Suivi de stations de taxons de flore vasculaire rares et menacés, et programme de collecte ex situ en Pays de la Loire - Bilan 2019
MESNAGE, Cécile
Auteur moral
Pays-de-la-Loire. Direction régionale de l'environnement, de l'aménagement et du logement
;Conservatoire botanique national (Brest, Finistère)
Auteur secondaire
Résumé
Ce programme de suivi stationnel a pour objectif d'apporter des précisions sur le degré de vulnérabilité des plantes prioritaires qui peut être constaté sur le terrain, de quantifier les populations, et de réaliser une analyse qualitative du contexte de la station du point de vue non seulement écologique, mais aussi du point de vue des facteurs humains influençant l'évolution des populations.
Editeur
DREAL Pays de la Loire
Descripteur Urbamet
environnement
;flore
Descripteur écoplanete
biodiversité
;protection de la flore
;suivi des populations
;conservatoire botanique
;analyse quantitative
;taxonomie
Thème
Environnement - Nature
;Nature
Texte intégral
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Suite
Suivi de stations de taxons
de flore vasculaire rares et
menacés, et programme de
collecte ex situ en Pays de
la Loire
Bilan pour l'année 2019
N
o
te
MESNAGE Cécile
Décembre 2019
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I. SUIVI STATIONNEL
1. Contexte et rappel des objectifs du programme
En s?appuyant sur une expérience précédemment lancée en Basse-Normandie en 2007, le
Conservatoire botanique national de Brest a développé en Pays de la Loire, à partir de
l?année 2008 et avec le soutien de la Direction régionale en charge de l?environnement et de
la Région, un programme de suivi des stations de plantes rares et/ou menacées dans la
région pour la flore vasculaire. Celui-ci se poursuit désormais sur des crédits de la DREAL
Pays de la Loire.
Ce programme de suivi stationnel a pour objectif d?apporter des précisions sur le degré de
vulnérabilité des plantes prioritaires qui peut être constaté sur le terrain, de quantifier les
populations, et de réaliser une analyse qualitative du contexte de la station du point de vue
non seulement écologique, mais aussi du point de vue des facteurs humains influençant
l?évolution des populations. Ainsi, l?appréciation in situ des tendances d?évolution et des
menaces s?exerçant concrètement sur les populations végétales et la prise en compte de
mesures effectives de conservation déjà mises en place permettent de venir préciser
l?évaluation de la vulnérabilité à l?échelle régionale. La collecte de ces informations s?est
d?ailleurs avérée très utile dans le cadre du travail d?élaboration de la liste rouge régionale
selon les critères de l?UICN (Dortel et al., 2015), par exemple.
En 2016, le CBN de Brest, à partir de la nouvelle liste rouge régionale établie selon la
méthode de l'UICN (Dortel et al., 2015), a défini de nouvelles priorités de conservation
(Mesnage et Lacroix, 2017). Quatre types d'enjeux ont été pris en compte dans le cadre de
ce travail :
? Enjeu de conservation in situ (mise en place de mesures effectives de conservation),
? Enjeu de collecte ex situ (mise en culture ou en banque de graines),
? Enjeu de suivi des populations et du contexte stationnel,
? Enjeu d?amélioration des connaissances (taxonomie, répartition).
Concernant l'enjeu de suivi des populations et du contexte stationnel, la hiérarchisation des
priorités prend en compte les taxons menacés de la liste rouge régionale, mais également les
taxons des annexes 2 et 4 de la Directive habitats et les taxons endémiques et
subendémiques cotés « LC » sur la liste rouge régionale.
La liste totale des taxons analysés compte ainsi 432 taxons.
Quatre niveaux de priorité ont été définis pour le suivi stationnel :
1. taxons cotés en CR et CR* + taxons à très faible occurrence régionale (présence après
2000 sur une seule commune en Pays de la Loire),
2. taxons cotés en EN + taxons à faible occurrence régionale (présence après 2000 sur 2
ou 3 communes en Pays de la Loire),
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3. autres taxons figurant aux annexes 2 et/ou 4 de la Directive habitats,
4. autres taxons menacés de la liste rouge régionale (VU et NT) + endémiques et
subendémiques cotés « LC ».
