrèsduPlagepomi.
Au niveau local ou dans le cadre d?opérations en réponse aux mesures opérationnelles du
Plagepomi,lesstructurescoordinatricesouopérateurspeuventcommuniquersurcertainesactions
quirentrentdanslecadreduPlagepomiouquicontribuentàl?atteintedel?objectifduPlagepomi.
Lesobjectifsprioritairesdecommunicationportentsurlasensibilisationdupubliccibleauxenjeuxet
surlamobilisationdesdifférentsacteursautourdesenjeuxpoissonsmigrateursafindesusciterdela
fiertémaiségalementdefavoriserl?émergencedemaîtrisesd?ouvrage.
G3B:Lesconnaissancesacquisessontdiffusées.
EncoordinationaveclesecrétariatduCogepomi,desactionsdediffusiondesconnaissancessont
organiséesrégulièrement.Cesopérationsdecommunicationpeuventsetraduireparl?organisationde
journées d?échanges ou la diffusion de synthèses écrites, permettant de créer ou renforcer les
relationsentrelacommunautédeschercheursetexperts,etlepublicdesdécideursetgestionnaires.
L?objectif principal de cette communication est d?apporter l?éclairage technique et scientifique
nécessairepourappuyerlesprisesdedécision.
4.5 OFP:Préserveretnepasdégraderlasituationexistante
4.5.1 OrientationP1:Prévenirtoutedégradationdel'accessibilitédeshabitatsdans
ladurée
Lesobstaclesàl'écoulement(seuilsetbarrages)peuventconstituer,mêmelorsqu'ilsprennenten
compte la présence des poissons migrateurs amphihalins par la présence de dispositifs de
franchissement,despointsdifficilespourlesmigrationsdemontaisonetdedévalaison.
L'objectifdel'orientationP1estdepréserverdansladuréelescapacitésdespoissonsmigrateurs
amphihalinsàfranchirlesobstaclesàl'écoulement.
Cetteorientationtrouveunrelaisdanslesorientations1Aet9BduSdageLoireBretagne20102015
quiont pourobjectif d'empêchertoutenouvelledégradationdesmilieuxet d'assurer lacontinuité
écologiquedescoursd'eau.
Ainsi,sil'équipementhydroélectriqued'ouvragesexistantssurdescoursd'eauclassésautitreduI
de l'article L.21417duCodede l'environnement, restepossible, il convient toutefois, tel que le
précise la circulaire du 25 janvier 2010 relative à la mise en oeuvre du plan d'actions pour la
restaurationdelacontinuitéécologique:
? deprivilégierlarecherched'équipementhydroélectriqued'ouvragesnonsituéssurlescoursd'eau
classés;
? àdéfaut,denepasdégraderlasituationexistanteenmatièredecontinuitéécologique,et,sile
maintiendel'ouvragen'estjustifiéparaucunautreusage,des'assurerquel'impactrésidueldu
maintiendel'ouvrageetdesonexploitationhydroélectrique,enmatièredecontinuitéécologique,
esttrèsprochedesconditionsquirésulteraientdel'effacementdel'ouvrage,toutenpermettant
une économie conséquente et justifiée sur le coût de cet effacement et en contribuant
suffisammentauxobjectifsdedéveloppementdesénergiesrenouvelables.
Rappelsréglementaires:
L?applicationdelaréglementationexistanteconstitueunprérequisessentielduPlagepomi
20142019.Entreautres,ilestrappelélaréglementationsurlestroissujetssuivants:
1.Leclassementdescoursd'eauenliste1autitredel'articleL.21417duCodedel'environnement
(cf.paragraphe3.3.1),esteffectifdepuisle22juillet2012etinterditlaconstructiondetoutnouvel
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ouvrageautoriséouconcédéencoursd'eau,quicréeraitunobstacleàlacontinuitéécologique.Par
ailleurs, le renouvellementdesdroitsexistantsestsubordonnéàdesprescriptionspermettantde
garantirlaprotectiondespoissonsmigrateursamphihalins.
2. La mise en conformité des ouvrages visàvis de la réglementation fait l'objet de contrôles
spécifiquesdanslecadredesplansdecontrôledesMISEN(cf.paragraphe3.3.1).
3.Lestravauxencoursd'eaufontl'objetàpartird'uncertainseuildeprocéduresdedéclarationou
d'autorisationautitredelaloisurl'eau(titre3delanomenclaturedelaloisurl'eau,préciséeà
l'article R.2141 du Code de l'environnement). En particulier, les travaux visés concernent les
obstacles à l'écoulement, la modification des profils en long ou en travers du lit mineur, la
modificationdelaluminosité,laconsolidationoulaprotectiondebergesetl'entretiendescoursd'eau
oucanaux.
Disposition P1A: Le respect des prescriptions pour le rétablissement de la continuité
écologique(entretiend'undispositifdefranchissement,manoeuvredesdispositifsmobiles)
par le propriétaire d'un ouvrage est traduit dans les actes administratifs lors des
renouvellementsdedroitetfaitl'objetdecontrôlesciblés.
L'efficacité continue des dispositifs de franchissement est assurée conformément à la notion
d'obligationderésultat.Danscecadre,lesrèglementsd'eauintègrentdesprescriptionsrelativesà
cetteobligationlorsdurenouvellementdesdroitsetdesopérationsdecontrôledelapolicedel'eau
etdelanatureveillentaurespectdecesobligations.
Enparallèle,unguidedebonnespratiquesestmisàdispositiondespropriétairesafindefaciliterles
opérationsd'entretienetdeleurapporterlesmeilleureschancesderéussite.
Unemutualisationdesmoyensdesurveillancedelafonctionnalitédesdispositifsdefranchissement
entre les différents propriétaires d'ouvrages est envisagée, afin de renforcer l'efficacité de la
surveillance de la fonctionnalité de la continuité écologique au droit des ouvrages. Une telle
démarches'effectueà l'échelle d'uncoursd'eaunécessitant laprotectioncomplètedespoissons
migrateurs amphihalins, dans le cadre duplan d?actions du Sagedevant identifier les mesures
nécessairesàlarestaurationdelacontinuitéécologique.
LeCogepomiencouragel'intégrationdecettedispositiondansleSdageLoireBretagne20162021.
Disposition P1B: Les nouvelles autorisations ou renouvellements d'autorisation
d'équipementoudesuréquipementhydroélectriqued'ouvragesexistantsnesontdélivrées
quesileprojetgarantitlanondégradationdesconditionsdefranchissementdanslesdeux
sensdemigration.
Cettedispositionsupposedemettreenregardlecoûtécologiquedel'aménagementhydroélectrique
etlebénéficeénergétiqueattendudel'exploitation,afindes'assurerquelebénéficeénergétiquede
l'installation contribue de manière suffisante aux objectifs de développement des énergies
renouvelables.
L'aménagementnedoitnotammentpasdégraderlasituationpréexistanteentermesdecontinuité
écologique. Le meilleur dispositif technique acceptable est recherché, pour éviter et réduire les
risques demortalités des poissons migrateurs amphihalins (grilles antiintrusion, turbines ichtyo
compatibles).
Lamiseenoeuvredecettedispositions'appuiesurlesconnaissancesacquisesenapplicationdela
dispositionC1B.
Cettedispositions'inscritdanslaprioritédonnée,surlescoursd'eauoùsetrouventdespopulations
sauvagesdepoissonsmigrateursamphihalins,àlaluttecontrelecumuld'obstaclesàfranchir.Ainsi,
àdéfautdedispositifssatisfaisantsdelimitationdesimpacts,l'aménagementn'estpossibleque:
? danslecasdeprojetsbénéficiantd'uneDUPoud'uneDIG;
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? siunemesurecompensatoireestprévue,sipossiblesurlamêmemassed'eau,afindemaintenir
auplusletauxde fractionnement àsontauxactuel.Lacompensationportesurtouteopération
permettantderetrouverdesconditionséquivalentesdetransportdessédiments,dediversification
deshabitats,devitessedetransfertdeseauxetdecirculationpiscicole.
LeCogepomiencouragelareprisedecettedispositiondansleSdageLoireBretagne20162021.
DispositionP1C:Lestravauxencoursd'eauveillentàmaintenirlacirculationdespoissons
migrateursamphihalinsentreleszonesavaletamontdusitedetravaux.
Pourlestravauxsusceptiblesdeperturberlamigrationdespoissonsmigrateursamphihalins,
laprioritéportesurleurréalisationendehorsdespériodesdemigrationactive,àdéfauteten
l'absence de dispositifs permettant de maintenir la circulation des poissons migrateurs
amphihalins.
Lespériodesdemigrationactivesontlessuivantes:
? pourlesaloses,lamigrationactives'échelonnedu1ermarsau15juin;
? pourleslamproies,lamigrationactives'échelonnedu1eroctobreau31mai;
? pour lesaumonatlantique, lespériodesdemigrationsactivessontpréciséesparsousbassins
versantsdansletableau4:
? pourlescivellesenestuaire,lamigrationactives'échelonnedu1ernovembreau30juin;
? pourlesanguillesargentées,lamigrationactivededévalaisons'échelonnedu1eroctobreau31
mars.
Lesespècesdepoissonsmigrateursamphihalinsdevantêtreprisesencomptesurchaquetronçonde
coursd'eaupourl'applicationdecettedispositionsontcellescibléesdansleclassementenliste2
arrêtéle10juillet2012autitredel'articleL.21417duCodedel'environnement.
Cettedispositionviseenparticulierlesinstallations,ouvrages,travauxetactivités(IOTA)soumisà
déclaration ou autorisation, notamment au niveau du titre 3 de l'article R.2141 du Code de
l'Environnement(impactssurlemilieuaquatiqueousurlasécuritépublique)telqu'ilestenvigueurle
jourdelapublicationdel'arrêtépréfectoralapprouvantleSDAGE,susceptiblesdeperturber,defaçon
temporaire(oupérenne),lamigrationdesespècesdepoissonsmigrateursamphihalins.
LeCogepomiencouragel'intégrationdecettedispositiondansleSdageLoireBretagne20162021.
4.5.2 OrientationP2:Éviterladégradationdeshabitatsetdelaqualitédeseaux,
afindemaintenirlaproductivitédeshabitatsetunequalitéd'eaucompatibleavecles
exigencesdesespèces
Leshabitatsdereproduction,dedéveloppementetdereposmigratoiredesespècesamphihalines
sontspécifiquesetméritentuneattentionparticulière.L'enjeuprincipalportesurlapréservationdes
habitatsfavorablesexistantsactuellementconnus(cf.paragraphe1.2.2).
Lesfacteursdedégradationdelaqualitédeshabitatssont multiples:colmatage,modificationdu
substrat,modificationdurégimehydraulique,pollutionschimiques,altérationdelamorphologie.
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Saumon
Bassinsversantsde l?Allier et de
laLoirebourguignonne,enavaldu
barragedeVillerest
1ermars?15juin
15septembre?30novembre
Autresbassinsversants 1erjanvier?15juin
15septembre?30novembre
Tableau4:Périodesdemigrationactivedessaumons
L'objectifdecetteorientationP2estdeproposerdesinterventionsquimaintiennentlaqualitédel'eau
quandelleestdéjàadaptéeàlaviedespoissonsmigrateursamphihalinsouqui l'améliorentpar
ailleurs.
EllerejointlesorientationsduSdageLoireBretagne20102015relativesàl'hydromorphologie,àla
réductiondespollutionsetàlagestionquantitativeaveccommeobjectifs:
? d'empêchertoutenouvelledégradationdescoursd'eau;
? deréduirelespollutionsorganiques;
? demaîtriserlespollutionsparlespesticidesetlessubstancesdangereuses;
? demaîtriserlesprélèvementseneau;
? depréserverlelittoral,lestêtesdebassinversant,leszoneshumidesetlabiodiversité.
Le Sdage LoireBretagne 20102015 précise également la nature du couvert environnemental
permanentdevantêtremisenplaceàproximitédescoursd'eaudanslesterritoiresclassésenzone
vulnérableauxnitrates(lacartedeszonesvulnérablesauxnitratesestdisponibleauparagraphe
2.4.3). Sadisposition 2B2 prévoit que les programmesd'actions définis au titre de la directive
nitratescomprennentsystématiquementl'obligationd'implanterdesdispositifsvégétaliséspérennes
(haies,bandesenherbées,ripisylves)d'unelargeurminimalede5mètreslelongdetouslescours
d'eau.EllecomplètelesarticlesR.21180et81duCodedel'environnement.
Lecouvertenvironnementalpermanentbénéficieauxmilieuxaquatiquespluslargementquepourla
simpleréductiondestransfertsdenitrates.Ilpermetégalementdefreinerl'érosiondessols.
Ainsi, le couvert environnemental permanent peut apparaîtrecommeunélément duprogramme
d'actionspourlaréductiondurisqued'érosiondessolsdansleszonesoùl'érosiondiffusedessols
agricolesestdenatureàcompromettrelaréalisationdesobjectifsdebonétatoudebonpotentiel.
Cezonageetcesprogrammesd'actionsdoiventêtreétablisparlespréfetsd'aprèsladisposition1B
4duSdageLoireBretagne20102015.
LeSdageLoireBretagne20102015contribueégalementparsonorientation8Aàlapréservation
deshabitatsdespoissonsmigrateursamphihalinssituésenzonehumide.Ilinstaureainsileprincipe
prioritaired'évitementd'impactsurunezonehumidepuisderéductiondesimpactsrésiduels,età
défautd'alternativeavéréeauprojetendehorsdelazonehumide,ilimposelacompensationdela
zonehumidedétruite.
Audelà, les SRCEdéveloppent la séquence éviter/réduire/compenser à l'ensemble des projets
altérantlatramebleuequ'ilsontdéfinis,danslamesureoùilsdoiventfairel'objetd'unepriseen
comptedelapartdel'Étatetdescollectivitésoudeleursgroupements.
Parailleurs,encequiconcernelesdispositifsdeprotectionspécifiquedeshabitatsremarquables,
voired'intérêtcommunautaires,unobjectif d'atteinted'unesurfacedezonesprotégéesatteignant
2%duterritoirenationalaétéfixéeetestdéclinéautraversdelastratégiedecréationdesaires
protégées(Scap).
Rappelréglementaire :
L?applicationdelaréglementationexistanteconstitueunprérequisessentielduPlagepomi
20142019.Entreautres,ilestrappelélaréglementationsuivante:
LeCodedel'environnementprévoit parsonarticleL.4323queladestructiondefrayèresoude
zonesdecroissanceoud'alimentationdelafaunepiscicolesoitpunide20000eurosd'amende(cf.
paragraphe 3.3.1), à moins qu'il ne résulte d'une autorisation ou d'une déclaration dont les
prescriptionsontétérespectéesoudetravauxd'urgenceexécutésenvuedeprévenirundanger
graveetimminent.
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Parailleurs,leCodedel'environnementprévoirdeuxdispositifspermettantdelimiterladégradation
desmilieuxaquatiques,entreautresdeshabitatsetdelaqualitédeseaux:
? l'étuded'impact:Lesprojetsd'aménagementsusceptiblesd'affecterlesmilieuxaquatiqueset
doncleshabitatsdesespècessont,selonleurampleur,soumisàétuded'impactenvertudes
articlesL.1221et R.1222duCodedel'environnement.L'étuded'impact comportedivers
éléments listés à l'article R.1225 du Code de l'environnement, dont un état initial de
l'environnement, l'évaluation des effets du projet et les mesures présentées par le
pétitionnairepouréviter,réduireetcompenserlesimpactsdesonprojet;
? l'évaluation d'incidences Natura 2000: Les projets (activités, travaux, aménagement,
ouvrages, installations) susceptibles d'affecter significativement un site Natura 2000 sont
soumis à une évaluation des incidences, en vertu de l'article L.4144 du Code de
l'environnement.L'évaluationd'incidencesdoit,encasd'incidencenégativeduprojetsurle
siteNatura2000,faireétatdessolutionsretenuespouréviter,réduirepuiscompensercette
incidence.
DispositionP2A:Lamiseenplacedecouvertsvégétauxpermanents,enrivedescoursd'eau
etdesplansd'eaudeplusdetroishectares,estencouragéedansuncadreconcertéetsous
formedeprojetspilotes.
Cette disposition repose sur l'intérêt des couverts végétaux permanents dans la réduction des
phénomènesd'érosiondessols,susceptiblesdecontribueraucolmatagedeshabitats.
Elleavaleurderecommandationetportesur lesbassinsversantsdescoursd'eaunécessitantla
protectioncomplètedes poissonsmigrateursamphihalins et nonclassésenzonevulnérable aux
nitrates. En effet, en zone vulnérable aux nitrates, la couverture végétale permanente est déjà
obligatoire.
Lamiseenoeuvredecettedispositionautraversdeprojetspilotespermetdelimiterl'érosiondessols,
delimiterlestransferts,d'améliorerleconfortdesespècesetdelimiterl'échauffementparl'ombrage.
Lesprojetspilotescontribueraientàlatrameverteassociéeàlatramebleueetsontinscritsdansles
programmesd'actionsprévusparladisposition1B4duSdageLoireBretagne20102015.
Il convient, dans leséventuels projetspilotes, d'envisager uneévaluationde leur efficacité sur la
productivitédeshabitats.
En lien avec cettedisposition, le Cogepomiencourage la reconductionde la disposition1B4du
SdageLoireBretagne20102015dansleSdage20162021.
Disposition P2B: Un renforcement de la protection des habitats de reproduction et de
développementdesjuvénilesdespopulationssauvagesdepoissonsmigrateursamphihalins
estrecherché.
Les dispositifs de protection spécifique, sont des outils de protection des habitats de nature
réglementaire(réservenaturelle,arrêtédeprotectiondebiotope)oucontractuelle(zonespécialede
conservationNatura2000).Lesréservesdepêche,temporairesoupermanentes,peuventégalement
contribueràcetobjectifdeprotectiondeshabitats.Cesdispositifsrenforcentlaprotectionminimale
apportéeparlaprotectiondesfrayèresinventoriéesenapplicationdel'articleL.4323duCodede
l'environnementetsontdétaillésauxparagraphes2.3.1et2.3.2.
Cettedispositionrecommande,danslesbassinsversantsdescoursd'eaunécessitantlaprotection
complète des poissons migrateurs amphihalins où des dispositifs de protection cités cidessus
existent,l'animationprioritairedecesdispositifs.UnesynergieestdéveloppéeentrelePlagepomiet
lesdocumentsd?objectifsNatura2000parunrenforcementdeséchangesavecleCogepomi.
Enaccompagnement,danslesbassinsversantsdescoursd'eaunécessitantlaprotectioncomplète
des poissons migrateurs amphihalins qui ne seraient pas déjà couverts par des dispositifs de
protectionspécifiquedeshabitats,undesdispositifslistéscidessuspeutêtremisenplace,après
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concertationlocale.Ilestrecommandéd?étendrecettedispositionaudomainepublicmaritimedans
lessousrégionsmarinesduGolfedeGascogneetdelamerCeltique.
Lamiseenoeuvredecettedispositions'articuleavecladéclinaisonrégionaledelaScap.
Par ailleurs, la protection d?habitats fonctionnels invite, en cas d?impact des végétaux exotiques
envahissants(surlabase,entreautres,desconnaissancesacquisesdanslecadredeladisposition
C1E) sur les habitats des poissons migrateurs amphihalins (par exemple, par la fermeture
progressivedesannexeshydrauliques)àlamiseenplaced?opérationsderégulation,afindecontenir
l?extensiondesinvasions.
DispositionP2C: Le fonctionnementhydrosédimentaire naturel descoursd'eaudoit être
recherché, notamment par la circulation des crues morphogènes, afin de conserver la
dynamiquederenouvellementdeshabitats,leurfonctionnalitéetleurproductivité.
Lefluxsédimentairepermet unrenouvellementdeshabitats cequientretient leurproductivité et
contribueaumaintiendeséquilibresdumilieu. Aussi estil nécessairedemaintenir la circulation
existantedessédimentset denepas l'altérer, cequisetraduit pardesmanoeuvresdesparties
mobilesdesouvragesquandilsencomportent.Lesouvragessituéssurdescoursd?eauclassésen
liste2autitredel?articleL.21417oùunfortenjeupourletransitsédimentaireaétéidentifiésont
notammentconcernésparcettedisposition.
Dessolutionsd'évacuationdessédiments,complémentairesàlagestiondesouvragespouvantdéjà
exister,serontrecherchées,notammentpourpermettreletransitdespetitescruesmorphogènes.
4.5.3 OrientationP3:Maintenirunrégimehydrologiquecompatibleaveclesbesoins
despoissonsmigrateursamphihalins
Le régime hydrologique et la dynamique fluviale sont des facteurs clés pour la survie et le
développement des poissons migrateurs amphihalins. Une faible hydrologie accroît en effet les
risquesderéchauffementrapideauprintempsréduisantd'autantlescapacitésdeconfortetdesurvie
des espèces. Prévenir cesétiageset lesgérer est un enjeu important pour la préservation des
populationsdepoissonsmigrateurs.
L'objectifdel'orientationP3portesurlapriseencomptedesbesoinsvitauxdespoissonsmigrateurs
amphihalinsdanslagestionquantitativeéquilibréedelaressourceeneau.Mêmesicetteorientation
viseparticulièrementlesaxesmigratoiresprincipaux,ellenedoittoutefoispasocculterl'importance
decertainsaffluentspouvantjouerunrôleessentieldanslecycledecertainesespèces.
L'orientation P3 interagit avec l'orientation fondamentale 7 du Sdage LoireBretagne 20102015
relativeàlamaîtrisedesprélèvementsd'eau.
LeSdageLoireBretagnedéfinitpourunegestionéquilibréedelaressourceledébitobjectifd'étiage
(DOE).LeDOEestundébitmoyenmensuelaudessusduquelilestconsidéréquel'ensembledes
usagesestpossibleenéquilibreaveclebonfonctionnementdumilieuaquatique.C'estledébitde
référencepourladélivrancedesautorisationsdeprélèvementetderejetsparlapolicedel'eau.Ildoit
êtrerespectéenmoyennehuitannéessurdix.
Enparallèle,leSdageidentifiedesbassinsversantsnécessitantuneprotectionrenforcéeàl'étiage,
oùlesmesuresdegestionconduisentàlimiter,voireréduire,lesprélèvementsenpériodeestivale,
du1eravrilau30octobre.Lesbassinsconcernéssont:
? lebassindelaVienne,delaconfluenceaveclaBlourdejusqu?àlaconfluenceaveclaCreuse,à
l'exceptiondessousbassinsdel'Envigneetdel'Ozon;
? lebassindel'Oudon;
? lesbassinsdelaLogne,delaBoulogne,del'OgnonetdulacdeGrandlieu;
? lesbassinsdecertainscôtiersvendéens(Auzance,Vertonne,VieetJaunay).
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Aussietafindemaintenirunéquilibreentrelesressources,lesbesoinsetl'alimentationdesmilieux
naturels,deszonesderépartitiondeseaux(ZRE)sontdéfiniesparlepréfetcoordonnateurdebassin
LoireBretagne.
LeclassementenZREconcernelessecteursgéographiquesexposésauxplusfortesconsommations
d'eauetconduitàladéterminationdesvolumesprélevablesparlesdifférentescatégoriesd'usagers
enfonctiondesressourcesetdel'annéeconsidérée.LesbassinsversantsclassésenZREfigurent
surlacartedansl'illustration42.
Pourlagestiondecrise,leSdageLoireBretagne20102015définitdanssonorientation7Eledébit
seuild'alerte(DSA)etledébitdecrise(DCR).LeDSAetleDCRsontdesdébitsjournaliersde
gestiondecrise.LavaleurduDSAestinférieureouégaleàcelleduDOE.EndessousduDSA,une
desactivitésutilisatricesdel'eauouunedesfonctionsducoursd'eauestcompromise.Ils'agitdonc
d'unseuildedéclenchementdesmesurescorrectives.LeDCRestlavaleurdedébitendessousde
laquelle seules les exigences de la santé, de la salubrité publique, de la sécurité civile, de
l'alimentationeneaupotableetlesbesoinsdesmilieuxnaturelspeuventêtresatisfaits.
Les Sagepeuvent, en fonction des enjeux identifiés localement, complétés le réseau de points
nodauxduSdage,audroitdesquelslesvaleursdesDOE,DSAetDCRs'appliquent.
Rappelréglementaire :
L?applicationdelaréglementationexistanteconstitueunprérequisessentielduPlagepomi
20142019.Entreautres,ilestrappelélaréglementationsuivante:
L'articleL.21418duCodedel'environnementprévoitdanssonpremieralinéaquetoutouvrageà
construire dans le lit d'un cours d'eau comporte des dispositifs maintenant dans ce lit un débit
minimal (dit débit minimal biologique) garantissant en permanence la vie, la circulation et la
reproductiondesespècesvivantdansleseauxaumomentdel'installationdel'ouvrageainsique,le
caséchéant,desdispositifsempêchantlapénétrationdupoissondanslescanauxd'amenéeetde
fuite.
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Illustration42:Zonesderépartitiondeseauxdanslebassin
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DispositionP3A: Lagestionéquilibréede la ressourceeneautient comptedesbesoins
vitauxdespoissonsmigrateursamphihalins,enétiagecommeencrue.
Cettedispositionrecommande,surlabasedesétudesdedébitsminimauxbiologiques(DMB)qui
intègrent les besoins des poissons amphihalins quandelles sont réalisées, que les DOEsoient
cohérentsaveclesDMB.
En complément, un enjeu existe sur la gestion de la ressource en eau dans les zones de
développementoudegrossissementdespoissonsmigrateursamphihalins,danslesbassinsversants
descoursd'eaunécessitantlaprotectioncomplètedespoissonsmigrateursamphihalins.Dansles
zones classées enZREsur ces territoires, il est recommandéque les études dedéfinition des
volumesprélevables intègrent lesbesoinsdespoissons migrateursamphihalins. Sont doncainsi
particulièrement visés par ce point les sousbassins versants fréquentés par des populations
sauvagesdepoissonsmigrateursamphihalinssuivants:
? lebassinduCher,enamontdeChâtressurCheretenavaldubarrageduPrat;
? lebassinduClain;
? lebassinduLay;
? lebassindelaSèvreniortaise.
Par ailleurs, les périodes de débits soutenus sont favorables aux migrations des poissons
amphihalins,enlimitantentreautresl'échauffementdesmassesd'eau.Ilestainsirecommandédans
lescoursd'eaunécessitantlaprotectioncomplètedespoissonsmigrateursamphihalinsdemaintenir
unécoulementsuffisantencrue,afinquelesconditionsdemigrationsnesoientpasaltérées.Cette
recommandations'appliquesurunemassed'eauauxpériodespropicesauxmigrationsdesespèces
de poissons migrateurs amphihalins présentes dans cette masse d'eau. Elle pourra conduire à
réfléchir à l?identification dedébits critiquesmigratoires, devant être respectés lors des périodes
migratoires et dont le franchissement à la baisse ne pourrait reposer que sur des conditions
naturelles.
DispositionP3B:Lacroissancedesdébitsréservésestrecherchéepourlesouvragessitués
sur un mêmecours d'eau, de l'amont vers l'aval. Ces débits cherchent à respecter et à
s'adapterauxbesoinsdespoissonsmigrateursamphihalins.
Lamiseenoeuvredecettedispositionpeuts?appuyersurl?identificationd?undébitcritiquemigratoire
àl?échelled?uncoursd?eau.
Les espèces de poissons migrateurs amphihalins à prendre en compte dans ces études
correspondentpartronçondecoursd'eauauxespècesciblesduclassementenliste2arrêté le
10juillet2012autitredel'articleL.21417duCodedel'environnement.
4.5.4 OrientationP4:Préserverdeseffectifssuffisantspourpermettrele
renouvellementnaturelautonomedespopulationsetunepêchedurabledeces
espèces.
Lapêchedesespècesamphihalinesconcernelespêcheursamateurs(auxlignes,auxenginsouaux
filets),dontl'effortdepêcheestàmieuxapprécier,etlespêcheursprofessionnels.Lesprincipales
espècesdepoissonsmigrateursamphihalinscibléessurlebassindelaLoire,laSèvreniortaiseet
lescôtiersvendéenssont:
? l'anguilleeuropéenne;
? lagrandealoseetl'alosefeinte;
? lalamproiemarineetlalamproiefluviatile.
Lebraconnagerestepratiquétoutaulongdel?annéesurlesanguilles,notammentlescivelles,etle
saumon,malgrél'interdictiongénéraledesapêche.
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Danslecontextedudéveloppementdurable, il devient nécessairedeconcilier l'activitédepêche
aveclapréservationdupatrimoinepiscicole.Lemaintiendelapêcheprofessionnelleetdelapêche
deloisirdesespècesmigratricesnedoitdoncpasremettreencausel'équilibredesécosystèmeset
lapérennitéàlongtermedesstocksdepoissonsmigrateursamphihalins.
Rappelsréglementaires
L?applicationdelaréglementationexistanteconstitueunprérequisessentielduPlagepomi
20142019.Entreautres,ilestrappelélaréglementationsuivante:
Lapêchedesespècesdepoissonsmigrateursamphihalins répondà la réglementationgénérale
définie par le Code de l'environnement, rappelée au paragraphe 2.1.4 : dates de pêche, taille
minimaledecaptures,réservesdepêche,réglementationdelapêcheàproximitédesouvrages.
La pêche des migrateurs en zone maritime est conditionnée à la détention d'une licence de la
commission milieux estuariens et amphihalins (CMEA) du comité national des pêches maritimes et
des élevages marins (CNPMEM).
Il est rappelé au paragraphe 2.1.4 l'interdiction de pêcher dans les dispositifs assurant la circulation
des poissons, dans les pertuis, vannages et passages d'eau à l'intérieur des bâtiments. La pêche est
également limitée depuis les barrages et écluses.
Les dispositions réglementaires encadrant la pêche de l?anguille sont maintenant définies dans le
cadre du plan anguille pris en application du règlement européen n°1100/2007 visant la reconstitution
du stock d'anguille.
DispositionP4A:Comptetenudeseffectifsconstatés,laconservationdespopulationsde
poissonsmigrateursamphihalinsfaitl'objetdemesuresd'interdictionouderestrictiondela
pêche.
Cettedispositions'inscrit dans lacontinuitédes interdictionsdepêcheeneaudouceétabliesou
reconduitesdanslePlagepomi20092013.
Comptetenudel'étatdespopulations,lesinterdictionstotalesdepêchedusaumonetdela
truitedemersontmaintenuesdansl'ensembleduterritoireduCogepomi,ainsiqu'enzone
maritimedanslazonedesdouzemilles.Lesinterdictionsdepêchedesalosesdanslebassin
delaSèvreniortaiseetdes lamproiesdanslesbassinsde laSèvreniortaise, de laLoire
bourguignonneetdelaMainesontégalementmaintenues.
Pour renforcer la cohérence des réglementations entre les domaines fluvial et maritime, des
restrictionsdepêcheeneauxsaléesdanslesestuairessontreconduites.
Enparticulier,lesquantitésdetimbresfiletspourlapêchedesalosesetdeslamproiesdansl'estuaire
delaLoireetenVendéesontplafonnées,auplusaunombreplafonddéfinientre2009et2013,soit
36unitésparespècedansl'estuairedelaLoire,et36unitésparespèceenVendée.
Pourl?anguille,lePlagepomipeutcompléterlaréglementationnationaleenvigueur,enparticulierpar
ladéfinitiondesmodalitésd'attributiondeslicencesdepêchedelacivelle.
Enfin,pouroptimiserl'applicationdecettedisposition,untravaildeprécisiondeslimitesdesaluredes
eauxseraengagédanslesestuairesduterritoireduCogepomioùcettelimiterestenondéfinie.
Disposition P4B: L'exercice de la pêche s'adapte au cycle biologique des espèces de
poissonsmigrateursamphihalins.
Lespériodesdemigrationetdereproductionconstituentdesphasesessentiellesdelavieeneau
douce des poissons migrateurs amphihalins. L'état des populations de poissons migrateurs
amphihalins devra être plus précisément caractérisé (données de captures, d'observation aux
stationsdecomptage...)(dispositionC3A).
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En fonction de cet état, des analyses multithématiques pourront envisager les conditions de
modificationdelaréglementationactuelledelapêchefixéeparladispositionP4A. Cesanalyses
intégreront aminimaunvolet technique, qui veillera àexaminer lesmodalités de gestionet de
contrôlede l'activité depêche, unvolet social et unvolet économique (tourisme, loisirs...). Leur
réalisationestconditionnéeàuneconcertationlargeaveclesacteurslocauxetassocieleCogepomi.
Laréglementationdelapêchedusaumonest,entreautres,viséeparcettedémarche.Auregardde
l?objectifduPlagepomi,touteéventuelleréouverturepartielledelapêchedusaumonnedevrapas
remettreencauselaviabilitédelapopulationsauvage.
Al?inverse,suiteàcesconcertationsetenfonctiondesniveauxdeseffectifs,afindepréserverune
pêchedurabledesespèces amphihalines, desactionsd'encadrement de l'exercicede la pêche,
pourrontêtreenvisagées.CesactionsserontcomplémentairesauxmesuresdeladispositionP4Aet
auxactionsdepréservationetderestaurationdeshabitatsliéesàlamiseenoeuvredesorientations
P1,P2,R1etR2.Ellespourrontportersurlamiseenplacederéservesdepêche,parexempleà
proximitédesouvragestransversaux,surdespériodesderelèvedesenginsoudesfiletssurles
zonesdereproductionconnuesoulesprincipauxaxesdemigrationsurunepartiedelapériodede
migrationactive,surdesmaillesminimales...
Lesconcertationssurdetellesactionsd?encadrementporteront,entreautressurlesaloses,dont
l'état de la population semble préoccupant au vu des effectifs comptés et des déclarations de
capturesparpêche.
DispositionP4C:Pourlacohérencedel'actionduPlagepomisurl'exercicedelapêche,la
coordinationinterservicesdanslaluttecontrelebraconnageestmaintenue.
Leseffortsdecontrôlepourluttercontrelebraconnagesetraduisentpardescontrôlesspécifiques
lorsdespériodesdemigrationsactivesoudephasedereposdespoissonsmigrateursamphihalins
endomainesfluvialetmaritime.Unevigilanceporteradansl?établissementdesplansdecontrôlessur
lesouvragescontrôlantl?accèsàd?importantessurfacesd?habitats,parexemplelesouvrageslistés
danslesmesuresdeladispositionR1C.
Laconnaissanceduterrain,parexempleissuedurôledeveilleenvironnementalequ?exercentles
pêcheurs,serautilementvaloriséeafind?optimiserlesopérationsdecontrôle.
Ces contrôles sont susceptibles d'être diligentés tout au long de l'année, quelle que soit la
réglementationdelapêchedel'espèceconcernée.
En accompagnement de cet effort de contrôle, une réflexion pourra conduire à une mise en
cohérencesurcertainssecteursdelaréglementationdelapêchedescarnassiersaveclaprésence
despoissonsmigrateursamphihalins,afinderéduirelesrisquesdecapturesaccidentelles.
DispositionP4D: Lesactivitésdanslescoursd?eau tiennent comptede laprésencedes
espècesdepoissonsmigrateurs.
Afin de préserver la reproduction, le développement et les migrations des poissons migrateurs
amphihalins,lesactivitésencoursd'eauveillentàéviterouréduireledérangementdespopulations.
Defait,cettedispositionconcerneentreautreslesdéversementsdepoissonsholobiotiques,lapêche
etlespratiquessportives.
Ilconvientdelimiterleurimpactsurlespopulationsdepoissonsmigrateurs,cequipassepar:
? l'intérêtdudéveloppementdesynergiesentrelePlagepomietlesplansdépartementauxpour
laprotectiondumilieuaquatiqueetlagestionpiscicole(PDPG)auniveaudépartemental;
? l'évaluationdesincidencesensiteNatura2000.
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DispositionP4E : Lesanimauxexotiquesenvahissantspeuvent, encasd?impact sur les
effectifsdepoissonsmigrateursamphihalins,fairel?objetdemesuresderégulation.
Cettedispositionneconcernepaslesespècesprotégées,commelecormoran(Phalacrocoraxcarbo
sinensis)quipeuventfairel?objetd?unerégulationparautorisationdetirsdeprélèvement.
Elle portespécifiquement sur lesespèces, essentiellement dans le cortègepiscicole, et dont la
croissancedeseffectifsexerceunepressionsusceptibledemenacerleséquilibresdespeuplements
enplace,etainsidecompromettrel?atteintedel?objectif deviabilitédespopulationsdepoissons
migrateursamphihalins.
Aprèsdémonstrationdeleurpressionsurlespopulationsdepoissonsmigrateursamphihalins(surla
base,entreautres,desconnaissancesacquisesdanslecadredeladispositionC1E),cesespèces
animalesenvahissantespeuventfairel?objetdemesuresderégulation.
4.6 OFR:Reconquérirleshabitatsfavorablesauxespèces
amphihalinesetrestaurerlespopulations
4.6.1 OrientationR1:Restaurerlescircuitsdemigrationsentrel'océanetleszones
d'habitatsproductifs.
Comptetenudesévolutions,encorepeuconnuesetdifficilementmaîtrisablesactuellement,de la
phasedeviemarinedespoissonsmigrateursamphihalins,ilconvientdefaciliteraumaximumles
migrationsdespoissonsdanslescorridorsfluviauxaucoursdeleurphasedeviedulçaquicole,en
prioritédanslesbassinsversantsmodérémentanthropisés,lescoursd'eauclassésenliste2autitre
del'articleL.21417ducodedel'environnementpour lespoissonsmigrateursamphihalinset les
coursd?eaudelazoned?actionsprioritairespourl?anguille.
Larestaurationdelalibrecirculationmigratoiredoitêtrepenséeàl'échelled'uncoursd'eau,dans
une logique d'axe qui tienne compte des impacts cumulés des ouvrages de franchissements
successifs,àlamontaisonetàladévalaison.
Lesobligationsderésultatsquiaccompagnentcetteorientationjustifientlamobilisationdemoyensde
contrôledurétablissementdelalibrecirculation.
Cetteorientations'articuleavecl'orientationfondamentale9duSdageLoireBretagne20102015qui
portesurlaréouverturedescoursd'eauauxpoissonsmigrateurs.
Elles'appuieégalementsurladisposition1B1duSdageLoireBretagne20102015quiprévoitque
lesSagecomprennentunobjectifdatéetchiffrépourlavaleurdutauxd'étagementducoursd'eau,
définicommelerapportentrelasommedeshauteursdechutesartificiellescrééesenétiageparles
obstaclestransversauxetledénivelénaturelducoursd'eau.
Rappelréglementaire :
L?applicationdelaréglementationexistanteconstitueunprérequisessentielduPlagepomi
20142019.Entreautres,ilestrappelélaréglementationsuivante:
Lescoursd'eauclassésenliste2autitredel'articleL.21417duCodedel'environnementdoivent
faire l'objet d'interventions permettant le transport suffisant des sédiments et la circulation des
poissonsmigrateurs(cf.paragraphe3.3.1).
Lamiseenconformitédesouvrages,leurgestionetleurentretienfontl'objetdecontrôlesplanifiés
danslesplansdecontrôledesMISEN.
Ilestrappeléquelestravaux,parexemplelaconstructiond'unepasseàpoissons,fontl'objetde
procèsverbauxderéception,cequicontribueàgarantirlaconformitédesaménagementsavecle
projetautorisé.
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Entermesderestaurationdelacontinuitéécologiqueetdegestiondesouvrages,lesSagepeuvent
établir un inventaire des ouvrages hydrauliques susceptibles de perturber de façon notable les
milieux aquatiques. Parmi cet inventaire, ils peuvent identifier dans leur règlement les ouvrages
hydrauliques fonctionnant au fil de l'eau, qui, sauf raisons d'intérêt général, sont soumis à des
obligations d'ouvertures régulières de leurs vannages (article L.212-5-1 du Code de l'environnement).
Disposition R1A: Les interventions sur les ouvrages aux fins de rétablissement de la
continuitéécologiquerépondentauxprioritésd'interventionssuivantes:
1) effacement;
2) arasementpartieletaménagementd'ouvertures,petitsseuilsdesubstitutionfranchissables
parconception;
3) ouverturedebarragesettransparencepargestiond'ouvrages;
4) aménagement de dispositif de franchissement ou de rivière de contournement avec
obligationd'entretienpermanentetdefonctionnementàlongterme.
Cettedispositiontrouveunrelaisavecladisposition9BduSdageLoireBretagne20102015.Sa
reconduitedansleSdage20162021devraêtrerecherchée.
A défaut de solutions alternatives, l'équipement d'un ouvrage par un dispositif de
franchissementestétudié.Laconceptiondesouvragesdefranchissementrecherche:
? leuradéquationauxespècesciblesdevantêtreprisesencompte,avecuneefficacitéattendue
suffisante;
? desfranchissementsaveczéroretardàlamontaisonetàladévalaison;
? l'entretien (retrait des embâcles, maintien du débit d?alimentation prescrit dans le règlement
d?eau) le moins important à efficacité suffisante afin de faciliter l'atteinte de l'objectif de
fonctionnalitépérennedesdispositifsdefranchissement;
Le projet s'accompagnede la mise enoeuvre par le propriétairedu suivi du fonctionnement du
dispositifdefranchissement,ainsiquedesonentretienafind?assurerunefonctionnalitépérenne.
Laconformitédelaconceptiondesouvragesdefranchissementauxobligationsréglementairesetà
cettedispositionestvérifiée,etconditionneleversementdesaidespubliquespourlaréalisationdes
aménagements.
DispositionR1B:Ledéveloppementd'unevisionprospectiveparcoursd'eauestrecherché,
afindepermettrelapropositionàl'échelledechaqueouvraged'uneinterventionquiprenne
encomptel'impactcumulédutraitementpourlamontaisonetladévalaisondel'ensembledes
ouvragessituéssurlecoursd'eau.
Cette disposition recommande le développement de logiques d'axe afin de réduire les impacts
cumulés des différents ouvrages sur la circulation piscicole, allant de pair avec les objectifs de
réductiondestauxd'étagement.
Ledéveloppementd'étudesàl'échelledescoursd'eauestàencouragerdanslecadredelamiseen
oeuvredesSage,voireeninterSageaucasoùplusieursSageexisteraientsurunmêmecoursd?eau,
enparticulier sur lesbassinsversantsoùsont présentesdespopulationssauvagesdepoissons
migrateursamphihalins:Allieretsesprincipauxaffluents,Cher,Creuse,Gartempe,Loir,Mayenne,
Sarthe,Sèvreniortaise,Vienne,Loire et ses affluents et notamment la Loire Bourguignonne et ses
affluents.
Cesétudes permettent aussi d'intervenir en priorité sur les ouvrages les plus difficiles pour les
migrations,enveillantàl'accessibilitéàl'ouvragedepuisl'avaldubassinversant.Ellespeuventainsi
utilementparticiperàlaconstructiondesprogrammesd'actionspourlarestaurationdelacontinuité
écologique que doivent prévoir les Sage, en application de la disposition 1B1 du Sdage
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LoireBretagne20102015.
Pourlescoursd'eauàmigrateursdubassindelaLoireetnoncouvertspardesSage,larecherche
demaîtrised'ouvragesetdefinancementsestsoutenuedanslecadreduPlagepomi.
La mise enoeuvre des logiques d'axe doit aussi s'accompagner de l'établissement d'indicateurs
permettantdesuivrelaréalisationduprogrammed'actionsetdefaireétatdesprogrèsobtenus,en
termesderéductiondel?étagementetdufractionnementdesmilieuxaquatiques,parexempleen
caractérisant l?impact des ouvrages sur les habitats (disposition C1B) ou sur les migrations
(dispositionC2C).
LeCogepomiencouragel'intégrationdecettedispositiondansleSdageLoireBretagne20162021.
DispositionR1C:Lamiseenoeuvreduclassementenliste2parl'arrêtédu10juillet2012,
conduitleCogepomiàporteruneattentionparticulièresurcertainsouvrages.
Lesouvragesconcernés,listésdansletableaudemesures,sontnotammentceuxquisontconsidérés
aujourd'huicommedifficilementfranchissablesetquisontsituésàl'exutoiredesousbassinsversants
ouderéseauxdemaraisoùsetrouventdeszonesdereproductionoudecroissancedespoissons
migrateursamphihalins.
Lamiseenoeuvredesobligationsréglementairesvisàvisdutransitsédimentaireetdelacirculation
piscicole(facilitationourétablissementdel'accèsauxzonessituéesenamont)surcesouvragesest
susceptibled'entraînerlesgainslesplusimportantsentermesdeproductivitépourlespopulationsde
poissonsamphihalinsetceàl'échelledel'ensembledubassin.
L'exercicede la policede l'eau tient comptedecettevigilanceparticulière, après informationdes
servicesquienontlachargeparleCogepomi.Unsuiviannueldel'avancementdesopérationssurles
ouvragesconcernésesteffectuéparleCogepomi.
DispositionR1D:Lagestionhydrauliqueglobaleàl'échelledescoursd'eaudesouvrages
transversauxetdesouvragesdeconnexionsentrecoursd'eauetzonesdemaraisestadaptée
afindetenircomptedescyclesbiologiquesdespoissonsmigrateursamphihalins.
Cette disposition à portée de recommandation vise à améliorer la gestion pour aider au
franchissementdesouvrages(arrêtsdeturbinage,ouverturesdevannes...).
Lesmanoeuvresd'ouvragespouvantêtreutilesàlacréationd'attraitspourlesmigrationsciblentles
périodesdemigrationactivedespoissonsamphihalinsprésents,préciséesendispositionP1C.
Danslecasdesouvragescôtiersetestuariens(soumisàlamarée),ces manoeuvres spécifiques
peuvent être mises en oeuvre pour permettre leur franchissement par les poissons migrateurs,
notamment lescivellesenphaseprécocedurecrutementoù leurprogressiondans lesestuaires
s'effectueparmigrationportée.
Par ailleurs, lesmanoeuvres desouvragessont favorablesaumaintienouà la restaurationdes
connexions entre cours d'eau et zones humides et favorisent la reconquête d'une mosaïque
fonctionnelled'habitats.
Cesmanoeuvresdoiventêtreadaptéesàlaconfigurationdel'ouvrage,sasituationetauxcontraintes
liées aux usages existants sur cet ouvrage. Elles peuvent être programmées en complément
d'aménagements«passifs»telsquel'ouverturedevantelles,d'échancruresoulaposedecalessur
lesélémentsmobilesdel'ouvragependantlapériodedemigration,afind'éviterl'accumulationdes
civellesenavaldel'ouvrage,oùellessontsurexposéesàlapêcheetàlaprédation.
Dans le cas particulier des ouvrages à usage hydroélectrique, une gestion des turbines peut
contribuer à réduire leur impact sur lespoissonsamphihalins lors despériodesdemigrationde
dévalaison.Desarrêtstemporairesdesturbineshydroélectriquespeuventainsiêtreprogrammés,de
manière synchronisée à l'échelle d'un axe migratoire, afin de limiter les mortalités directes et
indirectes liées au franchissement des turbines par les poissons migrateurs, en fonction de la
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configurationdel'ouvrageetdesonmoded'exploitation.
L'applicationdecettedispositioninviteàintégrerlesmodalitésdegestiondesouvragesdansles
règlements d'eau, éventuellement au terme d'une phase d'expérimentation des dispositifs de
franchissementsurplusieurssaisonsdemigration.
Lamiseenoeuvredecettedispositionpeuts'inscriredanslecadredes«logiquesd'axe»,dontle
développementestencouragéparladispositionR1B.
Disposition R1E: La gestion des écoulements se rapproche le plus possible du
fonctionnement naturel des bassins versants et des cours d'eau, afin de restaurer les
variabilités du régime hydrologique et de ne pas compromettre la reproduction, le
développementdesjuvénilesetlesmigrationsdespoissonsmigrateursamphihalins.
Lesvariationsdel'hydrologie,entreautreslesmontéesrapidesdedébit,sontunesourcedestimulià
mêmededéclencherdesmouvementsdemigrationsàlamontaison(entréeenestuaire,reprisede
migrationaprèsl'arrêtmigratoireestivalpourlesaumon)etàladévalaison(observationdespicsde
migrationdesanguillesargentéesetdessmoltslorsdespériodesdecruehivernaleouprintanière).
Une gestion rapprochée du régime naturel permet aussi de faciliter la circulation des crues
morphogènes,profitablesàunrenouvellementdeshabitats.
Cettedispositions'articuleavecladispositionP2Cquiportesurlemaintiendutransitsédimentaire,
afinquelagestiondesouvragessoitcompatiblelepluspossibleaveclescyclesbiologiquesdes
poissonsmigrateursamphihalins.Ellecomportedeuxvolets:
? l?un,surlesmanoeuvresdegestiondesouvrageshydrauliques;
? l?autre,surlagestiondesplansd?eau,susceptiblesd?affecterl?hydrologienaturelle.
Surlepremiervolet,ilconvientquelesmanoeuvresdegestiondesouvrageshydrauliquesévitentles
réductionsnonnaturellesdedébitsusceptiblesdeprovoquerunebaissesignificativedeshauteurs
d'eauenpériodedereproduction,afindeprévenirlesexondationsdenids.
Pourlesouvragesoùdesécluséessontpossibles,lesrèglementspeuventpréciserlesconditions
éventuellesdelimitationdeseffetsdesécluséesenpériodedereproductionetd'incubationdesoeufs.
Surlesecondvolet,ilconvientderechercherunegestionlaplusnaturellepossibledesouvragesà
vocationdesoutiend'étiagedansunelogiquederecherched'unfonctionnementhydrologiquequisoit
lemoinsartificialisépossible.Ensubstance,ils?agitderéduirel?impactduremplissagedesréserves
enpériodedemigrationactive.Celaserarecherchédanslalimitedurespectdesobjectifsassignésà
cesouvrages.
Aussi, et compte tenu de l?interception des écoulements gravitaires par les plans d?eau, cette
disposition invite à étudier un renforcement des modalités d?encadrement et de limitation de la
créationdenouveauxplansd?eaudansleSdageLoireBretagne20102015,enparticulierdansles
bassins versants des cours d?eau nécessitant la protection complète des poissons migrateurs
amphihalinsoùladensitédeplansd?eauestdéjàimportante.
4.6.2 OrientationR2:Reconquérirdeshabitatsfavorablesdansl'airederépartition
connuedesespècesamphihalines.
Lesmesuresderestaurationdelacontinuitéécologiquebénéficientauxhabitats,entreautresparla
restaurationdeladynamiquesédimentaire.
Ellesnesauraientcependantêtresuffisantes;desmesuresspécifiquesderestaurationdeshabitats
dereproductionetdedéveloppementdesjuvénilessontproposéesdanscetteorientationR2.
L'orientationR2seretrouvedansplusieursdispositionsduSdageLoireBretagne20102015.Eneffet,
sa disposition 1B1 prévoit que les Sage établissent un plan d'actions identifiant les mesures
nécessairesàlarestaurationdelacontinuitéécologique.Parextension,larestaurationdelaqualité
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physique et fonctionnelle des cours d'eau suppose d'intervenir dans tous les domaines qui
conditionnentl'habitatdesespècesvivantdanslesrivières.Ladisposition8A2prévoitaussiqueles
Sageouàdéfaut lespréfets identifientlesprincipesd'actionsàmettreenoeuvrepourassurerla
préservationetlagestiondeszoneshumides.
DispositionR2A:Aprèsconcertationlocale,lesdocumentsdeplanificationpeuventdéfinir
des objectifs spécifiques de qualité des eaux sur les secteurs de reproduction et de
développementdesjuvénilesdespoissonsmigrateursamphihalins.
L?incubationdesoeufsetlaviedestaconssontdesétapesessentiellesducycledeviedusaumon.
Afindetenircomptedeleursexigencesspécifiques,uneexigenceparticulièredequalitédeseaux
peut voir le jour dans les bassins versants où se trouvent des zones de reproduction et de
développementdesjuvéniles.
CettedispositionàvaleurderecommandationconcerneenparticulierlesaumondeLoireAllier.
Cette recommandation accompagne ainsi l'enjeu de conservation des populations de poissons
migrateursamphihalinsetcomplète ladispositionP2A.Elleavocationàêtredéclinéedansdes
sousbassinsversantsprécis,enfonctiondel?enjeuexistantpourlesespècesamphihalinesetdes
concertationsmenéesaveclesCLE,danslecadredeladispositionG2A.
Lesobjectifsdequalitéspécifiques,quiseraientdéfinisàl'échellelocaleetenconcertation,pourront
visernotammentlesparamètresd'oxygénation(oxygènedissous,demandebiologiqueenoxygène)
et lesnutriments(ammonium,orthophosphates)etleurpropositions'appuierasurlesexpériences
étrangèresetlesconnaissancesscientifiques.
Disposition R2B: Les bassins versants, où se situent des zones de reproduction et de
croissance d'espèces de poissons migrateurs amphihalins, font l'objet d'opérations de
restaurationdel'hydromorphologie,lorsquecelleciestaltérée.
Lesopérationssontproposées,conformémentà l'orientation1B1duSdageLoireBretagne2010
2015àl'échellecohérented'unbassinversantdanslecadred'unSagequandilexisteetcontribuent
aupland'actionsduSageenfaveurdelarestaurationdel'hydromorphologie.
Pourlamiseenoeuvredecettedisposition,ilestrecommandédansunpremiertempsnotammentla
réalisationdesopérationssuivantes,comptetenudeleurintérêtpourlaremobilisationsédimentaire,
sousréservedescontraintesdesécurité,desalubritépubliqueetderespectdesusages:
? l'effacementdesobstaclesàl'écoulement;
? l'arrêtdelaprotectiondebergespardestechniquesautresquevégétales;
? laluttecontrel'ensablementetlecolmatage,tellequelaréductiondupiétinementdesbergespar
lebétailoudel'abreuvementdirectementdanslecoursd'eau.
Cette disposition est susceptible de concerner notamment les têtes debassins versants dans le
bassindel'Allier,lesbassinsdelaVienneetdelaCreuse,ainsiquelesbassinsversantsdelafaçade
atlantique(côtiersvendéens,LoireavaletSèvreniortaise),oùsetrouventlesmaraisrétrolittoraux,et
laLoiremoyenneoùsetrouventdenombreusesannexeshydrauliques.