Tableau 1 : Nombre de taxons par niveau de priorité de suivi
Le programme de suivi stationnel s'appuie ainsi désormais sur ces nouvelles listes de
priorité. Il est envisagé que le plan de prospection du CBN de Brest mette la priorité de suivi
sur les niveaux de priorité 1 et 2. L?objectif est de réaliser dans les années à venir un suivi
stationnel sur le maximum de stations de ces taxons prioritaires. Ce niveau de suivi
renseigné dans l?outil « Suiviflore » du CBN correspond à ce qui a été qualifié en interne à de
la « Surveillance ».
Pour les 2 autres niveaux de priorité, le CBN de Brest pense plutôt se reposer sur de la
«Veille», c'est-à-dire une collecte des données via le réseau des observateurs du
Conservatoire. Les plantes de la liste de priorité 3 bénéficieront si possible d?une animation
par le CBN de Brest pour dynamiser plus fortement la remontée des données. Elles intègrent
5 taxons de la Directive habitats qui comptent un nombre encore relativement conséquent
de stations dans la région (les autres taxons de la Directive habitats figurent dans les
priorités 1 ou 2).
2. Méthode de suivi des stations
La méthode repose sur le remplissage sur le terrain d?une fiche stationnelle standard
permettant de renseigner diverses informations sur l?identité, la description de la station, les
données concernant l?écologie du taxon dans la station, les facteurs écologiques, la biologie
du taxon suivi, les principales atteintes et menaces recensées, la gestion des habitats
abritant le taxon pour aboutir à l?évaluation de l?état de conservation du taxon dans la
station. Cette description est accompagnée d?une cartographie de l'étendue de la station à
une échelle de précision d'a minima le 1/5 000.
Une fois remplies, ces fiches sont destinées à alimenter le volet « Suivi des plantes
vulnérables » de la base de données « SuiviFlore » du CBN de Brest. Celle-ci est en lien avec
la base d?information géographique Calluna qui gère les données de répartition de la flore au
CBN de Brest.
Ces fiches sont en premier lieu destinées aux permanents du CBN de Brest en charge du suivi
des espèces rares et/ou en régression, mais elles sont également accessibles aux
professionnels de la gestion des espaces naturels et des espèces, dans le cadre de
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démarches d?échanges scientifiques et techniques. Leur utilisation requiert alors une
formation spécifique et un encadrement de la part du CBN de Brest.
Une révision de l'outil "SuiviFlore" du CBN de Brest a été réalisée, donnant lieu à une
actualisation de la notice technique (cf. Mesnage, 2019).
3. Bilan des suivis stationnels mis en oeuvre en 2019 dans le cadre du tableau de bord de
suivi des plantes rares et menacées en Pays de la Loire
Depuis 2018, le CBN de Brest a élaboré un tableau de bord pour le suivi stationnel
s?appuyant sur les listes de taxons prioritaires. Il a choisi de porter ses efforts prioritairement
sur la liste des taxons de priorité 1 n'ayant encore jamais fait l'objet d'un suivi stationnel.
Après une première année de mise en oeuvre en 2018, en 2019 le CBN de Brest a poursuivi
ses prospections pour compléter les visites de stations de taxons prioritaires
(préférentiellement ceux de la liste de priorité 1).
51 stations se rapportant à 28 taxons (26 de la liste de priorité 1 et 2 de la liste de priorité 2)
ont ainsi pu faire l'objet d'un suivi stationnel renseigné dans l'outil "Suiviflore" du CBN de
Brest en 2019 : cf. liste des taxons suivis et des stations visitées dans le tableau 2 ci-dessous1.
Certaines stations ont été visitées par des partenaires ou membres du réseau de botanistes
bénévoles du CBN de Brest. On peut citer notamment :
? les stations d?Orchis coriophora et O. palustris situées en Loire-Atlantique qui ont fait
l?objet de prospections systématiques dans le cadre d?un projet d?atlas
départemental des Orchidées coordonné par l?association Bretagne-Vivante,
? des stations sarthoises suivies par l?antenne du Mans du CEN des Pays de la Loire
(Orchis palustris en vallée des Cartes par exemple, Pyrola minor) ou par des
bénévoles du réseau (Gentianella amarella).
Notons que pour près de la moitié de ces observations (47%) le taxon recherché n?a pas
été retrouvé.
1
S?ajoutent également plusieurs taxons prioritaires bénéficiant par ailleurs d?un plan régional de conservation
et pour lesquels les suivis sont régulièrement mis en oeuvre en dehors de ce tableau de bord de suivi des
populations régionales. On peut citer pour les taxons de priorité 1 : Allium ericetorum, Coleanthus substilis,
Gagea bohemica, Lycopodiella inundata et Marsilea quadrifolia qui ont fait l?objet d?un suivi de toutes ou partie
de leurs stations régionales en 2019.
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Tableau 2 : stations suivies en 2018 par le CBN de Brest de taxons définis comme prioritaires pour le suivi
Nom scientifique complet
CBNB
Priorités
de suivi
Département Commune
Lieu dit (= nom
de la station de
regroupement
si suivi)
Obs de
l'espèce
lors du
dernier
suivi
oui/non
Asplenium septentrionale (L.)
Hoffm. 1 44
Le Cellier
Saint Méen
oui
Asplenium septentrionale (L.)
Hoffm. 1 72
Rouessé-Vassé La Basse Vallée non
Cephalanthera rubra (L.) Rich. 1 85
Olonne-sur-mer
Forêt d'Olonne
(à l'ouest de la
Tantouille)
oui
Cynoglossum creticum Mill. 1 85 Talmont-Saint-Hilaire ZI du Pâtis oui
Cyperus flavescens L. 1
49 Chaumont-d'Anjou
Etang de
Malagué
oui
Cyperus flavescens L. 1 72 Marigné-Laillé Les Etangs oui
Cystopteris fragilis (L.) Bernh. 1 72 Dissay-sous-Courcillon Les Rottes oui
Echium asperrimum Lam. 2 85 Talmont-Saint-Hilaire Le Patis oui
Echium plantagineum L. 1 49 Freigné non
Equisetum sylvaticum L. 1 53
Saint-Denis-de-Gatine
Fossé 300m au
sud-est de "Les
Aunais"
non
Eriophorum vaginatum L. 1 72
Parigné l'Evêque
Nord-est de la
Saule
non
Eriophorum vaginatum L. 1 72
Saint-mars d'Outillé
Bord du Narais
(au NE du Pont
aux Brebis)
non
Eriophorum vaginatum L. 1 72
Saint-mars d'Outillé
Le Pont aux
Brebis
non
Fumaria vaillantii Loisel. 1
85 Saint Hilaire-de-Riez
la Conge
(chemin du
Barrilet)
oui
Gentianella amarella (L.)
Börner 1 72
Allières-Beauvoir
Les Huperies
non
Gentianella amarella (L.)
Börner 1 72
Contilly
Butte de la Nue
non
Helianthemum salicifolium (L.)
Mill. 1 49
Martigné-Briand
Les Grouas
oui
Hypericum montanum L. 1 85 Chantonnay Bois Charron non
Lythrum borysthenicum
(Schrank) Litv. 1 44
Gétigné
L'Ecarpière
(ancienne mine)
_ site de
stockage
oui
Myosotis stricta Link ex Roem.
& Schult.
1 49 Baugé-en-Anjou
Autour de
Vernus
non
Nigella arvensis L. subsp.
arvensis 1 49
Montreuil Bellay
Champagne de
Méron (Les
Nièdes - est)
oui
Orchis coriophora L. subsp.
coriophora 2 44
Gorges
La Censive
non
Orchis coriophora L. subsp.
coriophora 2 44
Batz-sur-mer Moulin de la
falaise
non
Orchis coriophora L. subsp.
coriophora 2
44 Préfailles Port aux Anes
(Nord) oui
Orchis coriophora L. subsp.