Enzonedemarais,larestaurationdel'hydromorphologiepourrapasserpardesopérationsd'entretien
desétiersetdesfossés.
Dans un second temps, cette disposition pourra se traduire par la possibilité d'interrompre toute
protectiondebergesdansl'optiquedemaintenirunespacedemobilitésuffisantpourlecoursd'eausi
cedernierestuneconditiondel'atteintedubonétat.
En parallèle, une réflexion pourra s?ouvrir sur la prise en compte de la présence de poissons
migrateursamphihalins(zonesdenurserieetdenourricerie)dansladéfinitiondesplansdedragage
enzoneestuarienneetmaritime.
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LeCogepomiencouragelareprisedecettedispositiondansleSdage20162021afindefavoriserla
restaurationdespopulationsdepoissonsmigrateursamphihalins.
4.6.3 OrientationR3:Accompagnerlareconquêted?habitatsproductifset
accessiblespardesopérationsdesoutientemporaired?effectifenjuvéniles
L'originalitéécobiologiquedespopulationsdepoissonsmigrateursamphihalinsrendessentiell'intérêt
depréserverlespopulationsenplaceetd'éviterleurextinctionpardesopérationsdesoutiendes
effectifs.Cesopérationspeuventavoirlieulorsquel'effectifnaturelestjugéinsuffisantpourassurerla
viabilitépérennedespopulationssauvagesetqu'iln'existepasd'incompatibilitétechniqueàleurmise
enoeuvre.
L?objectif du soutien d?effectif est d?intervenir en accompagnement temporaire d?opérations de
restaurationdeshabitatsproductifsetdeleuraccessibilitémigratoireafindepermettredesoutenirla
population sauvage résiduelle (logique de conservation) jusqu?à son niveau de viabilité ou de
participer à l?implantation d?une population sauvage sur un sousbassin versant (logique de
réintroduction).
Il est important deveiller àcequeles individusdéversésdans lecadred'opérationsdesoutien
d'effectifcontribuentàlareproductionenmilieunaturellorsducyclesuivantetqueleurdescendance
soitenmesuredefairedemême.
DanslesbassinsdelaLoire,delaSèvreniortaiseetdescôtiersvendéens,desopérationsdesoutien
d'effectifontlieupourlesaumondepuislesannées1970etpourlacivelledepuis2010.
Lesoutiend'effectifenjuvénilesdesaumonsafaitl'objetd'unrenforcementaudébutdesannées
2000,décidéparleministèreenchargedel'environnementle13juillet1994,ets'esttraduitparla
miseenservicedelasalmonicultureduHautAllier,leConservatoirenationaldusaumonsauvage.
Cettedécisionreposaitsurleconstatderisqued'extinctionélevédelapopulationsauvagesuiteà
quatreannéesconsécutivesdesécheresse,de1989à1993,aucoursdesquellesl'effectifannuelde
saumonsn'étaitqued'unecentained'individusdansl'Allier.
Lacivellefaitl'objetdepuis2010,danslecadreduPGA,d'unprogrammeexpérimentaldesoutien
d'effectif.Eneffet,laFranceadécidélamiseenplaceàtitreexpérimentald'opérationsdetransfert
decivellesdanslesdifférentsbassinshydrographiques.Cesopérationssontmisesenoeuvresous
l'égideduministèreenchargedel'écologie.Ellesportentsur5à10%desanguillespêchéesen
France.Pourl'unitédegestiondel'anguilleLoire,côtiersvendéensetSèvreniortaise,desopérations
sont réalisées depuis la saison de pêche 20102011 sur plusieurs cours d'eau et marais,
principalementenLoireAtlantiqueetenVendée.
Les dispositions d'évaluation des opérations de soutien d'effectif sont traitées dans l'orientation
fondamentalerelativeàlaconnaissance(OFC).
Ausujetdesopérationsdesoutiend'effectif, leSdageLoireBretagne20102015préciseparses
dispositions 9C1, 9C3 et 9C4 que les opérations de soutien d'effectif relatives aux poissons
migrateursamphihalinssont réaliséesconformémentauPlagepomi. Il indiqueégalementque les
massesd'eauentrèsbonétatnedoiventfairel'objetd'aucuneopérationdesoutiend'effectifetque
les masses d'eau en bon état ne peuvent accueillir une opération de soutien d'effectif que si
l'opérationneconduitpasàunedétériorationdel'étatdelamassed'eauouàuneremiseencause
del'objectiffixépourcettemassed'eau.
Disposition R3-A : Les programmes de soutien d?effectif intègrent les recommandations
scientifiques connues ou pouvant être émises lors de la mise en oeuvre du Plagepomi, et
s'appuient sur le maintien et l'amélioration des connaissances zootechniques.
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Les recommandations à prendre en compte pour les opérations de soutien d'effectif (saumon,
civelles...) sont issues notamment des travaux de groupes d'experts scientifiques, nationaux et
internationaux(commeleConseilscientifiquedusaumondeLoireAllier),etsonttraduitesdansles
documentsdecadragedesopérationsdesoutiend'effectif.Ellesconcernententreautreslaconduite
d'élevageetl'évaluationdesopérations,avecenparticulierdesexigencesenmatièrede:
? originedesgéniteurscontribuantàlaproductiondejuvéniles;
? élevage,afindeserapprocherdesconditionsnaturelles;
? priorité d'élevage: par exemple, l'intérêt biologique supérieur des stades de développement
précoces(oeufs,alevins)pourlesopérationsdesoutiend'effectifenjuvénilesdesaumon;
? stratégie,appropriéeàchaquebassinversant;
? évaluation des opérations, afin de qualifier leur contribution à la restauration des effectifs:
traçabilitédesjuvénilesparmarquagephysiqueouparanalysegénétique.
L'ensembledesrecommandationsscientifiquesconnuesàl'adoptionduPlagepomi20142019sont
respectées et des adaptations seront prévues dans sa mise en oeuvre en cas de nouvelles
recommandationsscientifiques,sousréservedefaisabilitétechniqueàcoûtraisonnable.
Lamiseenoeuvreopérationnelledecesrecommandationsveilleàtenircomptedel'évolutiondes
connaissanceszootechniques, qui profite de l'amélioration des connaissancessur la biologie des
poissonsmigrateursamphihalins(dispositionC2B).
Disposition R3B: Les programmes de soutien d?effectif respectent la logique de
nondégradation du milieu aquatique (capacités des habitats, interactions avec les
populationspiscicolesenplace?).
Lesprogrammesdesoutiend'effectifdetouteespèceamphihaline(civelles,saumon...)s'inscrivent
dansleprincipedenondégradationdumilieuaquatique.
Enparticulier, ilstiennentcomptedescapacitésd?accueildeshabitatsetdesinteractionsavecla
populationsauvageetlesautrespopulationspiscicolesprésentesdanslescoursd?eau.
Entreautres,il estnécessairedelimiterl'impactdusoutiend'effectifsurlareproductionnaturelle.
Ainsi,encequiconcernelesaumon,lesopérationsdesoutiend'effectifnedoiventpassaturerles
habitatshébergeantdesfrayèresnaturelles, etdeszonesrefuges,sanssoutiend'effectif dansle
cadredesprogrammesrépondantàl?orientationR3,peuventêtremisesenplace.Encomplémentde
lazonerefugeexistantedepuis2009dansleHautAllier,denouvelleszonesrefugesnepeuventêtre
délimitées quesi le linéaire de cours d'eauconcernépar leur emprise cumule les trois critères
suivants:
? uneaccessibilitéavecunretard,dûaufranchissementdesobstaclesàl'écoulement,inexistantou
limitéàlamontaison;
? dessurfacessuffisantesd'habitatsproductifs;
? l'absenced'obstaclesmajeursàladévalaisonversl'océan.
Leprogrammedesoutiend'effectif encivelles respecte, au droit dessites dedéversement, les
densitésmaximalesdedéversementprévuesdanslecadreduprogrammenationalderepeuplement.
Leprogrammedesoutiend'effectif ensaumondistingueledéversementdejuvénilesàdifférents
stadesdedéveloppement:
? lestadesmoltest,auvudelalittératurescientifiqueetdesélémentsd?évaluationdisponibles,le
stadeprésentantlemoindreintérêtbiologiquepourparticiperàlaconservationdelapopulationde
saumons sauvages de LoireAllier. L?effort de soutien d?effectif en smolts doit être réduit
progressivement sur lessecteursoùdeshabitatsproductifssont suffisammentprésentsetoù
prévautl?enjeudeconservationdelapopulationdesaumonssauvages(bassinsdel'Allieretdela
Loirebourguignonne).
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Lesoutiend?effectifaustadesmoltprésenteenrevancheunintérêtdanslesbiotopesdégradés,
oùleprogrammedesoutiend?effectifrépondàl?enjeuderéintroductiond?unepopulation(bassin
delaGartempe);
? les stades précoces de développement, et notamment le stade de l?alevin de printemps,
constituentlaprioritéduprogrammedesoutiend?effectifrelativementàl?enjeudeconservationde
la population de saumons sauvages (bassins de l'Allier et de la Loire bourguignonne). Sous
réservedelaconnaissancedeshabitatsproductifsetenrespectdel'ensembledel'orientationR3,
l'effortdesoutiend'effectifpourraitêtrerépartisurcertainsaffluentsdesaxesprincipaux;
? les oeufs en incubateurs constituent des expérimentations accompagnant la stratégie du
programmedesoutiend?effectifetpourlesquellesundispositifd?évaluationspécifiqueestmisen
place,afind?êtreenmesuredestatuersurleurintérêt(dispositionC4A).
Dansuneapprochepragmatique,afindepleinementvaloriserlesopérationsdesoutiend?effectif,
menéesenparallèledesopérationsprioritairesdepréservationetderestaurationdeshabitatsetde
la continuité écologique, touteopération dedéversement chercheraàoptimiser l?occupation des
habitats productifs favorables disponibles et est adaptée en fonction de la répartition de la
reproductionnaturelle et de l?évolution desconnaissances, entreautresdeshabitats(disposition
C1C).
DispositionR3C:Leprogrammedesoutiend?effectifensaumonsprivilégielaproductionde
juvénilesissusdegéniteurssauvagesetrechercheuneadaptationauxbesoinsdesoutien
annuel.
Afinderechercherunéquilibrebiologiqueentrelareproductionnaturelleetlesoutiend'effectif,sous
réservedefaisabilitétechnique,lesbesoinsdesoutiend'effectifvarierontenfonctiondusuccèsdela
reproductionnaturelle.
Schématiquement, la mise en oeuvre de cette approche dans la deuxième partie du Plagepomi
20142019pourraitconduirelesannéesoùestconstatéeunefaibleactivitédereproductionnaturelle
àuneaugmentationdel'effortdesoutiendeseffectifsetlesannéesoùestconstatéeuneforteactivité
dereproductionnaturelleàunplusfaibleeffortdesoutiend'effectif.Cetteapprocherequiertdedéfinir
les besoins préalables en termes de connaissanceet d'analyser sa faisabilité techniquedans la
mesureoùellenécessiteunecapacitéd'adaptationrapideauxobservations.Ellepourraitsetraduire
parunsoutiend'effectif quiciblerait préférentiellement leszonesd'habitat lesplusproductivesles
annéessuivantunefaiblereproductionnaturelle.
4.7 OFC:Améliorerlesconnaissancesetlesuividespopulationsdans
uncontextedechangementglobal
L'acquisitiondeconnaissancesconstitueunpilierduPlagepomi:mieuxconnaîtrelecomportementet
les habitats des populations de poissons migrateurs amphihalins permet en effet de retenir des
mesures de gestion adaptées afin de rechercher une efficacité maximale. Cette orientation
fondamentale s'inscrit en appui des deux orientations fondamentales précédentes relatives à la
préservationetàlarestaurationdeshabitatsetdeseffectifsdepoissonsmigrateursamphihalins.
Les opérations de suivi font l'objet d'échanges techniques et les protocoles font l'objet d'une
validation après concertation des partenaires concernés. Les informations acquises (donnéeset
résultatsinterprétés)sontmisesàdispositiondesgestionnairesetsontnotammentvaloriséesaux
finsd'éclairagedesprisesdedécisionsenmatièrederestaurationetdepréservationdesmilieux
aquatiques.
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4.7.1 OrientationC1:Renforcerl'évaluationetlacompréhensiondeladépendance
despoissonsmigrateursamphihalinsàleurshabitats
Laqualitédeshabitatsetleuraccessibilitésontdesfacteursexplicatifsessentielsdel'abondancedes
populationsdepoissonsmigrateursamphihalins.Aussiestilindispensabledepoursuivrelesefforts
decompréhensiondesrelationsentrelesespècesetleurshabitats,eneaudouce,enestuaireeten
mer,afind'êtreenmesuredeproposerdesmesuresdegestionquisoientlesplusadaptéesaux
contexteslocauxetd'éclairerlesorientationsfondamentalesPetRencequ'ellesconcernentles
habitatsetlescircuitsdemigrations.
Disposition C1A: Les connaissances acquises dans le cadre d?actions en faveur de
l?améliorationdesmilieux(programmedesurveillancedel?étatécologiquedeseaux,études
produites dans le cadre des Sage ou des contrats territoriaux en faveur des milieux
aquatiques?)sontexploitéesetvaloriséespourlesbesoinsduplandegestiondespoissons
migrateurs, afin d?êtreenmesuredeproposer, aubesoin, desmesuresd?évitement et de
réductiondesimpacts.
Lerassemblementdesconnaissancesacquisespardifférentsopérateurssurlaqualitédesmilieux
(suivisencontinudesdébitsettempératuresdel?eau,suivispérennesdelaqualitédeseauxparle
réseaudecontrôledesurveillance,suivisdesrejetsdestationsdetraitementdeseauxuséespar
autosurveillance?)estincontournablepourlamiseenoeuvredecettedisposition.
Enparticulier,ilconvientd?établirunbilandesconnaissancesacquisesdanslecadredel?élaboration
oudelamiseenoeuvredesSageetdescontratsterritoriauxenfaveurdesmilieuxaquatiques.
Lacapitalisationdecesinformationspermetdecaractériserl?étatdefonctionnalitédeshabitatsdes
poissonsmigrateursamphihalinsetdeproposerencasdeconstatdedégradationdesmesuresde
restauration.
Aubesoinetsousréserved'identificationdeleursbénéficesopérationnels,lafaisabilitéd'opérations
complémentairesd'étudesetdesuivisdesmilieuxdeviedespoissonsmigrateursamphihalinsest
étudiéedanslecadreduPlagepomi.
DispositionC1B:Les impacts des pollutions, des ouvrages et des plans d'eau sur le cycle de
vie des poissons migrateurs amphihalins font l'objet d'une caractérisation.
Lamiseenoeuvredecettedisposition,àl'interfaceentrelaqualitédesmilieuxaquatiquesetlecycle
deviedespoissonsmigrateursamphihalins,accompagnel'orientationR2etnotammentladisposition
R2A.
Ellesetraduitnotammentpardesopérationsinsituetexsitudesuivisdesimpactssurlasurvieetle
développement des juvéniles, et contribue à améliorer la connaissance des impacts des
perturbateursendocrinienssurlesespècesamphihalines.
Lesélémentssontportésàlaconnaissancedupublicetéclairentlesdécisionsprisesenregarddes
mesuresdesdispositionsP1B,P2CetR2A.
Disposition C1C: La connaissance qualitative et quantitative des habitats vitaux des
poissonsmigrateursamphihalinsdansleurphasedeviedulçaquicoleestactualiséepourdes
coursd'eauconnusoudécritepourdenouveauxcoursd'eau.
Cettedispositioncomprendunvoletd'approfondissementdesconnaissancesdeshabitatsdescours
d'eauoùdesétudespasséessontdisponibles.Desopérationspeuventyavoirlieudanscecadresi
des divergences sont constatées entre les observations de terrain et les études actuellement
disponibles.
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Lesétudesquipourraientêtremenéessurdescoursd'eauoutronçonsdecoursd'eaunondécrits
précisément actuellement pourront viser des secteurs de présence historique des espèces
amphihalinesoùlebonétatdesmassesd'eaupourraitjustifierunintérêtdereconquête.
Lesconnaissancesacquisesdanslecadredecettedispositionpourrontêtremobiliséesenappuides
orientations P1, P2, R1 et R2, afin de préserver les habitats favorables sur ces cours d'eau
nouvellementcaractérisésetdetravailleràlarestaurationdelacontinuitéécologiquedanscescours
d'eaupourpermettreauxpoissonsmigrateursamphihalinsdereconquérirceshabitats.
Lesétudesprospectivesquiconsistentàidentifierlesterritoiresàpotentield?accueilenamontde
verrous infranchissables peuvent accompagner les démarches de restauration des poissons
migrateurs,bienquelesterritoiresvisésparcesétudesprospectivesneconstituentpasdespriorités
de reconquêtedans le cadreducorpus réglementaire actuel (coursd'eaudeces territoiresnon
classés en liste 2 au titre de l'article L.21417 du code de l'environnement pour une espèce
amphihaline).
Toute étude menée sur un cours d'eau ou tronçon de cours d'eau non décrit précisément
actuellement intégrera un volet technique et un volet économique, afin d'évaluer le coût d'une
éventuelleopérationdereconquête.
Disposition C1D: Le changement climatique et ses effets sur l'évolution des milieux
aquatiques, lespratiquesdansles bassinsversants, l'adaptationdespoissonsmigrateurs
amphihalinsetlesmodificationséventuellesdesairesderépartitiondespoissonsmigrateurs
amphihalinsquelacombinaisondesprécédentsélémentspeutengendrerfont l'objetd'un
suiviparleCogepomi.
Parsuivi,ilconvientd'entendredeuxniveauxd'implicationduCogepomi:
? lerassemblementdesinformationsetétudesproduitessurlechangementclimatiquetraitantde
l'hydrologie,durégimethermique,descouverturesvégétalesetdelabiologiedesespèces;
? la mise en place éventuelle d'opérations spécifiques centrées sur les poissons migrateurs
amphihalinsdubassindelaLoire.
Cettedispositionrevêtégalementunintérêtderétrospectivehistoriquequipermettraitd'identifierdes
évolutionsmajeurespouvantexpliquerenpartie lesévolutionsquiontpuêtreconstatéessur les
effectifsdepoissonsmigrateursamphihalins.
Ces connaissances éclairent notamment les orientations P2 et P3 afin d'éviter d'accroître toute
dégradationetfournissentdespistesdetravailenfaveurdelarestaurationdeshabitats(orientation
R2).
DispositionC1E: L'évolution de la colonisation des bassins par les espèces envahissantes
fait l?objet d?une caractérisation et d?une évaluation de ses impacts.
Lesespècesenvahissantes,nativesouexotiques,sontsusceptiblesd'engendrerdesmodifications
d'équilibresauseindeshabitatsetdelachaînetrophiquepouvantsetraduirepar:
? desfermeturesd'habitats;
? des prédations accrues sur les poissons migrateurs amphihalins, parfois par des prédateurs
«émergents».
DeséchangessedéveloppententreleCogepomietlesréseauxdesuividesespècesenvahissantes
existantauniveaudubassindelaLoire(auniveaudubassindelaLoire,lacoordinationestassurée
parlaFédérationdesConservatoiresd'EspacesNaturels).
Cesconnaissancespermettentdedisposerd'élémentsd'appréciationpouraideraudéveloppement
d'actionsdanslecadredesdispositionsP2BetP4E.
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4.7.2 OrientationC2:Conforter les connaissances sur la biologie et le comportement des
espèces migratrices amphihalines, et poursuivre la surveillance des populations.
Après avoir constaté la présencedes poissons migrateurs amphihalins dans uncours d'eauou
tronçondecoursd'eauetlaprésenceconcomitanted'unesurfacesuffisanted'habitatsproductifs,il
convientd'envisagerdesopérationsdesuividucomportementdespoissonsmigrateursamphihalins.
Pourlescoursd'eauoutronçonsdecoursd'eauoùdesopérationsdesuiviontdéjàlieu,ilconvient
de veiller à la poursuite des opérations de suivi scientifique et technique, afin de maintenir
l'alimentationdeschroniquesdedonnéessuffisamment longuesseules, capablesdedonnerdes
indicationssurl'évolutiondel'étatd'unepopulation.
L'acquisitiondeconnaissancessurlabiologiedesespècesamphihalinesdistingue:
? enpremièrepriorité,lesopérationsdesuivisannuels,quipermettentderenseignerdesindicateurs
de l'état despopulationset de leurévolution, qui s'inscrivent encomplémentauxréseauxde
contrôledesurveillancedelaqualitédesmilieuxaquatiques;
? ensecondepriorité,lesétudesponctuelles,nécessitantuneffortparticulieruneannéedonnée,
ciblésurunoucertainsbassinsversants.
Lesétudessurlabiologiedesespèces,menéesinsitudansl'ensembleduterritoireduCogepomiou
exsitu,peuventrecouriràdespoissonsd'élevagedemêmesouchegénétiquequelapopulationen
placedanslebassinversantauquelserapportel'étude.
DispositionC2A:Desopérationsderecensementdepoissonsmigrateursamphihalinsont
lieusurdescoursd'eauoutronçondecoursd'eauoùleurprésencen'estpascaractérisée
précisémentàcejour.
Cettedispositionconcernenotammentlescoursd'eausituésdansl'airederépartitionhistoriquede
l'espèceconsidérée.
En accompagnement de la caractérisation des habitats favorables aux poissons migrateurs
amphihalins(dispositionC1C),l'inventairedelaprésencedesespècessurdenouveauxcoursd'eau
constitueuneveilleessentielle.
Cettedisposition reposesur la capitalisationdes connaissances existanteset pourraconduire à
l'émergence de nouvelles méthodes d'acquisition de connaissances, afin de développer une
connaissanceglobalelaplusexhaustivepossibleàl'échelledubassin.
DispositionC2B:Lasurvie,lareproduction,ledéveloppementetl'abondancedesjuvéniles
despoissonsmigrateurs amphihalins font l'objet d'unsuivi annuel, afin devérifier le bon
fonctionnementdescyclesbiologiquesdanslebassindelaLoire.
Cettedispositioncibleessentiellementcertainsbassinsversantsselonlarépartitiondeseffectifsd'une
espècedonnéeetlaprésencedepopulationssauvagesdepoissonsmigrateursamphihalins.
Elles'inscritdanslacontinuitédeschroniquesdedonnéesdisponibles.
Disposition C2C: Les migrations des poissons migrateurs amphihalins font l'objet
d'opérationsdesuivi.
Ladéclinaisondecettedispositionpermetd'évaluerlesretombéesdurétablissementdelacontinuité
écologiquedescoursd'eauetapparaîtcommeundispositifd'évaluationdel'orientationR1.
Cettedispositions'appuiesurdesopérationsannuelles,pouvantêtrecomplétéespardesopérations
ponctuellesdontl'intérêtrésidedanslesuividesmigrationsàl'échelled'uncoursd'eaudansson
ensemble.
Uneattention particulière pourraêtreportéeaux fluxentrée/sortieenestuaire, dans la limitedes
moyens techniquesdisponiblesàcoût raisonnable. Ladéclinaisondecettedispositionsurcecas
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spécifiquedesestuairessefaitencohérenceavecl'élaborationdupland'actionspourlemilieumarin
duGolfedeGascogne.
DispositionC2D:Lesdonnéesbiologiquessontvaloriséespourcomprendreladynamique
despopulationsdepoissonsmigrateursamphihalinsetsuivre l?évolutionvers l?objectif de
viabilitédespopulations.
Lesconnaissancesacquisesgrâcenotammentà lamiseenoeuvredesmesuresdesdispositions
C2BetC2Cpermettentdeprogresserdanslacompréhensiondesdynamiquesdepopulations.
Lamiseenoeuvredecettedispositionconduitàapprécierlaviabilitédespopulationssauvagesparle
suividedifférentsindicateursetàévaluerleseffectifscorrespondantauxseuilsd'exploitation,dont
l'atteinteàlahausseouàlabaissepeutconduireàunemodificationdesmesuresd'encadrementde
lapêche,exposéesparlesmesuresdesdispositionsP4AetP4B.
4.7.3 OrientationC3:Améliorerlaconnaissancedelapressiondepêcheexercée
surlespoissonsmigrateursamphihalins
Afind'éclairer la miseenoeuvre de l'orientation P4, il est nécessaire depoursuivreet renforcer
l'informationduCogepomisurl'étatdelapressiondepêchesurlespoissonsmigrateursamphihalins.
Rappelréglementaire :
L'articleR.43664duCodedel'environnementprévoitàsonpremieralinéaquetoutpêcheureneau
douce,professionneloudeloisir,doitteniràjouruncarnetdepêcheselonlesmodalitésfixéesparle
plandegestiondespoissonsmigrateurs.
Pourlapêchedel'anguille,cesmodalitéssontfixéespararrêtéduministrechargédelapêcheen
eaudouce(arrêtéministérieldu22octobre2010)etelless'accompagnentd'obligationsdéclaratives
pour les différents stades d'anguille pêchés (civelle, anguille jaune et anguille argentée). Ces
obligations déclaratives concernent tous les pêcheurs aux engins sur le domaine public
(professionnelsetamateurs),ainsiquelesmembresdesAAPPMAautorisésàpêcherauxenginssur
ledomaineprivé.
Lescapturesaccidentellesetaccessoiressontégalementconsignéesdanslecarnetdepêche.
DispositionC3A:LeCogepomiveilleàobtenirlesdonnéesdecaptureauprèsdesservices
enchargedeleurcentralisation.
Afind'améliorerlagestiondesespècesmigratricesamphihalinesetnotammentd'évaluerl'efficacité
desmesuresd'interdictiondelapêchedecertainesespècesamphihalines(dispositionP4A)etla
pertinence de mesures complémentaires d'encadrement des pratiques (disposition P4B), les
donnéesdecapturessontvaloriséesdanslecadreduCogepomi.
Lamiseenplaced'unedémarchederecueildesinformationsauprèsdesserviceschargésdela
collectedesinformationsetdesorganisationsreprésentativesdespêcheurs(FDAAPPMA,AAPPED,
CRPMEM)estétudiéeenpriorité,afinderemédierauxdifficultésactuellesderécupérationetde
valorisationdecesdonnéesàl?échelleduCogepomi.
4.7.4 OrientationC4:Évaluerl'efficacitédesprogrammesdesoutiend?effectifs,afin
d?êtreenmesuredelesadapterlecaséchéant.
Cetteorientations'inscritenétroiterelationavecl'orientationR3.
L?ensembledeseffetsdesprogrammesdesoutiend?effectifensaumonsdoitêtreévalué,notamment
sonefficacitéentermesd'individuscontributeursàlareproduction.
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Pourcequiconcernelemonitoringdesopérationsderepeuplementencivelles,lesélémentssont
cadrésauniveaunationaldansleplandegestiondel'anguilleetdansleprogrammeexpérimentaldu
repeuplement.
Cetteorientations'inscritdanslacontinuitédesprogrammesd'évaluationencours(suiviàsixmois,
unanettroisanspourlesopérationsdetransfertdecivelles,assignationgénétiqueparentalepourle
saumon).Samiseenoeuvreaccompagnedefaitlesprogrammesdesoutiend'effectif.
C4A: L'implantationdesjuvénilesdéversésdanslemilieunaturel lorsdesopérationsde
soutiend'effectiffaitl'objetdemesuresd'évaluation.
Cettedispositionapourobjectifdeconstaterl'occupationdeshabitatsdessitesdedéversementsuite
auxopérationsmenéesdanslecadredel?orientationR3.Unerécurrencederésultatsdéfavorables
d'implantation doit conduire à adapter les sites de déversements définis par les mesures de la
dispositionR3B.
Lamiseenoeuvredecettedispositions'articuleavecladispositionC2Betimpliquenotamment:
? d'évaluer les opérations expérimentales de soutien d'effectif par des chargements d?oeufs en
incubateursdeterrain;
? d'être en mesure d'identifier l'origine des juvéniles, ce qui peut nécessiter une analyse du
patrimoinegénétiquedesjuvénilesinventoriés;
? d'appliquer les protocoles desuivis harmonisés des opérations dedéversement pouvant être
définisauniveaunational.
C4B: Lacontributiondesindividusdéversésà lareproductionà l'issuede leur cyclede
grossissementestévaluée.
Comptetenudel'impossibilitétechniquedelamiseenoeuvred'uneopérationsurl'anguilledansle
cadreduPlagepomi,cettedispositionneportequesurlesaumon.
L'évaluationdecettecontributiondoitêtregénéraled'unepart,etdistinguerlapartdechaquestade
dedéversementutiliséquandlatechniquelepermetàcoûtraisonnable.
L'évaluationglobalepourrareposersurlapoursuitedel'opérationgénétiqued'assignationparentale,
lancéeen2009.Latraçabilitédel'élevagepermetdeconnaîtrelepatrimoinegénétiquedesdeux
parentsd'un individu déversédans le coursd'eau. Unprélèvement de tissuet d'écaillessur les
saumonsderetourspermetensuitel'analysedeleurADN.Cetteanalyserendpossiblel?assignation
dessaumonsderetoursàleursparents,sicesdernierssontoriginairesdelasalmoniculture.
Compte tenu des cycles biologiques des différents contingents issus d'une même reproduction,
quatrecohortesdifférentesreviennentenuneannée.
Les mesures d?évaluation des opérations de soutien d?effectif sont menées dans la mesure du
possibleensynergieavecd'autresopérationsnécessitant lamanipulationdepoissonsmigrateurs
afinderéduirelesimpactssurlapopulationsauvage.
Enparallèle,silatailledesjuvénilesdéverséslepermet,unmarquagephysiqueseraréalisé(par
exemplel?ablationdelanageoireadipeusedessmolts),afind?êtreenmesured?identifiervisuellement
l?originedupoissonderetour.
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(ATTENTION: OPTION concentréesdanslebieffluvialdelaLoire
aval, entre Les PontsdeCéet Anetz. Des annexes hydrauliques existent aussi plus enamont,
notammentenLoiremoyenne.
Cesannexespeuventjouerlerôledezonesd'abripourlespoissonsmigrateursamphihalinsaucours
deleursmigrations.
3.1.3 Leréseauhydrographique
Leréseauhydrographiqueconcernépar l'applicationduplandegestiondespoissonsmigrateurs
(PLAGEPOMI)comprend:
? lescoursd'eauetgroupesdecoursd'eauinscritsdanslebassinhydrographiquedelaLoirequi
s'étendentsur102000km²;
? lescoursd'eaucôtiersvendéensetàlaSèvreniortaisequis?étendentsur15000km²;
? plus généralement, les plans d'eau et zones humides, reliés au réseau hydrographique, et
fréquentésparlespoissonsmigrateursamphihalins.
Les caractéristiques topographiques, géologiques et hydrologiques conduisent à distinguer deux
grandescomposanteshydrographiquesdanslebassindelaLoire,delaSèvreniortaiseetdescôtiers
vendéens.
Lemassifarmoricainetlestablessédimentairesdubassinparisien
Cesterrains représentent lesdeux tiers duréseauhydrographiquedubassin. Cevaste territoire
couvretoutelapartieavalduréseauetpluslargementl?ensembledelapartiecentreouestdubassin.
Cesecteur représentea priori lesplusgrandessurfacesd'habitats productifs pour les poissons
migrateursamphihalins,enraisondesasuperficieetdesonaccessibilitédepuislafaçadeatlantique.
Pourautant, lescontraintesphysiqueset lespressionsanthropiquesquis?exercentsur lescours
d?eaudumassifarmoricainoudestablessédimentairesdubassinparisienlimitentlaformationde
facièsproductifspourlesespècespotamotoques,enparticulieràcausedesfaiblesniveauxdepente
naturelle qui caractérisent les versants de ce secteur aval et des obstacles à l'écoulement qui
accentuentfortementcedéficitdepentenaturelle.
La nature dominante des fonds doit également être prise en compte dans la mesure où la
granulométrieconstitueunélémentdéterminantdelaqualitédeshabitatsutilisésparlesespèces
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potamotoques.Eneffetlesgéniteursontbesoindelitsdecaillouxetdegraviersgrossierspoury
déposer leurs oeufs et les pontes sont très sensibles au colmatage par les éléments fins. Les
caractéristiquesgranulométriquesdescoursd?eaudelapartiecentreouestdubassinsontégalement
limitantes à cet égard, sous l?effet des contraintes naturelles et des transformations
hydromorphologiquesquipèsentsurlescoursd?eau.
Enfin,malgrélaproximitédel?océan,lafaiblessedesreliefsetlecaractèreimperméabledesterrains
dumassif armoricain limitent aussi ledébit d?étiageetlesconditionshydrologiquesfavorablesau
maintiendesfacièsd?eaucourantependantlesphasesdecroissancejuvénile.
Lemassifcentral
Cesterrainscouvrentunesurfacepluslimitée(untiersdelasuperficietotaledubassin)maisleurs
caractéristiques topographiques, géologiques et hydrologiques sont plus favorables aux espèces
potamotoques. En effet, les éléments structurants de ce secteur hydrographique favorisent la
formationdezonesdefrayèresetd?habitatsproductifspourlesjuvéniles.
Ces cours d?eau bénéficient d?altitude, de gradient de pente et de conditions hydrologiques
(12à17l/s/km2enmoyenneannuelle), qui se traduisent par unedominante naturelle de faciès
courantsurdesfondsàgranulométriegrossière.
En outre, contrairement au profil d?équilibre des rivières armoricaines et sédimentaires, la
morphologiedescoursd?eaudumassifcentralestsoumiseàdenombreuxaccidentstopographiques
etaffleurementsrocheux.Cesconditionsaugmententlafréquenced?apparitiondesradiersetrapides
le long des parcours migratoires, y compris dans les parties aval descours d?eau, en zone de
piémont.
3.1.4 Unterritoireàfortpotentielpourlespoissonsmigrateursamphihalins
Laconfigurationhydrographiquedubassin(estuaires,zoneshumidesetcoursd'eau)estfavorableà
l'accueildespoissonsmigrateursamphihalinspar:
? lapositioncentraledubassinsurlafaçadeatlantique,particulièrementbiensituéeparrapportàla
distributionocéaniquedesfluxmigratoires,
? lasurfaceimportantedubassin,soitplusducinquièmeduterritoiredeFrancemétropolitaine,et
surlequelsontrecensés120000kmdecoursd'eauàdesaltitudesfavorablesàlacolonisation
parlesespècesmigratrices,
? lessurfacesimportantesdemaraisetdezoneshumides,
? lecontextehydroécologiquetrèsrichesuivantladiversitédureliefetlagéologie,
? laprésenced'habitatsàfortpotentielproductif,enparticulierpourlesaumonatlantiquesurles
terrainsanciensdumassifcentral.
Suivantleurgradientdepente,leszonesdesocledubassinamontrépondentbienauxconditions
morphodynamiques nécessaires à la reproduction des grands migrateurs (saumon, lamproies,
aloses).Parailleurs,l'intégritédecesmilieuxestrelativementbienconservéedanslespartiesamont
dubassin,souventpréservéesparunespaceruralàdominanteherbagèreouforestière.
3.2 Descriptiondesdifférentssousbassinsversantsduterritoiredu
Cogepomi
Dixsousbassinsversantsontétédéfiniscomptetenudeleurhomogénéité:
? l'Allier,
? laLoireamont,
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? laLoirebourguignonne,dubarragedeVillerestàlaconfluencedel'AllieraveclaLoire,
? laLoiremoyenne,delaconfluencedel'AllieraveclaLoireàlaconfluencedelaVienneavecla
Loire,
? leCher,
? laVienne,
? laMaine,
? laLoireaval,delaconfluencedelaVienneaveclaLoirejusqu'àl'océan,
? laSèvreniortaise,
? lescoursd'eaucôtiersvendéens,affluentsàl'océanentrelabaiedel'Aiguillonetl'estuairedela
Loire.
Lessurfacesd'habitatsfavorablesparespèceserontprécisées,quandellessontconnues,dansla
partie 2 du Plagepomi, dans les paragraphes relatifs à chacune des espèces. Seuls sont ici
mentionnésdesélémentsqualitatifspourchacundesneufsoussecteurs.
3.2.1 Bassinversantdel'Allier
Lebassindel'Allierconcentrel'essentieldeshabitatsfavorablesactuellementaccessiblespourle
saumonatlantique àl'échelledubassindelaLoire.C'estégalementleseulbassinoùsurvit une
populationrésiduelledesaumonssauvages1.
Despopulationsd'anguilles, de lamproiesetd'alosessont égalementprésentessur lebassinde
l'Allier.
Laconstructiondeseuilsetbarragesdestinésàlaproductiond?hydroélectricité,ausoutiend'étiage,
àl?écrêtementdescruesoulacréationderetenuesd?eaupourl?irrigation,aprogressivementrestreint
l'airederépartitiondespoissonsmigrateursamphihalinssurcebassin,notammentdusaumon,en
limitantl'accèsauxhabitatssituéssurlespartieamontdescoursd'eaudecebassinversant.
L'effacementdubarragedeSaintÉtienneduViganen1998etl'équipementdubarragedePoutèsen
dispositifsde franchissementà la montaisonen1986et à la dévalaisonen1998ont permisde
faciliterl'accèsdusaumonauxsecteursdereproductionsituéssurlehautAllieretsesaffluents.Le
projetderéaménagementdubarragedePoutès(abaissementduseuiletréductiondelalongueurde
laretenue,accompagnésd'équipementspourlamontaison(passeàpoissonsàbassinssuccessifsà
macrorugositésdefond)etladévalaison(glissièrededévalaisonetgrillesantiintrusionauniveaude
la prise d'eau) et de clapets amovibles pour des débits de crueen position centrale du nouvel
ouvrage)permettradefaciliterlaconnexiondeshabitatsproductifsduHautAllier etderétablir le
transportsédimentaire.Toutefoisdesdifficultésmigratoirespersistentparailleurssur l'Allier etse
manifestentparl'accumulationderetardsdanslesmigrations.Cesdifficultéssemblentplusfortement
marquéesàladévalaison.
Contrairementauxautressousbassinsversants(Cher,Vienne,Maine,Sèvreniortaise)etbienque
lesconditionsdemigrationsrestentàaméliorer parendroit, leshabitatsfavorablesauxpoissons
migrateursamphihalinsdubassindel'Allierontpuresterplusaccessiblesqu'ailleurs.
3.2.2 BassinversantdelaLoireamont
Ce territoireconcerne la Loire, depuis sa source jusqu'aubarragedeVillerest. Actuellement, ce
territoire n'est pas accessible aux poissons migrateurs amphihalins, compte tenu du caractère
infranchissabledubarragedeVillerest.
1 Estconsidérécommeunsaumonsauvageunsaumonnédanslarivièredeparentsnéseuxmêmesdanslarivière,
d?aprèsladéfinitionduCIEM(WGNAS)en1997.
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Historiquement,cebassinaccueillaitdespopulationsdepoissonsmigrateursamphihalins.
3.2.3 BassinversantdelaLoirebourguignonne
CebassinversantestconstituéparlaLoire,dupieddubarragedeVillerestjusqu'aubecd'Allier.De
l'amontversl'aval,troisaffluentsprincipauxconfluentaveclaLoiredanscesecteurgéographique:
l'Arroux,laBesbreetl'Aron.
Historiquementlesaumonatlantique,lagrandealose,lalamproiemarineetl'anguilleétaientprésents
danscescoursd'eau.
La réduction des habitats de reproduction ou de grossissement est essentiellement due sur ce
territoire,notammentsurlesaffluentsdelaLoire,auxobstaclesquiontprogressivemententravéla
librecirculationpiscicoleetauxactivitésd'extractiondegranulatsquiontengendrédesdéséquilibres
sédimentairesprovoquantl'altérationd'unepartiedeshabitatsfavorables.
Al'heureactuelle,lesaumon,lalamproiemarineetlagrandealosesontrencontrésdanslaLoireet
dans les parties aval des affluents précédemment cités. Depuis l'aménagement de nouveaux
dispositifsdefranchissementaubarragedenavigationdeRoanneen2012,lespoissonsmigrateurs
amphihalins sont enmesurede remonter la Loire jusqu'aubarragedeVillerest. L'anguille est le
poissonamphihalinquiprésentelapluslargerépartitiongéographiquedanscesousbassinversant.
3.2.4 BassinversantdelaLoiremoyenne
Dubecd'AllieraubecdeVienne,laLoirereçoitdeuxaffluentsprincipaux:leCheretl'Indre.Lesous
bassinversantduCherfaitl'objetduparagraphe3.2.5.
La Loire moyenne constitue un secteur de passage pour l'ensemble des espèces migratrices
amphihalines. L'effacement du seuil mobile de Blois en 2005 dans le cadre du plan Loire et
l'équipementdesseuilsdesquatrecentralesnucléairesdeBellevillesurLoire,DampierreenBurly,
SaintLaurentNouanetAvoineontrétablitlatransparencemigratoire.
Deshabitatsfavorablesàlareproductiondesalosessontrecenséssurlapartieamontdecesecteur,
làoùlaLoiredélimitelesdépartementsduCheretdelaNièvre.
L'Indreestmarquéeparunnombreimportantd'obstaclestransversauxquiexpliquelaréductiondela
présencedespoissonsamphihalinssurcecoursd'eau.Seulel'anguilleyresteaujourd'huiprésente
demanièrenonanecdotique.
3.2.5 BassinversantduCher
Le bassin versant du Cher était historiquement peuplé d'anguilles, d'aloses, de lamproies, de
saumonset de truitesdemer. Il constitueaujourd'hui undesquatrebassinsprioritairespour la
restaurationdespopulationsd'anguillesdansleSdage20102015,etprésenteégalementunintérêt
pourd'autrespopulations,notammentd'alosesetdelamproies.
L'anthropisation de son cours, avec les aménagements pour la navigation en aval de
SaintAignansurCher (Cher dit «canalisé»), la créationdeseuils pour l'exploitation de la force
motricedel'eauetlesextractionsdegranulats,notammententreMontluçonetVierzon,ainsiqu'à
ChâtressurCher, ont engendré une altération de la continuité écologique et de la morphologie
pouvantexpliquerlarégressiondespopulationsdepoissonsmigrateursamphihalinsdansleCher.
L'abaissementdespartiesmobilesdesbarragesàaiguilleduChercanaliséenpériodeactivede
migration printanière va dans le sens d'une facilitation des migrations des poissons migrateurs
amphihalins.
Suiteàcespremièresévolutions,deslamproiesetdesalosessontobservéesdansleCherjusqu?à
unecinquantainedekilomètresenamontdeVierzon.Desmuletssontégalementprésentssurle
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Cher,notammentenavaldel?ouvragedeSavonnières,etdesobservationssporadiquesdetruitesde
mersontsignalées.L'anguillerestelepoissonmigrateuramphihalinlepluslargementrépartisurle
bassinduCheractuellement,avecuneprésencedanslesrivièresCher,Yèvre,Sauldre,etFouzon.
LeCherenamontdubarrageduPrat, infranchissable, est inaccessibleauxpoissonsmigrateurs
amphihalins.
3.2.6 BassinversantdelaVienne
Lebassinde la Vienneétait historiquementpeuplépar l'anguille, lesaloses, les lamproieset le
saumonatlantique.
Leterritoireestmarquéparuneagricultureextensivedepolycultureélevagesurl'ensembledestêtes
debassinversantetrassembledeszonesdegrandesculturesdanslesplainesdel'aval.
Auniveauhydraulique,l'édificationprogressived'ouvragestransversauxaconduitàuneraréfaction
desespècesdepoissonsamphihalines,quirecolonisentlebassindepuisl'effacementduseuilde
MaisonsRougesen1998à l'exutoiredu bassin de la Vienne. Si la densitédes ouvrages reste
importantesurlaVienne,laCreuseetlaGartempe,lesopérationssuccessivesd'aménagementen
faveur du rétablissement de la continuité écologiqueont permis, notamment sur la Vienne, une
progressiondufrontdecolonisationparlespoissonsamphihalinssurunedistancede120kmdepuis
15ans.Lesouvragesdescomplexesdel'IsleJourdain,surlaVienne,etd'Éguzon,surlaCreuse,
constituentactuellementdesverrousinfranchissables.
LebassindelaVienneestégalementmarquéparlaprésencedeplusieursmilliersdeplansd'eau,
susceptiblesd'impacterlesrégimeshydrologiqueetthermiquedescoursd'eauauxquelsilspeuvent
êtreconnectésoudanslesbassinsversantsdesquelsilsinterceptentlesécoulementsgravitaires.
Actuellement,lebassindelaVienneaccueillelapopulationdelamproiesmarineslaplusnombreuse
à l'échelle européenne et la population d'aloses la plus nombreuse dubassin de la Loire. Des
anguillessontégalementprésentesdanscebassin,l'undesquatredubassinLoireBretagneétant
identifié commebassin prioritaire pour la restauration de la population d'anguilles par le Sdage
20102015.
La Gartempea fait l?objet depuis les années1980d?un programmede restauration dusaumon
atlantique.Actuellement,dessaumonsfréquententlecoursavaldelaVienne,delaCreuseetdela
Gartempe.Aucuneopérationdesoutiend?effectifn?étantmenéedanslaVienneetdanslaCreuse,
cesobservationstémoignentdel?existenced?unerecolonisationnaturelledecesousbassinversant.
Toutefois, les données biologiques disponibles ne permettent pas d'attester l'existence d'une
populationsauvageautonomedesaumonsdanscebassin.
3.2.7 BassinversantdelaMaine
LebassindelaMaineaccueillaithistoriquementdespopulationsd'anguilles,d'aloses,delamproieset
de truites de mer. Ce bassin versant est aujourd'hui un des quatre bassins prioritaires pour la
restaurationdespopulationsd'anguillesdansleSdage20102015,etprésenteégalementunintérêt
marquépourlespopulationsd'alosesetdelamproies.
Lararéfactiondelaprésencedesmigrateursamphihalinsdanscebassinversantpeutprovenird'un
effetcumulédedifférentsfacteursayantengendréunealtérationdeshabitatsetdelamorphologie
descoursd'eau.
Ladensitédesouvragesestimportantesurlesprincipauxcoursd'eaudecebassinversant.Des
opérationsdegestionengagéescesdernièresannéessur laMayenneont permisderéduire les
difficultésdemigrationsurcecoursd'eau,notammentdesanguillesàladévalaison.Parailleurs,le
cloisonnementdesmilieuxestrenforcéparunedensitéimportantedeplansd'eaudanscebassin,qui
interceptent une partie des écoulements naturels. Un autre enjeu sur ce territoire porte sur la
conciliation des prélèvements pouvant être marqués, notamment en période d'étiage, avec les
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besoinsminimauxpourconserverlesfonctionnalitésdesmilieuxaquatiques.
3.2.8 BassinversantdelaLoireaval
DubecdeVienneàsonestuaire,laLoirepassedesondernierbieffluvialàsasectionmaritime.
Lechenalconstitueessentiellementunezonedetransitpourlespoissonsmigrateursquil?empruntent
lorsde leurmigrationdemontaisonet dedévalaison. Ilsdoivent doncs?adapterauxparamètres
environnementauxtrèsvariablesdel?estuaire(salinité,oxygènedissous,turbidité...).
Ce secteur est marqué par la présence de nombreuses annexes hydrauliques et des marais
estuariensdontlesfonctionnalitésetl'intérêtécologiquesontmajeursnotammentpourl'anguille.La
configurationactuelle desmarais remonteessentiellement aux travauxd'assèchement intervenus
entreleXVIIe et XIXe siècle, suite à de premiers aménagements dès le XIIe siècle.
LesmaraisNordLoireetSudLoireenavaldeNantes
LesmaraisestuariensdelaLoires?étendentsurunesuperficiede10130ha.Ilssontconstituésd?un
réseauhiérarchisédecanaux, douves et rigolesqui représentent un linéairecumulédeplusde
1700km,réguléparplusde250ouvrageshydrauliques.
Ceszonesdemaraisrassemblentégalementdessecteursd'habitatstemporairesintéressantspour
certainesautresespècesamphihalines(anguille,flet,mulet)oumarines(plie,sole,gobie,bar).La
présenced'espècesmarinesdanscesmaraisrenforcent d'autant plus l'intérêt d'unecoordination
entrelePlagepomi,leSdageetlePammdelasousrégionmarineduGolfedeGascogne.
Les aménagements portuaires, les modifications du lit des cours d?eau et la multiplication des
ouvrageshydrauliquesont bouleversé lescaractéristiqueshydrauliqueset le fonctionnementdes
marais,particulièrementdansl'estuairedelaLoire.
LesannexeshydrauliquesdelaLoireentreNantesetMontsoreau
Les annexes hydrauliques de la Loire (plus de 120 entre Nantes et Montsoreau) sont des
dépendances du fleuve qui ont un rôle temporaire visàvis des écoulements superficiels. Leur
agencement,généralementparallèleaufleuve,estdûàlatopographieparticulièreduremplissage
sédimentaire,lesabordsdulitmineur?lebourreletderiveplusélevésquelespiedsdecoteaux
s?opposantbiensouventàlafusiondirectedeseaux.
Ellesneparticipentauxécoulementsqu?audelàd?unecertainehauteurd?eauenfonctiondel?altitude
relativedeleur(s)connexion(s)aufleuve.Troistypesd?annexessontidentifiés:
? Lesbrassecondairessontconnectésenamontetenavalaubrasprincipaldontilssontséparés
pardesîlesstabiliséesetvégétalisées.Al?étiage,ilsprésententdevastesplagesdesablealors
qu?enpériodesdehauteseaux, ils peuvent devenir brasprincipaux. Nombred?entreeuxsont
barréspardesdiguesoudeschevrettesenenrochementsrenvoyant,endeçàd?uncertaindébit,
leseauxdanslesbrasnavigables.Lesbrassecondairesremplissentunefonctiond?écoulement
descrues,variablesselonleurniveaud?ensablementetdeconnexion(fonctionplusfaiblepourles
brasfermés).Leursfonctionsbiologiquesnesontpasnégligeablespourautant:sitesd?accueil
pourledéveloppementdesalevinsàlasortiedesbrasmorts,productivitéprimairesupérieureau
chenalprincipalet installationd?invertébrés(trichoptèresHydropsychidae, mollusquesdugenre
Unio?)grâceauralentissementducourant,reproductionenfonctiondesvariationshydrologiques
d?espècesrhéophiles (chevaine, ombre, barbeau, vandoise) et limnophiles(gardons, rotengle),
refugeencasdepollutionsaccidentelles.
? Les bras morts (ou boires) sont des dépressions de la plaine alluviale, anciens bras
abandonnés.Ellessontcaractériséesparunevégétationpermanenteetuneconnexionunique,le
plussouventàl?aval.Quandleurfondestperméable(sable,gravier),leniveaudel?eauysuitcelui
delanappealluvialeparcapillarité;parcontrequandellessontétanches,ellesseremplissentdes
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eauxderuissellementdescoteauxoudesaffluents,oupardébordementdirect.Lesbrasmorts
jouentunrôle importantauniveaudela reproductiondespoissonsphytophiles(inféodésà la
végétationherbacée)commelacarpe,lerotengleetlebrochet.Ellesreprésententégalementdes
zonesd'habitatsetdegrossissementpourl'anguilleadulte.
? Lesbassesvalléesd?affluentssontdeszonesinondables,submergéesparleseauxdel?affluent
oulorsdurefoulementdeseauxdelaLoire.Lebourreletderivecontraintl?affluentàemprunter
uneouplusieursboiresavantdesejeterdanslefleuve.Danslamajoritédescas,desvannages
placésàleurdébouchédanslavalléeymaintiennentuncertainniveaud?eaupendantl?étiage.
Elles constituent entre autres fonctions, en complémentarité avec les bras morts et les bras
secondaires, des zones de frayères productives, en particulier pour le brochet, grâce à la
couverturevégétale
L?aménagement du fleuve pour la navigation (obturation des bras secondaires par des digues,
resserrementdubrasnavigableentredesépis)etlesextractionsdesabledansle lit mineuront
provoquél?incisionduthalwegdenavigationdanslessablesdulit,induisantl?affaissementdeslignes
d?eaudefaiblesdébitset,demanièreconcomitante,l?assèchementestivaldesannexes.L?ensemble
du fonctionnement écologique de la vallée, en termes d?échanges de matière, d?énergie et de
population,enaétéaffecté.
Or,lesdépendancesetsolidaritéslatéralessontvitalespourdenombreusesespèces,notammentde
poissons,dontlebrochetetl?anguille.
DesPontsdeCéàNantes,lacartographiedes81annexeshydrauliquesréaliséeparleGIPLoire
Estuaire en2006constitue un inventaire exhaustif de cesmilieux répartis commesuit: 36bras
secondaires, 35 bras morts, 6 annexes artificielles et 4 marais mouillés. Lasuperficie totale est
d?environ2600hectares.
Deuxtypesdebiefssontdifférenciésenfonctiondesconditionshydrauliques: les35kmdubief
fluviomaritime,dontlalimiteamontsesitueàAnetzetles45kmdubieffluvial,d?AnetzauxPontsde
Cé.Lenombredebrasmortsetdebrassecondairesserépartitéquitablementdansles2biefs,mais
paslasuperficie,quirestelargementsupérieuredanslebieffluvial.
3.2.9 BassinversantdelaSèvreniortaise
LebassinversantdelaSèvreniortaiseétaithistoriquementpeupléd'anguilles,d'aloses,delamproies
etdetruitesdemer.Ilaccueilleégalementdespopulationsdefletcommunetreprésenteunintérêt
aujourd'huiimportantpourtouteslespopulationsdepoissonsamphihalins.Enparticulier,c'est,avec
lescôtiersvendéens,l'undesquatrebassinsversantsprioritairespourlarestaurationdespopulations
d'anguillesd'aprèsleSdage20102015.
Cebassinversantsedistingueparlafortedensitédesonréseauhydrographique,répartientredes
fleuvesetrivièresalimentantlemaraispoitevin,etunréseaudecanauxdanslemarais.