coriophora 2
44 Préfailles Port aux Anes
(Sud) oui
Orchis palustris Jacq. 1 44 Crossac Pont de l'Ile oui
Orchis palustris Jacq. 1 44 Donges L'Angle Moisan non
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Orchis palustris Jacq. 1 44 Saint-Joachim Le Lony non
Orchis palustris Jacq. 1 85
Olonnes-sur-mer
Marais d'Olonne
(La
Grenouillère)
oui
Orchis palustris Jacq. 1 85
Longeville-sur-mer
Prés de la
Saligottière
oui
Orchis palustris Jacq. 1 85
Bretignolles-sur-mer
Dunes de la
Gachère
oui
Orchis palustris Jacq. 1 72
Savigné-sous-le-Lude
Les Ruaux
(Vallée des
Cartes)
oui
Orchis palustris Jacq. 1 72
Savigné-sous-le-Lude
Les Bardinières
(Vallée des
Cartes)
oui
Orobanche arenaria Borkh. 1 49
Le Thoureil
Ile de Saint-
Maur
oui
Orobanche teucrii Holandre 1 72 Luché-Pringé Les Rosiers non
Parnassia palustris L. 1 72
Parigné l'Evêque
RNR de la Basse
Goulandière
non
Parnassia palustris L. 1 72
Saint-Mars-d'Outillé
Le Pont aux
brebis
non
Parnassia palustris L. 1 72
Saint-Mars-
d'Outillé/Marigné-laillé Les Etangs
non
Parnassia palustris L. 1 72
Savigné-sous-le-Lude
Les Bardinières
(vallée des
Cartes)
oui
Parnassia palustris L. 1 72
Savigné-sous-le-Lude
Les Ruaux
(vallée des
Cartes)
oui
Pedicularis palustris L. subsp.
palustris 1 72
Savigné-sous-le-Lude
la Gigotière
non
Physalis alkekengi L. var.
alkekengi 1 49
Vaudelnay
A travers la
vigne à les
Hacheraux
oui
Pinguicula vulgaris L. 1 72
Challes
Etang de la
Gardonnière
non
Pinguicula vulgaris L. 1 72
Ardenay-sur-Mérize
Nord-ouest de
l'étang de la
Gardonnière
oui
Potamogeton coloratus
Hornem. 1
85 Benet
Marais de
Lesson
non
Potamogeton coloratus
Hornem. 1
72 Parigné-l'évêque
La Basse
Goulandière
non
Potamogeton coloratus
Hornem. 1
72 Vaas Le Laurier non
Pyrola minor L. 1 72 Montfort-le-Genois La Belle Inutile non
Spiranthes aestivalis (Poir.)
Rich. 1 85
Olonne-sur-Mer
la Cassotte
(Mare isolée au
nord)
oui
Spiranthes aestivalis (Poir.)
Rich. 1 72
Savigné-sous-le-Lude
Les Ruaux
(vallée des
Cartes)
oui
Veronica triphyllos L. 1 49 Allonnes le Chantier oui
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Les prospections de 2019 ont permis de finaliser l?état des lieux des populations régionales
pour 12 taxons (dont plusieurs ne sont connus qu?en une unique station régionale), toutes
les stations connues et suffisamment précisées d?un point de vue géographiques ont ainsi pu
être visitée récemment et ont fait l?objet d?une fiche de suivi stationnel (tableau 3). Cinq
taxons n?ont pas été retrouvés dans leurs anciennes stations et sont donc présumés disparus
en Pays de la Loire : Echium plantagineum, Equisetum sylvaticum, Gentianella amarella,
Myosotis stricta et Orobanche teucrii.
Tableau 3 : taxons pour lesquels les suivis de 2019 ont permis de finaliser l?état des lieux des populations
régionales connues (en rouge : taxons non revus récemment)
Nom scientifique complet CBNB Nom scientifique complet TAXREF
Priorités
de suivi
Asplenium septentrionale (L.) Hoffm. Asplenium septentrionale (L.) Hoffm., 1795 1
Cynoglossum creticum Mill. Cynoglossum creticum Mill., 1768 1
Echium plantagineum L. Echium plantagineum L., 1771 1
Equisetum sylvaticum L. Equisetum sylvaticum L., 1753 1
Gentianella amarella (L.) Börner Gentianella amarella (L.) Börner, 1912 1
Lythrum borysthenicum (Schrank) Litv. Lythrum borysthenicum (Schrank) Litv., 1917 1
Myosotis stricta Link ex Roem. & Schult. Myosotis stricta Link ex Roem. & Schult., 1819 1
Nigella arvensis L. subsp. arvensis Nigella arvensis L., 1753 1
Orobanche teucrii Holandre Orobanche teucrii Holandre, 1829 1
Physalis alkekengi L. var. alkekengi Physalis alkekengi L. var. alkekengi 1
Pinguicula vulgaris L. Pinguicula vulgaris L., 1753 1
Spiranthes aestivalis (Poir.) Rich. Spiranthes aestivalis (Poir.) Rich., 1817 1
4. Plan de prospection pour l'année 2020
Le plan de prospection pour 2020 s'appuie pour la 3ème année consécutive exclusivement sur
la liste de priorité de suivi n°1, les taxons et stations n'ayant pas encore fait l'objet de suivi
stationnel étant privilégiés. Cette liste comporte 44 taxons, pour 166 stations répertoriées.