Lagestiondesniveauxd'eaudanslemaraisaconduità l'édificationdesnombreuxouvragesde
régulation depuis le Xe siècle. Cesystèmehydrauliquecomplexe se traduit par une succession
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d'ouvragesàfranchirpourlespoissonsmigrateursamphihalins.Unpremierenjeudanscebassin
versantportesurlarestaurationdelacontinuitéécologique.
La gestion quantitative représente l'enjeu majeur de ce territoire. En effet, les assèchements
successifsdezonesdemaraisparlepassé,etlesassecstemporairespouvantsurvenirenpériode
estivale, notamment dans certains cours d'eau, ont conduit à une forte réduction des surfaces
d'habitatsproductifspourlespoissonsmigrateursamphihalins.Aussi,lesopérationsdecuragedes
coursd'eauayantpuêtremenéesontengendréundéséquilibresédimentairequiaconduit àde
nouvellespertesd'habitatsessentielspourlesespècesamphihalines.Lagestiondesniveauxd'eau
revêt un intérêt biologique majeur, afin de restaurer des habitats productifs et de préserver la
submersiondezones demarais favorables à la reproduction et audéveloppement de certaines
espècesamphihalines.
3.2.10 Bassinsversantsdescôtiersvendéens
Lesbassinsversantsdescôtiersvendéenssontnotammentfréquentésparl'anguille,maispeuvent
aussi accueillir de petites populations d'aloses, de lamproies et de truite de mer. Ces bassins
versants restent des bassins favorables à l'accueil, notamment, des populations d'anguilles et
constituent,aveclaSèvreniortaise,undesquatrebassinsversantsprioritairespourlarestauration
despopulationsd'anguilled'aprèsleSdage20102015.
Laprésenced'ouvrageslimitelescapacitésdeprogressiondesespècesamphihalinesversleszones
amont desbassinsversants, tandis quedessurfacesd'habitats productifspeuvent êtreperdues
temporairementpardesépisodesd'assecsenpériodeestivaleessentiellement.
Les enjeuxprincipaux dans ces bassins versants portent, d'unepart, sur la gestion quantitative
équilibréedelaressourceeneau,afindemaintenirunehydrologiequipermettelemaintiend'habitats
productifs,etd'autrepart,surlarestaurationdelacontinuitéécologique,notammentamontaval.
3.3 Dispositifsd'évitementetderéductiondesimpactssurleshabitats
Plusieursdispositifs,denatureréglementaireoucontractuelle,permettentaujourd?huidemettreen
placedesmesuresdeprotectionetdegestiondeshabitatsenvuedesauvegarderlesespèceset
notammentlespoissonsmigrateurs.Cesdispositifsdeprotection,contraignantsouvolontaires,sont
considéréscommedesdispositifsvisantàpréveniretéviterlesimpactssurleshabitatsfavorables
auxpoissonsmigrateursamphihalins.
Enaccompagnementdecesmesuresdeprotectionetdegestion,ladémarchedesgestionnairesde
milieuxaquatiquesdéveloppedesapprochesderéductiondesimpactsdeaménagementssurles
fonctionnalitésdesmilieuxaquatiques.Cesmesuresderéductiond'impactdécoulentessentiellement
del'applicationdesdocumentsdeplanificationdansledomainedel'eau:leSdageetlesSage.
3.3.1 Lesprotectionscontraignantes
Laloiacréédesdispositifsdeprotectiondelabiodiversitépouvantprofiterauxhabitatsdespoissons
migrateursamphihalins.Cesdispositifscontraignants,prévusparlaréglementation,sontautonomes
oudécoulentdustatutdecertainscoursd'eaudansleSdageLoireBretagne20102015.
Laprotectiondesfrayères
Enapplicationdel'articleL.4323duCodedel'environnement,lesfrayèresdesaumonatlantique,de
lamproiemarine,delamproiefluviatile,degrandealoseetd'alosefeinteontétéinventoriéesdans
chaquedépartement.Ladestructiondefrayèressurlessecteursdélimitésestpassiblede20000¤
d'amende.Cedispositifapporteunpremierniveaudeprotectiondeshabitatsdereproductionetde
développementdesjuvénilesdesespècesamphihalinespotamotoques.
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L'inventairedes frayèresétablit enapplicationde l'article R.43211duCodede l'environnement
repose:
? pourlesaumonatlantique,lalamproiefluviatileetlalamproiemarine,surl'identificationdezones
defrayèresàpartird'unegranulométriecaractéristique(galetsdediamètre20à150mmpourle
saumonatlantique;graviersetpetitsgaletsdediamètre2à60mmpourlalamproiefluviatile;
graviersetgaletsdediamètre5à200mmpourlalamproiemarine);
? pourlagrandealoseetl'alosefeinte,surl'observationd'unedéposed'oeufsoudelaprésence
d'alevins.
Lesréservesnaturelles
Crééespardécretetplacéessousl?autoritédupréfet,lesréservesnaturellesnationalesconcernent
despartiesdeterritoiresdanslesquelleslafaune,laflore,lesol,leseaux,lesgisementsdeminéraux
oudefossilesoulemilieunaturelprésententuneimportanceparticulière.
Lesobjectifssontnotamment:
? lapréservationd?espècesanimalesouvégétalesetd?habitatsenvoiededisparitionsurtoutou
partieduterritoirenational;
? lareconstitutiondespopulationsanimalesouvégétalesoudeleurshabitats;
? lapréservationdebiotopesetdeformationsgéologiquesouspéléologiquesremarquables;
? lapréservationoulaconstitutiond?étapessurlesgrandesvoiesdemigrationdelafaunesauvage.
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Leclassement d'un territoireen réserve naturelle protège le milieude toutedestruction et toute
modificationanthropique.Chaquesitenaturelétantunique, l'ampleurdelaréglementationetdes
interdictionssur leterritoired'uneréserveest déterminéeaucasparcasetdécritedans l'arrêté
préfectoralquiinstituelacréationdelaréserve.
SurleterritoireduCogepomi,desréservesnaturellesnationalesontétéinstituéesdansplusieurs
territoires.OnpeutnotammentciterlesréservestellesqueleLacdeGrandlieu,levaldeLoireen
Bourgogneet le val d'Allier en Auvergnequi visent explicitement la protection des eaux et des
poissons et qui par leurs étendues de marais ou d'annexes fluviales représentent des habitats
diversifiéspermettantl'accueildecertainspoissonsmigrateursamphihalins,notammentl'anguille.
Lesarrêtésdeprotectiondebiotope
Instituéepararrêtépréfectoral, laprotectiondebiotopeviseàprévenir ladisparitiondesespèces
protégées(espècesanimalesnondomestiquesouvégétalesnoncultivées)parlafixationdemesures
deconservationdesbiotopes(entenduausensécologiqued?habitat)nécessairesàleuralimentation,
àleurreproduction,àleurreposouàleursurvie,cesbiotopespouvantêtreconstituéspardesmares,
desmarécages,desmarais,deshaies,desbosquets,deslandes,desdunes,despelousesoupar
toutesautresformationsnaturellespeuexploitéesparl'homme.
Unarrêté de protection debiotopepeut également avoir pour objet l'interdictionde touteaction
portant atteinte de manière indirecte à l'équilibre biologiquedes milieux telle que l'écobuage, le
brûlage, le broyagedes végétaux, la destructiondes taluset deshaies, l'épandagedeproduits
antiparasitaires.
Sur le territoireduCOGEPOMI, laGartempedans leLimousinest protégéesur40km.L?arrêté
prescritcertainesrestrictionsdesactivitéshumainesenvuedeprévenirladisparitiondufonddes
rivièresetpréserverainsileshabitatsnécessairesausaumon.LaLoireenBourgogneaégalement
faitl?objetd?unarrêtéenvuedeprotégerlesfrayèresd?alose.
Lagestionfoncièredeszoneshumides
LesloisGrenelleimposentl?acquisitionàl?échellenationalede20000hadezoneshumides d'ici
2015.LesAgencesdel?eauontpourobjectifd?acquérir13000hadezoneshumides(dont2600ha
enLoireBretagne),les7000harestantétantàacquérirparleConservatoirenationaldulittoralet
desrivageslacustres.
LeCodedel?urbanismeprévoitparsonarticleL.1421qu?àdesfinsdepréservationdelaqualitédes
sites, des paysages, des milieux naturels, des champs naturels d'expansion des crues et de
sauvegardedeshabitatsnaturels,lesConseilsgénérauxsontcompétentspourélaboreretmettreen
oeuvreunepolitiquedeprotection,degestionetd'ouvertureaupublicdesespacesnaturelssensibles
(ENS), boisés ou non. Cette politique des Conseils généraux doit être compatible avec les
dispositionsdesschémasdecohérenceterritoriale,euxmêmecompatiblesavecleSdage.Ainsi,les
ConseilsgénérauxpeuventêtreamenésàdélimiterdesENSàdesfinsdepréservationdeszones
humides,etcontribueràl'acquisitionfoncièredecesespaces.
LesConservatoiresd'espacesnaturelsontégalementuneprérogatived'acquisitionfoncièrepourla
préservationdelabiodiversité,cequileurpermetd'agirégalementenfaveurdelaprotectionfoncière
deszoneshumides.
Enfin,toutesleszoneshumidesinventoriéesdanslebassindelaLoiredoiventfairel'objetd'une
protectionsuffisantepar leur intégrationdanslesplans locauxd'urbanisme(PLU),établispar les
communes,tellequeleprévoitladisposition8A1duSdage.
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Leszoneshumidesd'intérêtenvironnementalparticulieretleszoneshumidesstratégiquespourla
gestiondel'eau
LeCodedel?environnementpermet(articleL.2113)àl?autoritéadministrativededélimiterdeszones
humides d'intérêt environnemental particulier (ZHIEP), qui doivent alors faire l?objet d?un plan
d?actions. LesZHIEPpeuvent êtreproposéespar les Commissions locales de l'eau (CLE). Ces
dernièrespeuventalors,àl?intérieurdecellescidélimiterdeszoneshumidesstratégiquespourla
gestiondel'eau(ZSGE).SeulelaCLEestcompétentepourproposerunclassementenZSGE.
CeclassementenZHIEPetZSGEretentitsurl?élaborationdesschémasrégionauxdecohérence
écologique(SRCE).Eneffet,leurtramebleuedoitintégrerlesZHIEPetZSGE(articleL.3711du
Codedel?environnement).
Toutefois,cedispositif n'a jusqu'àprésentpasétéutilisédanslebassindelaLoire,delaSèvre
niortaiseetdescôtiersvendéens.
Lescoursd'eaunécessitant uneprotectioncomplètedespoissonsmigrateursamphihalinset les
réservoirsbiologiques
LeSdageLoireBretagne20102015adéfinilescoursd'eaudanslesquelsuneprotectioncomplète
des poissons migrateurs amphihalins doit être assurée. Les cours d'eau correspondant sont
cartographiésdansl'illustration28.
Enparallèle,leSdage20102015aégalementdélimitédesréservoirsbiologiques(illustration29).
Cesdernierscorrespondentàdeszonesàfortediversitébiologique,depuislesquelsledéplacement
desespècesest susceptiblede restaurer l'écosystèmedesmassesd'eauattenanteset ainsi de
contribueràl'atteintedubonétatdecellesci.
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Illustration28:Coursd'eaunécessitantlaprotectioncomplètedespoissonsmigrateursamphihalins
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Lescoursd'eau,partiesdecoursd'eauoucanauxclassésautitredel'articleL.21417duCodede
l'environnement
Noncontraignantseneuxmême,lescoursd'eauprotégésparl'undesdeuxdispositifsprécédents
ont,defaitetcommepourlescoursd'eauentrèsbonétat,étéintégrésauclassementenliste1au
titredel'articleL.21417duCodedel'environnement(illustration30).
Ce classement dispose qu'aucune autorisation ou concession ne peut être accordée pour la
construction de nouveaux ouvrages s'ils constituent un obstacle à la continuité écologique. Le
classementenliste1autitredel'articleL.21417duCodedel'environnementesteffectifdepuisla
publicationdel'arrêtédupréfetcoordonnateurdebassinLoireBretagnele22juillet2012.
Leclassementenliste1prévoitégalementquesurlescoursd'eau,partiesdecoursd'eauoucanaux
classés, le renouvellement de la concession ou de l'autorisation des ouvrages existants,
régulièrementinstallés,estsubordonnéàdesprescriptionspermettantdemaintenirletrèsbonétat
écologiquedeseaux,demainteniroud'atteindrelebonétatécologiquedescoursd'eaud'unbassin
versantoud'assurerlaprotectiondespoissonsmigrateursvivantalternativementeneaudouceeten
eausalée.
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Illustration29:Coursd'eaujouantlerôlederéservoirbiologique
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L'articleL.21417duCodedel'environnement,alinéaI2°,préciseaussiquel'autoritéadministrative
établit,pourchaquebassinuneliste(diteliste2)decoursd'eau,partiesdecoursd'eauoucanaux
danslesquelsil estnécessaired'assurerletransportsuffisantdessédimentsetlacirculationdes
poissonsmigrateurs.Toutouvragedoityêtregéré,entretenuetéquipéselondesrèglesdéfiniespar
l'autoritéadministrative,enconcertationaveclepropriétaireou,àdéfaut,l'exploitant.
L'articlepoursuitenprécisantquecesobligationss'appliquent,àl'issued'undélaidecinqansaprès
lapublicationdeslistes,auxouvragesexistantsrégulièrementinstallés.
Leclassementenliste2autitredel'articleL.21417duCodedel'environnement(illustration31)est
effectif depuis la publication de l'arrêté du préfet coordonnateur de bassin LoireBretagne le
22juillet2012.
Lerétablissementdelacontinuitéécologiqueaudroit desouvragessituésdansdescoursd'eau
classésenliste2requiertquesoientprisesencomptelesespècesamphihalinesetholobiotiquesqui
ontjustifiéleclassementenliste2.
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Illustration30:Coursd'eauclassésenliste1autitredel'articleL.21417duCodedel'environnementdansle
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Lamiseenconformitédesouvragesvisàvisdesobligationsderésultat relativesà lacontinuité
écologique fait l'objet de contrôles ciblés prévus dans les plans de contrôle des missions
interservicesdel?eauetdelanature(MISEN)parlacirculairedu12novembre2010.
3.3.2 Lesprotectionsvolontaires
LeszonesspécialesdeconservationduréseauNatura2000
Les zones spéciales de conservation (ZSC) désignent des aires d'habitats d'espèces d'intérêt
communautaire,listésenannexe2deladirective«HabitatsFauneFlore»(DHFF).DanslesZSCse
mettentenplace,autraversdudocumentcontractuelqueconstitueledocumentd'objectifdusite
(DOCOB), des mesures destinées à éviter la détérioration des habitats et des mesures de
conservationrépondantauxexigencesécologiquesdeshabitatsnaturels.
Lesplansd'actionspourlapréservationetlagestiondeszoneshumides
LeSdage20102015prévoitquelesSagemettentenplacedesplansd'actionspermettantd'assurer
la gestion et l'entretien des zones humides sur leur territoire. Ce dispositif peut éventuellement
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Illustration31:Coursd'eauclassésenliste2autitredel'articleL.21417duCodedel'environnementdansle
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s'appuyer sur des contractualisations agroenvironnementales afin de favoriser un mode
d'exploitationagricolequipérenniselescaractéristiquesdezonehumidedesterrainsexploités.La
miseenoeuvredecesplansconcourtàlapréservationdeszoneshumides.
Lesschémasrégionauxdecohérenceécologique(SRCE)
LesSRCE,coélaborésparl'ÉtatetlesRégions,définissentlestramesvertesetbleues,constituées
decoeursdebiodiversitéreliésentreeuxpardescorridors.
L'articleL.3711duCodedel'environnementdisposequelatramebleuedesSRCEcontiennea
minimalescoursd'eau,partiesdecoursd'eauoucanauxclassésenliste1etliste2autitrede
l'articleL.21417duCodedel'environnement,ainsiquetoutoupartiedeszoneshumidesdontla
préservationoularemiseenétatcontribueauxobjectifsdebonétatdeseaux.
Lesdocumentsdeplanificationet lesprojetsde l'État, descollectivitésoudeleursgroupements
prennent en compte les SRCE et précisent les mesures permettant d'éviter, réduire, et le cas
échéant,compenserlesatteintesauxcontinuitésécologiques.
3.3.3 Réductiondesimpactssurlesmilieuxaquatiquesetleshabitats
Laréductiondesimpactspeut portersur leshabitatsdereproductionoudegrossissementmais
égalementsurlessecteursdemigrations.
Réductiondesimpactssurleshabitats
Leszoneshumidessontlesprincipauxhabitats,pourlesquelsdesmesuresderéductiond'impact
sontprévuesoupossiblesdanslesdocumentsdeplanificationdansledomainedel'eau.
LeSdageLoireBretagne20102015disposequelorsqu'unprojetimpacteunezonehumide,àdéfaut
detouteautrealternativeavérée,unecompensationdoitêtreprévuedanslemêmebassinversantet
àfonctionnalitéséquivalentes(dupointdevuedel'hydrologieetdelabiodiversité,disposition8B2
duSdageLoireBretagne20102015).Sanslaréuniondecestroisexigences,lacompensationdoit
portersuraumoins200%delasurfacedezonehumidedétruiteparleprojet.
LesSagepeuventdansleurrèglement(articleR.21247duCodedel'environnement)définirtoute
règlenécessaireaumaintienetàlarestaurationdesZHIEPetdesZSGE.
Pourassurerlarestaurationetlapréservationdelaqualitédel'eauetdesmilieuxaquatiques,les
Sagepeuvent égalementdéfinir des règlesparticulières d'utilisation de la ressourceeneauaux
opérationsentraînantdesimpactscumuléssignificatifsentermesdeprélèvementsouderejetsdans
lebassinversantouauxexploitationsagricolesprocédantàdesépandagesd'effluentsliquidesou
solides.
Réductiondesimpactssurlesmigrations
LeSdageLoireBretagne20102015prévoitquetouteopérationderestauration,modificationoude
créationd?ouvragetransversaldanslelitmineurdescoursd?eaufassel?objetd?unexamenportant
surl?opportunitédumaintienoudelacréationdel?ouvrage.Sicetexamenconclutàlapossibilitéde
créationd'unnouvelouvragetransversalenlitmineur,desmesurescompensatoiresdoiventalors
êtremisesenoeuvre. Cesmesurescompensatoires, présentéespar lemaîtred?ouvrage,doivent
prévoir,danslemêmebassinversant,desactionsd?effacementoud?arasementpartieloutouteautre
solution permettant de retrouver des conditions équivalentes de transport des sédiments, de
diversification des habitats, de vitesse de transfert des eaux (retardant la production de
phytoplancton)etdecirculationpiscicole.Adéfautdelaréuniondecesexigences,lacompensation
portesuruneréductioncumuléedechutesartificiellesd?aumoins200%,encherchantunecontinuité
linéairelaplusimportantepossible,surlemêmebassinversantouendernierrecourssurunautre
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immédiatementvoisin(disposition1B2duSdageLoireBretagne20102015).
L'exigencedecompensationnes?appliquepasauxouvragesexistants,légalementautorisésetdont
l?usageaétésuspendupourdesraisonsdesécuritépublique.
Parallèlement et afin d'améliorer le transport naturel des sédiments et d'assurer la continuité
écologique,lesSagepeuvent,dansleurrèglement(articleR.21247duCodedel'environnement),
définir touterèglefixant desobligationsd'ouverturepériodiquedecertainsouvrageshydrauliques
fonctionnantaufildel'eau.
3.4 Caractérisationdespressionsaltérantlesmilieuxaquatiquesetles
habitatsfavorablesauxpoissonsmigrateursamphihalins.
Lesmilieuxaquatiquescontinentauxoùviventlespoissonsmigrateursamphihalinssontexposésà
troisgrandescatégoriesdepressionsquesontl'altérationde:
? l'hydromorphologieavecnotammentlacontinuitéécologiqueetlaqualitédesetdeshabitats;
? l'hydrologieetlerégimethermique;
? laqualitédeseaux.
Lesréseauxdecontrôleetdesurveillancesuivisdepuis2007enapplicationdeladirectivecadresur
l'eaupermettentdedisposerd'unecaractérisationdel'étatécologiquedesdifférentesmassesd'eau
dubassinLoireBretagne,traduisantl'impactdecespressionssurlesmilieux.L'étatécologiquede
l'année2010afaitl'objetd'unevalidationparleComitédebassinenoctobre2012etestprésentéci
dessousdansl'illustration32.30,5%descoursd'eaudubassinLoireBretagnesontenbonoutrès
bonétatécologique.
Illustration32:Étatécologique2010descoursd'eau(Source:AELB,rapportàlaCommissionplanification,2012)
Le compartiment estuarien, qui constitue un espace essentiel dans l'adaptation des poissons
migrateursamphihalinsdumilieudulçaquicoleaumilieumarinetviceversa,estaffectéparlestrois
typesdepressionscitéscidessus.Leureffetseretrouvecumulédanslephénomènedubouchon
vaseuxestuarien,quiferal'objetd'undétailspécifique.
Enfin,lespressionss'exerçantsurlespoissonsmigrateursamphihalinsdanslemilieumarinseront
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égalementdétaillées.
Cetétatdeslieuxnepoursuitpasunobjectifdeprécisionexhaustif,maischercheplusàs'appuyer
surl'étatdeslieuxproduitdanslecadredelaDCEetàmettreenavantlespressionsmajeures
affectantlespopulationsdepoissonsmigrateursamphihalins.
3.4.1 Continuitéécologiqueetaccessibilitéauxhabitatsdereproductionetde
grossissement
Uneappréciationdelacontinuitéécologiqueàl?échelledubassindelaLoirepeutêtrefourniepar
l?indicateurdutauxd?étagement,développéedanslecadredelamiseenoeuvredeladirectivecadre
surl'eau.Letauxd'étagementestcalculéensommantleshauteursdeschutesartificiellesducours
d?eau, puisenlesdivisant par ledénivelénaturel du linéairederivièreconsidéré. Cet indicateur
intègre:
? lapertededissipationd?énergielelongducoursd?eau;
? laperted?habitatsetdediversité,parennoiementdeszoneslotiques,uniformisation,blocages
sédimentairesetcolmatage;
? ladifficultédefranchissementpourtouteslesespèces;
? l?altération de la qualité de l'eau, due au temps de séjour augmenté dans la retenue :
échauffement,évaporationetaggravationdel'eutrophisation.
Letauxd?étagementestuneapprochesynthétiqueduniveaud?altérationdel'hydromorphologied'un
coursd'eauetenparticulierdelapentenaturelleducoursd?eau,laquelleestlefacteurstructurant
l?orientation et la continuité de l?écoulement (eau et sédiments), la dynamique fluviale, la
diversificationetlaqualitédeshabitats,etlarépartitiondesespècesaquatiques.Letauxd'étagement
en2009desdrainsprincipauxdubassindelaLoireestdisponibledansl?illustration33.
Lefractionnementdesmilieuxaquatiquesparlacréationd'ouvragestransversauxestundesfacteurs
explicatifsdeladégradationdel'étatdeseaux.Engénéral,plusletauxd?étagementestélevé,moins
l'Indice«poissonsrivière»(IPR),indicateurde laqualitédespeuplementspiscicoles,estbon,et
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Illustration33:Tauxd'étagementdesprincipauxcoursd'eaudubassindelaLoireen
amontdubecdeVienne(Onema,2009)
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donc plus les peuplements de poissons sont dégradés (illustration34) : le bon état de ces
peuplements(enbleu)seréduitàmesurequeletauxd?étagementaugmente;inversementlerisque
denonatteintedubonétat(rose)augmenteavecletauxd?étagement.
Letauxd'étagementdémontreunesituationinégaleàl'échelledubassindelaLoire.SilaLoireet
l'Alliersontcaractérisésparunfaibleétagement,duàunfaiblenombred'obstaclesàl'écoulement,
d'autressousbassinsversantsprésententunétagementimportant(laVienneparexemple).Letaux
d'étagementprésenteégalementcertaineslimites:
? enzonedereliefimportant(bassinsversantsduMassifcentral,telquelebassinversantdela
Sioule),letauxd'étagementestartificiellementfaibledufaitdel'importantdénivelénaturel;
? enzonedemaraisetdeplaine,oùledénivelénaturelesttrèsfaible,unfaiblenombred'ouvrages
conduitàunétagementtrèsimportant.
Cetindicateurfaittoutdemêmeressortirlarelativepréservationdel'axeLoireAllier,quiconstitueun
hydrosystèmecontinudeprèsde1000kmavecunefaibledensitéd'ouvrages(unouvragetousles
vingt kilomètres dans l'Allier). Ce cas de figure est quasiment unique à l'échelle de la façade
atlantiqueeuropéenne.
Si les risques de mortalité au franchissement des ouvrages sont susceptibles d?augmenter en
fonction du nombre des ouvrages sur un cours d?eau, ils dépendent en premier lieu de la
configuration de ceuxci, liée à leur usage. Entre autres, les ouvrages à usage hydroélectrique
représentent une risque particulier de mortalité, compte tenu des risques d?entraînement des
poissonsdanslesturbines.
Lapolitiquenationalederestaurationdelacontinuitéécologique(traduiteparlepland'actionspourla
restaurationdelacontinuitéécologique),pilierdelapolitiquedereconquêtedubonétatdesmilieux
aquatiques,s'esttraduitepardesavancéesimportantesdepuislafind'année2009.Danslecadrede
la traduction des objectifs des lois Grenelle dans le IXème programme de l'Agence de l'eau
LoireBretagne,405ouvragesencoursd'eauontfait l'objetd'uneinterventionà lafinde l'année
2012.
Leseffortsdoiventnéanmoinssepoursuivrepourlerétablissementdelacontinuitéécologiquedans
les deux sens de migration, notamment à la dévalaison, et dans le respect des obligations et
échéances réglementaires. Aussi et bien que certains ouvrages aient déjà pu faire l'objet
d'aménagements pour la circulation piscicole, l'obligation de résultats impose une efficacité
permanenteetrequiertunentretienadéquat:
? certains ouvrages équipés sont sources de retard, soit par des difficultés d'attrait vers les
dispositifsdefranchissement,soitparunmanqued'entretiensetraduisantparuneobstructionde
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BassinsdelaLoire,delaSèvreniortaiseetdescôtiersvendéens?19février2014 62/98
Illustration34:Relationentreletauxd'étagementetl'état
despeuplementspiscicolesdubassindelaLoire(Source:
Onema,2010)
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cesmêmesdispositifs;
? certains ouvrages disposent d'équipements insuffisants pour être conformes au nouveau
classementdescoursd'eauenliste2autitredel'articleL.21417duCodedel'environnement
(obligationderétablirlacirculationpiscicoled'espècescibles,amphihalinesetholobiotiques,etla
circulationdessédiments).
Ces efforts doivent permettre aux espèces amphihalines de reconquérir les milieux jusqu?aux
ouvragesactuellement infranchissables,ditsverrous,etnonclassésenliste2autitredel'article
L.21417duCodedel'environnement.Sontconsidéréscommeverrous:
? lebarrageduPratsurleCher;
? lebarragedeLaRocheBâtl'AiguesurlaCreuse;
? lebarragedeVillerestsurlaLoire;
? lebarragedeSaintFraimbaultsurlaMayenne;
? lebarragedeChardessurlaVienne;
? lebarragedeQueuillesurlaSioule.
3.4.2 Hydrologieetrégimethermique
L'hydrologie est un facteur de contrôle important des migrations des poissons migrateurs
amphihalins.Eneffet,ledébitdescoursd?eauconditionnelestauxdesurviesàtouslesstadesdu
cycle biologique des poissons migrateurs amphihalins, dans tous les secteurs du bassin. En
particulier,lesdéficitshydrologiquesretentissentnégativementsurlesphasesdemigration,etlesflux
demontaisonetdedévalaisondesespècesamphihalinesdanslebassindelaLoire.
Lesfaiblesdébitsretardentl'engagementdesgéniteursenestuaire,amplifientl?effetdesobstacleset
augmentent les risquesdemortalité (échauffement plus rapide descoursd'eau). Demême, les
déficitshydrologiquessontsusceptiblesderetarderladévalaisondesespèces,pardiminutiondela
vitesseducourant(ilsselaissentengrandepartieporterparleflux),augmentationdelaprobabilité
de transit par les turbines des centrales hydroélectriques (plutôt que par les déversoirs ou
évacuateurs),etaugmentationdutempsd'attentedanslesretenuesdeseuilsetbarrages.
DanslecasdubassindelaLoire,l?incidencedel?hydrologieestd?autantplusfortequelescircuitsde
migrationsont plus longs. Il enrésultedes impactscumulatifsexacerbés, notamment encasde
sécheresseprintanière.
Outrecesévolutionsnaturelles,lamodificationdel'hydrologiepeutprovenirdesprélèvements,des
évolutionsdel'hydrographieparl'existencedeplansd'eau,oudelagestiondesétiagesetdescrues.
Lescruesjouentunrôleessentielpourlebonétatécologiquedescoursd'eau,notammentlespetites
cruesmorphogènesqui sont susceptibles demodifier le lit des coursd'eau, d'entretenir ainsi la
fonctionnalité des habitats, et de faciliter les mouvements migratoires, enparticulier en agissant
commeunstimulusdeladévalaison.
Lapressionexercéeparlesprélèvementssemanifestepardespompagesdanslescoursd'eaupour
divers usages (AEP, irrigation, abreuvement notamment) ou par des dérivations d'une certaine
quantité du débit sur un linéaire spécifique, par exemple pour l'alimentation d'une usine
hydroélectrique.
La gestionéquilibrée de la ressourceeneau fait l'objet duchapitre 7duSdageLoireBretagne
20102015.
Les plans d'eaumodifient également l'hydrographie naturelle du bassin versant. Afin de réduire
l'impact des plans d'eau sur les fonctionnalités écologiques des bassins versants, le Sdage
LoireBretagneencadre la créationet la régularisationdesplansd'eau(orientation1CduSdage
LoireBretagne20102015).Enparticulier,lacréationdenouveauxplansd'eaun'estplusautorisée
danslesbassinsversantscontributeursdesréservoirsbiologiquesouencasdedensitéimportante
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de plans d'eau. Aussi, les plans d'eau autorisés depuis 2010 doivent être isolés du réseau
hydrographiqueparuncanal dedérivationavecunprélèvementdustrict volumenécessaireaux
usagesassociésaupland'eauouêtrealimentésparruissellement.
Toutouvragerégulièrementautoriséquiengendreunobstacleàl'écoulementouladérivationd'une
partiedudébitducoursd'eau(alimentationd'unpland'eau,brasusinier...)faitl'objetd'unedécision
administrative.Enparticulier,cettedécisiondéfinitledébitréservédevantêtrelaissédanslecours
d'eaunaturel.Cedébitréservédoitpermettrede maintenirentouttemps,danslecoursd?eauun
débitminimalgarantissantenpermanencelavie,lacirculationetlareproductiondesespècesvivant
dansleseauxaumomentdel?installationdel?ouvrage.Cedébit estdit débit minimalbiologique
(DMB).Apartirde2014,ledébitréservénepeutpas,saufcasparticuliers,êtreinférieuraudixième
dumoduleducoursd'eauaudroitdel'ouvrage.
Aussi, le développement des différents usages, en particulier l'alimentation en eau potable, le
fonctionnementdescentralesnucléairesetl'agriculture,aconduitsurl'AllieretlaLoireàmettreen
placeunesystèmedesoutiendesdébitsenpérioded'étiage.Ilintroduittoutefoisuneartificialisation
significative du régimehydrologique, que le cadre défini pour encadrer son fonctionnement tend
cependantàlimiter.
Danslecontexteduchangementclimatique,lesévolutionsdurégimehydrologiquedanslebassinde
laLoire tendraient vers uneoccurrenceplus fréquented'étiagesplus marquéset plus longs. La
gestiondespoissonsmigrateursamphihalinsdevrasefairedanscesperspectives.
3.4.3 Qualitédeseaux
L'altérationdelaqualitédel'eauetdesmilieuxaquatiquespeutavoirpourorigine:
? lesmacropolluantsd'origineorganique,dontlapollutionparlesnutriments;
? lesmicropolluants.
Cespolluantssontsusceptiblesd'avoir uneffetdirectsur lespoissonsmigrateursamphihalinsen
perturbantleurmétabolismeetleurcomportementouuneffetindirectendégradantlaqualitédeleurs
habitats vitaux. Cela peut être le cas des apports en nutriments, à l'origine de phénomènes
d'eutrophisationpouvantaltérer l'oxygénationdumilieu, etainsi lasurviedespoissonsmigrateurs
amphihalinsdanscertainshabitatssurunepartiedel'année.
Cependant,àtitreindicatif,enLoireaval, lesconcentrationsmaximalesennitratesàlastationde
mesuredeSainteLucesurLoirenedépassentguère25mg/l,avecunesaisonnalitémarquée:les
plus fortesconcentrationsétant observéesenhiver. Entre1984et 2010,aucunetendancenese
dégage pour les teneurs en nitrates à la station de SainteLucesurLoire. Pour ce qui est du
phosphore,lasaisonnalitéestmoinsmarquéeetilestplutôtobservéeunecroissancedelateneuren
phosphore avec l'augmentation du taux de matières en suspension (MES), le phosphore étant
majoritairementadsorbésurlesMES.
Ainsi,lamiseenoeuvredesdirectiveseauxrésiduairesurbainesetnitratescontribuedepuis1991à
réduirelapollutionparlesmacropolluantsd'originesdomestique,industrielleetagricole:
? ladirectiveeauxrésiduairesurbainesaconduitàclasserl'ensembledubassindelaLoireetdes
côtiersvendéensenzonesensibleàl'azoteetauphosphoreavecdeuxéchéancespourlamise
enconformitédesstationsdetraitementdeseauxuséesdesagglomérationsdeplusde10000
équivalentshabitants,en2013et2017.Cettedirectiveconsisteàmettreenplacepourtoutesles
agglomérationsd'assainissementunsystèmedetraitementdeseauxuséesadapté,c'estàdire
respectantlesobjectifsdequalitédeseauxréceptricesafindenepascompromettrelesusages
quiysontassociés.
? ladirectivenitrateschercheàréduirelapollutiondescoursd'eauparlesnitratesd'origineagricole
etàcontenir lephénomèned'eutrophisationdescoursd'eauetdeseauxcôtières.Samiseen
oeuvresetraduitparladélimitationdezonesvulnérables(illustration35)surlesquellessontmisen
oeuvredesplansd'actionsquadriennauxvisantàfaireévoluerlespratiquesagricolesversune
réductiondesapportsennutrimentsetuneréductiondestransfertsverslescoursd'eau.Elleest
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accompagnée aussi d'incitations à modifier les pratiques agricoles: mesures
agroenvironnementalesenfaveurd'uneréductiondesintrantsetdel'agriculturebiologique,aides
pourlasécurisationdel'utilisationdespesticides,laplantationdehaies,l'implantationdezones
tamponsépuratoires...
Ceseffortsconcourentàréduireprogressivementlestauxdenitratesdansleseauxsuperficielleset
participent ainsi à uneaméliorationdubilanenoxygènedescoursd'eau, élément favorable aux
poissonsmigrateursamphihalins.Localement,desaltérationsdubilanenoxygènepeuventencore
êtrerencontréesappelantàmaintenirlesefforts.
La DCEconfirme les objectifs de cesdirectives sectorielles, dont la mise enoeuvre contribueà
l'atteintedubonétatdesmassesd'eau.Elleexigeparailleursdesrésultatsenmatièrederéduction
desrejetsdesubstancesdangereuses.Surcepoint,despolluantsd'origineindustrielle(commeles
polychlorobiphénylesPCB et les hydrocarbures aromatiques polycycliquesHAP) sont également
retrouvésdanslesmilieuxaquatiquesdanslebassindelaLoire,essentiellementdanslessédiments.
Lapollutiondessolsetdessédimentsaconduitàl'interdictiondel'usagedesPCBen1987.Compte
tenudespropriétéslipophilesdesPCB,lesespècespiscicolesvivantaucontactdessédimentssont
exposées à un risque d'accumulation accru de PCBdans leur tissus adipeux. C'est le cas des
anguillesnotamment.LeurcontaminationparlesPCBlorsdeleurgrossissementeneaudouceapour
conséquence une réduction des capacités reproductives des anguilles argentées. Afin de mieux
connaîtrel?étenduedelacontaminationdescoursd?eauparlesPCB,unplaninterministérield?actions
aétélancéentre2008et2012.Ceplans?articulaitautourdesixaxes:
? intensifierlaréductiondesrejetsdePCB;
? améliorerlesconnaissancesscientifiquessurledevenirdesPCBdanslesmilieuxaquatiqueset
gérercettepollution;
? renforcerlescontrôlessurlespoissonsdestinésàlaconsommationetadopterlesmesuresde
gestiondesrisquesappropriées;
? améliorerlaconnaissancedurisquesanitaireetsaprévention;
? accompagnerlespêcheursprofessionnelsetamateursimpactésparlesmesuresdegestiondes
risques;
? évalueretrendrecomptedesprogrèsduplan.
LesHAP,moléculeshydrophobes,s'adsorbentsurlessédiments.EnLoireaval,touteslesmolécules
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Illustration35:LeszonesvulnérablesauxnitratesdanslebassinLoireBretagne
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utiliséesdelafamilledesHAPontététrouvéesdansdesanalysesdesédimentsmenéesentre1996
et 2011. La remise en suspension de ces molécules, notamment par les dragages, reste peu
caractérisée.
Concernantlespesticides,leplanEcophytoaétélancéen2008parl'Étatafinderéduirel'usagedes
pesticidestoutenmaintenantuneagricultureéconomiquementperformante.Atitreindicatif,enLoire
aval,lamoléculelaplusfréquemmentidentifiéeestl'AMPA(produitdedégradationduglyphosate),
qui est présente dans 50% des échantillons analysés entre 1996 et 2011. L'atrazine déséthyl,
l'atrazineetlediruonsontlesmoléculeslesplusfréquemmentretrouvéesaprèsl'AMPA.
Les PCB, HAP et une partie des pesticides sont susceptibles de jouer le rôle de perturbateurs
endocriniens.L'effetdecesperturbateursendocrinienssurlespoissonsmigrateursamphihalinsreste
àcejourpeuconnu.
Audelàdesobjectifsd'étatdesmassesd'eaudéfinisparleSdageLoireBretagneetdesobjectifsà
atteindreenconséquenceentermesdequalitédeseaux, telsque fixéspar l'arrêtéministérieldu
25janvier2010,lesSagepeuventdéfinirdesobjectifsspécifiquesdequalitédeseauxafind'atteindre
leurspropresobjectifsdéfinisauvudesenjeuxduterritoire.
3.4.4 BouchonvaseuxestuariendelaLoire
En provenance des bassins versants, de l'océan ou du fond du lit des fleuves, les sédiments
transitentets?accumulentdanslesestuaires,formantuntapissurlefond,mélangedevaseetde
matièreorganique.Eneffet,pourl'estuairedelaLoire,larencontredesfluxenprovenancedufleuve
(27Gm3/an)etdel'océan(150Gm3/an)induisent,notammentenpériodedemorteseaux(faibles
coefficientsdemarée),defaiblesvitessesd'écoulements(faibledébitfluvial,faiblesdébitsdeflotset
dejusants)quiengendrentundépôtsédimentairesurlefonddel'estuaire.
Sousl?actiondescourants,demaréeoudecrue,lavaseetlamatièreorganiquesontremisesen
suspensionetconstituentlebouchonvaseux.L?extensiondubouchonvaseuxdépendnotammentdu
coefficientdemarée:plusceluiciestélevépluslavaseestmiseensuspensionetestdisperséesur
unegrandedistance(illustration36).
Ledéplacementdubouchonvaseuxdansl?estuaireestprincipalementconditionnéparledébitdu
fleuve: lorsque le débit est faible, la mer pénètre davantage dans l?estuaire et fait remonter le
bouchonvaseuxenamont;lorsdescrues,leseauxdoucespeuventexpulserlebouchonvaseux
versl'estuaireexterne.Ladynamiquedubouchonvaseuxdel'estuairedelaLoireestdétailléci
dessousdansl'illustration37.
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Illustration36:Évolutiondelateneurenmatièresensuspensionenfonctionducoefficientdemaréedans
l'estuairedelaLoire(GIPLoireestuaire)
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Ladégradationdesgrandesquantitésdematièreorganiquecontenuesdans le bouchonvaseux
consommedel?oxygèneetpeutentraînerdeshypoxiespréjudiciablespourlespoissonsmigrateurs
amphihalins.CesdéficitssontmajoritairementobservésenavaldeNantes,lesplusintensesétant
mesuréspendantlesviveseauxestivales(lestempératuresélevéesfavorisentladégradationdela
matièreorganique). Enhiver et auprintemps, lesdébits élevéset les températuresplusbasses
favorisentl?oxygénationdeseaux(illustration38).
Lesaménagementssuccessifsdel'estuairedelaLoirepourlanavigation(chenalisation)ontmodifié
sonfonctionnementhydromorphologique.Alorsquelefrontdemaréedynamiqueneremontaitque
jusqu'àNantesaumilieuduXIXesiècle,ilremontedésormaissurprèsde100km,jusqu'àhauteur
d'Ancenis.L'augmentationdesfluxdepolluantsenprovenancedubassindelaLoiredepuiscette
mêmepériodeacontribuéégalementàl'augmentationdesvolumesdematièresetdesteneursen
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Illustration38:ÉvolutiondesconcentrationsenO2dansl'estuairedelaLoireenrelation
avecledébitetlatempératuredel'eau(exempledel'annéehydrologique20072008)
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Illustration37:Localisationdubouchonvaseuxdansl'estuairedelaLoire(GIPLoireestuaire)
polluantsdubouchonvaseux. Cetteaccumulationdepolluantspeutêtrepréjudiciableauxpoissons
migrateursamphihalinsquiséjournentplusieurssemaines,voirequelquesmois,enestuaire:civelles,
flets,éperlans,esturgeons.
Les réseaux de suivi de la qualité des eaux de l'estuaire ont permis de mieux comprendre la
dynamiquedubouchonvaseux et permettent dedisposer d'uneappréciation deson impact sur
l'adaptationdespoissonsmigrateursamphihalinsenestuaire.Lepassagedel'estuairereprésente
unephaseobligatoireetessentielledanslecycledeviedespoissonsmigrateursamphihalins.Ces
espècesutilisenteneffetl'estuaire pour se nourrir, se réfugier, ou transiter. Selon leur période de
présence, elles sont plus ou moins impactées par les hypoxies.
Lesconnaissancessurlesrythmesmigratoiresontpermisd'analyserl'impactdubouchonvaseuxsur
lesdifférentespopulationsdepoissonsamphihalins,enfonctiondeleurprésenceenestuaire.Lecas
dusaumonestdétaillécidessousdansl'illustration39.
Cesdonnéesindiquentquelespériodesd'hypoxiesévèresontrencontréesessentiellemententre
juilletetoctobre.Lesgéniteurspotentielsenmontaisonquientreraienttôtdansl?estuairedelaLoire
pourraientêtreaffectésparunepérioded'hypoxietardive.Lessmoltsquitransitentenestuaireen
juinsontplusexposésaurisqued'hypoxiesévèrequeleurscongénèresarrivésplustôtenestuaire.
Les réseaux de suivis de l'estuaire de la Loire permettent également de calculer la durée des
périodes d?hypoxie, généralement citée commeun facteur clé pour la capacité de résistanceet
d?adaptation des poissons à ces déficits en oxygène. Sur la période20092012, la plus longue
périoded'hypoxieaatteintaumoins23jourset20heuresauPellerin(août2010),etplusde25jours
àCordemais(aoûtseptembre2012).
3.4.5 Pressionssurlemilieumarin
Danslemilieumarin,lesaltérationsducycledeviedesamphihalinscorrespondentàdesrésultantes
depressionsapportéesparlesfluxcontinentauxouàdespressionsspécifiques.
Lesapportsenpolluants(nutriments,substancesdangereuses...)sontsusceptiblesd'affecterlecycle
deviedespoissonsamphihalins, notammentsur leplateaucontinentalparuneaccélérationdes
phénomènes d'eutrophisation (se manifestant par les marées vertes sur le littoral) ou une
contaminationdesfondsmarinsaudroitdeszonesdenourricerie,réduisantleurproductivitéavecun
risquederépercussionsurl'équilibretrophique.Lesdragagesdesfondsestuariensoumarins,entre
autrespour la navigation, et le clapagedessédimentsdraguésenmer est unautre facteur de
déséquilibrepotentiel.
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Illustration39:Interactionentrelebouchonvaseux(concentrationminimalesenO2dissous
atteintesentre2007et2010)etlaprésencedessaumonsadultesetdessmoltsdansl'estuaire
delaLoire(GIPLoireestuaire)
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Enparallèle,lesévolutionsclimatiquesconstatéesengendrentprogressivementdesmodificationsde
lacourantologieetdupositionnementdesairesdegrossissementdesespècespotamotoques,qui
sontautantdefacteurspouvantaugmenterlesdistancesdemigration.
Les prélèvements par les pêcheries, pouvant constituer des valorisations accessoires, ne sont
vraisemblablementpasnonplusnégligeables.Atitred'exemple,lespêcheriesdemaquereauxen
Islande et aux îles Féroé ont capturé accidentellement, d'après les déclarations de capture
disponiblespourlesannées2010et2011,enmoyenne1,5saumonpour1000tdemaquereaux.
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4 Orientationsdesmesuresdegestionpourlapériode
20142019
4.1 Synthèsedespressionssurlesespècesamphihalines
L'étatdeslieuxdeshabitatsetdesespècesmetenévidencelesdifférentespressionsauxquelles
sontexposés lespoissonsmigrateursamphihalins. Cespressionsconcernentd'abord lesmilieux
aquatiquesetleshabitats,etenaffectentlaproductivité:
? altérationdelacontinuitéécologiqueetdelamorphologiedescoursd'eauengendrantdes
pertesdefonctionnalitésécologiques(réductiondesconnexionslatéralesetlongitudinales,
complexificationdescircuitsdemigrations);
? altérationdelaqualitédeseaux,rendantlesespècesamphihalinesplusvulnérables;
? modification de l'hydrologie, se traduisant par des adaptations nécessaires des espèces
amphihalines à unehydrologie réguléeou réduite (par les prélèvements) et impactant le
régimethermiquedescoursd'eau.
Mais les poissons migrateurs amphihalins sont également exposés à des pressions de
prélèvements:
? lespressionslistéescidessusets'exerçantsurlemilieuaquatique,ainsiquelesintroductions
d'espèces exotiques, sont susceptibles de provoquer des déséquilibres établissant de
nouvelles relations entre proies et prédateurs et nécessitant l'adaptation des poissons
migrateursamphihalins;
? lesprélèvementsparpêche.
LesinterventionsduPlagepomidoiventseconcentrersurlesquatrefacteurs,dits«maîtrisables»,
surlesquelsdeseffetspeuventêtreobtenus,àsavoir:
? laqualitédeseaux;
? lacontinuitéécologique;
? lamorphologieetleshabitats;
? lesprélèvementsparpêche.
Les actions sur les trois premiers axes permettent d'améliorer l'accessibilité aux habitats de
reproductionetdegrossissement,lafonctionnalitédesestuairesetlaproductivitédeshabitatseneau
douce.
Desactionssontaussisusceptiblesd'avoirdeseffetssurlesinteractionsproiesprédateursetsur
l'hydrologie,maisdemanièrepluslimitée.
Ilfautrappelerparailleursl'existencedepressionsqualifiéesde«nonmaîtrisables»autraversdu
Plagepomi:
? lespressionspropresaumilieumarin;
? lechangementclimatique.
PourchacundesdixsousbassinsversantsidentifiésparlePlagepomi,lespressionsrelativesàla
qualitédeseaux,àlacontinuitéécologiqueetàlamorphologie,àl'hydrologie,sontappréciéesen
regarddel'étatdeslieuxdesmassesd'eauétablienapplicationdeladirectivecadresurl'eau.Une
évaluationqualitativedelapressiondeprélèvementsparpêcheestégalementproposée.Pourle
saumonetlatruitedemer,cettepressiondepêchecorrespondàunepressiondepêcheaccidentelle
ouillégalecomptetenudesinterdictionsdepêcheeneaudouce.Ilestendemêmepourlesaloses
dans le bassin de la Sèvre niortaiseainsi quepour les lamproies dans les bassinsde la Loire
bourguignonne,delaMaineetdelaSèvreniortaise.
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Un faible niveau de pression sur un facteur maîtrisable conduira à une prépondérance des
orientations de préservation, tandis qu'un fort niveau de pression impliquera sur les facteurs
concernésàprivilégierlesorientationsderestauration(illustration40).Lesactionsdepréservationet
derestaurationserontmenéesprioritairementdanslessousbassinsversantsenfonctiondesenjeux
identifiéspourlesdifférentesespèces(illustration41).Lesopérationsd'acquisitiondeconnaissances
pourrontportersurlesdifférentssousbassinsversants,notammentceuxoùunenjeuimportantapu
êtreidentifiépourl'espèceconsidérée.
4.2 ObjectifduPlagepomi
Lasynthèsedespressionsauxquellessont exposées lesespècesmigratricesamphihalineset la
précision des enjeux relatifs à chaqueespèce conduisent à identifier un objectif de long terme
communpourlagrandealose,l?anguilleeuropéenne,lesaumonatlantiqueetlalamproiemarine:la
préservation et la reconquête de la viabilité pérenne des populations sauvages dans les
bassinsdelaLoire,delaSèvreniortaiseetdescôtiersvendéens.
Tousleseffortsdéployésdoiventseconcentrersurl?atteintedecetobjectif,cequisupposed?agir:
? enprioritépourlapréservationetlareconquêtedeshabitatsetdelacontinuitéécologique,
notammentdanslesbassinsversantsmodérémentanthropisés,descoursd'eauclassésen
liste2autitredel'articleL.21417ducodedel'environnementpourlespoissonsmigrateurs
amphihalinsetdelazoned?actionsprioritairespourl?anguille;
? aucasparcasetenaccompagnementpardesmesuresd?encadrementdespratiquesde
pêcheoudesoutientemporairedeseffectifs.Cesdernièresopérationsseront pleinement
valoriséespourmaintenirl?évolutionfavorabledespopulationsversleurviabilité,enparallèle
desactionsdepréservationetdereconquêtedeshabitatsetdelacontinuitéécologique;
? en faveur d?une poursuite de l?acquisition des connaissances afin de renforcer la
compréhensiondufonctionnementdespopulations.
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Illustration40:Caractérisationdespressionsprépondérantessurlesneufsousbassinsversants
Illustration41:Synthèsedesenjeuxrelatifsàchaqueespècedanslesneufsousbassinsversants
NB:Pourlesespècesdontleseffectifsoulesconnaissancessontfaiblesetnepermettentpasd'identifierunenjeuterritorial,
«noncaractérisé»signifiequel'espècepeutêtreprésentedanslebassinversantetqu'unenjeupeutexister,et«absent»
signifiequel'espècen'estpasprésentedubassinversant.
Anguille Saumon Aloses Lamproies Truite de mer Flet Mulet porc Esturgeon
Allier moyen fort moyen moyen non caractérisé absent non caractérisé absent absent
Loire bourguignonne moyen moyen fort moyen non caractérisé absent non caractérisé absent absent
Loire moyenne fort moyen fort moyen non caractérisé non caractérisé non caractérisé non caractérisé non caractérisé
Cher fort faible fort fort non caractérisé absent non caractérisé absent absent
Vienne fort moyen fort fort non caractérisé non caractérisé non caractérisé non caractérisé non caractérisé
Maine fort faible moyen moyen non caractérisé non caractérisé non caractérisé non caractérisé non caractérisé
Loire aval fort moyen moyen moyen non caractérisé non caractérisé non caractérisé non caractérisé non caractérisé
fort faible moyen moyen non caractérisé non caractérisé non caractérisé non caractérisé non caractérisé
Côtiers vendéens fort faible faible moyen non caractérisé non caractérisé non caractérisé non caractérisé non caractérisé
Eperlan
Sèvre niortaise
Pressions
Qualité de l'eau Continuité écologique et morphologie Hydrologie Prélèvements par pêche
Allier moyenne moyenne faible faible
Loire bourguignonne faible moyenne faible faible
Loire moyenne moyenne faible faible moyenne
Cher moyenne forte moyenne faible
Vienne moyenne moyenne moyenne faible
Maine forte forte moyenne faible
Loire aval forte forte moyenne forte
moyenne forte moyenne moyenne
Côtiers vendéens moyenne forte forte forte
Sèvre niortaise
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L?atteintedecet objectif requiert la recherched?uneconciliationdesenjeuxbiologiquesetsocio
économiquesassociésauxespècesmigratricesamphihalinesdanslesterritoires,enveillantàceque
lapriseencomptedecesderniersnecompromettepasl?atteintedeceluici.
Danslecasparticulierdusaumon, l'atteintedelaviabilitéde lapopulationsauvageconfèreune
prioritédepréservationdeshabitatsfonctionnelsetderestaurationdelacontinuitéécologiqueaux
territoires du bassin versant de l'Allier où se concentrent aujourd'hui les habitats productifs
accessibles sur lesquels est constatée la reproduction de saumons sauvages. L'atteinte de cet
objectif suppose un suivi de l'évolution tendancielle d'une série d'indicateurs reliant l'habitat au
développementdessaumons,commeparexempleletauxdesurviedesoeufs,letauxdesurviede
l?oeufausmolt,letauxdemortalitéàladévalaison,lenombredefrayères,lelinéairedecoursd?eau
accessible... Lesobjectifspources indicateurssont d'évoluer favorablement entre2014et 2019.
Enfin,àtitreindicatif,leCSPavaitfaitétaten1999enpremièreapproched'uneffectifdeviabilitéde
1700saumonsparanàVichy. Cettevaleurguidehistoriqueseraréviséelorsquelaconcertation
prévueendispositionsP4BetC2Dseraaboutie.
4.3 Troisorientationsfondamentalestechniques(OF)
AuregarddelaStranapomietdel'analysedespressionsconnuesetmaîtrisables,troisorientations
fondamentalestechniquesontétédéfiniespourbâtirleprésentPlagepomi:
? PPréserveretnepasdégraderl?existant:Cetteorientationfondamentaleprioritairerecouvre
aussibienlesespècesqueleshabitats.Ellerépondauxobjectifsdeprotectiondeshabitats,de
pêche durable des espèces amphihalines ou de fermeture de pêche selon la situation des
espèces,etderenforcementdelaprotectiondesespèces.
? R Reconquérir et restaurer les milieux favorables aux espèces amphihalines: Cette
orientationfondamentaleporteessentiellementsurleshabitats,leurqualitéetleuraccessibilité.
Desmesuresdesoutientemporaired?effectifsauregardd?unniveaudepopulationactuellement
insuffisantpourgarantirlapérennitéàlongtermedelapopulationsurlebassindegestionpeuvent
égalementcontribuerauxobjectifsdecetteorientationfondamentale.
? C Améliorer les connaissances et le suivi des populations dans un contexte de
changementglobal: Cetteorientationfondamentaleest indissociabledesdeuxpremières.La
connaissancedoitresteraucoeurdelaprisededécisiondesgestionnaires.Lesobjectifsdecette
orientationfondamentaleonttrait auxthématiquesbiologiques(caractérisationducomportement
desespèces...)etsocioéconomiques(caractérisationdelapressiondepêche,desouvrages,des
retenuesd'eau...).
La traduction opérationnelle de ces trois orientations fondamentales techniques s?appuie
nécessairementsurunequatrièmeorientationfondamentaletransversale(OFG,cf.paragraphe4.4),
visant à promouvoir le renforcement de la coopération entre les différents niveaux de
gouvernance,dudistrictLoireBretagneaubassinversantlocal.Cetteorientationfondamentale
repose sur la proposition d?une nouvelle place aux décideurs locaux, à travers notamment les
commissions localesde l?eau(CLE), ainsiquesur le partaged?expérienceset la communication
autourdelaproblématiquedespoissonsamphihalins.
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Chaqueorientationfondamentaleestdétailléeenorientations,dispositions.Unprogrammede
mesuresaccompagnelesdispositionsetpermetdeguiderleurdéclinaisonopérationnelle.
Lesorientationsetdispositionsrestentgénérales,àl'exceptiondequelquescasparticuliers.
Leprogrammedemesuresprécise l'espèceet lesbassinsversantsprioritaires. Lechamp
d?applicationterritorialdesmesuress?appuieaumaximumsurleszonagesexistants:cours
d?eaunécessitantlaprotectioncomplètedespoissonsmigrateursamphihalins,linéairesde
frayèresclassés,réservoirsbiologiques...
LesorientationsetdispositionsduPlagepomisontrédigéesdefaçon«autoportée».Ainsi,la
lectureetl'appropriationduPlagepomisontfacilitéesetl'insertiond'élémentsdecontenudu
PlagepomidansleSdageenserarendupossible. Eneffet, le Plagepominepossède une
portée réglementaire que pour soncontenu relatif à la pêche et ausoutiend?effectif. Le
contenuduPlagepomiconcernantlesmilieuxaquatiquesetleshabitatsn'aquevaleurde
recommandation. Or, l'essentiel des limites rencontréesdans l'atteinte depopulations de
poissonsmigrateursamphihalinsviablesconcernentlaqualitéetlafonctionnalitédesmilieux
aquatiques.Decefait,l'enjeuestdecréerdesliensavecleSdageetlesSage,documentsde
planificationopposablesdansledomainedel'eauetdesmilieuxaquatiques.
IlestainsiprécisédanslesorientationsetdispositionsduPlagepomi:
? l'existenced'orientationset/oudedispositionssimilairesdansleSdageLoireBretagne
20102015,qu'ilconviendraitdechercheràreconduiredansleSdage20162021;
? l'intérêtquecertainesdispositionsduPlagepomi20142019,notammentcellesrelatives
auxmilieuxaquatiquesetauxhabitats,soientreprisesdansleSdage20162021,afinde
leurconféreruncaractèreopposable.
Cettedémarchesejustifie,considérantquelesactionsenfaveurdespoissonsmigrateurs
amphihalins,donclamiseenoeuvreduPlagepomi,concourentàl'atteintedesobjectifsdela
politiquedepréservationetderestaurationdemilieuxaquatiquesissusdelaDCE.
LesorientationsetdispositionsduPlagepomidoiventainsiapporter,notammentencequi
concernelesmilieuxaquatiquesetleshabitats,despropositionsd'évolutionoudemaintien
delaréglementationetdesdocumentsdeplanificationenvigueurdansledomainedel'eau
etdesmilieuxaquatiques.
4.4 OFG:Unecoopérationdanslagouvernance
Enappuiauxtroisorientationsfondamentalestechniques,décritesciaprès,l'orientationrelativeàla
gouvernancepréciseladoublecohérencenécessaireàlamiseenoeuvreduPlagepomi:
? cohérence thématique: entre la thématique des poissons migrateurs amphihalins et la
thématiquedesmilieuxaquatiques;
? cohérence en matière de gouvernance: entre l'échelon du bassin hydrographiqueet du
Cogepomi, les partenaires techniques et l'échelon des décideurs locaux en matière de
milieuxaquatiques(CLE).
L'insertiondelagouvernancedespoissonsmigrateursamphihalinsdanslagouvernancedel'eauet
desmilieuxaquatiquesinviteàprivilégierlesoutilsexistants.
Plandegestiondespoissonsmigrateurs20142019
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4.4.1 OrientationG1:Maintenirunpilotagepartenarialdebassinsurlagestiondes
poissonsmigrateursamphihalins,inscritdanslecontextedelagouvernancedel'eau
etdesmilieuxaquatiques
Afindeconserverlavisibilitédelathématiquedespoissonsmigrateursamphihalins,ilconvientde
maintenir unecoordinationde lamiseenoeuvredecettepolitiquepar l'Étatet sesservices, qui
assurentlesecrétariatduCogepomi.
DispositionG1A:LesecrétariatduCogepomipilotelacoordinationdelamiseenoeuvredes
mesuresdegestion.
UnerépartitionthématiqueestretenueauniveaudusecrétariatduCogepomientre:
? la Dreal des Pays de la Loire, en chargede la déclinaison duPlagepomi pour les espèces
thalassotoques.ElleestencelaenchargenotammentdelacoordinationduPlagepomiavecle
plan de gestion de l'anguille (PGA) pris par la France en application du règlement visant la
reconstitutiondustockd'anguilleseuropéennes.EllepilotelePGAsurleterritoireduCogepomi;
? laDrealCentre,délégationdebassinLoireBretagne,enchargedeladéclinaisonduPlagepomi
pourlesespècespotamotoques.Elleestencelaenchargenotammentdelagestiondusaumon
atlantique,aveclepilotageduvoletduPlagepomirelatifausaumonatlantique,ditplansaumonde
LoireAllier.
LesecrétariatduCogepomitravailleenconcertationaveclaDirectiondel'eauetdelabiodiversitédu
ministèreenchargedel'écologieetveilleenparticulieràlabonnecirculationdesinformationssur
l'anguille(relationsentrePlagepomietPGA),parexempleausujetdesdonnéesdecaptures.
Disposition G1B: Le Cogepomi informe en tant que de besoin le Comité de bassin de
l'avancementduPlagepomi.
Cettedispositioncorrespondàlatraductionlocaledel'orientation13delastratégienationalepourles
poissonsmigrateursamphihalins,quiprévoitderapprocherlagouvernancedespoissonsmigrateurs
delagouvernancedel'eauetdesmilieuxaquatiques.
Lesecrétariat duCogepomiveilleàassocier lesacteursde l'eauetdesmilieuxaquatiquesà la
concertationdans laprisededécision. Enparticulier, il travaille encollaborationétroiteavec les
instancesdubassinLoireBretagne,notammentdanslapériodederévisionduSdagejusqu'enfin
d'année2015.
Disposition G1C: Le secrétariat du Cogepomi pilote le Plagepomi en s'appuyant sur
différentspartenaires.
LesecrétariatduCogepomipeutnotammentpérenniserouinstaurerdesgroupesd'appuiaupilotage,
rassemblantdespartenairessusceptiblesd'apporteruneanalyseobjectiveéclairantlaconduitedu
plandegestion.
Cesgroupesontvocationàapporterunregardcritiqueetàfaireémergerdespropositionspouvant
alimenterdesdocumentsdecadrageouinitierdesdémarchesverslessousbassinsversants.Les
projetsdedécisionssontétablisensynthèsedestravauxdecesgroupesetadoptésparlesecrétariat
duCogepomi,éventuellementaprèsconsultationdespartenaireslocauxoudebassinsurlessujets
quilenécessiteraient.
LespartenairesimpliquésdanslamiseenoeuvreduPlagepomisontnotamment:
? descollectivitésouleursgroupements;
? desétablissementspublics;
? desassociationsoufédérationsassociatives;
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? desentreprises.
4.4.2 OrientationG2:Associerlesinstanceschargéesdelagestiondel'eauetdes
milieuxaquatiquesàladéclinaisonduPlagepomi.
Lepartenariataveclesacteurslocauxdelagestiondel'eauetdesmilieuxaquatiquesestunenjeu
essentielduPlagepomi20142019.
G2A:Al'échelledessousbassinsversantsidentifiésauchapitre3oud'entitésexistantes
par ailleurs (bassin versant d'un Sage, périmètre d'un EPTB), une concertation peut être
instauréeenfaveurdespoissonsmigrateursamphihalins.
LesCLEouleurscommissionsthématiquesorganisentdeséchangessurlespoissonsmigrateurs
amphihalinsetlamiseenoeuvreduPlagepomi.Lesobjectifsdecettedémarchesontde:
? favoriserl'appropriationlocaledelathématiquepoissonsmigrateurs,endiffusantlocalementles
informationsacquisessurlespoissonsmigrateursamphihalins,afindesusciterunemobilisation
localesurlesujet,pouvantparexemplesetraduirepardesdispositionsrelativesauxpoissons
migrateursamphihalins dans lesplans d'aménagement et de gestion durable de l'eauet des
milieuxaquatiquesdesSage;
? mettre à disposition des acteurs locaux les éléments, notamment de cadrage ou de
connaissances,ayantpuêtreproduitsparailleursdanslamiseenoeuvreduPlagepomi.Cette
informationpermetenretourdefaireémergerdesbesoinslocalementqu'ilpeutêtreintéressantde
traduiredanslecadreparexempled'uncontratterritorialenfaveurdesmilieuxaquatiques,ouà
uneéchelleplusglobaledanslecadredelamiseenoeuvreduPlagepomi;
? informerdelaréalisationd?opérationsenfaveurdespoissonsmigrateursamphihalinsdansleur
territoire.
A défaut de CLE, tout groupe de travail fonctionnel déjà consacré aux poissons migrateurs
amphihalinspeutmenercetteconcertation.
Aussi il peut être envisagé, à l'échelle des grands sousbassins versants, la constitution de
commissions interSagesur lespoissonsmigrateursamphihalinsouuneinformationrégulièredes
commissionstechniquesterritorialesduComitédebassin,afinentreautresdefaciliterlacoordination
desactionsdesSage,desprogrammescontractuelsetdesservicesdel?Étatdanslamiseenoeuvre
duPlagepomi.
4.4.3 OrientationG3:Renforcerlepartaged?expériencesetlacommunication.
Lavalorisationdesconnaissancesacquisesàtraversunpartagedesexpériencesetunretourde
bonnespratiquesestunenjeuessentielduPlagepomi.Celasupposeuneinformationrégulière,des
structureschargéesdupilotageduPlagepomicommedesporteursdeprojet,del?avancementdes
actionsetainsidelamiseenoeuvredesmesuresopérationnellesduPlagepomi.
G3A:LamiseenoeuvreduPlagepomifait l?objetd?informationsrégulières, à l?échellede
bassincommeauxéchelleslocales.
Auniveaudubassin,lesecrétariatduCogepomifaitétatdel?avancementdanslamiseenoeuvredes
mesuresduPlagepomiets?appuiesur:
? des communications orales lors de réunions de concertation spécifiques aux poissons
migrateursamphihalinsoudanslecadrepluslargedelapolitiquedel?eauetdesmilieux
aquatiques;
? desdocumentsécrits decommunication (lettresd?information, communiquésdepresse...)
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rendantcomptedesprogrèsduPlagepomi.
Au niveau local ou dans le cadre d?opérations en réponse aux mesures opérationnelles du
Plagepomi,lesstructurescoordinatricesouopérateurspeuventcommuniquersurcertainesactions
quirentrentdanslecadreduPlagepomiouquicontribuentàl?atteintedel?objectifduPlagepomi.
Lesobjectifsprioritairesdecommunicationportentsurlasensibilisationdupubliccibleauxenjeuxet
surlamobilisationdesdifférentsacteursautourdesenjeuxpoissonsmigrateursafindesusciterdela
fiertémaiségalementdefavoriserl?émergencedemaîtrisesd?ouvrage.
G3B:Lesconnaissancesacquisessontdiffusées.
EncoordinationaveclesecrétariatduCogepomi,desactionsdediffusiondesconnaissancessont
organiséesrégulièrement.Cesopérationsdecommunicationpeuventsetraduireparl?organisationde
journées d?échanges ou la diffusion de synthèses écrites, permettant de créer ou renforcer les
relationsentrelacommunautédeschercheursetexperts,etlepublicdesdécideursetgestionnaires.
L?objectif principal de cette communication est d?apporter l?éclairage technique et scientifique
nécessairepourappuyerlesprisesdedécision.
4.5 OFP:Préserveretnepasdégraderlasituationexistante
4.5.1 OrientationP1:Prévenirtoutedégradationdel'accessibilitédeshabitatsdans
ladurée
Lesobstaclesàl'écoulement(seuilsetbarrages)peuventconstituer,mêmelorsqu'ilsprennenten
compte la présence des poissons migrateurs amphihalins par la présence de dispositifs de
franchissement,despointsdifficilespourlesmigrationsdemontaisonetdedévalaison.
L'objectifdel'orientationP1estdepréserverdansladuréelescapacitésdespoissonsmigrateurs
amphihalinsàfranchirlesobstaclesàl'écoulement.
Cetteorientationtrouveunrelaisdanslesorientations1Aet9BduSdageLoireBretagne20102015
quiont pourobjectif d'empêchertoutenouvelledégradationdesmilieuxet d'assurer lacontinuité
écologiquedescoursd'eau.
Ainsi,sil'équipementhydroélectriqued'ouvragesexistantssurdescoursd'eauclassésautitreduI
de l'article L.21417duCodede l'environnement, restepossible, il convient toutefois, tel que le
précise la circulaire du 25 janvier 2010 relative à la mise en oeuvre du plan d'actions pour la
restaurationdelacontinuitéécologique:
? deprivilégierlarecherched'équipementhydroélectriqued'ouvragesnonsituéssurlescoursd'eau
classés;
? àdéfaut,denepasdégraderlasituationexistanteenmatièredecontinuitéécologique,et,sile
maintiendel'ouvragen'estjustifiéparaucunautreusage,des'assurerquel'impactrésidueldu
maintiendel'ouvrageetdesonexploitationhydroélectrique,enmatièredecontinuitéécologique,
esttrèsprochedesconditionsquirésulteraientdel'effacementdel'ouvrage,toutenpermettant
une économie conséquente et justifiée sur le coût de cet effacement et en contribuant
suffisammentauxobjectifsdedéveloppementdesénergiesrenouvelables.
Rappelsréglementaires:
L?applicationdelaréglementationexistanteconstitueunprérequisessentielduPlagepomi
20142019.Entreautres,ilestrappelélaréglementationsurlestroissujetssuivants:
1.Leclassementdescoursd'eauenliste1autitredel'articleL.21417duCodedel'environnement
(cf.paragraphe3.3.1),esteffectifdepuisle22juillet2012etinterditlaconstructiondetoutnouvel
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ouvrageautoriséouconcédéencoursd'eau,quicréeraitunobstacleàlacontinuitéécologique.Par
ailleurs, le renouvellementdesdroitsexistantsestsubordonnéàdesprescriptionspermettantde
garantirlaprotectiondespoissonsmigrateursamphihalins.
2. La mise en conformité des ouvrages visàvis de la réglementation fait l'objet de contrôles
spécifiquesdanslecadredesplansdecontrôledesMISEN(cf.paragraphe3.3.1).
3.Lestravauxencoursd'eaufontl'objetàpartird'uncertainseuildeprocéduresdedéclarationou
d'autorisationautitredelaloisurl'eau(titre3delanomenclaturedelaloisurl'eau,préciséeà
l'article R.2141 du Code de l'environnement). En particulier, les travaux visés concernent les
obstacles à l'écoulement, la modification des profils en long ou en travers du lit mineur, la
modificationdelaluminosité,laconsolidationoulaprotectiondebergesetl'entretiendescoursd'eau
oucanaux.
Disposition P1A: Le respect des prescriptions pour le rétablissement de la continuité
écologique(entretiend'undispositifdefranchissement,manoeuvredesdispositifsmobiles)
par le propriétaire d'un ouvrage est traduit dans les actes administratifs lors des
renouvellementsdedroitetfaitl'objetdecontrôlesciblés.
L'efficacité continue des dispositifs de franchissement est assurée conformément à la notion
d'obligationderésultat.Danscecadre,lesrèglementsd'eauintègrentdesprescriptionsrelativesà
cetteobligationlorsdurenouvellementdesdroitsetdesopérationsdecontrôledelapolicedel'eau
etdelanatureveillentaurespectdecesobligations.
Enparallèle,unguidedebonnespratiquesestmisàdispositiondespropriétairesafindefaciliterles
opérationsd'entretienetdeleurapporterlesmeilleureschancesderéussite.
Unemutualisationdesmoyensdesurveillancedelafonctionnalitédesdispositifsdefranchissement
entre les différents propriétaires d'ouvrages est envisagée, afin de renforcer l'efficacité de la
surveillance de la fonctionnalité de la continuité écologique au droit des ouvrages. Une telle
démarches'effectueà l'échelle d'uncoursd'eaunécessitant laprotectioncomplètedespoissons
migrateurs amphihalins, dans le cadre duplan d?actions du Sagedevant identifier les mesures
nécessairesàlarestaurationdelacontinuitéécologique.
LeCogepomiencouragel'intégrationdecettedispositiondansleSdageLoireBretagne20162021.
Disposition P1B: Les nouvelles autorisations ou renouvellements d'autorisation
d'équipementoudesuréquipementhydroélectriqued'ouvragesexistantsnesontdélivrées
quesileprojetgarantitlanondégradationdesconditionsdefranchissementdanslesdeux
sensdemigration.
Cettedispositionsupposedemettreenregardlecoûtécologiquedel'aménagementhydroélectrique
etlebénéficeénergétiqueattendudel'exploitation,afindes'assurerquelebénéficeénergétiquede
l'installation contribue de manière suffisante aux objectifs de développement des énergies
renouvelables.
L'aménagementnedoitnotammentpasdégraderlasituationpréexistanteentermesdecontinuité
écologique. Le meilleur dispositif technique acceptable est recherché, pour éviter et réduire les
risques demortalités des poissons migrateurs amphihalins (grilles antiintrusion, turbines ichtyo
compatibles).
Lamiseenoeuvredecettedispositions'appuiesurlesconnaissancesacquisesenapplicationdela
dispositionC1B.
Cettedispositions'inscritdanslaprioritédonnée,surlescoursd'eauoùsetrouventdespopulations
sauvagesdepoissonsmigrateursamphihalins,àlaluttecontrelecumuld'obstaclesàfranchir.Ainsi,
àdéfautdedispositifssatisfaisantsdelimitationdesimpacts,l'aménagementn'estpossibleque:
? danslecasdeprojetsbénéficiantd'uneDUPoud'uneDIG;
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? siunemesurecompensatoireestprévue,sipossiblesurlamêmemassed'eau,afindemaintenir
auplusletauxde fractionnement àsontauxactuel.Lacompensationportesurtouteopération
permettantderetrouverdesconditionséquivalentesdetransportdessédiments,dediversification
deshabitats,devitessedetransfertdeseauxetdecirculationpiscicole.
LeCogepomiencouragelareprisedecettedispositiondansleSdageLoireBretagne20162021.
DispositionP1C:Lestravauxencoursd'eauveillentàmaintenirlacirculationdespoissons
migrateursamphihalinsentreleszonesavaletamontdusitedetravaux.
Pourlestravauxsusceptiblesdeperturberlamigrationdespoissonsmigrateursamphihalins,
laprioritéportesurleurréalisationendehorsdespériodesdemigrationactive,àdéfauteten
l'absence de dispositifs permettant de maintenir la circulation des poissons migrateurs
amphihalins.
Lespériodesdemigrationactivesontlessuivantes:
? pourlesaloses,lamigrationactives'échelonnedu1ermarsau15juin;
? pourleslamproies,lamigrationactives'échelonnedu1eroctobreau31mai;
? pour lesaumonatlantique, lespériodesdemigrationsactivessontpréciséesparsousbassins
versantsdansletableau4:
? pourlescivellesenestuaire,lamigrationactives'échelonnedu1ernovembreau30juin;
? pourlesanguillesargentées,lamigrationactivededévalaisons'échelonnedu1eroctobreau31
mars.
Lesespècesdepoissonsmigrateursamphihalinsdevantêtreprisesencomptesurchaquetronçonde
coursd'eaupourl'applicationdecettedispositionsontcellescibléesdansleclassementenliste2
arrêtéle10juillet2012autitredel'articleL.21417duCodedel'environnement.
Cettedispositionviseenparticulierlesinstallations,ouvrages,travauxetactivités(IOTA)soumisà
déclaration ou autorisation, notamment au niveau du titre 3 de l'article R.2141 du Code de
l'Environnement(impactssurlemilieuaquatiqueousurlasécuritépublique)telqu'ilestenvigueurle
jourdelapublicationdel'arrêtépréfectoralapprouvantleSDAGE,susceptiblesdeperturber,defaçon
temporaire(oupérenne),lamigrationdesespècesdepoissonsmigrateursamphihalins.
LeCogepomiencouragel'intégrationdecettedispositiondansleSdageLoireBretagne20162021.
4.5.2 OrientationP2:Éviterladégradationdeshabitatsetdelaqualitédeseaux,
afindemaintenirlaproductivitédeshabitatsetunequalitéd'eaucompatibleavecles
exigencesdesespèces
Leshabitatsdereproduction,dedéveloppementetdereposmigratoiredesespècesamphihalines
sontspécifiquesetméritentuneattentionparticulière.L'enjeuprincipalportesurlapréservationdes
habitatsfavorablesexistantsactuellementconnus(cf.paragraphe1.2.2).
Lesfacteursdedégradationdelaqualitédeshabitatssont multiples:colmatage,modificationdu
substrat,modificationdurégimehydraulique,pollutionschimiques,altérationdelamorphologie.
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Saumon
Bassinsversantsde l?Allier et de
laLoirebourguignonne,enavaldu
barragedeVillerest
1ermars?15juin
15septembre?30novembre
Autresbassinsversants 1erjanvier?15juin
15septembre?30novembre
Tableau4:Périodesdemigrationactivedessaumons
L'objectifdecetteorientationP2estdeproposerdesinterventionsquimaintiennentlaqualitédel'eau
quandelleestdéjàadaptéeàlaviedespoissonsmigrateursamphihalinsouqui l'améliorentpar
ailleurs.
EllerejointlesorientationsduSdageLoireBretagne20102015relativesàl'hydromorphologie,àla
réductiondespollutionsetàlagestionquantitativeaveccommeobjectifs:
? d'empêchertoutenouvelledégradationdescoursd'eau;
? deréduirelespollutionsorganiques;
? demaîtriserlespollutionsparlespesticidesetlessubstancesdangereuses;
? demaîtriserlesprélèvementseneau;
? depréserverlelittoral,lestêtesdebassinversant,leszoneshumidesetlabiodiversité.
Le Sdage LoireBretagne 20102015 précise également la nature du couvert environnemental
permanentdevantêtremisenplaceàproximitédescoursd'eaudanslesterritoiresclassésenzone
vulnérableauxnitrates(lacartedeszonesvulnérablesauxnitratesestdisponibleauparagraphe
2.4.3). Sadisposition 2B2 prévoit que les programmesd'actions définis au titre de la directive
nitratescomprennentsystématiquementl'obligationd'implanterdesdispositifsvégétaliséspérennes
(haies,bandesenherbées,ripisylves)d'unelargeurminimalede5mètreslelongdetouslescours
d'eau.EllecomplètelesarticlesR.21180et81duCodedel'environnement.
Lecouvertenvironnementalpermanentbénéficieauxmilieuxaquatiquespluslargementquepourla
simpleréductiondestransfertsdenitrates.Ilpermetégalementdefreinerl'érosiondessols.
Ainsi, le couvert environnemental permanent peut apparaîtrecommeunélément duprogramme
d'actionspourlaréductiondurisqued'érosiondessolsdansleszonesoùl'érosiondiffusedessols
agricolesestdenatureàcompromettrelaréalisationdesobjectifsdebonétatoudebonpotentiel.
Cezonageetcesprogrammesd'actionsdoiventêtreétablisparlespréfetsd'aprèsladisposition1B
4duSdageLoireBretagne20102015.
LeSdageLoireBretagne20102015contribueégalementparsonorientation8Aàlapréservation
deshabitatsdespoissonsmigrateursamphihalinssituésenzonehumide.Ilinstaureainsileprincipe
prioritaired'évitementd'impactsurunezonehumidepuisderéductiondesimpactsrésiduels,età
défautd'alternativeavéréeauprojetendehorsdelazonehumide,ilimposelacompensationdela
zonehumidedétruite.
Audelà, les SRCEdéveloppent la séquence éviter/réduire/compenser à l'ensemble des projets
altérantlatramebleuequ'ilsontdéfinis,danslamesureoùilsdoiventfairel'objetd'unepriseen
comptedelapartdel'Étatetdescollectivitésoudeleursgroupements.
Parailleurs,encequiconcernelesdispositifsdeprotectionspécifiquedeshabitatsremarquables,
voired'intérêtcommunautaires,unobjectif d'atteinted'unesurfacedezonesprotégéesatteignant
2%duterritoirenationalaétéfixéeetestdéclinéautraversdelastratégiedecréationdesaires
protégées(Scap).
Rappelréglementaire :
L?applicationdelaréglementationexistanteconstitueunprérequisessentielduPlagepomi
20142019.Entreautres,ilestrappelélaréglementationsuivante:
LeCodedel'environnementprévoit parsonarticleL.4323queladestructiondefrayèresoude
zonesdecroissanceoud'alimentationdelafaunepiscicolesoitpunide20000eurosd'amende(cf.
paragraphe 3.3.1), à moins qu'il ne résulte d'une autorisation ou d'une déclaration dont les
prescriptionsontétérespectéesoudetravauxd'urgenceexécutésenvuedeprévenirundanger
graveetimminent.
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Parailleurs,leCodedel'environnementprévoirdeuxdispositifspermettantdelimiterladégradation
desmilieuxaquatiques,entreautresdeshabitatsetdelaqualitédeseaux:
? l'étuded'impact:Lesprojetsd'aménagementsusceptiblesd'affecterlesmilieuxaquatiqueset
doncleshabitatsdesespècessont,selonleurampleur,soumisàétuded'impactenvertudes
articlesL.1221et R.1222duCodedel'environnement.L'étuded'impact comportedivers
éléments listés à l'article R.1225 du Code de l'environnement, dont un état initial de
l'environnement, l'évaluation des effets du projet et les mesures présentées par le
pétitionnairepouréviter,réduireetcompenserlesimpactsdesonprojet;
? l'évaluation d'incidences Natura 2000: Les projets (activités, travaux, aménagement,
ouvrages, installations) susceptibles d'affecter significativement un site Natura 2000 sont
soumis à une évaluation des incidences, en vertu de l'article L.4144 du Code de
l'environnement.L'évaluationd'incidencesdoit,encasd'incidencenégativeduprojetsurle
siteNatura2000,faireétatdessolutionsretenuespouréviter,réduirepuiscompensercette
incidence.
DispositionP2A:Lamiseenplacedecouvertsvégétauxpermanents,enrivedescoursd'eau
etdesplansd'eaudeplusdetroishectares,estencouragéedansuncadreconcertéetsous
formedeprojetspilotes.
Cette disposition repose sur l'intérêt des couverts végétaux permanents dans la réduction des
phénomènesd'érosiondessols,susceptiblesdecontribueraucolmatagedeshabitats.
Elleavaleurderecommandationetportesur lesbassinsversantsdescoursd'eaunécessitantla
protectioncomplètedes poissonsmigrateursamphihalins et nonclassésenzonevulnérable aux
nitrates. En effet, en zone vulnérable aux nitrates, la couverture végétale permanente est déjà
obligatoire.
Lamiseenoeuvredecettedispositionautraversdeprojetspilotespermetdelimiterl'érosiondessols,
delimiterlestransferts,d'améliorerleconfortdesespècesetdelimiterl'échauffementparl'ombrage.
Lesprojetspilotescontribueraientàlatrameverteassociéeàlatramebleueetsontinscritsdansles
programmesd'actionsprévusparladisposition1B4duSdageLoireBretagne20102015.
Il convient, dans leséventuels projetspilotes, d'envisager uneévaluationde leur efficacité sur la
productivitédeshabitats.
En lien avec cettedisposition, le Cogepomiencourage la reconductionde la disposition1B4du
SdageLoireBretagne20102015dansleSdage20162021.
Disposition P2B: Un renforcement de la protection des habitats de reproduction et de
développementdesjuvénilesdespopulationssauvagesdepoissonsmigrateursamphihalins
estrecherché.
Les dispositifs de protection spécifique, sont des outils de protection des habitats de nature
réglementaire(réservenaturelle,arrêtédeprotectiondebiotope)oucontractuelle(zonespécialede
conservationNatura2000).Lesréservesdepêche,temporairesoupermanentes,peuventégalement
contribueràcetobjectifdeprotectiondeshabitats.Cesdispositifsrenforcentlaprotectionminimale
apportéeparlaprotectiondesfrayèresinventoriéesenapplicationdel'articleL.4323duCodede
l'environnementetsontdétaillésauxparagraphes2.3.1et2.3.2.
Cettedispositionrecommande,danslesbassinsversantsdescoursd'eaunécessitantlaprotection
complète des poissons migrateurs amphihalins où des dispositifs de protection cités cidessus
existent,l'animationprioritairedecesdispositifs.UnesynergieestdéveloppéeentrelePlagepomiet
lesdocumentsd?objectifsNatura2000parunrenforcementdeséchangesavecleCogepomi.
Enaccompagnement,danslesbassinsversantsdescoursd'eaunécessitantlaprotectioncomplète
des poissons migrateurs amphihalins qui ne seraient pas déjà couverts par des dispositifs de
protectionspécifiquedeshabitats,undesdispositifslistéscidessuspeutêtremisenplace,après
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concertationlocale.Ilestrecommandéd?étendrecettedispositionaudomainepublicmaritimedans
lessousrégionsmarinesduGolfedeGascogneetdelamerCeltique.
Lamiseenoeuvredecettedispositions'articuleavecladéclinaisonrégionaledelaScap.
Par ailleurs, la protection d?habitats fonctionnels invite, en cas d?impact des végétaux exotiques
envahissants(surlabase,entreautres,desconnaissancesacquisesdanslecadredeladisposition
C1E) sur les habitats des poissons migrateurs amphihalins (par exemple, par la fermeture
progressivedesannexeshydrauliques)àlamiseenplaced?opérationsderégulation,afindecontenir
l?extensiondesinvasions.
DispositionP2C: Le fonctionnementhydrosédimentaire naturel descoursd'eaudoit être
recherché, notamment par la circulation des crues morphogènes, afin de conserver la
dynamiquederenouvellementdeshabitats,leurfonctionnalitéetleurproductivité.
Lefluxsédimentairepermet unrenouvellementdeshabitats cequientretient leurproductivité et
contribueaumaintiendeséquilibresdumilieu. Aussi estil nécessairedemaintenir la circulation
existantedessédimentset denepas l'altérer, cequisetraduit pardesmanoeuvresdesparties
mobilesdesouvragesquandilsencomportent.Lesouvragessituéssurdescoursd?eauclassésen
liste2autitredel?articleL.21417oùunfortenjeupourletransitsédimentaireaétéidentifiésont
notammentconcernésparcettedisposition.
Dessolutionsd'évacuationdessédiments,complémentairesàlagestiondesouvragespouvantdéjà
exister,serontrecherchées,notammentpourpermettreletransitdespetitescruesmorphogènes.
4.5.3 OrientationP3:Maintenirunrégimehydrologiquecompatibleaveclesbesoins
despoissonsmigrateursamphihalins
Le régime hydrologique et la dynamique fluviale sont des facteurs clés pour la survie et le
développement des poissons migrateurs amphihalins. Une faible hydrologie accroît en effet les
risquesderéchauffementrapideauprintempsréduisantd'autantlescapacitésdeconfortetdesurvie
des espèces. Prévenir cesétiageset lesgérer est un enjeu important pour la préservation des
populationsdepoissonsmigrateurs.
L'objectifdel'orientationP3portesurlapriseencomptedesbesoinsvitauxdespoissonsmigrateurs
amphihalinsdanslagestionquantitativeéquilibréedelaressourceeneau.Mêmesicetteorientation
viseparticulièrementlesaxesmigratoiresprincipaux,ellenedoittoutefoispasocculterl'importance
decertainsaffluentspouvantjouerunrôleessentieldanslecycledecertainesespèces.
L'orientation P3 interagit avec l'orientation fondamentale 7 du Sdage LoireBretagne 20102015
relativeàlamaîtrisedesprélèvementsd'eau.
LeSdageLoireBretagnedéfinitpourunegestionéquilibréedelaressourceledébitobjectifd'étiage
(DOE).LeDOEestundébitmoyenmensuelaudessusduquelilestconsidéréquel'ensembledes
usagesestpossibleenéquilibreaveclebonfonctionnementdumilieuaquatique.C'estledébitde
référencepourladélivrancedesautorisationsdeprélèvementetderejetsparlapolicedel'eau.Ildoit
êtrerespectéenmoyennehuitannéessurdix.
Enparallèle,leSdageidentifiedesbassinsversantsnécessitantuneprotectionrenforcéeàl'étiage,
oùlesmesuresdegestionconduisentàlimiter,voireréduire,lesprélèvementsenpériodeestivale,
du1eravrilau30octobre.Lesbassinsconcernéssont:
? lebassindelaVienne,delaconfluenceaveclaBlourdejusqu?àlaconfluenceaveclaCreuse,à
l'exceptiondessousbassinsdel'Envigneetdel'Ozon;
? lebassindel'Oudon;
? lesbassinsdelaLogne,delaBoulogne,del'OgnonetdulacdeGrandlieu;
? lesbassinsdecertainscôtiersvendéens(Auzance,Vertonne,VieetJaunay).
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Aussietafindemaintenirunéquilibreentrelesressources,lesbesoinsetl'alimentationdesmilieux
naturels,deszonesderépartitiondeseaux(ZRE)sontdéfiniesparlepréfetcoordonnateurdebassin
LoireBretagne.
LeclassementenZREconcernelessecteursgéographiquesexposésauxplusfortesconsommations
d'eauetconduitàladéterminationdesvolumesprélevablesparlesdifférentescatégoriesd'usagers
enfonctiondesressourcesetdel'annéeconsidérée.LesbassinsversantsclassésenZREfigurent
surlacartedansl'illustration42.
Pourlagestiondecrise,leSdageLoireBretagne20102015définitdanssonorientation7Eledébit
seuild'alerte(DSA)etledébitdecrise(DCR).LeDSAetleDCRsontdesdébitsjournaliersde
gestiondecrise.LavaleurduDSAestinférieureouégaleàcelleduDOE.EndessousduDSA,une
desactivitésutilisatricesdel'eauouunedesfonctionsducoursd'eauestcompromise.Ils'agitdonc
d'unseuildedéclenchementdesmesurescorrectives.LeDCRestlavaleurdedébitendessousde
laquelle seules les exigences de la santé, de la salubrité publique, de la sécurité civile, de
l'alimentationeneaupotableetlesbesoinsdesmilieuxnaturelspeuventêtresatisfaits.
Les Sagepeuvent, en fonction des enjeux identifiés localement, complétés le réseau de points
nodauxduSdage,audroitdesquelslesvaleursdesDOE,DSAetDCRs'appliquent.
Rappelréglementaire :
L?applicationdelaréglementationexistanteconstitueunprérequisessentielduPlagepomi
20142019.Entreautres,ilestrappelélaréglementationsuivante:
L'articleL.21418duCodedel'environnementprévoitdanssonpremieralinéaquetoutouvrageà
construire dans le lit d'un cours d'eau comporte des dispositifs maintenant dans ce lit un débit
minimal (dit débit minimal biologique) garantissant en permanence la vie, la circulation et la
reproductiondesespècesvivantdansleseauxaumomentdel'installationdel'ouvrageainsique,le
caséchéant,desdispositifsempêchantlapénétrationdupoissondanslescanauxd'amenéeetde
fuite.
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Illustration42:Zonesderépartitiondeseauxdanslebassin
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DispositionP3A: Lagestionéquilibréede la ressourceeneautient comptedesbesoins
vitauxdespoissonsmigrateursamphihalins,enétiagecommeencrue.
Cettedispositionrecommande,surlabasedesétudesdedébitsminimauxbiologiques(DMB)qui
intègrent les besoins des poissons amphihalins quandelles sont réalisées, que les DOEsoient
cohérentsaveclesDMB.
En complément, un enjeu existe sur la gestion de la ressource en eau dans les zones de
développementoudegrossissementdespoissonsmigrateursamphihalins,danslesbassinsversants
descoursd'eaunécessitantlaprotectioncomplètedespoissonsmigrateursamphihalins.Dansles
zones classées enZREsur ces territoires, il est recommandéque les études dedéfinition des
volumesprélevables intègrent lesbesoinsdespoissons migrateursamphihalins. Sont doncainsi
particulièrement visés par ce point les sousbassins versants fréquentés par des populations
sauvagesdepoissonsmigrateursamphihalinssuivants:
? lebassinduCher,enamontdeChâtressurCheretenavaldubarrageduPrat;
? lebassinduClain;
? lebassinduLay;
? lebassindelaSèvreniortaise.
Par ailleurs, les périodes de débits soutenus sont favorables aux migrations des poissons
amphihalins,enlimitantentreautresl'échauffementdesmassesd'eau.Ilestainsirecommandédans
lescoursd'eaunécessitantlaprotectioncomplètedespoissonsmigrateursamphihalinsdemaintenir
unécoulementsuffisantencrue,afinquelesconditionsdemigrationsnesoientpasaltérées.Cette
recommandations'appliquesurunemassed'eauauxpériodespropicesauxmigrationsdesespèces
de poissons migrateurs amphihalins présentes dans cette masse d'eau. Elle pourra conduire à
réfléchir à l?identification dedébits critiquesmigratoires, devant être respectés lors des périodes
migratoires et dont le franchissement à la baisse ne pourrait reposer que sur des conditions
naturelles.
DispositionP3B:Lacroissancedesdébitsréservésestrecherchéepourlesouvragessitués
sur un mêmecours d'eau, de l'amont vers l'aval. Ces débits cherchent à respecter et à
s'adapterauxbesoinsdespoissonsmigrateursamphihalins.
Lamiseenoeuvredecettedispositionpeuts?appuyersurl?identificationd?undébitcritiquemigratoire
àl?échelled?uncoursd?eau.
Les espèces de poissons migrateurs amphihalins à prendre en compte dans ces études
correspondentpartronçondecoursd'eauauxespècesciblesduclassementenliste2arrêté le
10juillet2012autitredel'articleL.21417duCodedel'environnement.
4.5.4 OrientationP4:Préserverdeseffectifssuffisantspourpermettrele
renouvellementnaturelautonomedespopulationsetunepêchedurabledeces
espèces.
Lapêchedesespècesamphihalinesconcernelespêcheursamateurs(auxlignes,auxenginsouaux
filets),dontl'effortdepêcheestàmieuxapprécier,etlespêcheursprofessionnels.Lesprincipales
espècesdepoissonsmigrateursamphihalinscibléessurlebassindelaLoire,laSèvreniortaiseet
lescôtiersvendéenssont:
? l'anguilleeuropéenne;
? lagrandealoseetl'alosefeinte;
? lalamproiemarineetlalamproiefluviatile.
Lebraconnagerestepratiquétoutaulongdel?annéesurlesanguilles,notammentlescivelles,etle
saumon,malgrél'interdictiongénéraledesapêche.
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Danslecontextedudéveloppementdurable, il devient nécessairedeconcilier l'activitédepêche
aveclapréservationdupatrimoinepiscicole.Lemaintiendelapêcheprofessionnelleetdelapêche
deloisirdesespècesmigratricesnedoitdoncpasremettreencausel'équilibredesécosystèmeset
lapérennitéàlongtermedesstocksdepoissonsmigrateursamphihalins.
Rappelsréglementaires
L?applicationdelaréglementationexistanteconstitueunprérequisessentielduPlagepomi
20142019.Entreautres,ilestrappelélaréglementationsuivante:
Lapêchedesespècesdepoissonsmigrateursamphihalins répondà la réglementationgénérale
définie par le Code de l'environnement, rappelée au paragraphe 2.1.4 : dates de pêche, taille
minimaledecaptures,réservesdepêche,réglementationdelapêcheàproximitédesouvrages.
La pêche des migrateurs en zone maritime est conditionnée à la détention d'une licence de la
commission milieux estuariens et amphihalins (CMEA) du comité national des pêches maritimes et
des élevages marins (CNPMEM).
Il est rappelé au paragraphe 2.1.4 l'interdiction de pêcher dans les dispositifs assurant la circulation
des poissons, dans les pertuis, vannages et passages d'eau à l'intérieur des bâtiments. La pêche est
également limitée depuis les barrages et écluses.
Les dispositions réglementaires encadrant la pêche de l?anguille sont maintenant définies dans le
cadre du plan anguille pris en application du règlement européen n°1100/2007 visant la reconstitution
du stock d'anguille.
DispositionP4A:Comptetenudeseffectifsconstatés,laconservationdespopulationsde
poissonsmigrateursamphihalinsfaitl'objetdemesuresd'interdictionouderestrictiondela
pêche.
Cettedispositions'inscrit dans lacontinuitédes interdictionsdepêcheeneaudouceétabliesou
reconduitesdanslePlagepomi20092013.
Comptetenudel'étatdespopulations,lesinterdictionstotalesdepêchedusaumonetdela
truitedemersontmaintenuesdansl'ensembleduterritoireduCogepomi,ainsiqu'enzone
maritimedanslazonedesdouzemilles.Lesinterdictionsdepêchedesalosesdanslebassin
delaSèvreniortaiseetdes lamproiesdanslesbassinsde laSèvreniortaise, de laLoire
bourguignonneetdelaMainesontégalementmaintenues.
Pour renforcer la cohérence des réglementations entre les domaines fluvial et maritime, des
restrictionsdepêcheeneauxsaléesdanslesestuairessontreconduites.
Enparticulier,lesquantitésdetimbresfiletspourlapêchedesalosesetdeslamproiesdansl'estuaire
delaLoireetenVendéesontplafonnées,auplusaunombreplafonddéfinientre2009et2013,soit
36unitésparespècedansl'estuairedelaLoire,et36unitésparespèceenVendée.
Pourl?anguille,lePlagepomipeutcompléterlaréglementationnationaleenvigueur,enparticulierpar
ladéfinitiondesmodalitésd'attributiondeslicencesdepêchedelacivelle.
Enfin,pouroptimiserl'applicationdecettedisposition,untravaildeprécisiondeslimitesdesaluredes
eauxseraengagédanslesestuairesduterritoireduCogepomioùcettelimiterestenondéfinie.
Disposition P4B: L'exercice de la pêche s'adapte au cycle biologique des espèces de
poissonsmigrateursamphihalins.
Lespériodesdemigrationetdereproductionconstituentdesphasesessentiellesdelavieeneau
douce des poissons migrateurs amphihalins. L'état des populations de poissons migrateurs
amphihalins devra être plus précisément caractérisé (données de captures, d'observation aux
stationsdecomptage...)(dispositionC3A).
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En fonction de cet état, des analyses multithématiques pourront envisager les conditions de
modificationdelaréglementationactuelledelapêchefixéeparladispositionP4A. Cesanalyses
intégreront aminimaunvolet technique, qui veillera àexaminer lesmodalités de gestionet de
contrôlede l'activité depêche, unvolet social et unvolet économique (tourisme, loisirs...). Leur
réalisationestconditionnéeàuneconcertationlargeaveclesacteurslocauxetassocieleCogepomi.
Laréglementationdelapêchedusaumonest,entreautres,viséeparcettedémarche.Auregardde
l?objectifduPlagepomi,touteéventuelleréouverturepartielledelapêchedusaumonnedevrapas
remettreencauselaviabilitédelapopulationsauvage.
Al?inverse,suiteàcesconcertationsetenfonctiondesniveauxdeseffectifs,afindepréserverune
pêchedurabledesespèces amphihalines, desactionsd'encadrement de l'exercicede la pêche,
pourrontêtreenvisagées.CesactionsserontcomplémentairesauxmesuresdeladispositionP4Aet
auxactionsdepréservationetderestaurationdeshabitatsliéesàlamiseenoeuvredesorientations
P1,P2,R1etR2.Ellespourrontportersurlamiseenplacederéservesdepêche,parexempleà
proximitédesouvragestransversaux,surdespériodesderelèvedesenginsoudesfiletssurles
zonesdereproductionconnuesoulesprincipauxaxesdemigrationsurunepartiedelapériodede
migrationactive,surdesmaillesminimales...
Lesconcertationssurdetellesactionsd?encadrementporteront,entreautressurlesaloses,dont
l'état de la population semble préoccupant au vu des effectifs comptés et des déclarations de
capturesparpêche.
DispositionP4C:Pourlacohérencedel'actionduPlagepomisurl'exercicedelapêche,la
coordinationinterservicesdanslaluttecontrelebraconnageestmaintenue.
Leseffortsdecontrôlepourluttercontrelebraconnagesetraduisentpardescontrôlesspécifiques
lorsdespériodesdemigrationsactivesoudephasedereposdespoissonsmigrateursamphihalins
endomainesfluvialetmaritime.Unevigilanceporteradansl?établissementdesplansdecontrôlessur
lesouvragescontrôlantl?accèsàd?importantessurfacesd?habitats,parexemplelesouvrageslistés
danslesmesuresdeladispositionR1C.
Laconnaissanceduterrain,parexempleissuedurôledeveilleenvironnementalequ?exercentles
pêcheurs,serautilementvaloriséeafind?optimiserlesopérationsdecontrôle.
Ces contrôles sont susceptibles d'être diligentés tout au long de l'année, quelle que soit la
réglementationdelapêchedel'espèceconcernée.
En accompagnement de cet effort de contrôle, une réflexion pourra conduire à une mise en
cohérencesurcertainssecteursdelaréglementationdelapêchedescarnassiersaveclaprésence
despoissonsmigrateursamphihalins,afinderéduirelesrisquesdecapturesaccidentelles.
DispositionP4D: Lesactivitésdanslescoursd?eau tiennent comptede laprésencedes
espècesdepoissonsmigrateurs.
Afin de préserver la reproduction, le développement et les migrations des poissons migrateurs
amphihalins,lesactivitésencoursd'eauveillentàéviterouréduireledérangementdespopulations.
Defait,cettedispositionconcerneentreautreslesdéversementsdepoissonsholobiotiques,lapêche
etlespratiquessportives.
Ilconvientdelimiterleurimpactsurlespopulationsdepoissonsmigrateurs,cequipassepar:
? l'intérêtdudéveloppementdesynergiesentrelePlagepomietlesplansdépartementauxpour
laprotectiondumilieuaquatiqueetlagestionpiscicole(PDPG)auniveaudépartemental;
? l'évaluationdesincidencesensiteNatura2000.
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DispositionP4E : Lesanimauxexotiquesenvahissantspeuvent, encasd?impact sur les
effectifsdepoissonsmigrateursamphihalins,fairel?objetdemesuresderégulation.
Cettedispositionneconcernepaslesespècesprotégées,commelecormoran(Phalacrocoraxcarbo
sinensis)quipeuventfairel?objetd?unerégulationparautorisationdetirsdeprélèvement.
Elle portespécifiquement sur lesespèces, essentiellement dans le cortègepiscicole, et dont la
croissancedeseffectifsexerceunepressionsusceptibledemenacerleséquilibresdespeuplements
enplace,etainsidecompromettrel?atteintedel?objectif deviabilitédespopulationsdepoissons
migrateursamphihalins.
Aprèsdémonstrationdeleurpressionsurlespopulationsdepoissonsmigrateursamphihalins(surla
base,entreautres,desconnaissancesacquisesdanslecadredeladispositionC1E),cesespèces
animalesenvahissantespeuventfairel?objetdemesuresderégulation.
4.6 OFR:Reconquérirleshabitatsfavorablesauxespèces
amphihalinesetrestaurerlespopulations
4.6.1 OrientationR1:Restaurerlescircuitsdemigrationsentrel'océanetleszones
d'habitatsproductifs.
Comptetenudesévolutions,encorepeuconnuesetdifficilementmaîtrisablesactuellement,de la
phasedeviemarinedespoissonsmigrateursamphihalins,ilconvientdefaciliteraumaximumles
migrationsdespoissonsdanslescorridorsfluviauxaucoursdeleurphasedeviedulçaquicole,en
prioritédanslesbassinsversantsmodérémentanthropisés,lescoursd'eauclassésenliste2autitre
del'articleL.21417ducodedel'environnementpour lespoissonsmigrateursamphihalinset les
coursd?eaudelazoned?actionsprioritairespourl?anguille.
Larestaurationdelalibrecirculationmigratoiredoitêtrepenséeàl'échelled'uncoursd'eau,dans
une logique d'axe qui tienne compte des impacts cumulés des ouvrages de franchissements
successifs,àlamontaisonetàladévalaison.
Lesobligationsderésultatsquiaccompagnentcetteorientationjustifientlamobilisationdemoyensde
contrôledurétablissementdelalibrecirculation.
Cetteorientations'articuleavecl'orientationfondamentale9duSdageLoireBretagne20102015qui
portesurlaréouverturedescoursd'eauauxpoissonsmigrateurs.
Elles'appuieégalementsurladisposition1B1duSdageLoireBretagne20102015quiprévoitque
lesSagecomprennentunobjectifdatéetchiffrépourlavaleurdutauxd'étagementducoursd'eau,
définicommelerapportentrelasommedeshauteursdechutesartificiellescrééesenétiageparles
obstaclestransversauxetledénivelénaturelducoursd'eau.
Rappelréglementaire :
L?applicationdelaréglementationexistanteconstitueunprérequisessentielduPlagepomi
20142019.Entreautres,ilestrappelélaréglementationsuivante:
Lescoursd'eauclassésenliste2autitredel'articleL.21417duCodedel'environnementdoivent
faire l'objet d'interventions permettant le transport suffisant des sédiments et la circulation des
poissonsmigrateurs(cf.paragraphe3.3.1).
Lamiseenconformitédesouvrages,leurgestionetleurentretienfontl'objetdecontrôlesplanifiés
danslesplansdecontrôledesMISEN.
Ilestrappeléquelestravaux,parexemplelaconstructiond'unepasseàpoissons,fontl'objetde
procèsverbauxderéception,cequicontribueàgarantirlaconformitédesaménagementsavecle
projetautorisé.
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Entermesderestaurationdelacontinuitéécologiqueetdegestiondesouvrages,lesSagepeuvent
établir un inventaire des ouvrages hydrauliques susceptibles de perturber de façon notable les
milieux aquatiques. Parmi cet inventaire, ils peuvent identifier dans leur règlement les ouvrages
hydrauliques fonctionnant au fil de l'eau, qui, sauf raisons d'intérêt général, sont soumis à des
obligations d'ouvertures régulières de leurs vannages (article L.212-5-1 du Code de l'environnement).
Disposition R1A: Les interventions sur les ouvrages aux fins de rétablissement de la
continuitéécologiquerépondentauxprioritésd'interventionssuivantes:
1) effacement;
2) arasementpartieletaménagementd'ouvertures,petitsseuilsdesubstitutionfranchissables
parconception;
3) ouverturedebarragesettransparencepargestiond'ouvrages;
4) aménagement de dispositif de franchissement ou de rivière de contournement avec
obligationd'entretienpermanentetdefonctionnementàlongterme.
Cettedispositiontrouveunrelaisavecladisposition9BduSdageLoireBretagne20102015.Sa
reconduitedansleSdage20162021devraêtrerecherchée.
A défaut de solutions alternatives, l'équipement d'un ouvrage par un dispositif de
franchissementestétudié.Laconceptiondesouvragesdefranchissementrecherche:
? leuradéquationauxespècesciblesdevantêtreprisesencompte,avecuneefficacitéattendue
suffisante;
? desfranchissementsaveczéroretardàlamontaisonetàladévalaison;
? l'entretien (retrait des embâcles, maintien du débit d?alimentation prescrit dans le règlement
d?eau) le moins important à efficacité suffisante afin de faciliter l'atteinte de l'objectif de
fonctionnalitépérennedesdispositifsdefranchissement;
Le projet s'accompagnede la mise enoeuvre par le propriétairedu suivi du fonctionnement du
dispositifdefranchissement,ainsiquedesonentretienafind?assurerunefonctionnalitépérenne.
Laconformitédelaconceptiondesouvragesdefranchissementauxobligationsréglementairesetà
cettedispositionestvérifiée,etconditionneleversementdesaidespubliquespourlaréalisationdes
aménagements.
DispositionR1B:Ledéveloppementd'unevisionprospectiveparcoursd'eauestrecherché,
afindepermettrelapropositionàl'échelledechaqueouvraged'uneinterventionquiprenne
encomptel'impactcumulédutraitementpourlamontaisonetladévalaisondel'ensembledes
ouvragessituéssurlecoursd'eau.