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II. COLLECTE EX SITU
Dans le cadre du travail réalisé en 2016 qui a défini de nouvelles priorités de conservation
(Mesnage et Lacroix, 2017), quatre niveaux de priorité ont été établis concernant l?enjeu de
conservation ex situ. Ils s?appuient sur les statuts de vulnérabilité des taxons de la récente
liste rouge régionale (Dortel et al., 2015) : CR et CR* pour la priorité 1, EN pour la priorité 2,
VU pour la priorité 3 et NT pour la priorité 4.
1. Bilan des collectes
Les collectes ont porté en 2019 sur 3 taxons menacés de la liste rouge des Pays de la Loire
(de priorité 1 et 2 pour les enjeux de conservation ex situ), uniquement sous forme de
graines (figure 3).
Tableau 4 : détail des prélèvements transmis au service ex situ du CBN de Brest en 2019
Taxon récolté
Matériel
récolté
Date de la
récolte
Lieu de la récolte
Station
décrite dans
Suiviflore
(Oui / Non /
C = fiche
créée à
l'occasion du
prélèvement)
NOM de référence RNFO
(version 1-01 du 13
septembre 2010)
(G =
graines, B =
boutures, P
= plante
entière, A =
appareil
souterrain)
(j/m/a)
Commune
(source INSEE,
2004)
Département Lieu-dit
Coordonnées GPS
(x-y en degrés
décimaux)
Fumaria vaillantii Loisel. G 09/04/2019
SAINT-HILAIRE-
DE-RIEZ (85226)
85
les
Conges
C
Daucus carota L. subsp.
gadeceaui (Rouy &
E.G.Camus) Heywood
G 22/08/2019
PIRIAC-SUR-MER
(44125)
44
de Por
es Ster
à
Riomor
3 lots
positionnés
au nibveau
des
pointages
de 2013
dont les
tests de
germiination
ont montré
des
populations
assez
"pures" de
D. gadeceai
oui
Helianthemum
salicifolium (L.) Mill.
G 18/06/2019
MARTIGNE-
BRIAND (49191)
49
Les
Grouas
C
2. Conclusion et perspectives pour la collecte ex situ
La mise en oeuvre de la stratégie initiée à partir de 2010 par le CBN de Brest pour la
conservation ex situ des taxons rares et/ou en régression sur le territoire d?agrément en Pays
de la Loire, reste à poursuivre dans les années à venir. Les futures collectes pourront
continuer à être orientées selon les niveaux de priorité définis en 2017 pour les enjeux de
conservation ex situ.
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Bibliographie
MESNAGE C., 2019 ? Programme de surveillance de la flore vasculaire rare et menacée.
Application "SuiviFlore" Définitions et protocole de remplissage des fiches de suivi.Notice
d'utilisation (Version 1) NANTES: Conservatoire botanique national de Brest. 23 pages
+annexes.
MESNAGE C., LACROIX P., 2017 - Actualisation des priorités de conservation de la flore
vasculaire des Pays de la Loire. Préfet de la région des Pays de la Loire. Nantes :
Conservatoire botanique national de Brest, 6 p. + 4 annexes (Note)
DORTEL F., MAGNANON S., BRINDEJONC O., 2015 - Liste rouge de la flore vasculaire des
Pays-de-la-Loire. Évaluation des menaces selon la méthodologie et la démarche de l?UICN :
document validé par l'UICN le 21/10/2015 et par le CSRPN le 26/11/2015. Conseil régional
des Pays de la Loire / DREAL Pays de la Loire. Brest : Conservatoire botanique national de
Brest, 53 p., annexes.
10/10
?Bibliographie
?