Cette disposition recommande le développement de logiques d'axe afin de réduire les impacts
cumulés des différents ouvrages sur la circulation piscicole, allant de pair avec les objectifs de
réductiondestauxd'étagement.
Ledéveloppementd'étudesàl'échelledescoursd'eauestàencouragerdanslecadredelamiseen
oeuvredesSage,voireeninterSageaucasoùplusieursSageexisteraientsurunmêmecoursd?eau,
enparticulier sur lesbassinsversantsoùsont présentesdespopulationssauvagesdepoissons
migrateursamphihalins:Allieretsesprincipauxaffluents,Cher,Creuse,Gartempe,Loir,Mayenne,
Sarthe,Sèvreniortaise,Vienne,Loire et ses affluents et notamment la Loire Bourguignonne et ses
affluents.
Cesétudes permettent aussi d'intervenir en priorité sur les ouvrages les plus difficiles pour les
migrations,enveillantàl'accessibilitéàl'ouvragedepuisl'avaldubassinversant.Ellespeuventainsi
utilementparticiperàlaconstructiondesprogrammesd'actionspourlarestaurationdelacontinuité
écologique que doivent prévoir les Sage, en application de la disposition 1B1 du Sdage
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LoireBretagne20102015.
Pourlescoursd'eauàmigrateursdubassindelaLoireetnoncouvertspardesSage,larecherche
demaîtrised'ouvragesetdefinancementsestsoutenuedanslecadreduPlagepomi.
La mise enoeuvre des logiques d'axe doit aussi s'accompagner de l'établissement d'indicateurs
permettantdesuivrelaréalisationduprogrammed'actionsetdefaireétatdesprogrèsobtenus,en
termesderéductiondel?étagementetdufractionnementdesmilieuxaquatiques,parexempleen
caractérisant l?impact des ouvrages sur les habitats (disposition C1B) ou sur les migrations
(dispositionC2C).
LeCogepomiencouragel'intégrationdecettedispositiondansleSdageLoireBretagne20162021.
DispositionR1C:Lamiseenoeuvreduclassementenliste2parl'arrêtédu10juillet2012,
conduitleCogepomiàporteruneattentionparticulièresurcertainsouvrages.
Lesouvragesconcernés,listésdansletableaudemesures,sontnotammentceuxquisontconsidérés
aujourd'huicommedifficilementfranchissablesetquisontsituésàl'exutoiredesousbassinsversants
ouderéseauxdemaraisoùsetrouventdeszonesdereproductionoudecroissancedespoissons
migrateursamphihalins.
Lamiseenoeuvredesobligationsréglementairesvisàvisdutransitsédimentaireetdelacirculation
piscicole(facilitationourétablissementdel'accèsauxzonessituéesenamont)surcesouvragesest
susceptibled'entraînerlesgainslesplusimportantsentermesdeproductivitépourlespopulationsde
poissonsamphihalinsetceàl'échelledel'ensembledubassin.
L'exercicede la policede l'eau tient comptedecettevigilanceparticulière, après informationdes
servicesquienontlachargeparleCogepomi.Unsuiviannueldel'avancementdesopérationssurles
ouvragesconcernésesteffectuéparleCogepomi.
DispositionR1D:Lagestionhydrauliqueglobaleàl'échelledescoursd'eaudesouvrages
transversauxetdesouvragesdeconnexionsentrecoursd'eauetzonesdemaraisestadaptée
afindetenircomptedescyclesbiologiquesdespoissonsmigrateursamphihalins.
Cette disposition à portée de recommandation vise à améliorer la gestion pour aider au
franchissementdesouvrages(arrêtsdeturbinage,ouverturesdevannes...).
Lesmanoeuvresd'ouvragespouvantêtreutilesàlacréationd'attraitspourlesmigrationsciblentles
périodesdemigrationactivedespoissonsamphihalinsprésents,préciséesendispositionP1C.
Danslecasdesouvragescôtiersetestuariens(soumisàlamarée),ces manoeuvres spécifiques
peuvent être mises en oeuvre pour permettre leur franchissement par les poissons migrateurs,
notamment lescivellesenphaseprécocedurecrutementoù leurprogressiondans lesestuaires
s'effectueparmigrationportée.
Par ailleurs, lesmanoeuvres desouvragessont favorablesaumaintienouà la restaurationdes
connexions entre cours d'eau et zones humides et favorisent la reconquête d'une mosaïque
fonctionnelled'habitats.
Cesmanoeuvresdoiventêtreadaptéesàlaconfigurationdel'ouvrage,sasituationetauxcontraintes
liées aux usages existants sur cet ouvrage. Elles peuvent être programmées en complément
d'aménagements«passifs»telsquel'ouverturedevantelles,d'échancruresoulaposedecalessur
lesélémentsmobilesdel'ouvragependantlapériodedemigration,afind'éviterl'accumulationdes
civellesenavaldel'ouvrage,oùellessontsurexposéesàlapêcheetàlaprédation.
Dans le cas particulier des ouvrages à usage hydroélectrique, une gestion des turbines peut
contribuer à réduire leur impact sur lespoissonsamphihalins lors despériodesdemigrationde
dévalaison.Desarrêtstemporairesdesturbineshydroélectriquespeuventainsiêtreprogrammés,de
manière synchronisée à l'échelle d'un axe migratoire, afin de limiter les mortalités directes et
indirectes liées au franchissement des turbines par les poissons migrateurs, en fonction de la
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configurationdel'ouvrageetdesonmoded'exploitation.
L'applicationdecettedispositioninviteàintégrerlesmodalitésdegestiondesouvragesdansles
règlements d'eau, éventuellement au terme d'une phase d'expérimentation des dispositifs de
franchissementsurplusieurssaisonsdemigration.
Lamiseenoeuvredecettedispositionpeuts'inscriredanslecadredes«logiquesd'axe»,dontle
développementestencouragéparladispositionR1B.
Disposition R1E: La gestion des écoulements se rapproche le plus possible du
fonctionnement naturel des bassins versants et des cours d'eau, afin de restaurer les
variabilités du régime hydrologique et de ne pas compromettre la reproduction, le
développementdesjuvénilesetlesmigrationsdespoissonsmigrateursamphihalins.
Lesvariationsdel'hydrologie,entreautreslesmontéesrapidesdedébit,sontunesourcedestimulià
mêmededéclencherdesmouvementsdemigrationsàlamontaison(entréeenestuaire,reprisede
migrationaprèsl'arrêtmigratoireestivalpourlesaumon)etàladévalaison(observationdespicsde
migrationdesanguillesargentéesetdessmoltslorsdespériodesdecruehivernaleouprintanière).
Une gestion rapprochée du régime naturel permet aussi de faciliter la circulation des crues
morphogènes,profitablesàunrenouvellementdeshabitats.
Cettedispositions'articuleavecladispositionP2Cquiportesurlemaintiendutransitsédimentaire,
afinquelagestiondesouvragessoitcompatiblelepluspossibleaveclescyclesbiologiquesdes
poissonsmigrateursamphihalins.Ellecomportedeuxvolets:
? l?un,surlesmanoeuvresdegestiondesouvrageshydrauliques;
? l?autre,surlagestiondesplansd?eau,susceptiblesd?affecterl?hydrologienaturelle.
Surlepremiervolet,ilconvientquelesmanoeuvresdegestiondesouvrageshydrauliquesévitentles
réductionsnonnaturellesdedébitsusceptiblesdeprovoquerunebaissesignificativedeshauteurs
d'eauenpériodedereproduction,afindeprévenirlesexondationsdenids.
Pourlesouvragesoùdesécluséessontpossibles,lesrèglementspeuventpréciserlesconditions
éventuellesdelimitationdeseffetsdesécluséesenpériodedereproductionetd'incubationdesoeufs.
Surlesecondvolet,ilconvientderechercherunegestionlaplusnaturellepossibledesouvragesà
vocationdesoutiend'étiagedansunelogiquederecherched'unfonctionnementhydrologiquequisoit
lemoinsartificialisépossible.Ensubstance,ils?agitderéduirel?impactduremplissagedesréserves
enpériodedemigrationactive.Celaserarecherchédanslalimitedurespectdesobjectifsassignésà
cesouvrages.
Aussi, et compte tenu de l?interception des écoulements gravitaires par les plans d?eau, cette
disposition invite à étudier un renforcement des modalités d?encadrement et de limitation de la
créationdenouveauxplansd?eaudansleSdageLoireBretagne20102015,enparticulierdansles
bassins versants des cours d?eau nécessitant la protection complète des poissons migrateurs
amphihalinsoùladensitédeplansd?eauestdéjàimportante.
4.6.2 OrientationR2:Reconquérirdeshabitatsfavorablesdansl'airederépartition
connuedesespècesamphihalines.
Lesmesuresderestaurationdelacontinuitéécologiquebénéficientauxhabitats,entreautresparla
restaurationdeladynamiquesédimentaire.
Ellesnesauraientcependantêtresuffisantes;desmesuresspécifiquesderestaurationdeshabitats
dereproductionetdedéveloppementdesjuvénilessontproposéesdanscetteorientationR2.
L'orientationR2seretrouvedansplusieursdispositionsduSdageLoireBretagne20102015.Eneffet,
sa disposition 1B1 prévoit que les Sage établissent un plan d'actions identifiant les mesures
nécessairesàlarestaurationdelacontinuitéécologique.Parextension,larestaurationdelaqualité
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physique et fonctionnelle des cours d'eau suppose d'intervenir dans tous les domaines qui
conditionnentl'habitatdesespècesvivantdanslesrivières.Ladisposition8A2prévoitaussiqueles
Sageouàdéfaut lespréfets identifientlesprincipesd'actionsàmettreenoeuvrepourassurerla
préservationetlagestiondeszoneshumides.
DispositionR2A:Aprèsconcertationlocale,lesdocumentsdeplanificationpeuventdéfinir
des objectifs spécifiques de qualité des eaux sur les secteurs de reproduction et de
développementdesjuvénilesdespoissonsmigrateursamphihalins.
L?incubationdesoeufsetlaviedestaconssontdesétapesessentiellesducycledeviedusaumon.
Afindetenircomptedeleursexigencesspécifiques,uneexigenceparticulièredequalitédeseaux
peut voir le jour dans les bassins versants où se trouvent des zones de reproduction et de
développementdesjuvéniles.
CettedispositionàvaleurderecommandationconcerneenparticulierlesaumondeLoireAllier.
Cette recommandation accompagne ainsi l'enjeu de conservation des populations de poissons
migrateursamphihalinsetcomplète ladispositionP2A.Elleavocationàêtredéclinéedansdes
sousbassinsversantsprécis,enfonctiondel?enjeuexistantpourlesespècesamphihalinesetdes
concertationsmenéesaveclesCLE,danslecadredeladispositionG2A.
Lesobjectifsdequalitéspécifiques,quiseraientdéfinisàl'échellelocaleetenconcertation,pourront
visernotammentlesparamètresd'oxygénation(oxygènedissous,demandebiologiqueenoxygène)
et lesnutriments(ammonium,orthophosphates)etleurpropositions'appuierasurlesexpériences
étrangèresetlesconnaissancesscientifiques.
Disposition R2B: Les bassins versants, où se situent des zones de reproduction et de
croissance d'espèces de poissons migrateurs amphihalins, font l'objet d'opérations de
restaurationdel'hydromorphologie,lorsquecelleciestaltérée.
Lesopérationssontproposées,conformémentà l'orientation1B1duSdageLoireBretagne2010
2015àl'échellecohérented'unbassinversantdanslecadred'unSagequandilexisteetcontribuent
aupland'actionsduSageenfaveurdelarestaurationdel'hydromorphologie.
Pourlamiseenoeuvredecettedisposition,ilestrecommandédansunpremiertempsnotammentla
réalisationdesopérationssuivantes,comptetenudeleurintérêtpourlaremobilisationsédimentaire,
sousréservedescontraintesdesécurité,desalubritépubliqueetderespectdesusages:
? l'effacementdesobstaclesàl'écoulement;
? l'arrêtdelaprotectiondebergespardestechniquesautresquevégétales;
? laluttecontrel'ensablementetlecolmatage,tellequelaréductiondupiétinementdesbergespar
lebétailoudel'abreuvementdirectementdanslecoursd'eau.
Cette disposition est susceptible de concerner notamment les têtes debassins versants dans le
bassindel'Allier,lesbassinsdelaVienneetdelaCreuse,ainsiquelesbassinsversantsdelafaçade
atlantique(côtiersvendéens,LoireavaletSèvreniortaise),oùsetrouventlesmaraisrétrolittoraux,et
laLoiremoyenneoùsetrouventdenombreusesannexeshydrauliques.
Enzonedemarais,larestaurationdel'hydromorphologiepourrapasserpardesopérationsd'entretien
desétiersetdesfossés.
Dans un second temps, cette disposition pourra se traduire par la possibilité d'interrompre toute
protectiondebergesdansl'optiquedemaintenirunespacedemobilitésuffisantpourlecoursd'eausi
cedernierestuneconditiondel'atteintedubonétat.
En parallèle, une réflexion pourra s?ouvrir sur la prise en compte de la présence de poissons
migrateursamphihalins(zonesdenurserieetdenourricerie)dansladéfinitiondesplansdedragage
enzoneestuarienneetmaritime.
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LeCogepomiencouragelareprisedecettedispositiondansleSdage20162021afindefavoriserla
restaurationdespopulationsdepoissonsmigrateursamphihalins.
4.6.3 OrientationR3:Accompagnerlareconquêted?habitatsproductifset
accessiblespardesopérationsdesoutientemporaired?effectifenjuvéniles
L'originalitéécobiologiquedespopulationsdepoissonsmigrateursamphihalinsrendessentiell'intérêt
depréserverlespopulationsenplaceetd'éviterleurextinctionpardesopérationsdesoutiendes
effectifs.Cesopérationspeuventavoirlieulorsquel'effectifnaturelestjugéinsuffisantpourassurerla
viabilitépérennedespopulationssauvagesetqu'iln'existepasd'incompatibilitétechniqueàleurmise
enoeuvre.
L?objectif du soutien d?effectif est d?intervenir en accompagnement temporaire d?opérations de
restaurationdeshabitatsproductifsetdeleuraccessibilitémigratoireafindepermettredesoutenirla
population sauvage résiduelle (logique de conservation) jusqu?à son niveau de viabilité ou de
participer à l?implantation d?une population sauvage sur un sousbassin versant (logique de
réintroduction).
Il est important deveiller àcequeles individusdéversésdans lecadred'opérationsdesoutien
d'effectifcontribuentàlareproductionenmilieunaturellorsducyclesuivantetqueleurdescendance
soitenmesuredefairedemême.
DanslesbassinsdelaLoire,delaSèvreniortaiseetdescôtiersvendéens,desopérationsdesoutien
d'effectifontlieupourlesaumondepuislesannées1970etpourlacivelledepuis2010.
Lesoutiend'effectifenjuvénilesdesaumonsafaitl'objetd'unrenforcementaudébutdesannées
2000,décidéparleministèreenchargedel'environnementle13juillet1994,ets'esttraduitparla
miseenservicedelasalmonicultureduHautAllier,leConservatoirenationaldusaumonsauvage.
Cettedécisionreposaitsurleconstatderisqued'extinctionélevédelapopulationsauvagesuiteà
quatreannéesconsécutivesdesécheresse,de1989à1993,aucoursdesquellesl'effectifannuelde
saumonsn'étaitqued'unecentained'individusdansl'Allier.
Lacivellefaitl'objetdepuis2010,danslecadreduPGA,d'unprogrammeexpérimentaldesoutien
d'effectif.Eneffet,laFranceadécidélamiseenplaceàtitreexpérimentald'opérationsdetransfert
decivellesdanslesdifférentsbassinshydrographiques.Cesopérationssontmisesenoeuvresous
l'égideduministèreenchargedel'écologie.Ellesportentsur5à10%desanguillespêchéesen
France.Pourl'unitédegestiondel'anguilleLoire,côtiersvendéensetSèvreniortaise,desopérations
sont réalisées depuis la saison de pêche 20102011 sur plusieurs cours d'eau et marais,
principalementenLoireAtlantiqueetenVendée.
Les dispositions d'évaluation des opérations de soutien d'effectif sont traitées dans l'orientation
fondamentalerelativeàlaconnaissance(OFC).
Ausujetdesopérationsdesoutiend'effectif, leSdageLoireBretagne20102015préciseparses
dispositions 9C1, 9C3 et 9C4 que les opérations de soutien d'effectif relatives aux poissons
migrateursamphihalinssont réaliséesconformémentauPlagepomi. Il indiqueégalementque les
massesd'eauentrèsbonétatnedoiventfairel'objetd'aucuneopérationdesoutiend'effectifetque
les masses d'eau en bon état ne peuvent accueillir une opération de soutien d'effectif que si
l'opérationneconduitpasàunedétériorationdel'étatdelamassed'eauouàuneremiseencause
del'objectiffixépourcettemassed'eau.
Disposition R3-A : Les programmes de soutien d?effectif intègrent les recommandations
scientifiques connues ou pouvant être émises lors de la mise en oeuvre du Plagepomi, et
s'appuient sur le maintien et l'amélioration des connaissances zootechniques.
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Les recommandations à prendre en compte pour les opérations de soutien d'effectif (saumon,
civelles...) sont issues notamment des travaux de groupes d'experts scientifiques, nationaux et
internationaux(commeleConseilscientifiquedusaumondeLoireAllier),etsonttraduitesdansles
documentsdecadragedesopérationsdesoutiend'effectif.Ellesconcernententreautreslaconduite
d'élevageetl'évaluationdesopérations,avecenparticulierdesexigencesenmatièrede:
? originedesgéniteurscontribuantàlaproductiondejuvéniles;
? élevage,afindeserapprocherdesconditionsnaturelles;
? priorité d'élevage: par exemple, l'intérêt biologique supérieur des stades de développement
précoces(oeufs,alevins)pourlesopérationsdesoutiend'effectifenjuvénilesdesaumon;
? stratégie,appropriéeàchaquebassinversant;
? évaluation des opérations, afin de qualifier leur contribution à la restauration des effectifs:
traçabilitédesjuvénilesparmarquagephysiqueouparanalysegénétique.
L'ensembledesrecommandationsscientifiquesconnuesàl'adoptionduPlagepomi20142019sont
respectées et des adaptations seront prévues dans sa mise en oeuvre en cas de nouvelles
recommandationsscientifiques,sousréservedefaisabilitétechniqueàcoûtraisonnable.
Lamiseenoeuvreopérationnelledecesrecommandationsveilleàtenircomptedel'évolutiondes
connaissanceszootechniques, qui profite de l'amélioration des connaissancessur la biologie des
poissonsmigrateursamphihalins(dispositionC2B).
Disposition R3B: Les programmes de soutien d?effectif respectent la logique de
nondégradation du milieu aquatique (capacités des habitats, interactions avec les
populationspiscicolesenplace?).
Lesprogrammesdesoutiend'effectifdetouteespèceamphihaline(civelles,saumon...)s'inscrivent
dansleprincipedenondégradationdumilieuaquatique.
Enparticulier, ilstiennentcomptedescapacitésd?accueildeshabitatsetdesinteractionsavecla
populationsauvageetlesautrespopulationspiscicolesprésentesdanslescoursd?eau.
Entreautres,il estnécessairedelimiterl'impactdusoutiend'effectifsurlareproductionnaturelle.
Ainsi,encequiconcernelesaumon,lesopérationsdesoutiend'effectifnedoiventpassaturerles
habitatshébergeantdesfrayèresnaturelles, etdeszonesrefuges,sanssoutiend'effectif dansle
cadredesprogrammesrépondantàl?orientationR3,peuventêtremisesenplace.Encomplémentde
lazonerefugeexistantedepuis2009dansleHautAllier,denouvelleszonesrefugesnepeuventêtre
délimitées quesi le linéaire de cours d'eauconcernépar leur emprise cumule les trois critères
suivants:
? uneaccessibilitéavecunretard,dûaufranchissementdesobstaclesàl'écoulement,inexistantou
limitéàlamontaison;
? dessurfacessuffisantesd'habitatsproductifs;
? l'absenced'obstaclesmajeursàladévalaisonversl'océan.
Leprogrammedesoutiend'effectif encivelles respecte, au droit dessites dedéversement, les
densitésmaximalesdedéversementprévuesdanslecadreduprogrammenationalderepeuplement.
Leprogrammedesoutiend'effectif ensaumondistingueledéversementdejuvénilesàdifférents
stadesdedéveloppement:
? lestadesmoltest,auvudelalittératurescientifiqueetdesélémentsd?évaluationdisponibles,le
stadeprésentantlemoindreintérêtbiologiquepourparticiperàlaconservationdelapopulationde
saumons sauvages de LoireAllier. L?effort de soutien d?effectif en smolts doit être réduit
progressivement sur lessecteursoùdeshabitatsproductifssont suffisammentprésentsetoù
prévautl?enjeudeconservationdelapopulationdesaumonssauvages(bassinsdel'Allieretdela
Loirebourguignonne).
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Lesoutiend?effectifaustadesmoltprésenteenrevancheunintérêtdanslesbiotopesdégradés,
oùleprogrammedesoutiend?effectifrépondàl?enjeuderéintroductiond?unepopulation(bassin
delaGartempe);
? les stades précoces de développement, et notamment le stade de l?alevin de printemps,
constituentlaprioritéduprogrammedesoutiend?effectifrelativementàl?enjeudeconservationde
la population de saumons sauvages (bassins de l'Allier et de la Loire bourguignonne). Sous
réservedelaconnaissancedeshabitatsproductifsetenrespectdel'ensembledel'orientationR3,
l'effortdesoutiend'effectifpourraitêtrerépartisurcertainsaffluentsdesaxesprincipaux;
? les oeufs en incubateurs constituent des expérimentations accompagnant la stratégie du
programmedesoutiend?effectifetpourlesquellesundispositifd?évaluationspécifiqueestmisen
place,afind?êtreenmesuredestatuersurleurintérêt(dispositionC4A).
Dansuneapprochepragmatique,afindepleinementvaloriserlesopérationsdesoutiend?effectif,
menéesenparallèledesopérationsprioritairesdepréservationetderestaurationdeshabitatsetde
la continuité écologique, touteopération dedéversement chercheraàoptimiser l?occupation des
habitats productifs favorables disponibles et est adaptée en fonction de la répartition de la
reproductionnaturelle et de l?évolution desconnaissances, entreautresdeshabitats(disposition
C1C).
DispositionR3C:Leprogrammedesoutiend?effectifensaumonsprivilégielaproductionde
juvénilesissusdegéniteurssauvagesetrechercheuneadaptationauxbesoinsdesoutien
annuel.
Afinderechercherunéquilibrebiologiqueentrelareproductionnaturelleetlesoutiend'effectif,sous
réservedefaisabilitétechnique,lesbesoinsdesoutiend'effectifvarierontenfonctiondusuccèsdela
reproductionnaturelle.
Schématiquement, la mise en oeuvre de cette approche dans la deuxième partie du Plagepomi
20142019pourraitconduirelesannéesoùestconstatéeunefaibleactivitédereproductionnaturelle
àuneaugmentationdel'effortdesoutiendeseffectifsetlesannéesoùestconstatéeuneforteactivité
dereproductionnaturelleàunplusfaibleeffortdesoutiend'effectif.Cetteapprocherequiertdedéfinir
les besoins préalables en termes de connaissanceet d'analyser sa faisabilité techniquedans la
mesureoùellenécessiteunecapacitéd'adaptationrapideauxobservations.Ellepourraitsetraduire
parunsoutiend'effectif quiciblerait préférentiellement leszonesd'habitat lesplusproductivesles
annéessuivantunefaiblereproductionnaturelle.
4.7 OFC:Améliorerlesconnaissancesetlesuividespopulationsdans
uncontextedechangementglobal
L'acquisitiondeconnaissancesconstitueunpilierduPlagepomi:mieuxconnaîtrelecomportementet
les habitats des populations de poissons migrateurs amphihalins permet en effet de retenir des
mesures de gestion adaptées afin de rechercher une efficacité maximale. Cette orientation
fondamentale s'inscrit en appui des deux orientations fondamentales précédentes relatives à la
préservationetàlarestaurationdeshabitatsetdeseffectifsdepoissonsmigrateursamphihalins.
Les opérations de suivi font l'objet d'échanges techniques et les protocoles font l'objet d'une
validation après concertation des partenaires concernés. Les informations acquises (donnéeset
résultatsinterprétés)sontmisesàdispositiondesgestionnairesetsontnotammentvaloriséesaux
finsd'éclairagedesprisesdedécisionsenmatièrederestaurationetdepréservationdesmilieux
aquatiques.
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4.7.1 OrientationC1:Renforcerl'évaluationetlacompréhensiondeladépendance
despoissonsmigrateursamphihalinsàleurshabitats
Laqualitédeshabitatsetleuraccessibilitésontdesfacteursexplicatifsessentielsdel'abondancedes
populationsdepoissonsmigrateursamphihalins.Aussiestilindispensabledepoursuivrelesefforts
decompréhensiondesrelationsentrelesespècesetleurshabitats,eneaudouce,enestuaireeten
mer,afind'êtreenmesuredeproposerdesmesuresdegestionquisoientlesplusadaptéesaux
contexteslocauxetd'éclairerlesorientationsfondamentalesPetRencequ'ellesconcernentles
habitatsetlescircuitsdemigrations.
Disposition C1A: Les connaissances acquises dans le cadre d?actions en faveur de
l?améliorationdesmilieux(programmedesurveillancedel?étatécologiquedeseaux,études
produites dans le cadre des Sage ou des contrats territoriaux en faveur des milieux
aquatiques?)sontexploitéesetvaloriséespourlesbesoinsduplandegestiondespoissons
migrateurs, afin d?êtreenmesuredeproposer, aubesoin, desmesuresd?évitement et de
réductiondesimpacts.
Lerassemblementdesconnaissancesacquisespardifférentsopérateurssurlaqualitédesmilieux
(suivisencontinudesdébitsettempératuresdel?eau,suivispérennesdelaqualitédeseauxparle
réseaudecontrôledesurveillance,suivisdesrejetsdestationsdetraitementdeseauxuséespar
autosurveillance?)estincontournablepourlamiseenoeuvredecettedisposition.
Enparticulier,ilconvientd?établirunbilandesconnaissancesacquisesdanslecadredel?élaboration
oudelamiseenoeuvredesSageetdescontratsterritoriauxenfaveurdesmilieuxaquatiques.
Lacapitalisationdecesinformationspermetdecaractériserl?étatdefonctionnalitédeshabitatsdes
poissonsmigrateursamphihalinsetdeproposerencasdeconstatdedégradationdesmesuresde
restauration.
Aubesoinetsousréserved'identificationdeleursbénéficesopérationnels,lafaisabilitéd'opérations
complémentairesd'étudesetdesuivisdesmilieuxdeviedespoissonsmigrateursamphihalinsest
étudiéedanslecadreduPlagepomi.
DispositionC1B:Les impacts des pollutions, des ouvrages et des plans d'eau sur le cycle de
vie des poissons migrateurs amphihalins font l'objet d'une caractérisation.
Lamiseenoeuvredecettedisposition,àl'interfaceentrelaqualitédesmilieuxaquatiquesetlecycle
deviedespoissonsmigrateursamphihalins,accompagnel'orientationR2etnotammentladisposition
R2A.
Ellesetraduitnotammentpardesopérationsinsituetexsitudesuivisdesimpactssurlasurvieetle
développement des juvéniles, et contribue à améliorer la connaissance des impacts des
perturbateursendocrinienssurlesespècesamphihalines.
Lesélémentssontportésàlaconnaissancedupublicetéclairentlesdécisionsprisesenregarddes
mesuresdesdispositionsP1B,P2CetR2A.
Disposition C1C: La connaissance qualitative et quantitative des habitats vitaux des
poissonsmigrateursamphihalinsdansleurphasedeviedulçaquicoleestactualiséepourdes
coursd'eauconnusoudécritepourdenouveauxcoursd'eau.
Cettedispositioncomprendunvoletd'approfondissementdesconnaissancesdeshabitatsdescours
d'eauoùdesétudespasséessontdisponibles.Desopérationspeuventyavoirlieudanscecadresi
des divergences sont constatées entre les observations de terrain et les études actuellement
disponibles.
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Lesétudesquipourraientêtremenéessurdescoursd'eauoutronçonsdecoursd'eaunondécrits
précisément actuellement pourront viser des secteurs de présence historique des espèces
amphihalinesoùlebonétatdesmassesd'eaupourraitjustifierunintérêtdereconquête.
Lesconnaissancesacquisesdanslecadredecettedispositionpourrontêtremobiliséesenappuides
orientations P1, P2, R1 et R2, afin de préserver les habitats favorables sur ces cours d'eau
nouvellementcaractérisésetdetravailleràlarestaurationdelacontinuitéécologiquedanscescours
d'eaupourpermettreauxpoissonsmigrateursamphihalinsdereconquérirceshabitats.
Lesétudesprospectivesquiconsistentàidentifierlesterritoiresàpotentield?accueilenamontde
verrous infranchissables peuvent accompagner les démarches de restauration des poissons
migrateurs,bienquelesterritoiresvisésparcesétudesprospectivesneconstituentpasdespriorités
de reconquêtedans le cadreducorpus réglementaire actuel (coursd'eaudeces territoiresnon
classés en liste 2 au titre de l'article L.21417 du code de l'environnement pour une espèce
amphihaline).
Toute étude menée sur un cours d'eau ou tronçon de cours d'eau non décrit précisément
actuellement intégrera un volet technique et un volet économique, afin d'évaluer le coût d'une
éventuelleopérationdereconquête.
Disposition C1D: Le changement climatique et ses effets sur l'évolution des milieux
aquatiques, lespratiquesdansles bassinsversants, l'adaptationdespoissonsmigrateurs
amphihalinsetlesmodificationséventuellesdesairesderépartitiondespoissonsmigrateurs
amphihalinsquelacombinaisondesprécédentsélémentspeutengendrerfont l'objetd'un
suiviparleCogepomi.
Parsuivi,ilconvientd'entendredeuxniveauxd'implicationduCogepomi:
? lerassemblementdesinformationsetétudesproduitessurlechangementclimatiquetraitantde
l'hydrologie,durégimethermique,descouverturesvégétalesetdelabiologiedesespèces;
? la mise en place éventuelle d'opérations spécifiques centrées sur les poissons migrateurs
amphihalinsdubassindelaLoire.
Cettedispositionrevêtégalementunintérêtderétrospectivehistoriquequipermettraitd'identifierdes
évolutionsmajeurespouvantexpliquerenpartie lesévolutionsquiontpuêtreconstatéessur les
effectifsdepoissonsmigrateursamphihalins.
Ces connaissances éclairent notamment les orientations P2 et P3 afin d'éviter d'accroître toute
dégradationetfournissentdespistesdetravailenfaveurdelarestaurationdeshabitats(orientation
R2).
DispositionC1E: L'évolution de la colonisation des bassins par les espèces envahissantes
fait l?objet d?une caractérisation et d?une évaluation de ses impacts.
Lesespècesenvahissantes,nativesouexotiques,sontsusceptiblesd'engendrerdesmodifications
d'équilibresauseindeshabitatsetdelachaînetrophiquepouvantsetraduirepar:
? desfermeturesd'habitats;
? des prédations accrues sur les poissons migrateurs amphihalins, parfois par des prédateurs
«émergents».
DeséchangessedéveloppententreleCogepomietlesréseauxdesuividesespècesenvahissantes
existantauniveaudubassindelaLoire(auniveaudubassindelaLoire,lacoordinationestassurée
parlaFédérationdesConservatoiresd'EspacesNaturels).
Cesconnaissancespermettentdedisposerd'élémentsd'appréciationpouraideraudéveloppement
d'actionsdanslecadredesdispositionsP2BetP4E.
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4.7.2 OrientationC2:Conforter les connaissances sur la biologie et le comportement des
espèces migratrices amphihalines, et poursuivre la surveillance des populations.
Après avoir constaté la présencedes poissons migrateurs amphihalins dans uncours d'eauou
tronçondecoursd'eauetlaprésenceconcomitanted'unesurfacesuffisanted'habitatsproductifs,il
convientd'envisagerdesopérationsdesuividucomportementdespoissonsmigrateursamphihalins.
Pourlescoursd'eauoutronçonsdecoursd'eauoùdesopérationsdesuiviontdéjàlieu,ilconvient
de veiller à la poursuite des opérations de suivi scientifique et technique, afin de maintenir
l'alimentationdeschroniquesdedonnéessuffisamment longuesseules, capablesdedonnerdes
indicationssurl'évolutiondel'étatd'unepopulation.
L'acquisitiondeconnaissancessurlabiologiedesespècesamphihalinesdistingue:
? enpremièrepriorité,lesopérationsdesuivisannuels,quipermettentderenseignerdesindicateurs
de l'état despopulationset de leurévolution, qui s'inscrivent encomplémentauxréseauxde
contrôledesurveillancedelaqualitédesmilieuxaquatiques;
? ensecondepriorité,lesétudesponctuelles,nécessitantuneffortparticulieruneannéedonnée,
ciblésurunoucertainsbassinsversants.
Lesétudessurlabiologiedesespèces,menéesinsitudansl'ensembleduterritoireduCogepomiou
exsitu,peuventrecouriràdespoissonsd'élevagedemêmesouchegénétiquequelapopulationen
placedanslebassinversantauquelserapportel'étude.
DispositionC2A:Desopérationsderecensementdepoissonsmigrateursamphihalinsont
lieusurdescoursd'eauoutronçondecoursd'eauoùleurprésencen'estpascaractérisée
précisémentàcejour.
Cettedispositionconcernenotammentlescoursd'eausituésdansl'airederépartitionhistoriquede
l'espèceconsidérée.
En accompagnement de la caractérisation des habitats favorables aux poissons migrateurs
amphihalins(dispositionC1C),l'inventairedelaprésencedesespècessurdenouveauxcoursd'eau
constitueuneveilleessentielle.
Cettedisposition reposesur la capitalisationdes connaissances existanteset pourraconduire à
l'émergence de nouvelles méthodes d'acquisition de connaissances, afin de développer une
connaissanceglobalelaplusexhaustivepossibleàl'échelledubassin.
DispositionC2B:Lasurvie,lareproduction,ledéveloppementetl'abondancedesjuvéniles
despoissonsmigrateurs amphihalins font l'objet d'unsuivi annuel, afin devérifier le bon
fonctionnementdescyclesbiologiquesdanslebassindelaLoire.
Cettedispositioncibleessentiellementcertainsbassinsversantsselonlarépartitiondeseffectifsd'une
espècedonnéeetlaprésencedepopulationssauvagesdepoissonsmigrateursamphihalins.
Elles'inscritdanslacontinuitédeschroniquesdedonnéesdisponibles.
Disposition C2C: Les migrations des poissons migrateurs amphihalins font l'objet
d'opérationsdesuivi.
Ladéclinaisondecettedispositionpermetd'évaluerlesretombéesdurétablissementdelacontinuité
écologiquedescoursd'eauetapparaîtcommeundispositifd'évaluationdel'orientationR1.
Cettedispositions'appuiesurdesopérationsannuelles,pouvantêtrecomplétéespardesopérations
ponctuellesdontl'intérêtrésidedanslesuividesmigrationsàl'échelled'uncoursd'eaudansson
ensemble.
Uneattention particulière pourraêtreportéeaux fluxentrée/sortieenestuaire, dans la limitedes
moyens techniquesdisponiblesàcoût raisonnable. Ladéclinaisondecettedispositionsurcecas
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spécifiquedesestuairessefaitencohérenceavecl'élaborationdupland'actionspourlemilieumarin
duGolfedeGascogne.
DispositionC2D:Lesdonnéesbiologiquessontvaloriséespourcomprendreladynamique
despopulationsdepoissonsmigrateursamphihalinsetsuivre l?évolutionvers l?objectif de
viabilitédespopulations.
Lesconnaissancesacquisesgrâcenotammentà lamiseenoeuvredesmesuresdesdispositions
C2BetC2Cpermettentdeprogresserdanslacompréhensiondesdynamiquesdepopulations.
Lamiseenoeuvredecettedispositionconduitàapprécierlaviabilitédespopulationssauvagesparle
suividedifférentsindicateursetàévaluerleseffectifscorrespondantauxseuilsd'exploitation,dont
l'atteinteàlahausseouàlabaissepeutconduireàunemodificationdesmesuresd'encadrementde
lapêche,exposéesparlesmesuresdesdispositionsP4AetP4B.
4.7.3 OrientationC3:Améliorerlaconnaissancedelapressiondepêcheexercée
surlespoissonsmigrateursamphihalins
Afind'éclairer la miseenoeuvre de l'orientation P4, il est nécessaire depoursuivreet renforcer
l'informationduCogepomisurl'étatdelapressiondepêchesurlespoissonsmigrateursamphihalins.
Rappelréglementaire :
L'articleR.43664duCodedel'environnementprévoitàsonpremieralinéaquetoutpêcheureneau
douce,professionneloudeloisir,doitteniràjouruncarnetdepêcheselonlesmodalitésfixéesparle
plandegestiondespoissonsmigrateurs.
Pourlapêchedel'anguille,cesmodalitéssontfixéespararrêtéduministrechargédelapêcheen
eaudouce(arrêtéministérieldu22octobre2010)etelless'accompagnentd'obligationsdéclaratives
pour les différents stades d'anguille pêchés (civelle, anguille jaune et anguille argentée). Ces
obligations déclaratives concernent tous les pêcheurs aux engins sur le domaine public
(professionnelsetamateurs),ainsiquelesmembresdesAAPPMAautorisésàpêcherauxenginssur
ledomaineprivé.
Lescapturesaccidentellesetaccessoiressontégalementconsignéesdanslecarnetdepêche.
DispositionC3A:LeCogepomiveilleàobtenirlesdonnéesdecaptureauprèsdesservices
enchargedeleurcentralisation.
Afind'améliorerlagestiondesespècesmigratricesamphihalinesetnotammentd'évaluerl'efficacité
desmesuresd'interdictiondelapêchedecertainesespècesamphihalines(dispositionP4A)etla
pertinence de mesures complémentaires d'encadrement des pratiques (disposition P4B), les
donnéesdecapturessontvaloriséesdanslecadreduCogepomi.
Lamiseenplaced'unedémarchederecueildesinformationsauprèsdesserviceschargésdela
collectedesinformationsetdesorganisationsreprésentativesdespêcheurs(FDAAPPMA,AAPPED,
CRPMEM)estétudiéeenpriorité,afinderemédierauxdifficultésactuellesderécupérationetde
valorisationdecesdonnéesàl?échelleduCogepomi.
4.7.4 OrientationC4:Évaluerl'efficacitédesprogrammesdesoutiend?effectifs,afin
d?êtreenmesuredelesadapterlecaséchéant.
Cetteorientations'inscritenétroiterelationavecl'orientationR3.
L?ensembledeseffetsdesprogrammesdesoutiend?effectifensaumonsdoitêtreévalué,notamment
sonefficacitéentermesd'individuscontributeursàlareproduction.
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Pourcequiconcernelemonitoringdesopérationsderepeuplementencivelles,lesélémentssont
cadrésauniveaunationaldansleplandegestiondel'anguilleetdansleprogrammeexpérimentaldu
repeuplement.
Cetteorientations'inscritdanslacontinuitédesprogrammesd'évaluationencours(suiviàsixmois,
unanettroisanspourlesopérationsdetransfertdecivelles,assignationgénétiqueparentalepourle
saumon).Samiseenoeuvreaccompagnedefaitlesprogrammesdesoutiend'effectif.
C4A: L'implantationdesjuvénilesdéversésdanslemilieunaturel lorsdesopérationsde
soutiend'effectiffaitl'objetdemesuresd'évaluation.
Cettedispositionapourobjectifdeconstaterl'occupationdeshabitatsdessitesdedéversementsuite
auxopérationsmenéesdanslecadredel?orientationR3.Unerécurrencederésultatsdéfavorables
d'implantation doit conduire à adapter les sites de déversements définis par les mesures de la
dispositionR3B.
Lamiseenoeuvredecettedispositions'articuleavecladispositionC2Betimpliquenotamment:
? d'évaluer les opérations expérimentales de soutien d'effectif par des chargements d?oeufs en
incubateursdeterrain;
? d'être en mesure d'identifier l'origine des juvéniles, ce qui peut nécessiter une analyse du
patrimoinegénétiquedesjuvénilesinventoriés;
? d'appliquer les protocoles desuivis harmonisés des opérations dedéversement pouvant être
définisauniveaunational.
C4B: Lacontributiondesindividusdéversésà lareproductionà l'issuede leur cyclede
grossissementestévaluée.
Comptetenudel'impossibilitétechniquedelamiseenoeuvred'uneopérationsurl'anguilledansle
cadreduPlagepomi,cettedispositionneportequesurlesaumon.
L'évaluationdecettecontributiondoitêtregénéraled'unepart,etdistinguerlapartdechaquestade
dedéversementutiliséquandlatechniquelepermetàcoûtraisonnable.
L'évaluationglobalepourrareposersurlapoursuitedel'opérationgénétiqued'assignationparentale,
lancéeen2009.Latraçabilitédel'élevagepermetdeconnaîtrelepatrimoinegénétiquedesdeux
parentsd'un individu déversédans le coursd'eau. Unprélèvement de tissuet d'écaillessur les
saumonsderetourspermetensuitel'analysedeleurADN.Cetteanalyserendpossiblel?assignation
dessaumonsderetoursàleursparents,sicesdernierssontoriginairesdelasalmoniculture.
Compte tenu des cycles biologiques des différents contingents issus d'une même reproduction,
quatrecohortesdifférentesreviennentenuneannée.
Les mesures d?évaluation des opérations de soutien d?effectif sont menées dans la mesure du
possibleensynergieavecd'autresopérationsnécessitant lamanipulationdepoissonsmigrateurs
afinderéduirelesimpactssurlapopulationsauvage.
Enparallèle,silatailledesjuvénilesdéverséslepermet,unmarquagephysiqueseraréalisé(par
exemplel?ablationdelanageoireadipeusedessmolts),afind?êtreenmesured?identifiervisuellement
l?originedupoissonderetour.
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INVALIDE) (ATTENTION: OPTION pourlespoissonsmigrateursamphihalinsaucours
deleursmigrations.
3.1.3 Leréseauhydrographique
Leréseauhydrographiqueconcernépar l'applicationduplandegestiondespoissonsmigrateurs
(PLAGEPOMI)comprend:
? lescoursd'eauetgroupesdecoursd'eauinscritsdanslebassinhydrographiquedelaLoirequi
s'étendentsur102000km²;
? lescoursd'eaucôtiersvendéensetàlaSèvreniortaisequis?étendentsur15000km²;
? plus généralement, les plans d'eau et zones humides, reliés au réseau hydrographique, et
fréquentésparlespoissonsmigrateursamphihalins.
Les caractéristiques topographiques, géologiques et hydrologiques conduisent à distinguer deux
grandescomposanteshydrographiquesdanslebassindelaLoire,delaSèvreniortaiseetdescôtiers
vendéens.
Lemassifarmoricainetlestablessédimentairesdubassinparisien
Cesterrains représentent lesdeux tiers duréseauhydrographiquedubassin. Cevaste territoire
couvretoutelapartieavalduréseauetpluslargementl?ensembledelapartiecentreouestdubassin.
Cesecteur représentea priori lesplusgrandessurfacesd'habitats productifs pour les poissons
migrateursamphihalins,enraisondesasuperficieetdesonaccessibilitédepuislafaçadeatlantique.
Pourautant, lescontraintesphysiqueset lespressionsanthropiquesquis?exercentsur lescours
d?eaudumassifarmoricainoudestablessédimentairesdubassinparisienlimitentlaformationde
facièsproductifspourlesespècespotamotoques,enparticulieràcausedesfaiblesniveauxdepente
naturelle qui caractérisent les versants de ce secteur aval et des obstacles à l'écoulement qui
accentuentfortementcedéficitdepentenaturelle.
La nature dominante des fonds doit également être prise en compte dans la mesure où la
granulométrieconstitueunélémentdéterminantdelaqualitédeshabitatsutilisésparlesespèces
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potamotoques.Eneffetlesgéniteursontbesoindelitsdecaillouxetdegraviersgrossierspoury
déposer leurs oeufs et les pontes sont très sensibles au colmatage par les éléments fins. Les
caractéristiquesgranulométriquesdescoursd?eaudelapartiecentreouestdubassinsontégalement
limitantes à cet égard, sous l?effet des contraintes naturelles et des transformations
hydromorphologiquesquipèsentsurlescoursd?eau.
Enfin,malgrélaproximitédel?océan,lafaiblessedesreliefsetlecaractèreimperméabledesterrains
dumassif armoricain limitent aussi ledébit d?étiageetlesconditionshydrologiquesfavorablesau
maintiendesfacièsd?eaucourantependantlesphasesdecroissancejuvénile.
Lemassifcentral
Cesterrainscouvrentunesurfacepluslimitée(untiersdelasuperficietotaledubassin)maisleurs
caractéristiques topographiques, géologiques et hydrologiques sont plus favorables aux espèces
potamotoques. En effet, les éléments structurants de ce secteur hydrographique favorisent la
formationdezonesdefrayèresetd?habitatsproductifspourlesjuvéniles.
Ces cours d?eau bénéficient d?altitude, de gradient de pente et de conditions hydrologiques
(12à17l/s/km2enmoyenneannuelle), qui se traduisent par unedominante naturelle de faciès
courantsurdesfondsàgranulométriegrossière.
En outre, contrairement au profil d?équilibre des rivières armoricaines et sédimentaires, la
morphologiedescoursd?eaudumassifcentralestsoumiseàdenombreuxaccidentstopographiques
etaffleurementsrocheux.Cesconditionsaugmententlafréquenced?apparitiondesradiersetrapides
le long des parcours migratoires, y compris dans les parties aval descours d?eau, en zone de
piémont.
3.1.4 Unterritoireàfortpotentielpourlespoissonsmigrateursamphihalins
Laconfigurationhydrographiquedubassin(estuaires,zoneshumidesetcoursd'eau)estfavorableà
l'accueildespoissonsmigrateursamphihalinspar:
? lapositioncentraledubassinsurlafaçadeatlantique,particulièrementbiensituéeparrapportàla
distributionocéaniquedesfluxmigratoires,
? lasurfaceimportantedubassin,soitplusducinquièmeduterritoiredeFrancemétropolitaine,et
surlequelsontrecensés120000kmdecoursd'eauàdesaltitudesfavorablesàlacolonisation
parlesespècesmigratrices,
? lessurfacesimportantesdemaraisetdezoneshumides,
? lecontextehydroécologiquetrèsrichesuivantladiversitédureliefetlagéologie,
? laprésenced'habitatsàfortpotentielproductif,enparticulierpourlesaumonatlantiquesurles
terrainsanciensdumassifcentral.
Suivantleurgradientdepente,leszonesdesocledubassinamontrépondentbienauxconditions
morphodynamiques nécessaires à la reproduction des grands migrateurs (saumon, lamproies,
aloses).Parailleurs,l'intégritédecesmilieuxestrelativementbienconservéedanslespartiesamont
dubassin,souventpréservéesparunespaceruralàdominanteherbagèreouforestière.
3.2 Descriptiondesdifférentssousbassinsversantsduterritoiredu
Cogepomi
Dixsousbassinsversantsontétédéfiniscomptetenudeleurhomogénéité:
? l'Allier,
? laLoireamont,
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? laLoirebourguignonne,dubarragedeVillerestàlaconfluencedel'AllieraveclaLoire,
? laLoiremoyenne,delaconfluencedel'AllieraveclaLoireàlaconfluencedelaVienneavecla
Loire,
? leCher,
? laVienne,
? laMaine,
? laLoireaval,delaconfluencedelaVienneaveclaLoirejusqu'àl'océan,
? laSèvreniortaise,
? lescoursd'eaucôtiersvendéens,affluentsàl'océanentrelabaiedel'Aiguillonetl'estuairedela
Loire.
Lessurfacesd'habitatsfavorablesparespèceserontprécisées,quandellessontconnues,dansla
partie 2 du Plagepomi, dans les paragraphes relatifs à chacune des espèces. Seuls sont ici
mentionnésdesélémentsqualitatifspourchacundesneufsoussecteurs.
3.2.1 Bassinversantdel'Allier
Lebassindel'Allierconcentrel'essentieldeshabitatsfavorablesactuellementaccessiblespourle
saumonatlantique àl'échelledubassindelaLoire.C'estégalementleseulbassinoùsurvit une
populationrésiduelledesaumonssauvages1.
Despopulationsd'anguilles, de lamproiesetd'alosessont égalementprésentessur lebassinde
l'Allier.
Laconstructiondeseuilsetbarragesdestinésàlaproductiond?hydroélectricité,ausoutiend'étiage,
àl?écrêtementdescruesoulacréationderetenuesd?eaupourl?irrigation,aprogressivementrestreint
l'airederépartitiondespoissonsmigrateursamphihalinssurcebassin,notammentdusaumon,en
limitantl'accèsauxhabitatssituéssurlespartieamontdescoursd'eaudecebassinversant.
L'effacementdubarragedeSaintÉtienneduViganen1998etl'équipementdubarragedePoutèsen
dispositifsde franchissementà la montaisonen1986et à la dévalaisonen1998ont permisde
faciliterl'accèsdusaumonauxsecteursdereproductionsituéssurlehautAllieretsesaffluents.Le
projetderéaménagementdubarragedePoutès(abaissementduseuiletréductiondelalongueurde
laretenue,accompagnésd'équipementspourlamontaison(passeàpoissonsàbassinssuccessifsà
macrorugositésdefond)etladévalaison(glissièrededévalaisonetgrillesantiintrusionauniveaude
la prise d'eau) et de clapets amovibles pour des débits de crueen position centrale du nouvel
ouvrage)permettradefaciliterlaconnexiondeshabitatsproductifsduHautAllier etderétablir le
transportsédimentaire.Toutefoisdesdifficultésmigratoirespersistentparailleurssur l'Allier etse
manifestentparl'accumulationderetardsdanslesmigrations.Cesdifficultéssemblentplusfortement
marquéesàladévalaison.
Contrairementauxautressousbassinsversants(Cher,Vienne,Maine,Sèvreniortaise)etbienque
lesconditionsdemigrationsrestentàaméliorer parendroit, leshabitatsfavorablesauxpoissons
migrateursamphihalinsdubassindel'Allierontpuresterplusaccessiblesqu'ailleurs.
3.2.2 BassinversantdelaLoireamont
Ce territoireconcerne la Loire, depuis sa source jusqu'aubarragedeVillerest. Actuellement, ce
territoire n'est pas accessible aux poissons migrateurs amphihalins, compte tenu du caractère
infranchissabledubarragedeVillerest.
1 Estconsidérécommeunsaumonsauvageunsaumonnédanslarivièredeparentsnéseuxmêmesdanslarivière,
d?aprèsladéfinitionduCIEM(WGNAS)en1997.
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Historiquement,cebassinaccueillaitdespopulationsdepoissonsmigrateursamphihalins.
3.2.3 BassinversantdelaLoirebourguignonne
CebassinversantestconstituéparlaLoire,dupieddubarragedeVillerestjusqu'aubecd'Allier.De
l'amontversl'aval,troisaffluentsprincipauxconfluentaveclaLoiredanscesecteurgéographique:
l'Arroux,laBesbreetl'Aron.
Historiquementlesaumonatlantique,lagrandealose,lalamproiemarineetl'anguilleétaientprésents
danscescoursd'eau.
La réduction des habitats de reproduction ou de grossissement est essentiellement due sur ce
territoire,notammentsurlesaffluentsdelaLoire,auxobstaclesquiontprogressivemententravéla
librecirculationpiscicoleetauxactivitésd'extractiondegranulatsquiontengendrédesdéséquilibres
sédimentairesprovoquantl'altérationd'unepartiedeshabitatsfavorables.
Al'heureactuelle,lesaumon,lalamproiemarineetlagrandealosesontrencontrésdanslaLoireet
dans les parties aval des affluents précédemment cités. Depuis l'aménagement de nouveaux
dispositifsdefranchissementaubarragedenavigationdeRoanneen2012,lespoissonsmigrateurs
amphihalins sont enmesurede remonter la Loire jusqu'aubarragedeVillerest. L'anguille est le
poissonamphihalinquiprésentelapluslargerépartitiongéographiquedanscesousbassinversant.
3.2.4 BassinversantdelaLoiremoyenne
Dubecd'AllieraubecdeVienne,laLoirereçoitdeuxaffluentsprincipaux:leCheretl'Indre.Lesous
bassinversantduCherfaitl'objetduparagraphe3.2.5.
La Loire moyenne constitue un secteur de passage pour l'ensemble des espèces migratrices
amphihalines. L'effacement du seuil mobile de Blois en 2005 dans le cadre du plan Loire et
l'équipementdesseuilsdesquatrecentralesnucléairesdeBellevillesurLoire,DampierreenBurly,
SaintLaurentNouanetAvoineontrétablitlatransparencemigratoire.
Deshabitatsfavorablesàlareproductiondesalosessontrecenséssurlapartieamontdecesecteur,
làoùlaLoiredélimitelesdépartementsduCheretdelaNièvre.
L'Indreestmarquéeparunnombreimportantd'obstaclestransversauxquiexpliquelaréductiondela
présencedespoissonsamphihalinssurcecoursd'eau.Seulel'anguilleyresteaujourd'huiprésente
demanièrenonanecdotique.
3.2.5 BassinversantduCher
Le bassin versant du Cher était historiquement peuplé d'anguilles, d'aloses, de lamproies, de
saumonset de truitesdemer. Il constitueaujourd'hui undesquatrebassinsprioritairespour la
restaurationdespopulationsd'anguillesdansleSdage20102015,etprésenteégalementunintérêt
pourd'autrespopulations,notammentd'alosesetdelamproies.
L'anthropisation de son cours, avec les aménagements pour la navigation en aval de
SaintAignansurCher (Cher dit «canalisé»), la créationdeseuils pour l'exploitation de la force
motricedel'eauetlesextractionsdegranulats,notammententreMontluçonetVierzon,ainsiqu'à
ChâtressurCher, ont engendré une altération de la continuité écologique et de la morphologie
pouvantexpliquerlarégressiondespopulationsdepoissonsmigrateursamphihalinsdansleCher.
L'abaissementdespartiesmobilesdesbarragesàaiguilleduChercanaliséenpériodeactivede
migration printanière va dans le sens d'une facilitation des migrations des poissons migrateurs
amphihalins.
Suiteàcespremièresévolutions,deslamproiesetdesalosessontobservéesdansleCherjusqu?à
unecinquantainedekilomètresenamontdeVierzon.Desmuletssontégalementprésentssurle
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Cher,notammentenavaldel?ouvragedeSavonnières,etdesobservationssporadiquesdetruitesde
mersontsignalées.L'anguillerestelepoissonmigrateuramphihalinlepluslargementrépartisurle
bassinduCheractuellement,avecuneprésencedanslesrivièresCher,Yèvre,Sauldre,etFouzon.
LeCherenamontdubarrageduPrat, infranchissable, est inaccessibleauxpoissonsmigrateurs
amphihalins.
3.2.6 BassinversantdelaVienne
Lebassinde la Vienneétait historiquementpeuplépar l'anguille, lesaloses, les lamproieset le
saumonatlantique.
Leterritoireestmarquéparuneagricultureextensivedepolycultureélevagesurl'ensembledestêtes
debassinversantetrassembledeszonesdegrandesculturesdanslesplainesdel'aval.
Auniveauhydraulique,l'édificationprogressived'ouvragestransversauxaconduitàuneraréfaction
desespècesdepoissonsamphihalines,quirecolonisentlebassindepuisl'effacementduseuilde
MaisonsRougesen1998à l'exutoiredu bassin de la Vienne. Si la densitédes ouvrages reste
importantesurlaVienne,laCreuseetlaGartempe,lesopérationssuccessivesd'aménagementen
faveur du rétablissement de la continuité écologiqueont permis, notamment sur la Vienne, une
progressiondufrontdecolonisationparlespoissonsamphihalinssurunedistancede120kmdepuis
15ans.Lesouvragesdescomplexesdel'IsleJourdain,surlaVienne,etd'Éguzon,surlaCreuse,
constituentactuellementdesverrousinfranchissables.
LebassindelaVienneestégalementmarquéparlaprésencedeplusieursmilliersdeplansd'eau,
susceptiblesd'impacterlesrégimeshydrologiqueetthermiquedescoursd'eauauxquelsilspeuvent
êtreconnectésoudanslesbassinsversantsdesquelsilsinterceptentlesécoulementsgravitaires.
Actuellement,lebassindelaVienneaccueillelapopulationdelamproiesmarineslaplusnombreuse
à l'échelle européenne et la population d'aloses la plus nombreuse dubassin de la Loire. Des
anguillessontégalementprésentesdanscebassin,l'undesquatredubassinLoireBretagneétant
identifié commebassin prioritaire pour la restauration de la population d'anguilles par le Sdage
20102015.
La Gartempea fait l?objet depuis les années1980d?un programmede restauration dusaumon
atlantique.Actuellement,dessaumonsfréquententlecoursavaldelaVienne,delaCreuseetdela
Gartempe.Aucuneopérationdesoutiend?effectifn?étantmenéedanslaVienneetdanslaCreuse,
cesobservationstémoignentdel?existenced?unerecolonisationnaturelledecesousbassinversant.
Toutefois, les données biologiques disponibles ne permettent pas d'attester l'existence d'une
populationsauvageautonomedesaumonsdanscebassin.
3.2.7 BassinversantdelaMaine
LebassindelaMaineaccueillaithistoriquementdespopulationsd'anguilles,d'aloses,delamproieset
de truites de mer. Ce bassin versant est aujourd'hui un des quatre bassins prioritaires pour la
restaurationdespopulationsd'anguillesdansleSdage20102015,etprésenteégalementunintérêt
marquépourlespopulationsd'alosesetdelamproies.
Lararéfactiondelaprésencedesmigrateursamphihalinsdanscebassinversantpeutprovenird'un
effetcumulédedifférentsfacteursayantengendréunealtérationdeshabitatsetdelamorphologie
descoursd'eau.
Ladensitédesouvragesestimportantesurlesprincipauxcoursd'eaudecebassinversant.Des
opérationsdegestionengagéescesdernièresannéessur laMayenneont permisderéduire les
difficultésdemigrationsurcecoursd'eau,notammentdesanguillesàladévalaison.Parailleurs,le
cloisonnementdesmilieuxestrenforcéparunedensitéimportantedeplansd'eaudanscebassin,qui
interceptent une partie des écoulements naturels. Un autre enjeu sur ce territoire porte sur la
conciliation des prélèvements pouvant être marqués, notamment en période d'étiage, avec les
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besoinsminimauxpourconserverlesfonctionnalitésdesmilieuxaquatiques.
3.2.8 BassinversantdelaLoireaval
DubecdeVienneàsonestuaire,laLoirepassedesondernierbieffluvialàsasectionmaritime.
Lechenalconstitueessentiellementunezonedetransitpourlespoissonsmigrateursquil?empruntent
lorsde leurmigrationdemontaisonet dedévalaison. Ilsdoivent doncs?adapterauxparamètres
environnementauxtrèsvariablesdel?estuaire(salinité,oxygènedissous,turbidité...).
Ce secteur est marqué par la présence de nombreuses annexes hydrauliques et des marais
estuariensdontlesfonctionnalitésetl'intérêtécologiquesontmajeursnotammentpourl'anguille.La
configurationactuelle desmarais remonteessentiellement aux travauxd'assèchement intervenus
entreleXVIIe et XIXe siècle, suite à de premiers aménagements dès le XIIe siècle.
LesmaraisNordLoireetSudLoireenavaldeNantes
LesmaraisestuariensdelaLoires?étendentsurunesuperficiede10130ha.Ilssontconstituésd?un
réseauhiérarchisédecanaux, douves et rigolesqui représentent un linéairecumulédeplusde
1700km,réguléparplusde250ouvrageshydrauliques.
Ceszonesdemaraisrassemblentégalementdessecteursd'habitatstemporairesintéressantspour
certainesautresespècesamphihalines(anguille,flet,mulet)oumarines(plie,sole,gobie,bar).La
présenced'espècesmarinesdanscesmaraisrenforcent d'autant plus l'intérêt d'unecoordination
entrelePlagepomi,leSdageetlePammdelasousrégionmarineduGolfedeGascogne.
Les aménagements portuaires, les modifications du lit des cours d?eau et la multiplication des
ouvrageshydrauliquesont bouleversé lescaractéristiqueshydrauliqueset le fonctionnementdes
marais,particulièrementdansl'estuairedelaLoire.
LesannexeshydrauliquesdelaLoireentreNantesetMontsoreau
Les annexes hydrauliques de la Loire (plus de 120 entre Nantes et Montsoreau) sont des
dépendances du fleuve qui ont un rôle temporaire visàvis des écoulements superficiels. Leur
agencement,généralementparallèleaufleuve,estdûàlatopographieparticulièreduremplissage
sédimentaire,lesabordsdulitmineur?lebourreletderiveplusélevésquelespiedsdecoteaux
s?opposantbiensouventàlafusiondirectedeseaux.
Ellesneparticipentauxécoulementsqu?audelàd?unecertainehauteurd?eauenfonctiondel?altitude
relativedeleur(s)connexion(s)aufleuve.Troistypesd?annexessontidentifiés:
? Lesbrassecondairessontconnectésenamontetenavalaubrasprincipaldontilssontséparés
pardesîlesstabiliséesetvégétalisées.Al?étiage,ilsprésententdevastesplagesdesablealors
qu?enpériodesdehauteseaux, ils peuvent devenir brasprincipaux. Nombred?entreeuxsont
barréspardesdiguesoudeschevrettesenenrochementsrenvoyant,endeçàd?uncertaindébit,
leseauxdanslesbrasnavigables.Lesbrassecondairesremplissentunefonctiond?écoulement
descrues,variablesselonleurniveaud?ensablementetdeconnexion(fonctionplusfaiblepourles
brasfermés).Leursfonctionsbiologiquesnesontpasnégligeablespourautant:sitesd?accueil
pourledéveloppementdesalevinsàlasortiedesbrasmorts,productivitéprimairesupérieureau
chenalprincipalet installationd?invertébrés(trichoptèresHydropsychidae, mollusquesdugenre
Unio?)grâceauralentissementducourant,reproductionenfonctiondesvariationshydrologiques
d?espècesrhéophiles (chevaine, ombre, barbeau, vandoise) et limnophiles(gardons, rotengle),
refugeencasdepollutionsaccidentelles.
? Les bras morts (ou boires) sont des dépressions de la plaine alluviale, anciens bras
abandonnés.Ellessontcaractériséesparunevégétationpermanenteetuneconnexionunique,le
plussouventàl?aval.Quandleurfondestperméable(sable,gravier),leniveaudel?eauysuitcelui
delanappealluvialeparcapillarité;parcontrequandellessontétanches,ellesseremplissentdes
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eauxderuissellementdescoteauxoudesaffluents,oupardébordementdirect.Lesbrasmorts
jouentunrôle importantauniveaudela reproductiondespoissonsphytophiles(inféodésà la
végétationherbacée)commelacarpe,lerotengleetlebrochet.Ellesreprésententégalementdes
zonesd'habitatsetdegrossissementpourl'anguilleadulte.
? Lesbassesvalléesd?affluentssontdeszonesinondables,submergéesparleseauxdel?affluent
oulorsdurefoulementdeseauxdelaLoire.Lebourreletderivecontraintl?affluentàemprunter
uneouplusieursboiresavantdesejeterdanslefleuve.Danslamajoritédescas,desvannages
placésàleurdébouchédanslavalléeymaintiennentuncertainniveaud?eaupendantl?étiage.
Elles constituent entre autres fonctions, en complémentarité avec les bras morts et les bras
secondaires, des zones de frayères productives, en particulier pour le brochet, grâce à la
couverturevégétale
L?aménagement du fleuve pour la navigation (obturation des bras secondaires par des digues,
resserrementdubrasnavigableentredesépis)etlesextractionsdesabledansle lit mineuront
provoquél?incisionduthalwegdenavigationdanslessablesdulit,induisantl?affaissementdeslignes
d?eaudefaiblesdébitset,demanièreconcomitante,l?assèchementestivaldesannexes.L?ensemble
du fonctionnement écologique de la vallée, en termes d?échanges de matière, d?énergie et de
population,enaétéaffecté.
Or,lesdépendancesetsolidaritéslatéralessontvitalespourdenombreusesespèces,notammentde
poissons,dontlebrochetetl?anguille.
DesPontsdeCéàNantes,lacartographiedes81annexeshydrauliquesréaliséeparleGIPLoire
Estuaire en2006constitue un inventaire exhaustif de cesmilieux répartis commesuit: 36bras
secondaires, 35 bras morts, 6 annexes artificielles et 4 marais mouillés. Lasuperficie totale est
d?environ2600hectares.
Deuxtypesdebiefssontdifférenciésenfonctiondesconditionshydrauliques: les35kmdubief
fluviomaritime,dontlalimiteamontsesitueàAnetzetles45kmdubieffluvial,d?AnetzauxPontsde
Cé.Lenombredebrasmortsetdebrassecondairesserépartitéquitablementdansles2biefs,mais
paslasuperficie,quirestelargementsupérieuredanslebieffluvial.
3.2.9 BassinversantdelaSèvreniortaise
LebassinversantdelaSèvreniortaiseétaithistoriquementpeupléd'anguilles,d'aloses,delamproies
etdetruitesdemer.Ilaccueilleégalementdespopulationsdefletcommunetreprésenteunintérêt
aujourd'huiimportantpourtouteslespopulationsdepoissonsamphihalins.Enparticulier,c'est,avec
lescôtiersvendéens,l'undesquatrebassinsversantsprioritairespourlarestaurationdespopulations
d'anguillesd'aprèsleSdage20102015.
Cebassinversantsedistingueparlafortedensitédesonréseauhydrographique,répartientredes
fleuvesetrivièresalimentantlemaraispoitevin,etunréseaudecanauxdanslemarais.
Lagestiondesniveauxd'eaudanslemaraisaconduità l'édificationdesnombreuxouvragesde
régulation depuis le Xe siècle. Cesystèmehydrauliquecomplexe se traduit par une succession
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d'ouvragesàfranchirpourlespoissonsmigrateursamphihalins.Unpremierenjeudanscebassin
versantportesurlarestaurationdelacontinuitéécologique.
La gestion quantitative représente l'enjeu majeur de ce territoire. En effet, les assèchements
successifsdezonesdemaraisparlepassé,etlesassecstemporairespouvantsurvenirenpériode
estivale, notamment dans certains cours d'eau, ont conduit à une forte réduction des surfaces
d'habitatsproductifspourlespoissonsmigrateursamphihalins.Aussi,lesopérationsdecuragedes
coursd'eauayantpuêtremenéesontengendréundéséquilibresédimentairequiaconduit àde
nouvellespertesd'habitatsessentielspourlesespècesamphihalines.Lagestiondesniveauxd'eau
revêt un intérêt biologique majeur, afin de restaurer des habitats productifs et de préserver la
submersiondezones demarais favorables à la reproduction et audéveloppement de certaines
espècesamphihalines.
3.2.10 Bassinsversantsdescôtiersvendéens
Lesbassinsversantsdescôtiersvendéenssontnotammentfréquentésparl'anguille,maispeuvent
aussi accueillir de petites populations d'aloses, de lamproies et de truite de mer. Ces bassins
versants restent des bassins favorables à l'accueil, notamment, des populations d'anguilles et
constituent,aveclaSèvreniortaise,undesquatrebassinsversantsprioritairespourlarestauration
despopulationsd'anguilled'aprèsleSdage20102015.
Laprésenced'ouvrageslimitelescapacitésdeprogressiondesespècesamphihalinesversleszones
amont desbassinsversants, tandis quedessurfacesd'habitats productifspeuvent êtreperdues
temporairementpardesépisodesd'assecsenpériodeestivaleessentiellement.
Les enjeuxprincipaux dans ces bassins versants portent, d'unepart, sur la gestion quantitative
équilibréedelaressourceeneau,afindemaintenirunehydrologiequipermettelemaintiend'habitats
productifs,etd'autrepart,surlarestaurationdelacontinuitéécologique,notammentamontaval.
3.3 Dispositifsd'évitementetderéductiondesimpactssurleshabitats
Plusieursdispositifs,denatureréglementaireoucontractuelle,permettentaujourd?huidemettreen
placedesmesuresdeprotectionetdegestiondeshabitatsenvuedesauvegarderlesespèceset
notammentlespoissonsmigrateurs.Cesdispositifsdeprotection,contraignantsouvolontaires,sont
considéréscommedesdispositifsvisantàpréveniretéviterlesimpactssurleshabitatsfavorables
auxpoissonsmigrateursamphihalins.
Enaccompagnementdecesmesuresdeprotectionetdegestion,ladémarchedesgestionnairesde
milieuxaquatiquesdéveloppedesapprochesderéductiondesimpactsdeaménagementssurles
fonctionnalitésdesmilieuxaquatiques.Cesmesuresderéductiond'impactdécoulentessentiellement
del'applicationdesdocumentsdeplanificationdansledomainedel'eau:leSdageetlesSage.
3.3.1 Lesprotectionscontraignantes
Laloiacréédesdispositifsdeprotectiondelabiodiversitépouvantprofiterauxhabitatsdespoissons
migrateursamphihalins.Cesdispositifscontraignants,prévusparlaréglementation,sontautonomes
oudécoulentdustatutdecertainscoursd'eaudansleSdageLoireBretagne20102015.
Laprotectiondesfrayères
Enapplicationdel'articleL.4323duCodedel'environnement,lesfrayèresdesaumonatlantique,de
lamproiemarine,delamproiefluviatile,degrandealoseetd'alosefeinteontétéinventoriéesdans
chaquedépartement.Ladestructiondefrayèressurlessecteursdélimitésestpassiblede20000¤
d'amende.Cedispositifapporteunpremierniveaudeprotectiondeshabitatsdereproductionetde
développementdesjuvénilesdesespècesamphihalinespotamotoques.
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L'inventairedes frayèresétablit enapplicationde l'article R.43211duCodede l'environnement
repose:
? pourlesaumonatlantique,lalamproiefluviatileetlalamproiemarine,surl'identificationdezones
defrayèresàpartird'unegranulométriecaractéristique(galetsdediamètre20à150mmpourle
saumonatlantique;graviersetpetitsgaletsdediamètre2à60mmpourlalamproiefluviatile;
graviersetgaletsdediamètre5à200mmpourlalamproiemarine);
? pourlagrandealoseetl'alosefeinte,surl'observationd'unedéposed'oeufsoudelaprésence
d'alevins.
Lesréservesnaturelles
Crééespardécretetplacéessousl?autoritédupréfet,lesréservesnaturellesnationalesconcernent
despartiesdeterritoiresdanslesquelleslafaune,laflore,lesol,leseaux,lesgisementsdeminéraux
oudefossilesoulemilieunaturelprésententuneimportanceparticulière.
Lesobjectifssontnotamment:
? lapréservationd?espècesanimalesouvégétalesetd?habitatsenvoiededisparitionsurtoutou
partieduterritoirenational;
? lareconstitutiondespopulationsanimalesouvégétalesoudeleurshabitats;
? lapréservationdebiotopesetdeformationsgéologiquesouspéléologiquesremarquables;
? lapréservationoulaconstitutiond?étapessurlesgrandesvoiesdemigrationdelafaunesauvage.
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Leclassement d'un territoireen réserve naturelle protège le milieude toutedestruction et toute
modificationanthropique.Chaquesitenaturelétantunique, l'ampleurdelaréglementationetdes
interdictionssur leterritoired'uneréserveest déterminéeaucasparcasetdécritedans l'arrêté
préfectoralquiinstituelacréationdelaréserve.
SurleterritoireduCogepomi,desréservesnaturellesnationalesontétéinstituéesdansplusieurs
territoires.OnpeutnotammentciterlesréservestellesqueleLacdeGrandlieu,levaldeLoireen
Bourgogneet le val d'Allier en Auvergnequi visent explicitement la protection des eaux et des
poissons et qui par leurs étendues de marais ou d'annexes fluviales représentent des habitats
diversifiéspermettantl'accueildecertainspoissonsmigrateursamphihalins,notammentl'anguille.
Lesarrêtésdeprotectiondebiotope
Instituéepararrêtépréfectoral, laprotectiondebiotopeviseàprévenir ladisparitiondesespèces
protégées(espècesanimalesnondomestiquesouvégétalesnoncultivées)parlafixationdemesures
deconservationdesbiotopes(entenduausensécologiqued?habitat)nécessairesàleuralimentation,
àleurreproduction,àleurreposouàleursurvie,cesbiotopespouvantêtreconstituéspardesmares,
desmarécages,desmarais,deshaies,desbosquets,deslandes,desdunes,despelousesoupar
toutesautresformationsnaturellespeuexploitéesparl'homme.
Unarrêté de protection debiotopepeut également avoir pour objet l'interdictionde touteaction
portant atteinte de manière indirecte à l'équilibre biologiquedes milieux telle que l'écobuage, le
brûlage, le broyagedes végétaux, la destructiondes taluset deshaies, l'épandagedeproduits
antiparasitaires.
Sur le territoireduCOGEPOMI, laGartempedans leLimousinest protégéesur40km.L?arrêté
prescritcertainesrestrictionsdesactivitéshumainesenvuedeprévenirladisparitiondufonddes
rivièresetpréserverainsileshabitatsnécessairesausaumon.LaLoireenBourgogneaégalement
faitl?objetd?unarrêtéenvuedeprotégerlesfrayèresd?alose.
Lagestionfoncièredeszoneshumides
LesloisGrenelleimposentl?acquisitionàl?échellenationalede20000hadezoneshumides d'ici
2015.LesAgencesdel?eauontpourobjectifd?acquérir13000hadezoneshumides(dont2600ha
enLoireBretagne),les7000harestantétantàacquérirparleConservatoirenationaldulittoralet
desrivageslacustres.
LeCodedel?urbanismeprévoitparsonarticleL.1421qu?àdesfinsdepréservationdelaqualitédes
sites, des paysages, des milieux naturels, des champs naturels d'expansion des crues et de
sauvegardedeshabitatsnaturels,lesConseilsgénérauxsontcompétentspourélaboreretmettreen
oeuvreunepolitiquedeprotection,degestionetd'ouvertureaupublicdesespacesnaturelssensibles
(ENS), boisés ou non. Cette politique des Conseils généraux doit être compatible avec les
dispositionsdesschémasdecohérenceterritoriale,euxmêmecompatiblesavecleSdage.Ainsi,les
ConseilsgénérauxpeuventêtreamenésàdélimiterdesENSàdesfinsdepréservationdeszones
humides,etcontribueràl'acquisitionfoncièredecesespaces.
LesConservatoiresd'espacesnaturelsontégalementuneprérogatived'acquisitionfoncièrepourla
préservationdelabiodiversité,cequileurpermetd'agirégalementenfaveurdelaprotectionfoncière
deszoneshumides.
Enfin,toutesleszoneshumidesinventoriéesdanslebassindelaLoiredoiventfairel'objetd'une
protectionsuffisantepar leur intégrationdanslesplans locauxd'urbanisme(PLU),établispar les
communes,tellequeleprévoitladisposition8A1duSdage.
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Leszoneshumidesd'intérêtenvironnementalparticulieretleszoneshumidesstratégiquespourla
gestiondel'eau
LeCodedel?environnementpermet(articleL.2113)àl?autoritéadministrativededélimiterdeszones
humides d'intérêt environnemental particulier (ZHIEP), qui doivent alors faire l?objet d?un plan
d?actions. LesZHIEPpeuvent êtreproposéespar les Commissions locales de l'eau (CLE). Ces
dernièrespeuventalors,àl?intérieurdecellescidélimiterdeszoneshumidesstratégiquespourla
gestiondel'eau(ZSGE).SeulelaCLEestcompétentepourproposerunclassementenZSGE.
CeclassementenZHIEPetZSGEretentitsurl?élaborationdesschémasrégionauxdecohérence
écologique(SRCE).Eneffet,leurtramebleuedoitintégrerlesZHIEPetZSGE(articleL.3711du
Codedel?environnement).
Toutefois,cedispositif n'a jusqu'àprésentpasétéutilisédanslebassindelaLoire,delaSèvre
niortaiseetdescôtiersvendéens.
Lescoursd'eaunécessitant uneprotectioncomplètedespoissonsmigrateursamphihalinset les
réservoirsbiologiques
LeSdageLoireBretagne20102015adéfinilescoursd'eaudanslesquelsuneprotectioncomplète
des poissons migrateurs amphihalins doit être assurée. Les cours d'eau correspondant sont
cartographiésdansl'illustration28.
Enparallèle,leSdage20102015aégalementdélimitédesréservoirsbiologiques(illustration29).
Cesdernierscorrespondentàdeszonesàfortediversitébiologique,depuislesquelsledéplacement
desespècesest susceptiblede restaurer l'écosystèmedesmassesd'eauattenanteset ainsi de
contribueràl'atteintedubonétatdecellesci.
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Illustration28:Coursd'eaunécessitantlaprotectioncomplètedespoissonsmigrateursamphihalins
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Lescoursd'eau,partiesdecoursd'eauoucanauxclassésautitredel'articleL.21417duCodede
l'environnement
Noncontraignantseneuxmême,lescoursd'eauprotégésparl'undesdeuxdispositifsprécédents
ont,defaitetcommepourlescoursd'eauentrèsbonétat,étéintégrésauclassementenliste1au
titredel'articleL.21417duCodedel'environnement(illustration30).
Ce classement dispose qu'aucune autorisation ou concession ne peut être accordée pour la
construction de nouveaux ouvrages s'ils constituent un obstacle à la continuité écologique. Le
classementenliste1autitredel'articleL.21417duCodedel'environnementesteffectifdepuisla
publicationdel'arrêtédupréfetcoordonnateurdebassinLoireBretagnele22juillet2012.
Leclassementenliste1prévoitégalementquesurlescoursd'eau,partiesdecoursd'eauoucanaux
classés, le renouvellement de la concession ou de l'autorisation des ouvrages existants,
régulièrementinstallés,estsubordonnéàdesprescriptionspermettantdemaintenirletrèsbonétat
écologiquedeseaux,demainteniroud'atteindrelebonétatécologiquedescoursd'eaud'unbassin
versantoud'assurerlaprotectiondespoissonsmigrateursvivantalternativementeneaudouceeten
eausalée.
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Illustration29:Coursd'eaujouantlerôlederéservoirbiologique
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L'articleL.21417duCodedel'environnement,alinéaI2°,préciseaussiquel'autoritéadministrative
établit,pourchaquebassinuneliste(diteliste2)decoursd'eau,partiesdecoursd'eauoucanaux
danslesquelsil estnécessaired'assurerletransportsuffisantdessédimentsetlacirculationdes
poissonsmigrateurs.Toutouvragedoityêtregéré,entretenuetéquipéselondesrèglesdéfiniespar
l'autoritéadministrative,enconcertationaveclepropriétaireou,àdéfaut,l'exploitant.
L'articlepoursuitenprécisantquecesobligationss'appliquent,àl'issued'undélaidecinqansaprès
lapublicationdeslistes,auxouvragesexistantsrégulièrementinstallés.
Leclassementenliste2autitredel'articleL.21417duCodedel'environnement(illustration31)est
effectif depuis la publication de l'arrêté du préfet coordonnateur de bassin LoireBretagne le
22juillet2012.
Lerétablissementdelacontinuitéécologiqueaudroit desouvragessituésdansdescoursd'eau
classésenliste2requiertquesoientprisesencomptelesespècesamphihalinesetholobiotiquesqui
ontjustifiéleclassementenliste2.
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Illustration30:Coursd'eauclassésenliste1autitredel'articleL.21417duCodedel'environnementdansle
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Lamiseenconformitédesouvragesvisàvisdesobligationsderésultat relativesà lacontinuité
écologique fait l'objet de contrôles ciblés prévus dans les plans de contrôle des missions
interservicesdel?eauetdelanature(MISEN)parlacirculairedu12novembre2010.
3.3.2 Lesprotectionsvolontaires
LeszonesspécialesdeconservationduréseauNatura2000
Les zones spéciales de conservation (ZSC) désignent des aires d'habitats d'espèces d'intérêt
communautaire,listésenannexe2deladirective«HabitatsFauneFlore»(DHFF).DanslesZSCse
mettentenplace,autraversdudocumentcontractuelqueconstitueledocumentd'objectifdusite
(DOCOB), des mesures destinées à éviter la détérioration des habitats et des mesures de
conservationrépondantauxexigencesécologiquesdeshabitatsnaturels.
Lesplansd'actionspourlapréservationetlagestiondeszoneshumides
LeSdage20102015prévoitquelesSagemettentenplacedesplansd'actionspermettantd'assurer
la gestion et l'entretien des zones humides sur leur territoire. Ce dispositif peut éventuellement
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Illustration31:Coursd'eauclassésenliste2autitredel'articleL.21417duCodedel'environnementdansle
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s'appuyer sur des contractualisations agroenvironnementales afin de favoriser un mode
d'exploitationagricolequipérenniselescaractéristiquesdezonehumidedesterrainsexploités.La
miseenoeuvredecesplansconcourtàlapréservationdeszoneshumides.
Lesschémasrégionauxdecohérenceécologique(SRCE)
LesSRCE,coélaborésparl'ÉtatetlesRégions,définissentlestramesvertesetbleues,constituées
decoeursdebiodiversitéreliésentreeuxpardescorridors.
L'articleL.3711duCodedel'environnementdisposequelatramebleuedesSRCEcontiennea
minimalescoursd'eau,partiesdecoursd'eauoucanauxclassésenliste1etliste2autitrede
l'articleL.21417duCodedel'environnement,ainsiquetoutoupartiedeszoneshumidesdontla
préservationoularemiseenétatcontribueauxobjectifsdebonétatdeseaux.
Lesdocumentsdeplanificationet lesprojetsde l'État, descollectivitésoudeleursgroupements
prennent en compte les SRCE et précisent les mesures permettant d'éviter, réduire, et le cas
échéant,compenserlesatteintesauxcontinuitésécologiques.
3.3.3 Réductiondesimpactssurlesmilieuxaquatiquesetleshabitats
Laréductiondesimpactspeut portersur leshabitatsdereproductionoudegrossissementmais
égalementsurlessecteursdemigrations.
Réductiondesimpactssurleshabitats
Leszoneshumidessontlesprincipauxhabitats,pourlesquelsdesmesuresderéductiond'impact
sontprévuesoupossiblesdanslesdocumentsdeplanificationdansledomainedel'eau.
LeSdageLoireBretagne20102015disposequelorsqu'unprojetimpacteunezonehumide,àdéfaut
detouteautrealternativeavérée,unecompensationdoitêtreprévuedanslemêmebassinversantet
àfonctionnalitéséquivalentes(dupointdevuedel'hydrologieetdelabiodiversité,disposition8B2
duSdageLoireBretagne20102015).Sanslaréuniondecestroisexigences,lacompensationdoit
portersuraumoins200%delasurfacedezonehumidedétruiteparleprojet.
LesSagepeuventdansleurrèglement(articleR.21247duCodedel'environnement)définirtoute
règlenécessaireaumaintienetàlarestaurationdesZHIEPetdesZSGE.
Pourassurerlarestaurationetlapréservationdelaqualitédel'eauetdesmilieuxaquatiques,les
Sagepeuvent égalementdéfinir des règlesparticulières d'utilisation de la ressourceeneauaux
opérationsentraînantdesimpactscumuléssignificatifsentermesdeprélèvementsouderejetsdans
lebassinversantouauxexploitationsagricolesprocédantàdesépandagesd'effluentsliquidesou
solides.
Réductiondesimpactssurlesmigrations
LeSdageLoireBretagne20102015prévoitquetouteopérationderestauration,modificationoude
créationd?ouvragetransversaldanslelitmineurdescoursd?eaufassel?objetd?unexamenportant
surl?opportunitédumaintienoudelacréationdel?ouvrage.Sicetexamenconclutàlapossibilitéde
créationd'unnouvelouvragetransversalenlitmineur,desmesurescompensatoiresdoiventalors
êtremisesenoeuvre. Cesmesurescompensatoires, présentéespar lemaîtred?ouvrage,doivent
prévoir,danslemêmebassinversant,desactionsd?effacementoud?arasementpartieloutouteautre
solution permettant de retrouver des conditions équivalentes de transport des sédiments, de
diversification des habitats, de vitesse de transfert des eaux (retardant la production de
phytoplancton)etdecirculationpiscicole.Adéfautdelaréuniondecesexigences,lacompensation
portesuruneréductioncumuléedechutesartificiellesd?aumoins200%,encherchantunecontinuité
linéairelaplusimportantepossible,surlemêmebassinversantouendernierrecourssurunautre
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immédiatementvoisin(disposition1B2duSdageLoireBretagne20102015).
L'exigencedecompensationnes?appliquepasauxouvragesexistants,légalementautorisésetdont
l?usageaétésuspendupourdesraisonsdesécuritépublique.
Parallèlement et afin d'améliorer le transport naturel des sédiments et d'assurer la continuité
écologique,lesSagepeuvent,dansleurrèglement(articleR.21247duCodedel'environnement),
définir touterèglefixant desobligationsd'ouverturepériodiquedecertainsouvrageshydrauliques
fonctionnantaufildel'eau.
3.4 Caractérisationdespressionsaltérantlesmilieuxaquatiquesetles
habitatsfavorablesauxpoissonsmigrateursamphihalins.
Lesmilieuxaquatiquescontinentauxoùviventlespoissonsmigrateursamphihalinssontexposésà
troisgrandescatégoriesdepressionsquesontl'altérationde:
? l'hydromorphologieavecnotammentlacontinuitéécologiqueetlaqualitédesetdeshabitats;
? l'hydrologieetlerégimethermique;
? laqualitédeseaux.
Lesréseauxdecontrôleetdesurveillancesuivisdepuis2007enapplicationdeladirectivecadresur
l'eaupermettentdedisposerd'unecaractérisationdel'étatécologiquedesdifférentesmassesd'eau
dubassinLoireBretagne,traduisantl'impactdecespressionssurlesmilieux.L'étatécologiquede
l'année2010afaitl'objetd'unevalidationparleComitédebassinenoctobre2012etestprésentéci
dessousdansl'illustration32.30,5%descoursd'eaudubassinLoireBretagnesontenbonoutrès
bonétatécologique.
Illustration32:Étatécologique2010descoursd'eau(Source:AELB,rapportàlaCommissionplanification,2012)
Le compartiment estuarien, qui constitue un espace essentiel dans l'adaptation des poissons
migrateursamphihalinsdumilieudulçaquicoleaumilieumarinetviceversa,estaffectéparlestrois
typesdepressionscitéscidessus.Leureffetseretrouvecumulédanslephénomènedubouchon
vaseuxestuarien,quiferal'objetd'undétailspécifique.
Enfin,lespressionss'exerçantsurlespoissonsmigrateursamphihalinsdanslemilieumarinseront
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égalementdétaillées.
Cetétatdeslieuxnepoursuitpasunobjectifdeprécisionexhaustif,maischercheplusàs'appuyer
surl'étatdeslieuxproduitdanslecadredelaDCEetàmettreenavantlespressionsmajeures
affectantlespopulationsdepoissonsmigrateursamphihalins.
3.4.1 Continuitéécologiqueetaccessibilitéauxhabitatsdereproductionetde
grossissement
Uneappréciationdelacontinuitéécologiqueàl?échelledubassindelaLoirepeutêtrefourniepar
l?indicateurdutauxd?étagement,développéedanslecadredelamiseenoeuvredeladirectivecadre
surl'eau.Letauxd'étagementestcalculéensommantleshauteursdeschutesartificiellesducours
d?eau, puisenlesdivisant par ledénivelénaturel du linéairederivièreconsidéré. Cet indicateur
intègre:
? lapertededissipationd?énergielelongducoursd?eau;
? laperted?habitatsetdediversité,parennoiementdeszoneslotiques,uniformisation,blocages
sédimentairesetcolmatage;
? ladifficultédefranchissementpourtouteslesespèces;
? l?altération de la qualité de l'eau, due au temps de séjour augmenté dans la retenue :
échauffement,évaporationetaggravationdel'eutrophisation.
Letauxd?étagementestuneapprochesynthétiqueduniveaud?altérationdel'hydromorphologied'un
coursd'eauetenparticulierdelapentenaturelleducoursd?eau,laquelleestlefacteurstructurant
l?orientation et la continuité de l?écoulement (eau et sédiments), la dynamique fluviale, la
diversificationetlaqualitédeshabitats,etlarépartitiondesespècesaquatiques.Letauxd'étagement
en2009desdrainsprincipauxdubassindelaLoireestdisponibledansl?illustration33.
Lefractionnementdesmilieuxaquatiquesparlacréationd'ouvragestransversauxestundesfacteurs
explicatifsdeladégradationdel'étatdeseaux.Engénéral,plusletauxd?étagementestélevé,moins
l'Indice«poissonsrivière»(IPR),indicateurde laqualitédespeuplementspiscicoles,estbon,et
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BassinsdelaLoire,delaSèvreniortaiseetdescôtiersvendéens?19février2014 61/98
Illustration33:Tauxd'étagementdesprincipauxcoursd'eaudubassindelaLoireen
amontdubecdeVienne(Onema,2009)
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donc plus les peuplements de poissons sont dégradés (illustration34) : le bon état de ces
peuplements(enbleu)seréduitàmesurequeletauxd?étagementaugmente;inversementlerisque
denonatteintedubonétat(rose)augmenteavecletauxd?étagement.
Letauxd'étagementdémontreunesituationinégaleàl'échelledubassindelaLoire.SilaLoireet
l'Alliersontcaractérisésparunfaibleétagement,duàunfaiblenombred'obstaclesàl'écoulement,
d'autressousbassinsversantsprésententunétagementimportant(laVienneparexemple).Letaux
d'étagementprésenteégalementcertaineslimites:
? enzonedereliefimportant(bassinsversantsduMassifcentral,telquelebassinversantdela
Sioule),letauxd'étagementestartificiellementfaibledufaitdel'importantdénivelénaturel;
? enzonedemaraisetdeplaine,oùledénivelénaturelesttrèsfaible,unfaiblenombred'ouvrages
conduitàunétagementtrèsimportant.
Cetindicateurfaittoutdemêmeressortirlarelativepréservationdel'axeLoireAllier,quiconstitueun
hydrosystèmecontinudeprèsde1000kmavecunefaibledensitéd'ouvrages(unouvragetousles
vingt kilomètres dans l'Allier). Ce cas de figure est quasiment unique à l'échelle de la façade
atlantiqueeuropéenne.
Si les risques de mortalité au franchissement des ouvrages sont susceptibles d?augmenter en
fonction du nombre des ouvrages sur un cours d?eau, ils dépendent en premier lieu de la
configuration de ceuxci, liée à leur usage. Entre autres, les ouvrages à usage hydroélectrique
représentent une risque particulier de mortalité, compte tenu des risques d?entraînement des
poissonsdanslesturbines.
Lapolitiquenationalederestaurationdelacontinuitéécologique(traduiteparlepland'actionspourla
restaurationdelacontinuitéécologique),pilierdelapolitiquedereconquêtedubonétatdesmilieux
aquatiques,s'esttraduitepardesavancéesimportantesdepuislafind'année2009.Danslecadrede
la traduction des objectifs des lois Grenelle dans le IXème programme de l'Agence de l'eau
LoireBretagne,405ouvragesencoursd'eauontfait l'objetd'uneinterventionà lafinde l'année
2012.
Leseffortsdoiventnéanmoinssepoursuivrepourlerétablissementdelacontinuitéécologiquedans
les deux sens de migration, notamment à la dévalaison, et dans le respect des obligations et
échéances réglementaires. Aussi et bien que certains ouvrages aient déjà pu faire l'objet
d'aménagements pour la circulation piscicole, l'obligation de résultats impose une efficacité
permanenteetrequiertunentretienadéquat:
? certains ouvrages équipés sont sources de retard, soit par des difficultés d'attrait vers les
dispositifsdefranchissement,soitparunmanqued'entretiensetraduisantparuneobstructionde
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BassinsdelaLoire,delaSèvreniortaiseetdescôtiersvendéens?19février2014 62/98
Illustration34:Relationentreletauxd'étagementetl'état
despeuplementspiscicolesdubassindelaLoire(Source:
Onema,2010)
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cesmêmesdispositifs;
? certains ouvrages disposent d'équipements insuffisants pour être conformes au nouveau
classementdescoursd'eauenliste2autitredel'articleL.21417duCodedel'environnement
(obligationderétablirlacirculationpiscicoled'espècescibles,amphihalinesetholobiotiques,etla
circulationdessédiments).
Ces efforts doivent permettre aux espèces amphihalines de reconquérir les milieux jusqu?aux
ouvragesactuellement infranchissables,ditsverrous,etnonclassésenliste2autitredel'article
L.21417duCodedel'environnement.Sontconsidéréscommeverrous:
? lebarrageduPratsurleCher;
? lebarragedeLaRocheBâtl'AiguesurlaCreuse;
? lebarragedeVillerestsurlaLoire;
? lebarragedeSaintFraimbaultsurlaMayenne;
? lebarragedeChardessurlaVienne;
? lebarragedeQueuillesurlaSioule.
3.4.2 Hydrologieetrégimethermique
L'hydrologie est un facteur de contrôle important des migrations des poissons migrateurs
amphihalins.Eneffet,ledébitdescoursd?eauconditionnelestauxdesurviesàtouslesstadesdu
cycle biologique des poissons migrateurs amphihalins, dans tous les secteurs du bassin. En
particulier,lesdéficitshydrologiquesretentissentnégativementsurlesphasesdemigration,etlesflux
demontaisonetdedévalaisondesespècesamphihalinesdanslebassindelaLoire.
Lesfaiblesdébitsretardentl'engagementdesgéniteursenestuaire,amplifientl?effetdesobstacleset
augmentent les risquesdemortalité (échauffement plus rapide descoursd'eau). Demême, les
déficitshydrologiquessontsusceptiblesderetarderladévalaisondesespèces,pardiminutiondela
vitesseducourant(ilsselaissentengrandepartieporterparleflux),augmentationdelaprobabilité
de transit par les turbines des centrales hydroélectriques (plutôt que par les déversoirs ou
évacuateurs),etaugmentationdutempsd'attentedanslesretenuesdeseuilsetbarrages.
DanslecasdubassindelaLoire,l?incidencedel?hydrologieestd?autantplusfortequelescircuitsde
migrationsont plus longs. Il enrésultedes impactscumulatifsexacerbés, notamment encasde
sécheresseprintanière.
Outrecesévolutionsnaturelles,lamodificationdel'hydrologiepeutprovenirdesprélèvements,des
évolutionsdel'hydrographieparl'existencedeplansd'eau,oudelagestiondesétiagesetdescrues.
Lescruesjouentunrôleessentielpourlebonétatécologiquedescoursd'eau,notammentlespetites
cruesmorphogènesqui sont susceptibles demodifier le lit des coursd'eau, d'entretenir ainsi la
fonctionnalité des habitats, et de faciliter les mouvements migratoires, enparticulier en agissant
commeunstimulusdeladévalaison.
Lapressionexercéeparlesprélèvementssemanifestepardespompagesdanslescoursd'eaupour
divers usages (AEP, irrigation, abreuvement notamment) ou par des dérivations d'une certaine
quantité du débit sur un linéaire spécifique, par exemple pour l'alimentation d'une usine
hydroélectrique.
La gestionéquilibrée de la ressourceeneau fait l'objet duchapitre 7duSdageLoireBretagne
20102015.
Les plans d'eaumodifient également l'hydrographie naturelle du bassin versant. Afin de réduire
l'impact des plans d'eau sur les fonctionnalités écologiques des bassins versants, le Sdage
LoireBretagneencadre la créationet la régularisationdesplansd'eau(orientation1CduSdage
LoireBretagne20102015).Enparticulier,lacréationdenouveauxplansd'eaun'estplusautorisée
danslesbassinsversantscontributeursdesréservoirsbiologiquesouencasdedensitéimportante
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de plans d'eau. Aussi, les plans d'eau autorisés depuis 2010 doivent être isolés du réseau
hydrographiqueparuncanal dedérivationavecunprélèvementdustrict volumenécessaireaux
usagesassociésaupland'eauouêtrealimentésparruissellement.
Toutouvragerégulièrementautoriséquiengendreunobstacleàl'écoulementouladérivationd'une
partiedudébitducoursd'eau(alimentationd'unpland'eau,brasusinier...)faitl'objetd'unedécision
administrative.Enparticulier,cettedécisiondéfinitledébitréservédevantêtrelaissédanslecours
d'eaunaturel.Cedébitréservédoitpermettrede maintenirentouttemps,danslecoursd?eauun
débitminimalgarantissantenpermanencelavie,lacirculationetlareproductiondesespècesvivant
dansleseauxaumomentdel?installationdel?ouvrage.Cedébit estdit débit minimalbiologique
(DMB).Apartirde2014,ledébitréservénepeutpas,saufcasparticuliers,êtreinférieuraudixième
dumoduleducoursd'eauaudroitdel'ouvrage.
Aussi, le développement des différents usages, en particulier l'alimentation en eau potable, le
fonctionnementdescentralesnucléairesetl'agriculture,aconduitsurl'AllieretlaLoireàmettreen
placeunesystèmedesoutiendesdébitsenpérioded'étiage.Ilintroduittoutefoisuneartificialisation
significative du régimehydrologique, que le cadre défini pour encadrer son fonctionnement tend
cependantàlimiter.
Danslecontexteduchangementclimatique,lesévolutionsdurégimehydrologiquedanslebassinde
laLoire tendraient vers uneoccurrenceplus fréquented'étiagesplus marquéset plus longs. La
gestiondespoissonsmigrateursamphihalinsdevrasefairedanscesperspectives.
3.4.3 Qualitédeseaux
L'altérationdelaqualitédel'eauetdesmilieuxaquatiquespeutavoirpourorigine:
? lesmacropolluantsd'origineorganique,dontlapollutionparlesnutriments;
? lesmicropolluants.
Cespolluantssontsusceptiblesd'avoir uneffetdirectsur lespoissonsmigrateursamphihalinsen
perturbantleurmétabolismeetleurcomportementouuneffetindirectendégradantlaqualitédeleurs
habitats vitaux. Cela peut être le cas des apports en nutriments, à l'origine de phénomènes
d'eutrophisationpouvantaltérer l'oxygénationdumilieu, etainsi lasurviedespoissonsmigrateurs
amphihalinsdanscertainshabitatssurunepartiedel'année.
Cependant,àtitreindicatif,enLoireaval, lesconcentrationsmaximalesennitratesàlastationde
mesuredeSainteLucesurLoirenedépassentguère25mg/l,avecunesaisonnalitémarquée:les
plus fortesconcentrationsétant observéesenhiver. Entre1984et 2010,aucunetendancenese
dégage pour les teneurs en nitrates à la station de SainteLucesurLoire. Pour ce qui est du
phosphore,lasaisonnalitéestmoinsmarquéeetilestplutôtobservéeunecroissancedelateneuren
phosphore avec l'augmentation du taux de matières en suspension (MES), le phosphore étant
majoritairementadsorbésurlesMES.
Ainsi,lamiseenoeuvredesdirectiveseauxrésiduairesurbainesetnitratescontribuedepuis1991à
réduirelapollutionparlesmacropolluantsd'originesdomestique,industrielleetagricole:
? ladirectiveeauxrésiduairesurbainesaconduitàclasserl'ensembledubassindelaLoireetdes
côtiersvendéensenzonesensibleàl'azoteetauphosphoreavecdeuxéchéancespourlamise
enconformitédesstationsdetraitementdeseauxuséesdesagglomérationsdeplusde10000
équivalentshabitants,en2013et2017.Cettedirectiveconsisteàmettreenplacepourtoutesles
agglomérationsd'assainissementunsystèmedetraitementdeseauxuséesadapté,c'estàdire
respectantlesobjectifsdequalitédeseauxréceptricesafindenepascompromettrelesusages
quiysontassociés.
? ladirectivenitrateschercheàréduirelapollutiondescoursd'eauparlesnitratesd'origineagricole
etàcontenir lephénomèned'eutrophisationdescoursd'eauetdeseauxcôtières.Samiseen
oeuvresetraduitparladélimitationdezonesvulnérables(illustration35)surlesquellessontmisen
oeuvredesplansd'actionsquadriennauxvisantàfaireévoluerlespratiquesagricolesversune
réductiondesapportsennutrimentsetuneréductiondestransfertsverslescoursd'eau.Elleest
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accompagnée aussi d'incitations à modifier les pratiques agricoles: mesures
agroenvironnementalesenfaveurd'uneréductiondesintrantsetdel'agriculturebiologique,aides
pourlasécurisationdel'utilisationdespesticides,laplantationdehaies,l'implantationdezones
tamponsépuratoires...
Ceseffortsconcourentàréduireprogressivementlestauxdenitratesdansleseauxsuperficielleset
participent ainsi à uneaméliorationdubilanenoxygènedescoursd'eau, élément favorable aux
poissonsmigrateursamphihalins.Localement,desaltérationsdubilanenoxygènepeuventencore
êtrerencontréesappelantàmaintenirlesefforts.
La DCEconfirme les objectifs de cesdirectives sectorielles, dont la mise enoeuvre contribueà
l'atteintedubonétatdesmassesd'eau.Elleexigeparailleursdesrésultatsenmatièrederéduction
desrejetsdesubstancesdangereuses.Surcepoint,despolluantsd'origineindustrielle(commeles
polychlorobiphénylesPCB et les hydrocarbures aromatiques polycycliquesHAP) sont également
retrouvésdanslesmilieuxaquatiquesdanslebassindelaLoire,essentiellementdanslessédiments.
Lapollutiondessolsetdessédimentsaconduitàl'interdictiondel'usagedesPCBen1987.Compte
tenudespropriétéslipophilesdesPCB,lesespècespiscicolesvivantaucontactdessédimentssont
exposées à un risque d'accumulation accru de PCBdans leur tissus adipeux. C'est le cas des
anguillesnotamment.LeurcontaminationparlesPCBlorsdeleurgrossissementeneaudouceapour
conséquence une réduction des capacités reproductives des anguilles argentées. Afin de mieux
connaîtrel?étenduedelacontaminationdescoursd?eauparlesPCB,unplaninterministérield?actions
aétélancéentre2008et2012.Ceplans?articulaitautourdesixaxes:
? intensifierlaréductiondesrejetsdePCB;
? améliorerlesconnaissancesscientifiquessurledevenirdesPCBdanslesmilieuxaquatiqueset
gérercettepollution;
? renforcerlescontrôlessurlespoissonsdestinésàlaconsommationetadopterlesmesuresde
gestiondesrisquesappropriées;
? améliorerlaconnaissancedurisquesanitaireetsaprévention;
? accompagnerlespêcheursprofessionnelsetamateursimpactésparlesmesuresdegestiondes
risques;
? évalueretrendrecomptedesprogrèsduplan.
LesHAP,moléculeshydrophobes,s'adsorbentsurlessédiments.EnLoireaval,touteslesmolécules
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Illustration35:LeszonesvulnérablesauxnitratesdanslebassinLoireBretagne
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utiliséesdelafamilledesHAPontététrouvéesdansdesanalysesdesédimentsmenéesentre1996
et 2011. La remise en suspension de ces molécules, notamment par les dragages, reste peu
caractérisée.
Concernantlespesticides,leplanEcophytoaétélancéen2008parl'Étatafinderéduirel'usagedes
pesticidestoutenmaintenantuneagricultureéconomiquementperformante.Atitreindicatif,enLoire
aval,lamoléculelaplusfréquemmentidentifiéeestl'AMPA(produitdedégradationduglyphosate),
qui est présente dans 50% des échantillons analysés entre 1996 et 2011. L'atrazine déséthyl,
l'atrazineetlediruonsontlesmoléculeslesplusfréquemmentretrouvéesaprèsl'AMPA.
Les PCB, HAP et une partie des pesticides sont susceptibles de jouer le rôle de perturbateurs
endocriniens.L'effetdecesperturbateursendocrinienssurlespoissonsmigrateursamphihalinsreste
àcejourpeuconnu.
Audelàdesobjectifsd'étatdesmassesd'eaudéfinisparleSdageLoireBretagneetdesobjectifsà
atteindreenconséquenceentermesdequalitédeseaux, telsque fixéspar l'arrêtéministérieldu
25janvier2010,lesSagepeuventdéfinirdesobjectifsspécifiquesdequalitédeseauxafind'atteindre
leurspropresobjectifsdéfinisauvudesenjeuxduterritoire.
3.4.4 BouchonvaseuxestuariendelaLoire
En provenance des bassins versants, de l'océan ou du fond du lit des fleuves, les sédiments
transitentets?accumulentdanslesestuaires,formantuntapissurlefond,mélangedevaseetde
matièreorganique.Eneffet,pourl'estuairedelaLoire,larencontredesfluxenprovenancedufleuve
(27Gm3/an)etdel'océan(150Gm3/an)induisent,notammentenpériodedemorteseaux(faibles
coefficientsdemarée),defaiblesvitessesd'écoulements(faibledébitfluvial,faiblesdébitsdeflotset
dejusants)quiengendrentundépôtsédimentairesurlefonddel'estuaire.
Sousl?actiondescourants,demaréeoudecrue,lavaseetlamatièreorganiquesontremisesen
suspensionetconstituentlebouchonvaseux.L?extensiondubouchonvaseuxdépendnotammentdu
coefficientdemarée:plusceluiciestélevépluslavaseestmiseensuspensionetestdisperséesur
unegrandedistance(illustration36).
Ledéplacementdubouchonvaseuxdansl?estuaireestprincipalementconditionnéparledébitdu
fleuve: lorsque le débit est faible, la mer pénètre davantage dans l?estuaire et fait remonter le
bouchonvaseuxenamont;lorsdescrues,leseauxdoucespeuventexpulserlebouchonvaseux
versl'estuaireexterne.Ladynamiquedubouchonvaseuxdel'estuairedelaLoireestdétailléci
dessousdansl'illustration37.
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Illustration36:Évolutiondelateneurenmatièresensuspensionenfonctionducoefficientdemaréedans
l'estuairedelaLoire(GIPLoireestuaire)
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Ladégradationdesgrandesquantitésdematièreorganiquecontenuesdans le bouchonvaseux
consommedel?oxygèneetpeutentraînerdeshypoxiespréjudiciablespourlespoissonsmigrateurs
amphihalins.CesdéficitssontmajoritairementobservésenavaldeNantes,lesplusintensesétant
mesuréspendantlesviveseauxestivales(lestempératuresélevéesfavorisentladégradationdela
matièreorganique). Enhiver et auprintemps, lesdébits élevéset les températuresplusbasses
favorisentl?oxygénationdeseaux(illustration38).
Lesaménagementssuccessifsdel'estuairedelaLoirepourlanavigation(chenalisation)ontmodifié
sonfonctionnementhydromorphologique.Alorsquelefrontdemaréedynamiqueneremontaitque
jusqu'àNantesaumilieuduXIXesiècle,ilremontedésormaissurprèsde100km,jusqu'àhauteur
d'Ancenis.L'augmentationdesfluxdepolluantsenprovenancedubassindelaLoiredepuiscette
mêmepériodeacontribuéégalementàl'augmentationdesvolumesdematièresetdesteneursen
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Illustration38:ÉvolutiondesconcentrationsenO2dansl'estuairedelaLoireenrelation
avecledébitetlatempératuredel'eau(exempledel'annéehydrologique20072008)
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Illustration37:Localisationdubouchonvaseuxdansl'estuairedelaLoire(GIPLoireestuaire)
polluantsdubouchonvaseux. Cetteaccumulationdepolluantspeutêtrepréjudiciableauxpoissons
migrateursamphihalinsquiséjournentplusieurssemaines,voirequelquesmois,enestuaire:civelles,
flets,éperlans,esturgeons.
Les réseaux de suivi de la qualité des eaux de l'estuaire ont permis de mieux comprendre la
dynamiquedubouchonvaseux et permettent dedisposer d'uneappréciation deson impact sur
l'adaptationdespoissonsmigrateursamphihalinsenestuaire.Lepassagedel'estuairereprésente
unephaseobligatoireetessentielledanslecycledeviedespoissonsmigrateursamphihalins.Ces
espècesutilisenteneffetl'estuaire pour se nourrir, se réfugier, ou transiter. Selon leur période de
présence, elles sont plus ou moins impactées par les hypoxies.
Lesconnaissancessurlesrythmesmigratoiresontpermisd'analyserl'impactdubouchonvaseuxsur
lesdifférentespopulationsdepoissonsamphihalins,enfonctiondeleurprésenceenestuaire.Lecas
dusaumonestdétaillécidessousdansl'illustration39.
Cesdonnéesindiquentquelespériodesd'hypoxiesévèresontrencontréesessentiellemententre
juilletetoctobre.Lesgéniteurspotentielsenmontaisonquientreraienttôtdansl?estuairedelaLoire
pourraientêtreaffectésparunepérioded'hypoxietardive.Lessmoltsquitransitentenestuaireen
juinsontplusexposésaurisqued'hypoxiesévèrequeleurscongénèresarrivésplustôtenestuaire.
Les réseaux de suivis de l'estuaire de la Loire permettent également de calculer la durée des
périodes d?hypoxie, généralement citée commeun facteur clé pour la capacité de résistanceet
d?adaptation des poissons à ces déficits en oxygène. Sur la période20092012, la plus longue
périoded'hypoxieaatteintaumoins23jourset20heuresauPellerin(août2010),etplusde25jours
àCordemais(aoûtseptembre2012).
3.4.5 Pressionssurlemilieumarin
Danslemilieumarin,lesaltérationsducycledeviedesamphihalinscorrespondentàdesrésultantes
depressionsapportéesparlesfluxcontinentauxouàdespressionsspécifiques.
Lesapportsenpolluants(nutriments,substancesdangereuses...)sontsusceptiblesd'affecterlecycle
deviedespoissonsamphihalins, notammentsur leplateaucontinentalparuneaccélérationdes
phénomènes d'eutrophisation (se manifestant par les marées vertes sur le littoral) ou une
contaminationdesfondsmarinsaudroitdeszonesdenourricerie,réduisantleurproductivitéavecun
risquederépercussionsurl'équilibretrophique.Lesdragagesdesfondsestuariensoumarins,entre
autrespour la navigation, et le clapagedessédimentsdraguésenmer est unautre facteur de
déséquilibrepotentiel.
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Illustration39:Interactionentrelebouchonvaseux(concentrationminimalesenO2dissous
atteintesentre2007et2010)etlaprésencedessaumonsadultesetdessmoltsdansl'estuaire
delaLoire(GIPLoireestuaire)
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Enparallèle,lesévolutionsclimatiquesconstatéesengendrentprogressivementdesmodificationsde
lacourantologieetdupositionnementdesairesdegrossissementdesespècespotamotoques,qui
sontautantdefacteurspouvantaugmenterlesdistancesdemigration.
Les prélèvements par les pêcheries, pouvant constituer des valorisations accessoires, ne sont
vraisemblablementpasnonplusnégligeables.Atitred'exemple,lespêcheriesdemaquereauxen
Islande et aux îles Féroé ont capturé accidentellement, d'après les déclarations de capture
disponiblespourlesannées2010et2011,enmoyenne1,5saumonpour1000tdemaquereaux.
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4 Orientationsdesmesuresdegestionpourlapériode
20142019
4.1 Synthèsedespressionssurlesespècesamphihalines
L'étatdeslieuxdeshabitatsetdesespècesmetenévidencelesdifférentespressionsauxquelles
sontexposés lespoissonsmigrateursamphihalins. Cespressionsconcernentd'abord lesmilieux
aquatiquesetleshabitats,etenaffectentlaproductivité:
? altérationdelacontinuitéécologiqueetdelamorphologiedescoursd'eauengendrantdes
pertesdefonctionnalitésécologiques(réductiondesconnexionslatéralesetlongitudinales,
complexificationdescircuitsdemigrations);
? altérationdelaqualitédeseaux,rendantlesespècesamphihalinesplusvulnérables;
? modification de l'hydrologie, se traduisant par des adaptations nécessaires des espèces
amphihalines à unehydrologie réguléeou réduite (par les prélèvements) et impactant le
régimethermiquedescoursd'eau.
Mais les poissons migrateurs amphihalins sont également exposés à des pressions de
prélèvements:
? lespressionslistéescidessusets'exerçantsurlemilieuaquatique,ainsiquelesintroductions
d'espèces exotiques, sont susceptibles de provoquer des déséquilibres établissant de
nouvelles relations entre proies et prédateurs et nécessitant l'adaptation des poissons
migrateursamphihalins;
? lesprélèvementsparpêche.
LesinterventionsduPlagepomidoiventseconcentrersurlesquatrefacteurs,dits«maîtrisables»,
surlesquelsdeseffetspeuventêtreobtenus,àsavoir:
? laqualitédeseaux;
? lacontinuitéécologique;
? lamorphologieetleshabitats;
? lesprélèvementsparpêche.
Les actions sur les trois premiers axes permettent d'améliorer l'accessibilité aux habitats de
reproductionetdegrossissement,lafonctionnalitédesestuairesetlaproductivitédeshabitatseneau
douce.
Desactionssontaussisusceptiblesd'avoirdeseffetssurlesinteractionsproiesprédateursetsur
l'hydrologie,maisdemanièrepluslimitée.
Ilfautrappelerparailleursl'existencedepressionsqualifiéesde«nonmaîtrisables»autraversdu
Plagepomi:
? lespressionspropresaumilieumarin;
? lechangementclimatique.
PourchacundesdixsousbassinsversantsidentifiésparlePlagepomi,lespressionsrelativesàla
qualitédeseaux,àlacontinuitéécologiqueetàlamorphologie,àl'hydrologie,sontappréciéesen
regarddel'étatdeslieuxdesmassesd'eauétablienapplicationdeladirectivecadresurl'eau.Une
évaluationqualitativedelapressiondeprélèvementsparpêcheestégalementproposée.Pourle
saumonetlatruitedemer,cettepressiondepêchecorrespondàunepressiondepêcheaccidentelle
ouillégalecomptetenudesinterdictionsdepêcheeneaudouce.Ilestendemêmepourlesaloses
dans le bassin de la Sèvre niortaiseainsi quepour les lamproies dans les bassinsde la Loire
bourguignonne,delaMaineetdelaSèvreniortaise.
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Un faible niveau de pression sur un facteur maîtrisable conduira à une prépondérance des
orientations de préservation, tandis qu'un fort niveau de pression impliquera sur les facteurs
concernésàprivilégierlesorientationsderestauration(illustration40).Lesactionsdepréservationet
derestaurationserontmenéesprioritairementdanslessousbassinsversantsenfonctiondesenjeux
identifiéspourlesdifférentesespèces(illustration41).Lesopérationsd'acquisitiondeconnaissances
pourrontportersurlesdifférentssousbassinsversants,notammentceuxoùunenjeuimportantapu
êtreidentifiépourl'espèceconsidérée.
4.2 ObjectifduPlagepomi
Lasynthèsedespressionsauxquellessont exposées lesespècesmigratricesamphihalineset la
précision des enjeux relatifs à chaqueespèce conduisent à identifier un objectif de long terme
communpourlagrandealose,l?anguilleeuropéenne,lesaumonatlantiqueetlalamproiemarine:la
préservation et la reconquête de la viabilité pérenne des populations sauvages dans les
bassinsdelaLoire,delaSèvreniortaiseetdescôtiersvendéens.
Tousleseffortsdéployésdoiventseconcentrersurl?atteintedecetobjectif,cequisupposed?agir:
? enprioritépourlapréservationetlareconquêtedeshabitatsetdelacontinuitéécologique,
notammentdanslesbassinsversantsmodérémentanthropisés,descoursd'eauclassésen
liste2autitredel'articleL.21417ducodedel'environnementpourlespoissonsmigrateurs
amphihalinsetdelazoned?actionsprioritairespourl?anguille;
? aucasparcasetenaccompagnementpardesmesuresd?encadrementdespratiquesde
pêcheoudesoutientemporairedeseffectifs.Cesdernièresopérationsseront pleinement
valoriséespourmaintenirl?évolutionfavorabledespopulationsversleurviabilité,enparallèle
desactionsdepréservationetdereconquêtedeshabitatsetdelacontinuitéécologique;
? en faveur d?une poursuite de l?acquisition des connaissances afin de renforcer la
compréhensiondufonctionnementdespopulations.
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Illustration40:Caractérisationdespressionsprépondérantessurlesneufsousbassinsversants
Illustration41:Synthèsedesenjeuxrelatifsàchaqueespècedanslesneufsousbassinsversants
NB:Pourlesespècesdontleseffectifsoulesconnaissancessontfaiblesetnepermettentpasd'identifierunenjeuterritorial,
«noncaractérisé»signifiequel'espècepeutêtreprésentedanslebassinversantetqu'unenjeupeutexister,et«absent»
signifiequel'espècen'estpasprésentedubassinversant.
Anguille Saumon Aloses Lamproies Truite de mer Flet Mulet porc Esturgeon
Allier moyen fort moyen moyen non caractérisé absent non caractérisé absent absent
Loire bourguignonne moyen moyen fort moyen non caractérisé absent non caractérisé absent absent
Loire moyenne fort moyen fort moyen non caractérisé non caractérisé non caractérisé non caractérisé non caractérisé
Cher fort faible fort fort non caractérisé absent non caractérisé absent absent
Vienne fort moyen fort fort non caractérisé non caractérisé non caractérisé non caractérisé non caractérisé
Maine fort faible moyen moyen non caractérisé non caractérisé non caractérisé non caractérisé non caractérisé
Loire aval fort moyen moyen moyen non caractérisé non caractérisé non caractérisé non caractérisé non caractérisé
fort faible moyen moyen non caractérisé non caractérisé non caractérisé non caractérisé non caractérisé
Côtiers vendéens fort faible faible moyen non caractérisé non caractérisé non caractérisé non caractérisé non caractérisé
Eperlan
Sèvre niortaise
Pressions
Qualité de l'eau Continuité écologique et morphologie Hydrologie Prélèvements par pêche
Allier moyenne moyenne faible faible
Loire bourguignonne faible moyenne faible faible
Loire moyenne moyenne faible faible moyenne
Cher moyenne forte moyenne faible
Vienne moyenne moyenne moyenne faible
Maine forte forte moyenne faible
Loire aval forte forte moyenne forte
moyenne forte moyenne moyenne
Côtiers vendéens moyenne forte forte forte
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L?atteintedecet objectif requiert la recherched?uneconciliationdesenjeuxbiologiquesetsocio
économiquesassociésauxespècesmigratricesamphihalinesdanslesterritoires,enveillantàceque
lapriseencomptedecesderniersnecompromettepasl?atteintedeceluici.
Danslecasparticulierdusaumon, l'atteintedelaviabilitéde lapopulationsauvageconfèreune
prioritédepréservationdeshabitatsfonctionnelsetderestaurationdelacontinuitéécologiqueaux
territoires du bassin versant de l'Allier où se concentrent aujourd'hui les habitats productifs
accessibles sur lesquels est constatée la reproduction de saumons sauvages. L'atteinte de cet
objectif suppose un suivi de l'évolution tendancielle d'une série d'indicateurs reliant l'habitat au
développementdessaumons,commeparexempleletauxdesurviedesoeufs,letauxdesurviede
l?oeufausmolt,letauxdemortalitéàladévalaison,lenombredefrayères,lelinéairedecoursd?eau
accessible... Lesobjectifspources indicateurssont d'évoluer favorablement entre2014et 2019.
Enfin,àtitreindicatif,leCSPavaitfaitétaten1999enpremièreapproched'uneffectifdeviabilitéde
1700saumonsparanàVichy. Cettevaleurguidehistoriqueseraréviséelorsquelaconcertation
prévueendispositionsP4BetC2Dseraaboutie.
4.3 Troisorientationsfondamentalestechniques(OF)
AuregarddelaStranapomietdel'analysedespressionsconnuesetmaîtrisables,troisorientations
fondamentalestechniquesontétédéfiniespourbâtirleprésentPlagepomi:
? PPréserveretnepasdégraderl?existant:Cetteorientationfondamentaleprioritairerecouvre
aussibienlesespècesqueleshabitats.Ellerépondauxobjectifsdeprotectiondeshabitats,de
pêche durable des espèces amphihalines ou de fermeture de pêche selon la situation des
espèces,etderenforcementdelaprotectiondesespèces.
? R Reconquérir et restaurer les milieux favorables aux espèces amphihalines: Cette
orientationfondamentaleporteessentiellementsurleshabitats,leurqualitéetleuraccessibilité.
Desmesuresdesoutientemporaired?effectifsauregardd?unniveaudepopulationactuellement
insuffisantpourgarantirlapérennitéàlongtermedelapopulationsurlebassindegestionpeuvent
égalementcontribuerauxobjectifsdecetteorientationfondamentale.
? C Améliorer les connaissances et le suivi des populations dans un contexte de
changementglobal: Cetteorientationfondamentaleest indissociabledesdeuxpremières.La
connaissancedoitresteraucoeurdelaprisededécisiondesgestionnaires.Lesobjectifsdecette
orientationfondamentaleonttrait auxthématiquesbiologiques(caractérisationducomportement
desespèces...)etsocioéconomiques(caractérisationdelapressiondepêche,desouvrages,des
retenuesd'eau...).
La traduction opérationnelle de ces trois orientations fondamentales techniques s?appuie
nécessairementsurunequatrièmeorientationfondamentaletransversale(OFG,cf.paragraphe4.4),
visant à promouvoir le renforcement de la coopération entre les différents niveaux de
gouvernance,dudistrictLoireBretagneaubassinversantlocal.Cetteorientationfondamentale
repose sur la proposition d?une nouvelle place aux décideurs locaux, à travers notamment les
commissions localesde l?eau(CLE), ainsiquesur le partaged?expérienceset la communication
autourdelaproblématiquedespoissonsamphihalins.
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Chaqueorientationfondamentaleestdétailléeenorientations,dispositions.Unprogrammede
mesuresaccompagnelesdispositionsetpermetdeguiderleurdéclinaisonopérationnelle.
Lesorientationsetdispositionsrestentgénérales,àl'exceptiondequelquescasparticuliers.
Leprogrammedemesuresprécise l'espèceet lesbassinsversantsprioritaires. Lechamp
d?applicationterritorialdesmesuress?appuieaumaximumsurleszonagesexistants:cours
d?eaunécessitantlaprotectioncomplètedespoissonsmigrateursamphihalins,linéairesde
frayèresclassés,réservoirsbiologiques...
LesorientationsetdispositionsduPlagepomisontrédigéesdefaçon«autoportée».Ainsi,la
lectureetl'appropriationduPlagepomisontfacilitéesetl'insertiond'élémentsdecontenudu
PlagepomidansleSdageenserarendupossible. Eneffet, le Plagepominepossède une
portée réglementaire que pour soncontenu relatif à la pêche et ausoutiend?effectif. Le
contenuduPlagepomiconcernantlesmilieuxaquatiquesetleshabitatsn'aquevaleurde
recommandation. Or, l'essentiel des limites rencontréesdans l'atteinte depopulations de
poissonsmigrateursamphihalinsviablesconcernentlaqualitéetlafonctionnalitédesmilieux
aquatiques.Decefait,l'enjeuestdecréerdesliensavecleSdageetlesSage,documentsde
planificationopposablesdansledomainedel'eauetdesmilieuxaquatiques.
IlestainsiprécisédanslesorientationsetdispositionsduPlagepomi:
? l'existenced'orientationset/oudedispositionssimilairesdansleSdageLoireBretagne
20102015,qu'ilconviendraitdechercheràreconduiredansleSdage20162021;
? l'intérêtquecertainesdispositionsduPlagepomi20142019,notammentcellesrelatives
auxmilieuxaquatiquesetauxhabitats,soientreprisesdansleSdage20162021,afinde
leurconféreruncaractèreopposable.
Cettedémarchesejustifie,considérantquelesactionsenfaveurdespoissonsmigrateurs
amphihalins,donclamiseenoeuvreduPlagepomi,concourentàl'atteintedesobjectifsdela
politiquedepréservationetderestaurationdemilieuxaquatiquesissusdelaDCE.
LesorientationsetdispositionsduPlagepomidoiventainsiapporter,notammentencequi
concernelesmilieuxaquatiquesetleshabitats,despropositionsd'évolutionoudemaintien
delaréglementationetdesdocumentsdeplanificationenvigueurdansledomainedel'eau
etdesmilieuxaquatiques.
4.4 OFG:Unecoopérationdanslagouvernance
Enappuiauxtroisorientationsfondamentalestechniques,décritesciaprès,l'orientationrelativeàla
gouvernancepréciseladoublecohérencenécessaireàlamiseenoeuvreduPlagepomi:
? cohérence thématique: entre la thématique des poissons migrateurs amphihalins et la
thématiquedesmilieuxaquatiques;
? cohérence en matière de gouvernance: entre l'échelon du bassin hydrographiqueet du
Cogepomi, les partenaires techniques et l'échelon des décideurs locaux en matière de
milieuxaquatiques(CLE).
L'insertiondelagouvernancedespoissonsmigrateursamphihalinsdanslagouvernancedel'eauet
desmilieuxaquatiquesinviteàprivilégierlesoutilsexistants.
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4.4.1 OrientationG1:Maintenirunpilotagepartenarialdebassinsurlagestiondes
poissonsmigrateursamphihalins,inscritdanslecontextedelagouvernancedel'eau
etdesmilieuxaquatiques
Afindeconserverlavisibilitédelathématiquedespoissonsmigrateursamphihalins,ilconvientde
maintenir unecoordinationde lamiseenoeuvredecettepolitiquepar l'Étatet sesservices, qui
assurentlesecrétariatduCogepomi.
DispositionG1A:LesecrétariatduCogepomipilotelacoordinationdelamiseenoeuvredes
mesuresdegestion.
UnerépartitionthématiqueestretenueauniveaudusecrétariatduCogepomientre:
? la Dreal des Pays de la Loire, en chargede la déclinaison duPlagepomi pour les espèces
thalassotoques.ElleestencelaenchargenotammentdelacoordinationduPlagepomiavecle
plan de gestion de l'anguille (PGA) pris par la France en application du règlement visant la
reconstitutiondustockd'anguilleseuropéennes.EllepilotelePGAsurleterritoireduCogepomi;
? laDrealCentre,délégationdebassinLoireBretagne,enchargedeladéclinaisonduPlagepomi
pourlesespècespotamotoques.Elleestencelaenchargenotammentdelagestiondusaumon
atlantique,aveclepilotageduvoletduPlagepomirelatifausaumonatlantique,ditplansaumonde
LoireAllier.
LesecrétariatduCogepomitravailleenconcertationaveclaDirectiondel'eauetdelabiodiversitédu
ministèreenchargedel'écologieetveilleenparticulieràlabonnecirculationdesinformationssur
l'anguille(relationsentrePlagepomietPGA),parexempleausujetdesdonnéesdecaptures.
Disposition G1B: Le Cogepomi informe en tant que de besoin le Comité de bassin de
l'avancementduPlagepomi.
Cettedispositioncorrespondàlatraductionlocaledel'orientation13delastratégienationalepourles
poissonsmigrateursamphihalins,quiprévoitderapprocherlagouvernancedespoissonsmigrateurs
delagouvernancedel'eauetdesmilieuxaquatiques.
Lesecrétariat duCogepomiveilleàassocier lesacteursde l'eauetdesmilieuxaquatiquesà la
concertationdans laprisededécision. Enparticulier, il travaille encollaborationétroiteavec les
instancesdubassinLoireBretagne,notammentdanslapériodederévisionduSdagejusqu'enfin
d'année2015.
Disposition G1C: Le secrétariat du Cogepomi pilote le Plagepomi en s'appuyant sur
différentspartenaires.
LesecrétariatduCogepomipeutnotammentpérenniserouinstaurerdesgroupesd'appuiaupilotage,
rassemblantdespartenairessusceptiblesd'apporteruneanalyseobjectiveéclairantlaconduitedu
plandegestion.
Cesgroupesontvocationàapporterunregardcritiqueetàfaireémergerdespropositionspouvant
alimenterdesdocumentsdecadrageouinitierdesdémarchesverslessousbassinsversants.Les
projetsdedécisionssontétablisensynthèsedestravauxdecesgroupesetadoptésparlesecrétariat
duCogepomi,éventuellementaprèsconsultationdespartenaireslocauxoudebassinsurlessujets
quilenécessiteraient.
LespartenairesimpliquésdanslamiseenoeuvreduPlagepomisontnotamment:
? descollectivitésouleursgroupements;
? desétablissementspublics;
? desassociationsoufédérationsassociatives;
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? desentreprises.
4.4.2 OrientationG2:Associerlesinstanceschargéesdelagestiondel'eauetdes
milieuxaquatiquesàladéclinaisonduPlagepomi.
Lepartenariataveclesacteurslocauxdelagestiondel'eauetdesmilieuxaquatiquesestunenjeu
essentielduPlagepomi20142019.
G2A:Al'échelledessousbassinsversantsidentifiésauchapitre3oud'entitésexistantes
par ailleurs (bassin versant d'un Sage, périmètre d'un EPTB), une concertation peut être
instauréeenfaveurdespoissonsmigrateursamphihalins.
LesCLEouleurscommissionsthématiquesorganisentdeséchangessurlespoissonsmigrateurs
amphihalinsetlamiseenoeuvreduPlagepomi.Lesobjectifsdecettedémarchesontde:
? favoriserl'appropriationlocaledelathématiquepoissonsmigrateurs,endiffusantlocalementles
informationsacquisessurlespoissonsmigrateursamphihalins,afindesusciterunemobilisation
localesurlesujet,pouvantparexemplesetraduirepardesdispositionsrelativesauxpoissons
migrateursamphihalins dans lesplans d'aménagement et de gestion durable de l'eauet des
milieuxaquatiquesdesSage;
? mettre à disposition des acteurs locaux les éléments, notamment de cadrage ou de
connaissances,ayantpuêtreproduitsparailleursdanslamiseenoeuvreduPlagepomi.Cette
informationpermetenretourdefaireémergerdesbesoinslocalementqu'ilpeutêtreintéressantde
traduiredanslecadreparexempled'uncontratterritorialenfaveurdesmilieuxaquatiques,ouà
uneéchelleplusglobaledanslecadredelamiseenoeuvreduPlagepomi;
? informerdelaréalisationd?opérationsenfaveurdespoissonsmigrateursamphihalinsdansleur
territoire.
A défaut de CLE, tout groupe de travail fonctionnel déjà consacré aux poissons migrateurs
amphihalinspeutmenercetteconcertation.
Aussi il peut être envisagé, à l'échelle des grands sousbassins versants, la constitution de
commissions interSagesur lespoissonsmigrateursamphihalinsouuneinformationrégulièredes
commissionstechniquesterritorialesduComitédebassin,afinentreautresdefaciliterlacoordination
desactionsdesSage,desprogrammescontractuelsetdesservicesdel?Étatdanslamiseenoeuvre
duPlagepomi.
4.4.3 OrientationG3:Renforcerlepartaged?expériencesetlacommunication.
Lavalorisationdesconnaissancesacquisesàtraversunpartagedesexpériencesetunretourde
bonnespratiquesestunenjeuessentielduPlagepomi.Celasupposeuneinformationrégulière,des
structureschargéesdupilotageduPlagepomicommedesporteursdeprojet,del?avancementdes
actionsetainsidelamiseenoeuvredesmesuresopérationnellesduPlagepomi.
G3A:LamiseenoeuvreduPlagepomifait l?objetd?informationsrégulières, à l?échellede
bassincommeauxéchelleslocales.
Auniveaudubassin,lesecrétariatduCogepomifaitétatdel?avancementdanslamiseenoeuvredes
mesuresduPlagepomiets?appuiesur:
? des communications orales lors de réunions de concertation spécifiques aux poissons
migrateursamphihalinsoudanslecadrepluslargedelapolitiquedel?eauetdesmilieux
aquatiques;
? desdocumentsécrits decommunication (lettresd?information, communiquésdepresse...)
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rendantcomptedesprogrèsduPlagepomi.
Au niveau local ou dans le cadre d?opérations en réponse aux mesures opérationnelles du
Plagepomi,lesstructurescoordinatricesouopérateurspeuventcommuniquersurcertainesactions
quirentrentdanslecadreduPlagepomiouquicontribuentàl?atteintedel?objectifduPlagepomi.
Lesobjectifsprioritairesdecommunicationportentsurlasensibilisationdupubliccibleauxenjeuxet
surlamobilisationdesdifférentsacteursautourdesenjeuxpoissonsmigrateursafindesusciterdela
fiertémaiségalementdefavoriserl?émergencedemaîtrisesd?ouvrage.
G3B:Lesconnaissancesacquisessontdiffusées.
EncoordinationaveclesecrétariatduCogepomi,desactionsdediffusiondesconnaissancessont
organiséesrégulièrement.Cesopérationsdecommunicationpeuventsetraduireparl?organisationde
journées d?échanges ou la diffusion de synthèses écrites, permettant de créer ou renforcer les
relationsentrelacommunautédeschercheursetexperts,etlepublicdesdécideursetgestionnaires.
L?objectif principal de cette communication est d?apporter l?éclairage technique et scientifique
nécessairepourappuyerlesprisesdedécision.
4.5 OFP:Préserveretnepasdégraderlasituationexistante
4.5.1 OrientationP1:Prévenirtoutedégradationdel'accessibilitédeshabitatsdans
ladurée
Lesobstaclesàl'écoulement(seuilsetbarrages)peuventconstituer,mêmelorsqu'ilsprennenten
compte la présence des poissons migrateurs amphihalins par la présence de dispositifs de
franchissement,despointsdifficilespourlesmigrationsdemontaisonetdedévalaison.
L'objectifdel'orientationP1estdepréserverdansladuréelescapacitésdespoissonsmigrateurs
amphihalinsàfranchirlesobstaclesàl'écoulement.
Cetteorientationtrouveunrelaisdanslesorientations1Aet9BduSdageLoireBretagne20102015
quiont pourobjectif d'empêchertoutenouvelledégradationdesmilieuxet d'assurer lacontinuité
écologiquedescoursd'eau.
Ainsi,sil'équipementhydroélectriqued'ouvragesexistantssurdescoursd'eauclassésautitreduI
de l'article L.21417duCodede l'environnement, restepossible, il convient toutefois, tel que le
précise la circulaire du 25 janvier 2010 relative à la mise en oeuvre du plan d'actions pour la
restaurationdelacontinuitéécologique:
? deprivilégierlarecherched'équipementhydroélectriqued'ouvragesnonsituéssurlescoursd'eau
classés;
? àdéfaut,denepasdégraderlasituationexistanteenmatièredecontinuitéécologique,et,sile
maintiendel'ouvragen'estjustifiéparaucunautreusage,des'assurerquel'impactrésidueldu
maintiendel'ouvrageetdesonexploitationhydroélectrique,enmatièredecontinuitéécologique,
esttrèsprochedesconditionsquirésulteraientdel'effacementdel'ouvrage,toutenpermettant
une économie conséquente et justifiée sur le coût de cet effacement et en contribuant
suffisammentauxobjectifsdedéveloppementdesénergiesrenouvelables.
Rappelsréglementaires:
L?applicationdelaréglementationexistanteconstitueunprérequisessentielduPlagepomi
20142019.Entreautres,ilestrappelélaréglementationsurlestroissujetssuivants:
1.Leclassementdescoursd'eauenliste1autitredel'articleL.21417duCodedel'environnement
(cf.paragraphe3.3.1),esteffectifdepuisle22juillet2012etinterditlaconstructiondetoutnouvel
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ouvrageautoriséouconcédéencoursd'eau,quicréeraitunobstacleàlacontinuitéécologique.Par
ailleurs, le renouvellementdesdroitsexistantsestsubordonnéàdesprescriptionspermettantde
garantirlaprotectiondespoissonsmigrateursamphihalins.
2. La mise en conformité des ouvrages visàvis de la réglementation fait l'objet de contrôles
spécifiquesdanslecadredesplansdecontrôledesMISEN(cf.paragraphe3.3.1).
3.Lestravauxencoursd'eaufontl'objetàpartird'uncertainseuildeprocéduresdedéclarationou
d'autorisationautitredelaloisurl'eau(titre3delanomenclaturedelaloisurl'eau,préciséeà
l'article R.2141 du Code de l'environnement). En particulier, les travaux visés concernent les
obstacles à l'écoulement, la modification des profils en long ou en travers du lit mineur, la
modificationdelaluminosité,laconsolidationoulaprotectiondebergesetl'entretiendescoursd'eau
oucanaux.
Disposition P1A: Le respect des prescriptions pour le rétablissement de la continuité
écologique(entretiend'undispositifdefranchissement,manoeuvredesdispositifsmobiles)
par le propriétaire d'un ouvrage est traduit dans les actes administratifs lors des
renouvellementsdedroitetfaitl'objetdecontrôlesciblés.
L'efficacité continue des dispositifs de franchissement est assurée conformément à la notion
d'obligationderésultat.Danscecadre,lesrèglementsd'eauintègrentdesprescriptionsrelativesà
cetteobligationlorsdurenouvellementdesdroitsetdesopérationsdecontrôledelapolicedel'eau
etdelanatureveillentaurespectdecesobligations.
Enparallèle,unguidedebonnespratiquesestmisàdispositiondespropriétairesafindefaciliterles
opérationsd'entretienetdeleurapporterlesmeilleureschancesderéussite.
Unemutualisationdesmoyensdesurveillancedelafonctionnalitédesdispositifsdefranchissement
entre les différents propriétaires d'ouvrages est envisagée, afin de renforcer l'efficacité de la
surveillance de la fonctionnalité de la continuité écologique au droit des ouvrages. Une telle
démarches'effectueà l'échelle d'uncoursd'eaunécessitant laprotectioncomplètedespoissons
migrateurs amphihalins, dans le cadre duplan d?actions du Sagedevant identifier les mesures
nécessairesàlarestaurationdelacontinuitéécologique.
LeCogepomiencouragel'intégrationdecettedispositiondansleSdageLoireBretagne20162021.
Disposition P1B: Les nouvelles autorisations ou renouvellements d'autorisation
d'équipementoudesuréquipementhydroélectriqued'ouvragesexistantsnesontdélivrées
quesileprojetgarantitlanondégradationdesconditionsdefranchissementdanslesdeux
sensdemigration.
Cettedispositionsupposedemettreenregardlecoûtécologiquedel'aménagementhydroélectrique
etlebénéficeénergétiqueattendudel'exploitation,afindes'assurerquelebénéficeénergétiquede
l'installation contribue de manière suffisante aux objectifs de développement des énergies
renouvelables.
L'aménagementnedoitnotammentpasdégraderlasituationpréexistanteentermesdecontinuité
écologique. Le meilleur dispositif technique acceptable est recherché, pour éviter et réduire les
risques demortalités des poissons migrateurs amphihalins (grilles antiintrusion, turbines ichtyo
compatibles).
Lamiseenoeuvredecettedispositions'appuiesurlesconnaissancesacquisesenapplicationdela
dispositionC1B.
Cettedispositions'inscritdanslaprioritédonnée,surlescoursd'eauoùsetrouventdespopulations
sauvagesdepoissonsmigrateursamphihalins,àlaluttecontrelecumuld'obstaclesàfranchir.Ainsi,
àdéfautdedispositifssatisfaisantsdelimitationdesimpacts,l'aménagementn'estpossibleque:
? danslecasdeprojetsbénéficiantd'uneDUPoud'uneDIG;
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? siunemesurecompensatoireestprévue,sipossiblesurlamêmemassed'eau,afindemaintenir
auplusletauxde fractionnement àsontauxactuel.Lacompensationportesurtouteopération
permettantderetrouverdesconditionséquivalentesdetransportdessédiments,dediversification
deshabitats,devitessedetransfertdeseauxetdecirculationpiscicole.
LeCogepomiencouragelareprisedecettedispositiondansleSdageLoireBretagne20162021.
DispositionP1C:Lestravauxencoursd'eauveillentàmaintenirlacirculationdespoissons
migrateursamphihalinsentreleszonesavaletamontdusitedetravaux.
Pourlestravauxsusceptiblesdeperturberlamigrationdespoissonsmigrateursamphihalins,
laprioritéportesurleurréalisationendehorsdespériodesdemigrationactive,àdéfauteten
l'absence de dispositifs permettant de maintenir la circulation des poissons migrateurs
amphihalins.
Lespériodesdemigrationactivesontlessuivantes:
? pourlesaloses,lamigrationactives'échelonnedu1ermarsau15juin;
? pourleslamproies,lamigrationactives'échelonnedu1eroctobreau31mai;
? pour lesaumonatlantique, lespériodesdemigrationsactivessontpréciséesparsousbassins
versantsdansletableau4:
? pourlescivellesenestuaire,lamigrationactives'échelonnedu1ernovembreau30juin;
? pourlesanguillesargentées,lamigrationactivededévalaisons'échelonnedu1eroctobreau31
mars.
Lesespècesdepoissonsmigrateursamphihalinsdevantêtreprisesencomptesurchaquetronçonde
coursd'eaupourl'applicationdecettedispositionsontcellescibléesdansleclassementenliste2
arrêtéle10juillet2012autitredel'articleL.21417duCodedel'environnement.
Cettedispositionviseenparticulierlesinstallations,ouvrages,travauxetactivités(IOTA)soumisà
déclaration ou autorisation, notamment au niveau du titre 3 de l'article R.2141 du Code de
l'Environnement(impactssurlemilieuaquatiqueousurlasécuritépublique)telqu'ilestenvigueurle
jourdelapublicationdel'arrêtépréfectoralapprouvantleSDAGE,susceptiblesdeperturber,defaçon
temporaire(oupérenne),lamigrationdesespècesdepoissonsmigrateursamphihalins.
LeCogepomiencouragel'intégrationdecettedispositiondansleSdageLoireBretagne20162021.
4.5.2 OrientationP2:Éviterladégradationdeshabitatsetdelaqualitédeseaux,
afindemaintenirlaproductivitédeshabitatsetunequalitéd'eaucompatibleavecles
exigencesdesespèces
Leshabitatsdereproduction,dedéveloppementetdereposmigratoiredesespècesamphihalines
sontspécifiquesetméritentuneattentionparticulière.L'enjeuprincipalportesurlapréservationdes
habitatsfavorablesexistantsactuellementconnus(cf.paragraphe1.2.2).
Lesfacteursdedégradationdelaqualitédeshabitatssont multiples:colmatage,modificationdu
substrat,modificationdurégimehydraulique,pollutionschimiques,altérationdelamorphologie.
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Saumon
Bassinsversantsde l?Allier et de
laLoirebourguignonne,enavaldu
barragedeVillerest
1ermars?15juin
15septembre?30novembre
Autresbassinsversants 1erjanvier?15juin
15septembre?30novembre
Tableau4:Périodesdemigrationactivedessaumons
L'objectifdecetteorientationP2estdeproposerdesinterventionsquimaintiennentlaqualitédel'eau
quandelleestdéjàadaptéeàlaviedespoissonsmigrateursamphihalinsouqui l'améliorentpar
ailleurs.
EllerejointlesorientationsduSdageLoireBretagne20102015relativesàl'hydromorphologie,àla
réductiondespollutionsetàlagestionquantitativeaveccommeobjectifs:
? d'empêchertoutenouvelledégradationdescoursd'eau;
? deréduirelespollutionsorganiques;
? demaîtriserlespollutionsparlespesticidesetlessubstancesdangereuses;
? demaîtriserlesprélèvementseneau;
? depréserverlelittoral,lestêtesdebassinversant,leszoneshumidesetlabiodiversité.
Le Sdage LoireBretagne 20102015 précise également la nature du couvert environnemental
permanentdevantêtremisenplaceàproximitédescoursd'eaudanslesterritoiresclassésenzone
vulnérableauxnitrates(lacartedeszonesvulnérablesauxnitratesestdisponibleauparagraphe
2.4.3). Sadisposition 2B2 prévoit que les programmesd'actions définis au titre de la directive
nitratescomprennentsystématiquementl'obligationd'implanterdesdispositifsvégétaliséspérennes
(haies,bandesenherbées,ripisylves)d'unelargeurminimalede5mètreslelongdetouslescours
d'eau.EllecomplètelesarticlesR.21180et81duCodedel'environnement.
Lecouvertenvironnementalpermanentbénéficieauxmilieuxaquatiquespluslargementquepourla
simpleréductiondestransfertsdenitrates.Ilpermetégalementdefreinerl'érosiondessols.
Ainsi, le couvert environnemental permanent peut apparaîtrecommeunélément duprogramme
d'actionspourlaréductiondurisqued'érosiondessolsdansleszonesoùl'érosiondiffusedessols
agricolesestdenatureàcompromettrelaréalisationdesobjectifsdebonétatoudebonpotentiel.
Cezonageetcesprogrammesd'actionsdoiventêtreétablisparlespréfetsd'aprèsladisposition1B
4duSdageLoireBretagne20102015.
LeSdageLoireBretagne20102015contribueégalementparsonorientation8Aàlapréservation
deshabitatsdespoissonsmigrateursamphihalinssituésenzonehumide.Ilinstaureainsileprincipe
prioritaired'évitementd'impactsurunezonehumidepuisderéductiondesimpactsrésiduels,età
défautd'alternativeavéréeauprojetendehorsdelazonehumide,ilimposelacompensationdela
zonehumidedétruite.
Audelà, les SRCEdéveloppent la séquence éviter/réduire/compenser à l'ensemble des projets
altérantlatramebleuequ'ilsontdéfinis,danslamesureoùilsdoiventfairel'objetd'unepriseen
comptedelapartdel'Étatetdescollectivitésoudeleursgroupements.
Parailleurs,encequiconcernelesdispositifsdeprotectionspécifiquedeshabitatsremarquables,
voired'intérêtcommunautaires,unobjectif d'atteinted'unesurfacedezonesprotégéesatteignant
2%duterritoirenationalaétéfixéeetestdéclinéautraversdelastratégiedecréationdesaires
protégées(Scap).
Rappelréglementaire :
L?applicationdelaréglementationexistanteconstitueunprérequisessentielduPlagepomi
20142019.Entreautres,ilestrappelélaréglementationsuivante:
LeCodedel'environnementprévoit parsonarticleL.4323queladestructiondefrayèresoude
zonesdecroissanceoud'alimentationdelafaunepiscicolesoitpunide20000eurosd'amende(cf.
paragraphe 3.3.1), à moins qu'il ne résulte d'une autorisation ou d'une déclaration dont les
prescriptionsontétérespectéesoudetravauxd'urgenceexécutésenvuedeprévenirundanger
graveetimminent.
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BassinsdelaLoire,delaSèvreniortaiseetdescôtiersvendéens?19février2014 79/98
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Parailleurs,leCodedel'environnementprévoirdeuxdispositifspermettantdelimiterladégradation
desmilieuxaquatiques,entreautresdeshabitatsetdelaqualitédeseaux:
? l'étuded'impact:Lesprojetsd'aménagementsusceptiblesd'affecterlesmilieuxaquatiqueset
doncleshabitatsdesespècessont,selonleurampleur,soumisàétuded'impactenvertudes
articlesL.1221et R.1222duCodedel'environnement.L'étuded'impact comportedivers
éléments listés à l'article R.1225 du Code de l'environnement, dont un état initial de
l'environnement, l'évaluation des effets du projet et les mesures présentées par le
pétitionnairepouréviter,réduireetcompenserlesimpactsdesonprojet;
? l'évaluation d'incidences Natura 2000: Les projets (activités, travaux, aménagement,
ouvrages, installations) susceptibles d'affecter significativement un site Natura 2000 sont
soumis à une évaluation des incidences, en vertu de l'article L.4144 du Code de
l'environnement.L'évaluationd'incidencesdoit,encasd'incidencenégativeduprojetsurle
siteNatura2000,faireétatdessolutionsretenuespouréviter,réduirepuiscompensercette
incidence.
DispositionP2A:Lamiseenplacedecouvertsvégétauxpermanents,enrivedescoursd'eau
etdesplansd'eaudeplusdetroishectares,estencouragéedansuncadreconcertéetsous
formedeprojetspilotes.
Cette disposition repose sur l'intérêt des couverts végétaux permanents dans la réduction des
phénomènesd'érosiondessols,susceptiblesdecontribueraucolmatagedeshabitats.
Elleavaleurderecommandationetportesur lesbassinsversantsdescoursd'eaunécessitantla
protectioncomplètedes poissonsmigrateursamphihalins et nonclassésenzonevulnérable aux
nitrates. En effet, en zone vulnérable aux nitrates, la couverture végétale permanente est déjà
obligatoire.
Lamiseenoeuvredecettedispositionautraversdeprojetspilotespermetdelimiterl'érosiondessols,
delimiterlestransferts,d'améliorerleconfortdesespècesetdelimiterl'échauffementparl'ombrage.
Lesprojetspilotescontribueraientàlatrameverteassociéeàlatramebleueetsontinscritsdansles
programmesd'actionsprévusparladisposition1B4duSdageLoireBretagne20102015.
Il convient, dans leséventuels projetspilotes, d'envisager uneévaluationde leur efficacité sur la
productivitédeshabitats.
En lien avec cettedisposition, le Cogepomiencourage la reconductionde la disposition1B4du
SdageLoireBretagne20102015dansleSdage20162021.
Disposition P2B: Un renforcement de la protection des habitats de reproduction et de
développementdesjuvénilesdespopulationssauvagesdepoissonsmigrateursamphihalins
estrecherché.
Les dispositifs de protection spécifique, sont des outils de protection des habitats de nature
réglementaire(réservenaturelle,arrêtédeprotectiondebiotope)oucontractuelle(zonespécialede
conservationNatura2000).Lesréservesdepêche,temporairesoupermanentes,peuventégalement
contribueràcetobjectifdeprotectiondeshabitats.Cesdispositifsrenforcentlaprotectionminimale
apportéeparlaprotectiondesfrayèresinventoriéesenapplicationdel'articleL.4323duCodede
l'environnementetsontdétaillésauxparagraphes2.3.1et2.3.2.
Cettedispositionrecommande,danslesbassinsversantsdescoursd'eaunécessitantlaprotection
complète des poissons migrateurs amphihalins où des dispositifs de protection cités cidessus
existent,l'animationprioritairedecesdispositifs.UnesynergieestdéveloppéeentrelePlagepomiet
lesdocumentsd?objectifsNatura2000parunrenforcementdeséchangesavecleCogepomi.
Enaccompagnement,danslesbassinsversantsdescoursd'eaunécessitantlaprotectioncomplète
des poissons migrateurs amphihalins qui ne seraient pas déjà couverts par des dispositifs de
protectionspécifiquedeshabitats,undesdispositifslistéscidessuspeutêtremisenplace,après
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concertationlocale.Ilestrecommandéd?étendrecettedispositionaudomainepublicmaritimedans
lessousrégionsmarinesduGolfedeGascogneetdelamerCeltique.
Lamiseenoeuvredecettedispositions'articuleavecladéclinaisonrégionaledelaScap.
Par ailleurs, la protection d?habitats fonctionnels invite, en cas d?impact des végétaux exotiques
envahissants(surlabase,entreautres,desconnaissancesacquisesdanslecadredeladisposition
C1E) sur les habitats des poissons migrateurs amphihalins (par exemple, par la fermeture
progressivedesannexeshydrauliques)àlamiseenplaced?opérationsderégulation,afindecontenir
l?extensiondesinvasions.
DispositionP2C: Le fonctionnementhydrosédimentaire naturel descoursd'eaudoit être
recherché, notamment par la circulation des crues morphogènes, afin de conserver la
dynamiquederenouvellementdeshabitats,leurfonctionnalitéetleurproductivité.
Lefluxsédimentairepermet unrenouvellementdeshabitats cequientretient leurproductivité et
contribueaumaintiendeséquilibresdumilieu. Aussi estil nécessairedemaintenir la circulation
existantedessédimentset denepas l'altérer, cequisetraduit pardesmanoeuvresdesparties
mobilesdesouvragesquandilsencomportent.Lesouvragessituéssurdescoursd?eauclassésen
liste2autitredel?articleL.21417oùunfortenjeupourletransitsédimentaireaétéidentifiésont
notammentconcernésparcettedisposition.
Dessolutionsd'évacuationdessédiments,complémentairesàlagestiondesouvragespouvantdéjà
exister,serontrecherchées,notammentpourpermettreletransitdespetitescruesmorphogènes.
4.5.3 OrientationP3:Maintenirunrégimehydrologiquecompatibleaveclesbesoins
despoissonsmigrateursamphihalins
Le régime hydrologique et la dynamique fluviale sont des facteurs clés pour la survie et le
développement des poissons migrateurs amphihalins. Une faible hydrologie accroît en effet les
risquesderéchauffementrapideauprintempsréduisantd'autantlescapacitésdeconfortetdesurvie
des espèces. Prévenir cesétiageset lesgérer est un enjeu important pour la préservation des
populationsdepoissonsmigrateurs.
L'objectifdel'orientationP3portesurlapriseencomptedesbesoinsvitauxdespoissonsmigrateurs
amphihalinsdanslagestionquantitativeéquilibréedelaressourceeneau.Mêmesicetteorientation
viseparticulièrementlesaxesmigratoiresprincipaux,ellenedoittoutefoispasocculterl'importance
decertainsaffluentspouvantjouerunrôleessentieldanslecycledecertainesespèces.
L'orientation P3 interagit avec l'orientation fondamentale 7 du Sdage LoireBretagne 20102015
relativeàlamaîtrisedesprélèvementsd'eau.
LeSdageLoireBretagnedéfinitpourunegestionéquilibréedelaressourceledébitobjectifd'étiage
(DOE).LeDOEestundébitmoyenmensuelaudessusduquelilestconsidéréquel'ensembledes
usagesestpossibleenéquilibreaveclebonfonctionnementdumilieuaquatique.C'estledébitde
référencepourladélivrancedesautorisationsdeprélèvementetderejetsparlapolicedel'eau.Ildoit
êtrerespectéenmoyennehuitannéessurdix.
Enparallèle,leSdageidentifiedesbassinsversantsnécessitantuneprotectionrenforcéeàl'étiage,
oùlesmesuresdegestionconduisentàlimiter,voireréduire,lesprélèvementsenpériodeestivale,
du1eravrilau30octobre.Lesbassinsconcernéssont:
? lebassindelaVienne,delaconfluenceaveclaBlourdejusqu?àlaconfluenceaveclaCreuse,à
l'exceptiondessousbassinsdel'Envigneetdel'Ozon;
? lebassindel'Oudon;
? lesbassinsdelaLogne,delaBoulogne,del'OgnonetdulacdeGrandlieu;
? lesbassinsdecertainscôtiersvendéens(Auzance,Vertonne,VieetJaunay).
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Aussietafindemaintenirunéquilibreentrelesressources,lesbesoinsetl'alimentationdesmilieux
naturels,deszonesderépartitiondeseaux(ZRE)sontdéfiniesparlepréfetcoordonnateurdebassin
LoireBretagne.
LeclassementenZREconcernelessecteursgéographiquesexposésauxplusfortesconsommations
d'eauetconduitàladéterminationdesvolumesprélevablesparlesdifférentescatégoriesd'usagers
enfonctiondesressourcesetdel'annéeconsidérée.LesbassinsversantsclassésenZREfigurent
surlacartedansl'illustration42.
Pourlagestiondecrise,leSdageLoireBretagne20102015définitdanssonorientation7Eledébit
seuild'alerte(DSA)etledébitdecrise(DCR).LeDSAetleDCRsontdesdébitsjournaliersde
gestiondecrise.LavaleurduDSAestinférieureouégaleàcelleduDOE.EndessousduDSA,une
desactivitésutilisatricesdel'eauouunedesfonctionsducoursd'eauestcompromise.Ils'agitdonc
d'unseuildedéclenchementdesmesurescorrectives.LeDCRestlavaleurdedébitendessousde
laquelle seules les exigences de la santé, de la salubrité publique, de la sécurité civile, de
l'alimentationeneaupotableetlesbesoinsdesmilieuxnaturelspeuventêtresatisfaits.
Les Sagepeuvent, en fonction des enjeux identifiés localement, complétés le réseau de points
nodauxduSdage,audroitdesquelslesvaleursdesDOE,DSAetDCRs'appliquent.
Rappelréglementaire :
L?applicationdelaréglementationexistanteconstitueunprérequisessentielduPlagepomi
20142019.Entreautres,ilestrappelélaréglementationsuivante:
L'articleL.21418duCodedel'environnementprévoitdanssonpremieralinéaquetoutouvrageà
construire dans le lit d'un cours d'eau comporte des dispositifs maintenant dans ce lit un débit
minimal (dit débit minimal biologique) garantissant en permanence la vie, la circulation et la
reproductiondesespècesvivantdansleseauxaumomentdel'installationdel'ouvrageainsique,le
caséchéant,desdispositifsempêchantlapénétrationdupoissondanslescanauxd'amenéeetde
fuite.
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Illustration42:Zonesderépartitiondeseauxdanslebassin
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DispositionP3A: Lagestionéquilibréede la ressourceeneautient comptedesbesoins
vitauxdespoissonsmigrateursamphihalins,enétiagecommeencrue.
Cettedispositionrecommande,surlabasedesétudesdedébitsminimauxbiologiques(DMB)qui
intègrent les besoins des poissons amphihalins quandelles sont réalisées, que les DOEsoient
cohérentsaveclesDMB.
En complément, un enjeu existe sur la gestion de la ressource en eau dans les zones de
développementoudegrossissementdespoissonsmigrateursamphihalins,danslesbassinsversants
descoursd'eaunécessitantlaprotectioncomplètedespoissonsmigrateursamphihalins.Dansles
zones classées enZREsur ces territoires, il est recommandéque les études dedéfinition des
volumesprélevables intègrent lesbesoinsdespoissons migrateursamphihalins. Sont doncainsi
particulièrement visés par ce point les sousbassins versants fréquentés par des populations
sauvagesdepoissonsmigrateursamphihalinssuivants:
? lebassinduCher,enamontdeChâtressurCheretenavaldubarrageduPrat;
? lebassinduClain;
? lebassinduLay;
? lebassindelaSèvreniortaise.
Par ailleurs, les périodes de débits soutenus sont favorables aux migrations des poissons
amphihalins,enlimitantentreautresl'échauffementdesmassesd'eau.Ilestainsirecommandédans
lescoursd'eaunécessitantlaprotectioncomplètedespoissonsmigrateursamphihalinsdemaintenir
unécoulementsuffisantencrue,afinquelesconditionsdemigrationsnesoientpasaltérées.Cette
recommandations'appliquesurunemassed'eauauxpériodespropicesauxmigrationsdesespèces
de poissons migrateurs amphihalins présentes dans cette masse d'eau. Elle pourra conduire à
réfléchir à l?identification dedébits critiquesmigratoires, devant être respectés lors des périodes
migratoires et dont le franchissement à la baisse ne pourrait reposer que sur des conditions
naturelles.
DispositionP3B:Lacroissancedesdébitsréservésestrecherchéepourlesouvragessitués
sur un mêmecours d'eau, de l'amont vers l'aval. Ces débits cherchent à respecter et à
s'adapterauxbesoinsdespoissonsmigrateursamphihalins.
Lamiseenoeuvredecettedispositionpeuts?appuyersurl?identificationd?undébitcritiquemigratoire
àl?échelled?uncoursd?eau.
Les espèces de poissons migrateurs amphihalins à prendre en compte dans ces études
correspondentpartronçondecoursd'eauauxespècesciblesduclassementenliste2arrêté le
10juillet2012autitredel'articleL.21417duCodedel'environnement.
4.5.4 OrientationP4:Préserverdeseffectifssuffisantspourpermettrele
renouvellementnaturelautonomedespopulationsetunepêchedurabledeces
espèces.
Lapêchedesespècesamphihalinesconcernelespêcheursamateurs(auxlignes,auxenginsouaux
filets),dontl'effortdepêcheestàmieuxapprécier,etlespêcheursprofessionnels.Lesprincipales
espècesdepoissonsmigrateursamphihalinscibléessurlebassindelaLoire,laSèvreniortaiseet
lescôtiersvendéenssont:
? l'anguilleeuropéenne;
? lagrandealoseetl'alosefeinte;
? lalamproiemarineetlalamproiefluviatile.
Lebraconnagerestepratiquétoutaulongdel?annéesurlesanguilles,notammentlescivelles,etle
saumon,malgrél'interdictiongénéraledesapêche.
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Danslecontextedudéveloppementdurable, il devient nécessairedeconcilier l'activitédepêche
aveclapréservationdupatrimoinepiscicole.Lemaintiendelapêcheprofessionnelleetdelapêche
deloisirdesespècesmigratricesnedoitdoncpasremettreencausel'équilibredesécosystèmeset
lapérennitéàlongtermedesstocksdepoissonsmigrateursamphihalins.
Rappelsréglementaires
L?applicationdelaréglementationexistanteconstitueunprérequisessentielduPlagepomi
20142019.Entreautres,ilestrappelélaréglementationsuivante:
Lapêchedesespècesdepoissonsmigrateursamphihalins répondà la réglementationgénérale
définie par le Code de l'environnement, rappelée au paragraphe 2.1.4 : dates de pêche, taille
minimaledecaptures,réservesdepêche,réglementationdelapêcheàproximitédesouvrages.
La pêche des migrateurs en zone maritime est conditionnée à la détention d'une licence de la
commission milieux estuariens et amphihalins (CMEA) du comité national des pêches maritimes et
des élevages marins (CNPMEM).
Il est rappelé au paragraphe 2.1.4 l'interdiction de pêcher dans les dispositifs assurant la circulation
des poissons, dans les pertuis, vannages et passages d'eau à l'intérieur des bâtiments. La pêche est
également limitée depuis les barrages et écluses.
Les dispositions réglementaires encadrant la pêche de l?anguille sont maintenant définies dans le
cadre du plan anguille pris en application du règlement européen n°1100/2007 visant la reconstitution
du stock d'anguille.
DispositionP4A:Comptetenudeseffectifsconstatés,laconservationdespopulationsde
poissonsmigrateursamphihalinsfaitl'objetdemesuresd'interdictionouderestrictiondela
pêche.
Cettedispositions'inscrit dans lacontinuitédes interdictionsdepêcheeneaudouceétabliesou
reconduitesdanslePlagepomi20092013.
Comptetenudel'étatdespopulations,lesinterdictionstotalesdepêchedusaumonetdela
truitedemersontmaintenuesdansl'ensembleduterritoireduCogepomi,ainsiqu'enzone
maritimedanslazonedesdouzemilles.Lesinterdictionsdepêchedesalosesdanslebassin
delaSèvreniortaiseetdes lamproiesdanslesbassinsde laSèvreniortaise, de laLoire
bourguignonneetdelaMainesontégalementmaintenues.
Pour renforcer la cohérence des réglementations entre les domaines fluvial et maritime, des
restrictionsdepêcheeneauxsaléesdanslesestuairessontreconduites.
Enparticulier,lesquantitésdetimbresfiletspourlapêchedesalosesetdeslamproiesdansl'estuaire
delaLoireetenVendéesontplafonnées,auplusaunombreplafonddéfinientre2009et2013,soit
36unitésparespècedansl'estuairedelaLoire,et36unitésparespèceenVendée.
Pourl?anguille,lePlagepomipeutcompléterlaréglementationnationaleenvigueur,enparticulierpar
ladéfinitiondesmodalitésd'attributiondeslicencesdepêchedelacivelle.
Enfin,pouroptimiserl'applicationdecettedisposition,untravaildeprécisiondeslimitesdesaluredes
eauxseraengagédanslesestuairesduterritoireduCogepomioùcettelimiterestenondéfinie.
Disposition P4B: L'exercice de la pêche s'adapte au cycle biologique des espèces de
poissonsmigrateursamphihalins.
Lespériodesdemigrationetdereproductionconstituentdesphasesessentiellesdelavieeneau
douce des poissons migrateurs amphihalins. L'état des populations de poissons migrateurs
amphihalins devra être plus précisément caractérisé (données de captures, d'observation aux
stationsdecomptage...)(dispositionC3A).
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En fonction de cet état, des analyses multithématiques pourront envisager les conditions de
modificationdelaréglementationactuelledelapêchefixéeparladispositionP4A. Cesanalyses
intégreront aminimaunvolet technique, qui veillera àexaminer lesmodalités de gestionet de
contrôlede l'activité depêche, unvolet social et unvolet économique (tourisme, loisirs...). Leur
réalisationestconditionnéeàuneconcertationlargeaveclesacteurslocauxetassocieleCogepomi.
Laréglementationdelapêchedusaumonest,entreautres,viséeparcettedémarche.Auregardde
l?objectifduPlagepomi,touteéventuelleréouverturepartielledelapêchedusaumonnedevrapas
remettreencauselaviabilitédelapopulationsauvage.
Al?inverse,suiteàcesconcertationsetenfonctiondesniveauxdeseffectifs,afindepréserverune
pêchedurabledesespèces amphihalines, desactionsd'encadrement de l'exercicede la pêche,
pourrontêtreenvisagées.CesactionsserontcomplémentairesauxmesuresdeladispositionP4Aet
auxactionsdepréservationetderestaurationdeshabitatsliéesàlamiseenoeuvredesorientations
P1,P2,R1etR2.Ellespourrontportersurlamiseenplacederéservesdepêche,parexempleà
proximitédesouvragestransversaux,surdespériodesderelèvedesenginsoudesfiletssurles
zonesdereproductionconnuesoulesprincipauxaxesdemigrationsurunepartiedelapériodede
migrationactive,surdesmaillesminimales...
Lesconcertationssurdetellesactionsd?encadrementporteront,entreautressurlesaloses,dont
l'état de la population semble préoccupant au vu des effectifs comptés et des déclarations de
capturesparpêche.
DispositionP4C:Pourlacohérencedel'actionduPlagepomisurl'exercicedelapêche,la
coordinationinterservicesdanslaluttecontrelebraconnageestmaintenue.
Leseffortsdecontrôlepourluttercontrelebraconnagesetraduisentpardescontrôlesspécifiques
lorsdespériodesdemigrationsactivesoudephasedereposdespoissonsmigrateursamphihalins
endomainesfluvialetmaritime.Unevigilanceporteradansl?établissementdesplansdecontrôlessur
lesouvragescontrôlantl?accèsàd?importantessurfacesd?habitats,parexemplelesouvrageslistés
danslesmesuresdeladispositionR1C.
Laconnaissanceduterrain,parexempleissuedurôledeveilleenvironnementalequ?exercentles
pêcheurs,serautilementvaloriséeafind?optimiserlesopérationsdecontrôle.
Ces contrôles sont susceptibles d'être diligentés tout au long de l'année, quelle que soit la
réglementationdelapêchedel'espèceconcernée.
En accompagnement de cet effort de contrôle, une réflexion pourra conduire à une mise en
cohérencesurcertainssecteursdelaréglementationdelapêchedescarnassiersaveclaprésence
despoissonsmigrateursamphihalins,afinderéduirelesrisquesdecapturesaccidentelles.
DispositionP4D: Lesactivitésdanslescoursd?eau tiennent comptede laprésencedes
espècesdepoissonsmigrateurs.
Afin de préserver la reproduction, le développement et les migrations des poissons migrateurs
amphihalins,lesactivitésencoursd'eauveillentàéviterouréduireledérangementdespopulations.
Defait,cettedispositionconcerneentreautreslesdéversementsdepoissonsholobiotiques,lapêche
etlespratiquessportives.
Ilconvientdelimiterleurimpactsurlespopulationsdepoissonsmigrateurs,cequipassepar:
? l'intérêtdudéveloppementdesynergiesentrelePlagepomietlesplansdépartementauxpour
laprotectiondumilieuaquatiqueetlagestionpiscicole(PDPG)auniveaudépartemental;
? l'évaluationdesincidencesensiteNatura2000.
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DispositionP4E : Lesanimauxexotiquesenvahissantspeuvent, encasd?impact sur les
effectifsdepoissonsmigrateursamphihalins,fairel?objetdemesuresderégulation.
Cettedispositionneconcernepaslesespècesprotégées,commelecormoran(Phalacrocoraxcarbo
sinensis)quipeuventfairel?objetd?unerégulationparautorisationdetirsdeprélèvement.
Elle portespécifiquement sur lesespèces, essentiellement dans le cortègepiscicole, et dont la
croissancedeseffectifsexerceunepressionsusceptibledemenacerleséquilibresdespeuplements
enplace,etainsidecompromettrel?atteintedel?objectif deviabilitédespopulationsdepoissons
migrateursamphihalins.
Aprèsdémonstrationdeleurpressionsurlespopulationsdepoissonsmigrateursamphihalins(surla
base,entreautres,desconnaissancesacquisesdanslecadredeladispositionC1E),cesespèces
animalesenvahissantespeuventfairel?objetdemesuresderégulation.
4.6 OFR:Reconquérirleshabitatsfavorablesauxespèces
amphihalinesetrestaurerlespopulations
4.6.1 OrientationR1:Restaurerlescircuitsdemigrationsentrel'océanetleszones
d'habitatsproductifs.
Comptetenudesévolutions,encorepeuconnuesetdifficilementmaîtrisablesactuellement,de la
phasedeviemarinedespoissonsmigrateursamphihalins,ilconvientdefaciliteraumaximumles
migrationsdespoissonsdanslescorridorsfluviauxaucoursdeleurphasedeviedulçaquicole,en
prioritédanslesbassinsversantsmodérémentanthropisés,lescoursd'eauclassésenliste2autitre
del'articleL.21417ducodedel'environnementpour lespoissonsmigrateursamphihalinset les
coursd?eaudelazoned?actionsprioritairespourl?anguille.
Larestaurationdelalibrecirculationmigratoiredoitêtrepenséeàl'échelled'uncoursd'eau,dans
une logique d'axe qui tienne compte des impacts cumulés des ouvrages de franchissements
successifs,àlamontaisonetàladévalaison.
Lesobligationsderésultatsquiaccompagnentcetteorientationjustifientlamobilisationdemoyensde
contrôledurétablissementdelalibrecirculation.
Cetteorientations'articuleavecl'orientationfondamentale9duSdageLoireBretagne20102015qui
portesurlaréouverturedescoursd'eauauxpoissonsmigrateurs.
Elles'appuieégalementsurladisposition1B1duSdageLoireBretagne20102015quiprévoitque
lesSagecomprennentunobjectifdatéetchiffrépourlavaleurdutauxd'étagementducoursd'eau,
définicommelerapportentrelasommedeshauteursdechutesartificiellescrééesenétiageparles
obstaclestransversauxetledénivelénaturelducoursd'eau.
Rappelréglementaire :
L?applicationdelaréglementationexistanteconstitueunprérequisessentielduPlagepomi
20142019.Entreautres,ilestrappelélaréglementationsuivante:
Lescoursd'eauclassésenliste2autitredel'articleL.21417duCodedel'environnementdoivent
faire l'objet d'interventions permettant le transport suffisant des sédiments et la circulation des
poissonsmigrateurs(cf.paragraphe3.3.1).
Lamiseenconformitédesouvrages,leurgestionetleurentretienfontl'objetdecontrôlesplanifiés
danslesplansdecontrôledesMISEN.
Ilestrappeléquelestravaux,parexemplelaconstructiond'unepasseàpoissons,fontl'objetde
procèsverbauxderéception,cequicontribueàgarantirlaconformitédesaménagementsavecle
projetautorisé.
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Entermesderestaurationdelacontinuitéécologiqueetdegestiondesouvrages,lesSagepeuvent
établir un inventaire des ouvrages hydrauliques susceptibles de perturber de façon notable les
milieux aquatiques. Parmi cet inventaire, ils peuvent identifier dans leur règlement les ouvrages
hydrauliques fonctionnant au fil de l'eau, qui, sauf raisons d'intérêt général, sont soumis à des
obligations d'ouvertures régulières de leurs vannages (article L.212-5-1 du Code de l'environnement).
Disposition R1A: Les interventions sur les ouvrages aux fins de rétablissement de la
continuitéécologiquerépondentauxprioritésd'interventionssuivantes:
1) effacement;
2) arasementpartieletaménagementd'ouvertures,petitsseuilsdesubstitutionfranchissables
parconception;
3) ouverturedebarragesettransparencepargestiond'ouvrages;
4) aménagement de dispositif de franchissement ou de rivière de contournement avec
obligationd'entretienpermanentetdefonctionnementàlongterme.
Cettedispositiontrouveunrelaisavecladisposition9BduSdageLoireBretagne20102015.Sa
reconduitedansleSdage20162021devraêtrerecherchée.
A défaut de solutions alternatives, l'équipement d'un ouvrage par un dispositif de
franchissementestétudié.Laconceptiondesouvragesdefranchissementrecherche:
? leuradéquationauxespècesciblesdevantêtreprisesencompte,avecuneefficacitéattendue
suffisante;
? desfranchissementsaveczéroretardàlamontaisonetàladévalaison;
? l'entretien (retrait des embâcles, maintien du débit d?alimentation prescrit dans le règlement
d?eau) le moins important à efficacité suffisante afin de faciliter l'atteinte de l'objectif de
fonctionnalitépérennedesdispositifsdefranchissement;
Le projet s'accompagnede la mise enoeuvre par le propriétairedu suivi du fonctionnement du
dispositifdefranchissement,ainsiquedesonentretienafind?assurerunefonctionnalitépérenne.
Laconformitédelaconceptiondesouvragesdefranchissementauxobligationsréglementairesetà
cettedispositionestvérifiée,etconditionneleversementdesaidespubliquespourlaréalisationdes
aménagements.
DispositionR1B:Ledéveloppementd'unevisionprospectiveparcoursd'eauestrecherché,
afindepermettrelapropositionàl'échelledechaqueouvraged'uneinterventionquiprenne
encomptel'impactcumulédutraitementpourlamontaisonetladévalaisondel'ensembledes
ouvragessituéssurlecoursd'eau.
Cette disposition recommande le développement de logiques d'axe afin de réduire les impacts
cumulés des différents ouvrages sur la circulation piscicole, allant de pair avec les objectifs de
réductiondestauxd'étagement.
Ledéveloppementd'étudesàl'échelledescoursd'eauestàencouragerdanslecadredelamiseen
oeuvredesSage,voireeninterSageaucasoùplusieursSageexisteraientsurunmêmecoursd?eau,
enparticulier sur lesbassinsversantsoùsont présentesdespopulationssauvagesdepoissons
migrateursamphihalins:Allieretsesprincipauxaffluents,Cher,Creuse,Gartempe,Loir,Mayenne,
Sarthe,Sèvreniortaise,Vienne,Loire et ses affluents et notamment la Loire Bourguignonne et ses
affluents.
Cesétudes permettent aussi d'intervenir en priorité sur les ouvrages les plus difficiles pour les
migrations,enveillantàl'accessibilitéàl'ouvragedepuisl'avaldubassinversant.Ellespeuventainsi
utilementparticiperàlaconstructiondesprogrammesd'actionspourlarestaurationdelacontinuité
écologique que doivent prévoir les Sage, en application de la disposition 1B1 du Sdage
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LoireBretagne20102015.
Pourlescoursd'eauàmigrateursdubassindelaLoireetnoncouvertspardesSage,larecherche
demaîtrised'ouvragesetdefinancementsestsoutenuedanslecadreduPlagepomi.
La mise enoeuvre des logiques d'axe doit aussi s'accompagner de l'établissement d'indicateurs
permettantdesuivrelaréalisationduprogrammed'actionsetdefaireétatdesprogrèsobtenus,en
termesderéductiondel?étagementetdufractionnementdesmilieuxaquatiques,parexempleen
caractérisant l?impact des ouvrages sur les habitats (disposition C1B) ou sur les migrations
(dispositionC2C).
LeCogepomiencouragel'intégrationdecettedispositiondansleSdageLoireBretagne20162021.
DispositionR1C:Lamiseenoeuvreduclassementenliste2parl'arrêtédu10juillet2012,
conduitleCogepomiàporteruneattentionparticulièresurcertainsouvrages.
Lesouvragesconcernés,listésdansletableaudemesures,sontnotammentceuxquisontconsidérés
aujourd'huicommedifficilementfranchissablesetquisontsituésàl'exutoiredesousbassinsversants
ouderéseauxdemaraisoùsetrouventdeszonesdereproductionoudecroissancedespoissons
migrateursamphihalins.
Lamiseenoeuvredesobligationsréglementairesvisàvisdutransitsédimentaireetdelacirculation
piscicole(facilitationourétablissementdel'accèsauxzonessituéesenamont)surcesouvragesest
susceptibled'entraînerlesgainslesplusimportantsentermesdeproductivitépourlespopulationsde
poissonsamphihalinsetceàl'échelledel'ensembledubassin.
L'exercicede la policede l'eau tient comptedecettevigilanceparticulière, après informationdes
servicesquienontlachargeparleCogepomi.Unsuiviannueldel'avancementdesopérationssurles
ouvragesconcernésesteffectuéparleCogepomi.
DispositionR1D:Lagestionhydrauliqueglobaleàl'échelledescoursd'eaudesouvrages
transversauxetdesouvragesdeconnexionsentrecoursd'eauetzonesdemaraisestadaptée
afindetenircomptedescyclesbiologiquesdespoissonsmigrateursamphihalins.
Cette disposition à portée de recommandation vise à améliorer la gestion pour aider au
franchissementdesouvrages(arrêtsdeturbinage,ouverturesdevannes...).
Lesmanoeuvresd'ouvragespouvantêtreutilesàlacréationd'attraitspourlesmigrationsciblentles
périodesdemigrationactivedespoissonsamphihalinsprésents,préciséesendispositionP1C.
Danslecasdesouvragescôtiersetestuariens(soumisàlamarée),ces manoeuvres spécifiques
peuvent être mises en oeuvre pour permettre leur franchissement par les poissons migrateurs,
notamment lescivellesenphaseprécocedurecrutementoù leurprogressiondans lesestuaires
s'effectueparmigrationportée.
Par ailleurs, lesmanoeuvres desouvragessont favorablesaumaintienouà la restaurationdes
connexions entre cours d'eau et zones humides et favorisent la reconquête d'une mosaïque
fonctionnelled'habitats.
Cesmanoeuvresdoiventêtreadaptéesàlaconfigurationdel'ouvrage,sasituationetauxcontraintes
liées aux usages existants sur cet ouvrage. Elles peuvent être programmées en complément
d'aménagements«passifs»telsquel'ouverturedevantelles,d'échancruresoulaposedecalessur
lesélémentsmobilesdel'ouvragependantlapériodedemigration,afind'éviterl'accumulationdes
civellesenavaldel'ouvrage,oùellessontsurexposéesàlapêcheetàlaprédation.
Dans le cas particulier des ouvrages à usage hydroélectrique, une gestion des turbines peut
contribuer à réduire leur impact sur lespoissonsamphihalins lors despériodesdemigrationde
dévalaison.Desarrêtstemporairesdesturbineshydroélectriquespeuventainsiêtreprogrammés,de
manière synchronisée à l'échelle d'un axe migratoire, afin de limiter les mortalités directes et
indirectes liées au franchissement des turbines par les poissons migrateurs, en fonction de la
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configurationdel'ouvrageetdesonmoded'exploitation.
L'applicationdecettedispositioninviteàintégrerlesmodalitésdegestiondesouvragesdansles
règlements d'eau, éventuellement au terme d'une phase d'expérimentation des dispositifs de
franchissementsurplusieurssaisonsdemigration.
Lamiseenoeuvredecettedispositionpeuts'inscriredanslecadredes«logiquesd'axe»,dontle
développementestencouragéparladispositionR1B.
Disposition R1E: La gestion des écoulements se rapproche le plus possible du
fonctionnement naturel des bassins versants et des cours d'eau, afin de restaurer les
variabilités du régime hydrologique et de ne pas compromettre la reproduction, le
développementdesjuvénilesetlesmigrationsdespoissonsmigrateursamphihalins.
Lesvariationsdel'hydrologie,entreautreslesmontéesrapidesdedébit,sontunesourcedestimulià
mêmededéclencherdesmouvementsdemigrationsàlamontaison(entréeenestuaire,reprisede
migrationaprèsl'arrêtmigratoireestivalpourlesaumon)etàladévalaison(observationdespicsde
migrationdesanguillesargentéesetdessmoltslorsdespériodesdecruehivernaleouprintanière).
Une gestion rapprochée du régime naturel permet aussi de faciliter la circulation des crues
morphogènes,profitablesàunrenouvellementdeshabitats.
Cettedispositions'articuleavecladispositionP2Cquiportesurlemaintiendutransitsédimentaire,
afinquelagestiondesouvragessoitcompatiblelepluspossibleaveclescyclesbiologiquesdes
poissonsmigrateursamphihalins.Ellecomportedeuxvolets:
? l?un,surlesmanoeuvresdegestiondesouvrageshydrauliques;
? l?autre,surlagestiondesplansd?eau,susceptiblesd?affecterl?hydrologienaturelle.
Surlepremiervolet,ilconvientquelesmanoeuvresdegestiondesouvrageshydrauliquesévitentles
réductionsnonnaturellesdedébitsusceptiblesdeprovoquerunebaissesignificativedeshauteurs
d'eauenpériodedereproduction,afindeprévenirlesexondationsdenids.
Pourlesouvragesoùdesécluséessontpossibles,lesrèglementspeuventpréciserlesconditions
éventuellesdelimitationdeseffetsdesécluséesenpériodedereproductionetd'incubationdesoeufs.
Surlesecondvolet,ilconvientderechercherunegestionlaplusnaturellepossibledesouvragesà
vocationdesoutiend'étiagedansunelogiquederecherched'unfonctionnementhydrologiquequisoit
lemoinsartificialisépossible.Ensubstance,ils?agitderéduirel?impactduremplissagedesréserves
enpériodedemigrationactive.Celaserarecherchédanslalimitedurespectdesobjectifsassignésà
cesouvrages.
Aussi, et compte tenu de l?interception des écoulements gravitaires par les plans d?eau, cette
disposition invite à étudier un renforcement des modalités d?encadrement et de limitation de la
créationdenouveauxplansd?eaudansleSdageLoireBretagne20102015,enparticulierdansles
bassins versants des cours d?eau nécessitant la protection complète des poissons migrateurs
amphihalinsoùladensitédeplansd?eauestdéjàimportante.
4.6.2 OrientationR2:Reconquérirdeshabitatsfavorablesdansl'airederépartition
connuedesespècesamphihalines.
Lesmesuresderestaurationdelacontinuitéécologiquebénéficientauxhabitats,entreautresparla
restaurationdeladynamiquesédimentaire.
Ellesnesauraientcependantêtresuffisantes;desmesuresspécifiquesderestaurationdeshabitats
dereproductionetdedéveloppementdesjuvénilessontproposéesdanscetteorientationR2.
L'orientationR2seretrouvedansplusieursdispositionsduSdageLoireBretagne20102015.Eneffet,
sa disposition 1B1 prévoit que les Sage établissent un plan d'actions identifiant les mesures
nécessairesàlarestaurationdelacontinuitéécologique.Parextension,larestaurationdelaqualité
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physique et fonctionnelle des cours d'eau suppose d'intervenir dans tous les domaines qui
conditionnentl'habitatdesespècesvivantdanslesrivières.Ladisposition8A2prévoitaussiqueles
Sageouàdéfaut lespréfets identifientlesprincipesd'actionsàmettreenoeuvrepourassurerla
préservationetlagestiondeszoneshumides.
DispositionR2A:Aprèsconcertationlocale,lesdocumentsdeplanificationpeuventdéfinir
des objectifs spécifiques de qualité des eaux sur les secteurs de reproduction et de
développementdesjuvénilesdespoissonsmigrateursamphihalins.
L?incubationdesoeufsetlaviedestaconssontdesétapesessentiellesducycledeviedusaumon.
Afindetenircomptedeleursexigencesspécifiques,uneexigenceparticulièredequalitédeseaux
peut voir le jour dans les bassins versants où se trouvent des zones de reproduction et de
développementdesjuvéniles.
CettedispositionàvaleurderecommandationconcerneenparticulierlesaumondeLoireAllier.
Cette recommandation accompagne ainsi l'enjeu de conservation des populations de poissons
migrateursamphihalinsetcomplète ladispositionP2A.Elleavocationàêtredéclinéedansdes
sousbassinsversantsprécis,enfonctiondel?enjeuexistantpourlesespècesamphihalinesetdes
concertationsmenéesaveclesCLE,danslecadredeladispositionG2A.
Lesobjectifsdequalitéspécifiques,quiseraientdéfinisàl'échellelocaleetenconcertation,pourront
visernotammentlesparamètresd'oxygénation(oxygènedissous,demandebiologiqueenoxygène)
et lesnutriments(ammonium,orthophosphates)etleurpropositions'appuierasurlesexpériences
étrangèresetlesconnaissancesscientifiques.
Disposition R2B: Les bassins versants, où se situent des zones de reproduction et de
croissance d'espèces de poissons migrateurs amphihalins, font l'objet d'opérations de
restaurationdel'hydromorphologie,lorsquecelleciestaltérée.
Lesopérationssontproposées,conformémentà l'orientation1B1duSdageLoireBretagne2010
2015àl'échellecohérented'unbassinversantdanslecadred'unSagequandilexisteetcontribuent
aupland'actionsduSageenfaveurdelarestaurationdel'hydromorphologie.
Pourlamiseenoeuvredecettedisposition,ilestrecommandédansunpremiertempsnotammentla
réalisationdesopérationssuivantes,comptetenudeleurintérêtpourlaremobilisationsédimentaire,
sousréservedescontraintesdesécurité,desalubritépubliqueetderespectdesusages:
? l'effacementdesobstaclesàl'écoulement;
? l'arrêtdelaprotectiondebergespardestechniquesautresquevégétales;
? laluttecontrel'ensablementetlecolmatage,tellequelaréductiondupiétinementdesbergespar
lebétailoudel'abreuvementdirectementdanslecoursd'eau.
Cette disposition est susceptible de concerner notamment les têtes debassins versants dans le
bassindel'Allier,lesbassinsdelaVienneetdelaCreuse,ainsiquelesbassinsversantsdelafaçade
atlantique(côtiersvendéens,LoireavaletSèvreniortaise),oùsetrouventlesmaraisrétrolittoraux,et
laLoiremoyenneoùsetrouventdenombreusesannexeshydrauliques.
Enzonedemarais,larestaurationdel'hydromorphologiepourrapasserpardesopérationsd'entretien
desétiersetdesfossés.
Dans un second temps, cette disposition pourra se traduire par la possibilité d'interrompre toute
protectiondebergesdansl'optiquedemaintenirunespacedemobilitésuffisantpourlecoursd'eausi
cedernierestuneconditiondel'atteintedubonétat.
En parallèle, une réflexion pourra s?ouvrir sur la prise en compte de la présence de poissons
migrateursamphihalins(zonesdenurserieetdenourricerie)dansladéfinitiondesplansdedragage
enzoneestuarienneetmaritime.
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LeCogepomiencouragelareprisedecettedispositiondansleSdage20162021afindefavoriserla
restaurationdespopulationsdepoissonsmigrateursamphihalins.
4.6.3 OrientationR3:Accompagnerlareconquêted?habitatsproductifset
accessiblespardesopérationsdesoutientemporaired?effectifenjuvéniles
L'originalitéécobiologiquedespopulationsdepoissonsmigrateursamphihalinsrendessentiell'intérêt
depréserverlespopulationsenplaceetd'éviterleurextinctionpardesopérationsdesoutiendes
effectifs.Cesopérationspeuventavoirlieulorsquel'effectifnaturelestjugéinsuffisantpourassurerla
viabilitépérennedespopulationssauvagesetqu'iln'existepasd'incompatibilitétechniqueàleurmise
enoeuvre.
L?objectif du soutien d?effectif est d?intervenir en accompagnement temporaire d?opérations de
restaurationdeshabitatsproductifsetdeleuraccessibilitémigratoireafindepermettredesoutenirla
population sauvage résiduelle (logique de conservation) jusqu?à son niveau de viabilité ou de
participer à l?implantation d?une population sauvage sur un sousbassin versant (logique de
réintroduction).
Il est important deveiller àcequeles individusdéversésdans lecadred'opérationsdesoutien
d'effectifcontribuentàlareproductionenmilieunaturellorsducyclesuivantetqueleurdescendance
soitenmesuredefairedemême.
DanslesbassinsdelaLoire,delaSèvreniortaiseetdescôtiersvendéens,desopérationsdesoutien
d'effectifontlieupourlesaumondepuislesannées1970etpourlacivelledepuis2010.
Lesoutiend'effectifenjuvénilesdesaumonsafaitl'objetd'unrenforcementaudébutdesannées
2000,décidéparleministèreenchargedel'environnementle13juillet1994,ets'esttraduitparla
miseenservicedelasalmonicultureduHautAllier,leConservatoirenationaldusaumonsauvage.
Cettedécisionreposaitsurleconstatderisqued'extinctionélevédelapopulationsauvagesuiteà
quatreannéesconsécutivesdesécheresse,de1989à1993,aucoursdesquellesl'effectifannuelde
saumonsn'étaitqued'unecentained'individusdansl'Allier.
Lacivellefaitl'objetdepuis2010,danslecadreduPGA,d'unprogrammeexpérimentaldesoutien
d'effectif.Eneffet,laFranceadécidélamiseenplaceàtitreexpérimentald'opérationsdetransfert
decivellesdanslesdifférentsbassinshydrographiques.Cesopérationssontmisesenoeuvresous
l'égideduministèreenchargedel'écologie.Ellesportentsur5à10%desanguillespêchéesen
France.Pourl'unitédegestiondel'anguilleLoire,côtiersvendéensetSèvreniortaise,desopérations
sont réalisées depuis la saison de pêche 20102011 sur plusieurs cours d'eau et marais,
principalementenLoireAtlantiqueetenVendée.
Les dispositions d'évaluation des opérations de soutien d'effectif sont traitées dans l'orientation
fondamentalerelativeàlaconnaissance(OFC).
Ausujetdesopérationsdesoutiend'effectif, leSdageLoireBretagne20102015préciseparses
dispositions 9C1, 9C3 et 9C4 que les opérations de soutien d'effectif relatives aux poissons
migrateursamphihalinssont réaliséesconformémentauPlagepomi. Il indiqueégalementque les
massesd'eauentrèsbonétatnedoiventfairel'objetd'aucuneopérationdesoutiend'effectifetque
les masses d'eau en bon état ne peuvent accueillir une opération de soutien d'effectif que si
l'opérationneconduitpasàunedétériorationdel'étatdelamassed'eauouàuneremiseencause
del'objectiffixépourcettemassed'eau.
Disposition R3-A : Les programmes de soutien d?effectif intègrent les recommandations
scientifiques connues ou pouvant être émises lors de la mise en oeuvre du Plagepomi, et
s'appuient sur le maintien et l'amélioration des connaissances zootechniques.
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Les recommandations à prendre en compte pour les opérations de soutien d'effectif (saumon,
civelles...) sont issues notamment des travaux de groupes d'experts scientifiques, nationaux et
internationaux(commeleConseilscientifiquedusaumondeLoireAllier),etsonttraduitesdansles
documentsdecadragedesopérationsdesoutiend'effectif.Ellesconcernententreautreslaconduite
d'élevageetl'évaluationdesopérations,avecenparticulierdesexigencesenmatièrede:
? originedesgéniteurscontribuantàlaproductiondejuvéniles;
? élevage,afindeserapprocherdesconditionsnaturelles;
? priorité d'élevage: par exemple, l'intérêt biologique supérieur des stades de développement
précoces(oeufs,alevins)pourlesopérationsdesoutiend'effectifenjuvénilesdesaumon;
? stratégie,appropriéeàchaquebassinversant;
? évaluation des opérations, afin de qualifier leur contribution à la restauration des effectifs:
traçabilitédesjuvénilesparmarquagephysiqueouparanalysegénétique.
L'ensembledesrecommandationsscientifiquesconnuesàl'adoptionduPlagepomi20142019sont
respectées et des adaptations seront prévues dans sa mise en oeuvre en cas de nouvelles
recommandationsscientifiques,sousréservedefaisabilitétechniqueàcoûtraisonnable.
Lamiseenoeuvreopérationnelledecesrecommandationsveilleàtenircomptedel'évolutiondes
connaissanceszootechniques, qui profite de l'amélioration des connaissancessur la biologie des
poissonsmigrateursamphihalins(dispositionC2B).
Disposition R3B: Les programmes de soutien d?effectif respectent la logique de
nondégradation du milieu aquatique (capacités des habitats, interactions avec les
populationspiscicolesenplace?).
Lesprogrammesdesoutiend'effectifdetouteespèceamphihaline(civelles,saumon...)s'inscrivent
dansleprincipedenondégradationdumilieuaquatique.
Enparticulier, ilstiennentcomptedescapacitésd?accueildeshabitatsetdesinteractionsavecla
populationsauvageetlesautrespopulationspiscicolesprésentesdanslescoursd?eau.
Entreautres,il estnécessairedelimiterl'impactdusoutiend'effectifsurlareproductionnaturelle.
Ainsi,encequiconcernelesaumon,lesopérationsdesoutiend'effectifnedoiventpassaturerles
habitatshébergeantdesfrayèresnaturelles, etdeszonesrefuges,sanssoutiend'effectif dansle
cadredesprogrammesrépondantàl?orientationR3,peuventêtremisesenplace.Encomplémentde
lazonerefugeexistantedepuis2009dansleHautAllier,denouvelleszonesrefugesnepeuventêtre
délimitées quesi le linéaire de cours d'eauconcernépar leur emprise cumule les trois critères
suivants:
? uneaccessibilitéavecunretard,dûaufranchissementdesobstaclesàl'écoulement,inexistantou
limitéàlamontaison;
? dessurfacessuffisantesd'habitatsproductifs;
? l'absenced'obstaclesmajeursàladévalaisonversl'océan.
Leprogrammedesoutiend'effectif encivelles respecte, au droit dessites dedéversement, les
densitésmaximalesdedéversementprévuesdanslecadreduprogrammenationalderepeuplement.
Leprogrammedesoutiend'effectif ensaumondistingueledéversementdejuvénilesàdifférents
stadesdedéveloppement:
? lestadesmoltest,auvudelalittératurescientifiqueetdesélémentsd?évaluationdisponibles,le
stadeprésentantlemoindreintérêtbiologiquepourparticiperàlaconservationdelapopulationde
saumons sauvages de LoireAllier. L?effort de soutien d?effectif en smolts doit être réduit
progressivement sur lessecteursoùdeshabitatsproductifssont suffisammentprésentsetoù
prévautl?enjeudeconservationdelapopulationdesaumonssauvages(bassinsdel'Allieretdela
Loirebourguignonne).
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Lesoutiend?effectifaustadesmoltprésenteenrevancheunintérêtdanslesbiotopesdégradés,
oùleprogrammedesoutiend?effectifrépondàl?enjeuderéintroductiond?unepopulation(bassin
delaGartempe);
? les stades précoces de développement, et notamment le stade de l?alevin de printemps,
constituentlaprioritéduprogrammedesoutiend?effectifrelativementàl?enjeudeconservationde
la population de saumons sauvages (bassins de l'Allier et de la Loire bourguignonne). Sous
réservedelaconnaissancedeshabitatsproductifsetenrespectdel'ensembledel'orientationR3,
l'effortdesoutiend'effectifpourraitêtrerépartisurcertainsaffluentsdesaxesprincipaux;
? les oeufs en incubateurs constituent des expérimentations accompagnant la stratégie du
programmedesoutiend?effectifetpourlesquellesundispositifd?évaluationspécifiqueestmisen
place,afind?êtreenmesuredestatuersurleurintérêt(dispositionC4A).
Dansuneapprochepragmatique,afindepleinementvaloriserlesopérationsdesoutiend?effectif,
menéesenparallèledesopérationsprioritairesdepréservationetderestaurationdeshabitatsetde
la continuité écologique, touteopération dedéversement chercheraàoptimiser l?occupation des
habitats productifs favorables disponibles et est adaptée en fonction de la répartition de la
reproductionnaturelle et de l?évolution desconnaissances, entreautresdeshabitats(disposition
C1C).
DispositionR3C:Leprogrammedesoutiend?effectifensaumonsprivilégielaproductionde
juvénilesissusdegéniteurssauvagesetrechercheuneadaptationauxbesoinsdesoutien
annuel.
Afinderechercherunéquilibrebiologiqueentrelareproductionnaturelleetlesoutiend'effectif,sous
réservedefaisabilitétechnique,lesbesoinsdesoutiend'effectifvarierontenfonctiondusuccèsdela
reproductionnaturelle.
Schématiquement, la mise en oeuvre de cette approche dans la deuxième partie du Plagepomi
20142019pourraitconduirelesannéesoùestconstatéeunefaibleactivitédereproductionnaturelle
àuneaugmentationdel'effortdesoutiendeseffectifsetlesannéesoùestconstatéeuneforteactivité
dereproductionnaturelleàunplusfaibleeffortdesoutiend'effectif.Cetteapprocherequiertdedéfinir
les besoins préalables en termes de connaissanceet d'analyser sa faisabilité techniquedans la
mesureoùellenécessiteunecapacitéd'adaptationrapideauxobservations.Ellepourraitsetraduire
parunsoutiend'effectif quiciblerait préférentiellement leszonesd'habitat lesplusproductivesles
annéessuivantunefaiblereproductionnaturelle.
4.7 OFC:Améliorerlesconnaissancesetlesuividespopulationsdans
uncontextedechangementglobal
L'acquisitiondeconnaissancesconstitueunpilierduPlagepomi:mieuxconnaîtrelecomportementet
les habitats des populations de poissons migrateurs amphihalins permet en effet de retenir des
mesures de gestion adaptées afin de rechercher une efficacité maximale. Cette orientation
fondamentale s'inscrit en appui des deux orientations fondamentales précédentes relatives à la
préservationetàlarestaurationdeshabitatsetdeseffectifsdepoissonsmigrateursamphihalins.
Les opérations de suivi font l'objet d'échanges techniques et les protocoles font l'objet d'une
validation après concertation des partenaires concernés. Les informations acquises (donnéeset
résultatsinterprétés)sontmisesàdispositiondesgestionnairesetsontnotammentvaloriséesaux
finsd'éclairagedesprisesdedécisionsenmatièrederestaurationetdepréservationdesmilieux
aquatiques.
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4.7.1 OrientationC1:Renforcerl'évaluationetlacompréhensiondeladépendance
despoissonsmigrateursamphihalinsàleurshabitats
Laqualitédeshabitatsetleuraccessibilitésontdesfacteursexplicatifsessentielsdel'abondancedes
populationsdepoissonsmigrateursamphihalins.Aussiestilindispensabledepoursuivrelesefforts
decompréhensiondesrelationsentrelesespècesetleurshabitats,eneaudouce,enestuaireeten
mer,afind'êtreenmesuredeproposerdesmesuresdegestionquisoientlesplusadaptéesaux
contexteslocauxetd'éclairerlesorientationsfondamentalesPetRencequ'ellesconcernentles
habitatsetlescircuitsdemigrations.
Disposition C1A: Les connaissances acquises dans le cadre d?actions en faveur de
l?améliorationdesmilieux(programmedesurveillancedel?étatécologiquedeseaux,études
produites dans le cadre des Sage ou des contrats territoriaux en faveur des milieux
aquatiques?)sontexploitéesetvaloriséespourlesbesoinsduplandegestiondespoissons
migrateurs, afin d?êtreenmesuredeproposer, aubesoin, desmesuresd?évitement et de
réductiondesimpacts.
Lerassemblementdesconnaissancesacquisespardifférentsopérateurssurlaqualitédesmilieux
(suivisencontinudesdébitsettempératuresdel?eau,suivispérennesdelaqualitédeseauxparle
réseaudecontrôledesurveillance,suivisdesrejetsdestationsdetraitementdeseauxuséespar
autosurveillance?)estincontournablepourlamiseenoeuvredecettedisposition.
Enparticulier,ilconvientd?établirunbilandesconnaissancesacquisesdanslecadredel?élaboration
oudelamiseenoeuvredesSageetdescontratsterritoriauxenfaveurdesmilieuxaquatiques.
Lacapitalisationdecesinformationspermetdecaractériserl?étatdefonctionnalitédeshabitatsdes
poissonsmigrateursamphihalinsetdeproposerencasdeconstatdedégradationdesmesuresde
restauration.
Aubesoinetsousréserved'identificationdeleursbénéficesopérationnels,lafaisabilitéd'opérations
complémentairesd'étudesetdesuivisdesmilieuxdeviedespoissonsmigrateursamphihalinsest
étudiéedanslecadreduPlagepomi.
DispositionC1B:Les impacts des pollutions, des ouvrages et des plans d'eau sur le cycle de
vie des poissons migrateurs amphihalins font l'objet d'une caractérisation.
Lamiseenoeuvredecettedisposition,àl'interfaceentrelaqualitédesmilieuxaquatiquesetlecycle
deviedespoissonsmigrateursamphihalins,accompagnel'orientationR2etnotammentladisposition
R2A.
Ellesetraduitnotammentpardesopérationsinsituetexsitudesuivisdesimpactssurlasurvieetle
développement des juvéniles, et contribue à améliorer la connaissance des impacts des
perturbateursendocrinienssurlesespècesamphihalines.
Lesélémentssontportésàlaconnaissancedupublicetéclairentlesdécisionsprisesenregarddes
mesuresdesdispositionsP1B,P2CetR2A.
Disposition C1C: La connaissance qualitative et quantitative des habitats vitaux des
poissonsmigrateursamphihalinsdansleurphasedeviedulçaquicoleestactualiséepourdes
coursd'eauconnusoudécritepourdenouveauxcoursd'eau.
Cettedispositioncomprendunvoletd'approfondissementdesconnaissancesdeshabitatsdescours
d'eauoùdesétudespasséessontdisponibles.Desopérationspeuventyavoirlieudanscecadresi
des divergences sont constatées entre les observations de terrain et les études actuellement
disponibles.
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Lesétudesquipourraientêtremenéessurdescoursd'eauoutronçonsdecoursd'eaunondécrits
précisément actuellement pourront viser des secteurs de présence historique des espèces
amphihalinesoùlebonétatdesmassesd'eaupourraitjustifierunintérêtdereconquête.
Lesconnaissancesacquisesdanslecadredecettedispositionpourrontêtremobiliséesenappuides
orientations P1, P2, R1 et R2, afin de préserver les habitats favorables sur ces cours d'eau
nouvellementcaractérisésetdetravailleràlarestaurationdelacontinuitéécologiquedanscescours
d'eaupourpermettreauxpoissonsmigrateursamphihalinsdereconquérirceshabitats.
Lesétudesprospectivesquiconsistentàidentifierlesterritoiresàpotentield?accueilenamontde
verrous infranchissables peuvent accompagner les démarches de restauration des poissons
migrateurs,bienquelesterritoiresvisésparcesétudesprospectivesneconstituentpasdespriorités
de reconquêtedans le cadreducorpus réglementaire actuel (coursd'eaudeces territoiresnon
classés en liste 2 au titre de l'article L.21417 du code de l'environnement pour une espèce
amphihaline).
Toute étude menée sur un cours d'eau ou tronçon de cours d'eau non décrit précisément
actuellement intégrera un volet technique et un volet économique, afin d'évaluer le coût d'une
éventuelleopérationdereconquête.
Disposition C1D: Le changement climatique et ses effets sur l'évolution des milieux
aquatiques, lespratiquesdansles bassinsversants, l'adaptationdespoissonsmigrateurs
amphihalinsetlesmodificationséventuellesdesairesderépartitiondespoissonsmigrateurs
amphihalinsquelacombinaisondesprécédentsélémentspeutengendrerfont l'objetd'un
suiviparleCogepomi.
Parsuivi,ilconvientd'entendredeuxniveauxd'implicationduCogepomi:
? lerassemblementdesinformationsetétudesproduitessurlechangementclimatiquetraitantde
l'hydrologie,durégimethermique,descouverturesvégétalesetdelabiologiedesespèces;
? la mise en place éventuelle d'opérations spécifiques centrées sur les poissons migrateurs
amphihalinsdubassindelaLoire.
Cettedispositionrevêtégalementunintérêtderétrospectivehistoriquequipermettraitd'identifierdes
évolutionsmajeurespouvantexpliquerenpartie lesévolutionsquiontpuêtreconstatéessur les
effectifsdepoissonsmigrateursamphihalins.
Ces connaissances éclairent notamment les orientations P2 et P3 afin d'éviter d'accroître toute
dégradationetfournissentdespistesdetravailenfaveurdelarestaurationdeshabitats(orientation
R2).
DispositionC1E: L'évolution de la colonisation des bassins par les espèces envahissantes
fait l?objet d?une caractérisation et d?une évaluation de ses impacts.
Lesespècesenvahissantes,nativesouexotiques,sontsusceptiblesd'engendrerdesmodifications
d'équilibresauseindeshabitatsetdelachaînetrophiquepouvantsetraduirepar:
? desfermeturesd'habitats;
? des prédations accrues sur les poissons migrateurs amphihalins, parfois par des prédateurs
«émergents».
DeséchangessedéveloppententreleCogepomietlesréseauxdesuividesespècesenvahissantes
existantauniveaudubassindelaLoire(auniveaudubassindelaLoire,lacoordinationestassurée
parlaFédérationdesConservatoiresd'EspacesNaturels).
Cesconnaissancespermettentdedisposerd'élémentsd'appréciationpouraideraudéveloppement
d'actionsdanslecadredesdispositionsP2BetP4E.
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4.7.2 OrientationC2:Conforter les connaissances sur la biologie et le comportement des
espèces migratrices amphihalines, et poursuivre la surveillance des populations.
Après avoir constaté la présencedes poissons migrateurs amphihalins dans uncours d'eauou
tronçondecoursd'eauetlaprésenceconcomitanted'unesurfacesuffisanted'habitatsproductifs,il
convientd'envisagerdesopérationsdesuividucomportementdespoissonsmigrateursamphihalins.
Pourlescoursd'eauoutronçonsdecoursd'eauoùdesopérationsdesuiviontdéjàlieu,ilconvient
de veiller à la poursuite des opérations de suivi scientifique et technique, afin de maintenir
l'alimentationdeschroniquesdedonnéessuffisamment longuesseules, capablesdedonnerdes
indicationssurl'évolutiondel'étatd'unepopulation.
L'acquisitiondeconnaissancessurlabiologiedesespècesamphihalinesdistingue:
? enpremièrepriorité,lesopérationsdesuivisannuels,quipermettentderenseignerdesindicateurs
de l'état despopulationset de leurévolution, qui s'inscrivent encomplémentauxréseauxde
contrôledesurveillancedelaqualitédesmilieuxaquatiques;
? ensecondepriorité,lesétudesponctuelles,nécessitantuneffortparticulieruneannéedonnée,
ciblésurunoucertainsbassinsversants.
Lesétudessurlabiologiedesespèces,menéesinsitudansl'ensembleduterritoireduCogepomiou
exsitu,peuventrecouriràdespoissonsd'élevagedemêmesouchegénétiquequelapopulationen
placedanslebassinversantauquelserapportel'étude.
DispositionC2A:Desopérationsderecensementdepoissonsmigrateursamphihalinsont
lieusurdescoursd'eauoutronçondecoursd'eauoùleurprésencen'estpascaractérisée
précisémentàcejour.
Cettedispositionconcernenotammentlescoursd'eausituésdansl'airederépartitionhistoriquede
l'espèceconsidérée.
En accompagnement de la caractérisation des habitats favorables aux poissons migrateurs
amphihalins(dispositionC1C),l'inventairedelaprésencedesespècessurdenouveauxcoursd'eau
constitueuneveilleessentielle.
Cettedisposition reposesur la capitalisationdes connaissances existanteset pourraconduire à
l'émergence de nouvelles méthodes d'acquisition de connaissances, afin de développer une
connaissanceglobalelaplusexhaustivepossibleàl'échelledubassin.
DispositionC2B:Lasurvie,lareproduction,ledéveloppementetl'abondancedesjuvéniles
despoissonsmigrateurs amphihalins font l'objet d'unsuivi annuel, afin devérifier le bon
fonctionnementdescyclesbiologiquesdanslebassindelaLoire.
Cettedispositioncibleessentiellementcertainsbassinsversantsselonlarépartitiondeseffectifsd'une
espècedonnéeetlaprésencedepopulationssauvagesdepoissonsmigrateursamphihalins.
Elles'inscritdanslacontinuitédeschroniquesdedonnéesdisponibles.
Disposition C2C: Les migrations des poissons migrateurs amphihalins font l'objet
d'opérationsdesuivi.
Ladéclinaisondecettedispositionpermetd'évaluerlesretombéesdurétablissementdelacontinuité
écologiquedescoursd'eauetapparaîtcommeundispositifd'évaluationdel'orientationR1.
Cettedispositions'appuiesurdesopérationsannuelles,pouvantêtrecomplétéespardesopérations
ponctuellesdontl'intérêtrésidedanslesuividesmigrationsàl'échelled'uncoursd'eaudansson
ensemble.
Uneattention particulière pourraêtreportéeaux fluxentrée/sortieenestuaire, dans la limitedes
moyens techniquesdisponiblesàcoût raisonnable. Ladéclinaisondecettedispositionsurcecas
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spécifiquedesestuairessefaitencohérenceavecl'élaborationdupland'actionspourlemilieumarin
duGolfedeGascogne.
DispositionC2D:Lesdonnéesbiologiquessontvaloriséespourcomprendreladynamique
despopulationsdepoissonsmigrateursamphihalinsetsuivre l?évolutionvers l?objectif de
viabilitédespopulations.
Lesconnaissancesacquisesgrâcenotammentà lamiseenoeuvredesmesuresdesdispositions
C2BetC2Cpermettentdeprogresserdanslacompréhensiondesdynamiquesdepopulations.
Lamiseenoeuvredecettedispositionconduitàapprécierlaviabilitédespopulationssauvagesparle
suividedifférentsindicateursetàévaluerleseffectifscorrespondantauxseuilsd'exploitation,dont
l'atteinteàlahausseouàlabaissepeutconduireàunemodificationdesmesuresd'encadrementde
lapêche,exposéesparlesmesuresdesdispositionsP4AetP4B.
4.7.3 OrientationC3:Améliorerlaconnaissancedelapressiondepêcheexercée
surlespoissonsmigrateursamphihalins
Afind'éclairer la miseenoeuvre de l'orientation P4, il est nécessaire depoursuivreet renforcer
l'informationduCogepomisurl'étatdelapressiondepêchesurlespoissonsmigrateursamphihalins.
Rappelréglementaire :
L'articleR.43664duCodedel'environnementprévoitàsonpremieralinéaquetoutpêcheureneau
douce,professionneloudeloisir,doitteniràjouruncarnetdepêcheselonlesmodalitésfixéesparle
plandegestiondespoissonsmigrateurs.
Pourlapêchedel'anguille,cesmodalitéssontfixéespararrêtéduministrechargédelapêcheen
eaudouce(arrêtéministérieldu22octobre2010)etelless'accompagnentd'obligationsdéclaratives
pour les différents stades d'anguille pêchés (civelle, anguille jaune et anguille argentée). Ces
obligations déclaratives concernent tous les pêcheurs aux engins sur le domaine public
(professionnelsetamateurs),ainsiquelesmembresdesAAPPMAautorisésàpêcherauxenginssur
ledomaineprivé.
Lescapturesaccidentellesetaccessoiressontégalementconsignéesdanslecarnetdepêche.
DispositionC3A:LeCogepomiveilleàobtenirlesdonnéesdecaptureauprèsdesservices
enchargedeleurcentralisation.
Afind'améliorerlagestiondesespècesmigratricesamphihalinesetnotammentd'évaluerl'efficacité
desmesuresd'interdictiondelapêchedecertainesespècesamphihalines(dispositionP4A)etla
pertinence de mesures complémentaires d'encadrement des pratiques (disposition P4B), les
donnéesdecapturessontvaloriséesdanslecadreduCogepomi.
Lamiseenplaced'unedémarchederecueildesinformationsauprèsdesserviceschargésdela
collectedesinformationsetdesorganisationsreprésentativesdespêcheurs(FDAAPPMA,AAPPED,
CRPMEM)estétudiéeenpriorité,afinderemédierauxdifficultésactuellesderécupérationetde
valorisationdecesdonnéesàl?échelleduCogepomi.
4.7.4 OrientationC4:Évaluerl'efficacitédesprogrammesdesoutiend?effectifs,afin
d?êtreenmesuredelesadapterlecaséchéant.
Cetteorientations'inscritenétroiterelationavecl'orientationR3.
L?ensembledeseffetsdesprogrammesdesoutiend?effectifensaumonsdoitêtreévalué,notamment
sonefficacitéentermesd'individuscontributeursàlareproduction.
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Pourcequiconcernelemonitoringdesopérationsderepeuplementencivelles,lesélémentssont
cadrésauniveaunationaldansleplandegestiondel'anguilleetdansleprogrammeexpérimentaldu
repeuplement.
Cetteorientations'inscritdanslacontinuitédesprogrammesd'évaluationencours(suiviàsixmois,
unanettroisanspourlesopérationsdetransfertdecivelles,assignationgénétiqueparentalepourle
saumon).Samiseenoeuvreaccompagnedefaitlesprogrammesdesoutiend'effectif.
C4A: L'implantationdesjuvénilesdéversésdanslemilieunaturel lorsdesopérationsde
soutiend'effectiffaitl'objetdemesuresd'évaluation.
Cettedispositionapourobjectifdeconstaterl'occupationdeshabitatsdessitesdedéversementsuite
auxopérationsmenéesdanslecadredel?orientationR3.Unerécurrencederésultatsdéfavorables
d'implantation doit conduire à adapter les sites de déversements définis par les mesures de la
dispositionR3B.
Lamiseenoeuvredecettedispositions'articuleavecladispositionC2Betimpliquenotamment:
? d'évaluer les opérations expérimentales de soutien d'effectif par des chargements d?oeufs en
incubateursdeterrain;
? d'être en mesure d'identifier l'origine des juvéniles, ce qui peut nécessiter une analyse du
patrimoinegénétiquedesjuvénilesinventoriés;
? d'appliquer les protocoles desuivis harmonisés des opérations dedéversement pouvant être
définisauniveaunational.
C4B: Lacontributiondesindividusdéversésà lareproductionà l'issuede leur cyclede
grossissementestévaluée.
Comptetenudel'impossibilitétechniquedelamiseenoeuvred'uneopérationsurl'anguilledansle
cadreduPlagepomi,cettedispositionneportequesurlesaumon.
L'évaluationdecettecontributiondoitêtregénéraled'unepart,etdistinguerlapartdechaquestade
dedéversementutiliséquandlatechniquelepermetàcoûtraisonnable.
L'évaluationglobalepourrareposersurlapoursuitedel'opérationgénétiqued'assignationparentale,
lancéeen2009.Latraçabilitédel'élevagepermetdeconnaîtrelepatrimoinegénétiquedesdeux
parentsd'un individu déversédans le coursd'eau. Unprélèvement de tissuet d'écaillessur les
saumonsderetourspermetensuitel'analysedeleurADN.Cetteanalyserendpossiblel?assignation
dessaumonsderetoursàleursparents,sicesdernierssontoriginairesdelasalmoniculture.
Compte tenu des cycles biologiques des différents contingents issus d'une même reproduction,
quatrecohortesdifférentesreviennentenuneannée.
Les mesures d?évaluation des opérations de soutien d?effectif sont menées dans la mesure du
possibleensynergieavecd'autresopérationsnécessitant lamanipulationdepoissonsmigrateurs
afinderéduirelesimpactssurlapopulationsauvage.
Enparallèle,silatailledesjuvénilesdéverséslepermet,unmarquagephysiqueseraréalisé(par
exemplel?ablationdelanageoireadipeusedessmolts),afind?êtreenmesured?identifiervisuellement
l?originedupoissonderetour.
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